Nonlabens sp. MIC269: AAT17_04060
Help
Entry
AAT17_04060 CDS
T04144
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
nom
Nonlabens sp. MIC269
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nom00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
nom02000
]
AAT17_04060
Transporters [BR:
nom02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AAT17_04060
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALM20468
UniProt:
A0AAI8BUS1
LinkDB
All DBs
Position
869912..872959
Genome browser
AA seq
1015 aa
AA seq
DB search
MKTKFKGILTLLLALVAQVAFAQQTVTGTVSDADGPVGGATVSIKGSNTFASTNFDGEYS
IQANPEDVLVFSYVGYDAKEETVGNRTVIDVTLSSALEEVVVQAYRTSSTKRSNIAANVI
TAKQIQDRPNASAIQRLQGQVPGLIIQTASGQPGANSTIQLRGVSSINGNTEPLIIIDGI
PVDEDAFRTINPLDIESQTVLKDAAATAIYGNRGANGVIIIKTKGGAYNQELQVSYTGQT
RITELIDTEYDLFNSRDYLRLENERGIGLGATLTDAEINAYAVNTDWSDTFYRTGFSQLH
NLSLRSGGKNLNQFTSVNYTYEEGSLQASDLQRFTVRNNLNIKSDNDRFNLATSLQVGYS
KNNSQSEPETRNNAIYFNSIYNSNFGLPYFDPNNYDTRIEEWVGSLQARLSPYVTLDNIL
FNGNREDEMKIIAGANSSYKISDNWTARYNIGVDYRQQTFLRYADPNSALARVRASFIGP
GEVEGFQTESFFNDFRFNSTASIGYKKTFGANEDGSNGHTILANGYVEYVKAHFKSFGFS
QTGLDPRTFSPGNDGGAFIGDNEDNDEFVPTVNSGKGSTGLFSYFAEFDYDYADKYGFGA
TIRRDASSRFSGDNKWGTFWSVAGRWNISEEAFMKDVNWVNSLKLRASYGSVGNDRIAST
YYGALNNTRTLFTTGLSYADNQTFVRSQLGNADLRWESVNTANLGLDYELFNRRLRGTLD
FYNRKTTDLFSPRSVSTLVIASGTQQANIGDLVNRGIELGARYDLIIPKSNKGFDLDIFA
NVSYNENEVTSIDAPDGIIDNGSSVIQEGAQLNEYFVVPYLGVNPANGNLLFLDANGNPT
EAPTLDDRRLTGTDTVPDFQGGFGFEMNYNNFFFETQFSFMTGLQRFDFNQRDYYDINNL
GQTQLSSDLTRSWTPTNRVTDMPSLAATNIATGPLSDRFLIDSDFLRVRFMQLGYNFDEA
ALDKIFLDSARIYVNAENLVTWTKWLGSDPESTRLSEYNRYPTPRIFSVGIDLQF
NT seq
3048 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaaaatttaaaggaattttgacgctattactagcgttagttgcgcaagtagct
tttgcgcagcagactgttaccggtacggtatcagatgcagatggacctgttggaggtgca
acagtgtctattaaaggttcgaataccttcgcatcaactaattttgatggtgaatatagt
attcaagctaaccctgaagacgtgcttgtctttagttatgtaggatatgatgctaaagaa
gagaccgttggtaatagaacagttatcgatgtaacacttagttctgctcttgaagaggta
gtagttcaggcatatcgtacttcatctaccaaaaggagtaacattgctgcaaatgttatt
accgctaaacaaatccaagacagacctaacgcaagtgctattcaaaggttacaaggtcag
gtacctggacttattattcaaacggcttctggtcaaccaggcgcaaactctacaattcaa
ttaagaggtgtgagttctattaatggtaatacagagccacttatcattattgatggtatt
cctgttgatgaagatgccttcagaacaataaatccattggatattgaaagtcagactgta
cttaaagatgcggcagcaactgcaatctatggtaatagaggtgcaaatggtgtaattatc
atcaaaactaaaggtggtgcttataatcaagagcttcaagttagttatacgggacagact
agaattacggaattaatagacacagagtatgacctgttcaactcacgtgactacttaaga
ctagaaaatgaacgaggaatcggtcttggtgcaactttaacagacgctgaaataaatgca
tatgcggttaacaccgactggagtgatactttctatagaactgggtttagtcaattacac
aatttatctttaagatctggtggtaaaaacttgaaccaattcacatctgttaactacact
tacgaagaaggttctttacaagcatcagacttacagagatttaccgttagaaacaattta
aatataaagtcagataatgatcgctttaatttggcaacatctcttcaagtagggtattct
aaaaacaattctcagtcagagcctgagacaagaaataatgctatttattttaactctatc
tataattctaattttggtttaccttattttgatccaaacaattatgatacaagaatagag
gaatgggtgggtagtttacaggcacgtttatctccatatgttaccttggacaacatttta
ttcaatggtaatagagaagatgaaatgaaaatcattgctggtgcaaattcatcttataaa
attagtgataattggacagcgagatacaacattggtgtggattatcgtcaacaaacattt
ttaagatatgctgatcctaattctgctctagcaagagtaagagcaagtttcattggacct
ggagaagtagaaggatttcaaacagaatcatttttcaatgactttagatttaactcgact
gcaagcataggttataagaaaacttttggtgcgaatgaagacggaagtaatggtcacaca
atattagcaaacggatatgtagaatatgtgaaggctcactttaaaagttttggcttttct
caaacaggtttagacccaagaacatttagtcctggaaatgacggtggagccttcattggt
gacaatgaagataatgacgaatttgttccaacggttaactctggaaaaggtagtacaggt
ctattctcatattttgcagaatttgattatgattatgccgacaaatatggttttggtgca
acaatacgtagagatgcttcatcaagatttagcggagacaacaaatggggtactttttgg
tctgttgcaggtagatggaatatttcggaagaagcatttatgaaagatgtaaactgggtt
aattcattaaaactaagagcttcatatggtagcgtaggtaatgaccgaattgcttcaacg
tattatggagcacttaacaatacaagaactttatttactacaggattatcatatgctgat
aatcaaactttcgtaagatctcaattaggaaatgcagacttgagatgggagtcggtaaac
acagcaaaccttggtttagattatgaattatttaacagaagattaagaggtacattagat
ttctacaacagaaaaactactgatttattttctccgagatctgtttctactttagtaatt
gctagtggtacacagcaagctaacattggagacttggtgaatcgtggtattgaattagga
gctagatatgatttaataatcccaaaatcaaacaaaggatttgatttagacatatttgct
aacgtaagttacaatgaaaatgaggtaacttcaattgacgctccagatggaatcattgat
aacggttcatcggtaatccaagaaggagctcaattaaatgaatactttgtagtgccttat
ctaggagtaaatccagcaaacggtaacttgttattcttagatgctaatggaaatccaaca
gaagctccaacactagatgatagaagattaactggaactgatactgtgccagatttccaa
ggtggatttggttttgaaatgaactataacaatttcttttttgaaactcaatttagtttc
atgactggattacaaagatttgactttaatcaacgtgattattatgacatcaataattta
ggtcaaactcaattatctagtgaccttacaagatcgtggacaccaacaaatagagttaca
gacatgccatctttagcagctactaacatagctactggaccattatcagatagattctta
atagactcagactttttaagagttcgtttcatgcaattgggttacaactttgatgaggca
gcattagataaaattttccttgacagtgctagaatatatgtaaatgctgaaaacttagtt
acttggactaagtggttaggatctgatccagaaagtacacgtttatcagaatacaacaga
tacccaacaccacgtatttttagtgtaggtattgatttacaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system