Nostoc sp. NIES-3756: NOS3756_26720
Help
Entry
NOS3756_26720 CDS
T04170
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
non
Nostoc sp. NIES-3756
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
non00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
non02000
]
NOS3756_26720
Transporters [BR:
non02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NOS3756_26720
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAT53710
LinkDB
All DBs
Position
complement(3094976..3100501)
Genome browser
AA seq
1841 aa
AA seq
DB search
MTRSPNNRRLSLRLLRRTSLVVGFVALAGITIGTWWVRNYVYKDLVPLVETNLEQLLGRS
IKLGQVERFTLSSLRFSSLSIPATPTDPDRVAAQAVDVRFSPLQVLFTRTLVLNVTLVKP
NVYIQQDQDGRWVTAQVKTGEGRGPIQTQLQSLELVDGNIELLSAPAPTKPQGSVVLTQV
GGIARFSSDNERINYQVNGQLTRGGAVKISGETQPKTQLTNLQLSAQSLEASDVSRLLKV
PIVLQAGRVDADLAVQIPPKQSEISITGTATPTQVTAKVENLPQPFSNANGRLTFQGQTI
GLENLSANFGQVPLLANGTVNLQTGYNLAAQVKSVSAKQLLDTFKVKSPVPAAGEVTAAI
KVQGALQQPVLSGTASNIKPIQVDRVLFTGVKTDFRLAVGDKVTQIAVPNLTLVPAAGGQ
IIGNGQGQLGGNVNFNIEADGISGDVLARTYGINPPTNIGNVSAKAAITGSLGKQPLALN
VASVQVQPPAGGQIVGRGQVQLAPQGNVAFNIQAQNLPGDALAKTNNNIKVGNVSANARV
SGTLGNLRAVAQVQAPTATYPTTGEIVVAQQGNLLLPSAVLNVAGGTVRANGRVIQQRWQ
AAVNASQIQLNSFAQIPPQFQGVLSNATFNLSGSTASFQPSTIQASGRANLNVAGGRVNL
RDVNLNNGRWQAVANASQIQFNRLAQIPTQFQGVLSSATFNLSGGTASFQPSTIQASGQA
NLNVAGGRVNLRNVNLNNGRWQAVANASQIQLNRFSPQLRGRLNSNVQLAGTTASFQLAD
IRAAGEINASQGIAQLAQPINAQFQWNGQQIIVQRATTPGLSASGAIAVQLPESGTPQIA
GLNLNVQAQNFDLSKTGFQTPGDIAIAGLLNFNGRVTGTLNTPQATGNIRLRNFYVGNLA
FDPVLTGNVNFQGGQGASLRLAGTQDKIALNLNANYRPTSFLVQRAGAVTTGRTEGDNLI
INAQQFPIALASAFLPNNQLRPLGGTLSGNLTVNLNNYALAGDVALANPRIARASADEFR
GNINYADGTASLSNGLLRVGDSNIAVSGSLQAGNDPKFRLQANLNQTRVENLLQAFNIFD
FRDFGGGLEAPTLAGAEALNTTPVRLPNADLQTQLDYFRQIQTTVAQQQQQDRQQQPPLP
SLQQLTGALSGAITASGSLRTGLNVGFNFQGDNWQWGDYSINQVIADGNFADGVLTLSPL
RVGINGGLVAFAGQLSPEQLSGQLSVNSLPLSLLDPFIARYPVDITGQVNAIANLTGSLE
NPRATGELTLANATLNQQPVQTGQLSFDYNNARLNFDSTLLLTGTQPIAINGSIPAALPF
ATQPTNNNININANVSNEGLSLLNLLTNNQVAWVDGQGQVNVNVQGTFNQPVINGNATIN
NATISAQALTNPLTNVTGTVQFNGDILNVQGIQATYNQGLITASGSLPIFTAADISNPLS
VAIQDKLNLQVAELYTGDVSGNAVIRGTALKPRIGGEITLSDGQVTIGNTSDNKSQRANT
TNNPTTIQLERNQPATTATNTTTIQSNGNQSETTVTQPAPTRPNLPIEFADLRLNLGDDV
RVTSQPLLSFVPGGAEFIQPLLRFDAEGDLTINGTLAQPRPQGVIRLTGGRISLFTTEFT
LERGYEHTAQFTPSQGLDPTLDVRLVAIVPEASNRSDRILESPLSAEISDVSPTTFGTLR
TVRIQARATGPASQLANNLELTSQPSRSRGEIVALLGGSILNNFAQGDAGQGLTSFASST
ILGSLQGTITAIGQTIGFSEFRIFPTPTTSRESSRASVLDLSAEGVFDINRNFSVSLSSP
LSTTTSLRYNVLYRLNDDILVRGSTNLGDDSQLFVEYETRF
NT seq
5526 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgcgctctccaaataaccgccgtttatctctacgacttcttagacgcactagtctg
gttgtaggatttgtagcattggcaggaattactatcggtacttggtgggtaagaaactat
gtatataaagatttagttcccttagttgagacgaacctagagcaattgctgggacgctct
atcaaattggggcaagttgaacgttttaccttatctagtctgagatttagttctctatcg
ataccagcaacccccacagaccctgatagagtggctgcacaagcagtagatgtgcggttt
tcgcccttacaagttctctttacccgaacgctagttttaaatgtcactttagtcaaaccc
aatgtttatattcaacaggatcaagatggtcgttgggtgacggcgcaagtaaagacaggg
gagggtagaggcccaattcaaacgcagttgcagtcactagagcttgttgatgggaatatt
gagttattatcagcacccgcgccaactaaaccccaaggttctgtagtattaacgcaagtt
ggtggtattgctagattttcgtctgataacgagcggataaattatcaagtcaatggtcaa
cttaccagggggggagcggttaaaatctctggcgaaacacaacccaaaacccaactgaca
aatctccagttgtcagcacagagtttagaagcttctgatgtcagccgtttgcttaaagta
ccaattgttttgcaagctgggcgtgtagatgctgatttagcagtgcaaattcctcccaag
cagtcagaaatatcaattacgggaacggctacgccaactcaagttacggcgaaagtggaa
aacttaccgcaaccgttttccaacgccaatggtagattaacatttcaaggacagacaatt
ggtttagaaaatctcagtgctaactttggccaggttcccttgttggcgaatggcactgtt
aatctgcaaacgggttacaatcttgctgctcaggtaaagtccgttagtgccaaacaactc
ttagacacctttaaagtaaaatcaccagtccccgcagccggagaagttacagccgctatc
aaagtgcaaggtgcattacagcagccagtcctgagtggtacagctagtaatatcaaacct
attcaagttgaccgagttttatttacaggtgtaaaaactgactttcgcttggctgtagga
gataaggtcactcaaattgcagtacctaatttgacattggttcccgccgcaggtggtcaa
attatcgggaacggtcaaggtcaactaggaggtaatgtcaattttaatattgaagctgat
ggtatttccggagatgtactggcacggacttatggtataaatccacctacgaatattggc
aatgtctcagctaaagcagcaattactggttctttaggaaaacagcccctagccttaaat
gttgctagtgtgcaagtgcaacctccagccggggggcaaattgttgggcgtggtcaagtc
caattggctccccaaggtaacgttgcattcaacattcaagctcaaaatttaccaggggat
gcactggctaaaacaaacaacaatatcaaagttggtaatgtttccgcaaacgccagagtt
tccggcactttgggcaatttgcgagcggtggcacaggtacaagcaccaacggctacttat
ccaaccacaggagaaatagttgttgcacagcaaggaaatcttctcttacccagtgcagtt
ttaaatgtggctggtggtactgtcagggcaaatggtcgggttattcaacaacgctggcaa
gctgctgtcaatgcttcgcaaattcaactcaacagttttgcccagataccaccgcagttc
caaggagtgttaagcaatgccacgttcaatttatcaggcagcacggcttctttccaaccc
tcaaccatccaagcaagcggaagggcaaacctgaatgtggcaggcggtagagttaacctt
agagatgtcaacctgaataatggacgctggcaggctgtagctaacgcttcgcaaattcaa
ttcaaccgtttagcacaaataccaacccagttccaaggagtattaagcagtgcgacattc
aatttatcaggaggcacggcttctttccaaccctcaaccatccaagctagtggacaagca
aacctgaatgtggcaggcggtagagttaacctgagaaatgtcaacctgaataatggacgc
tggcaagctgtagctaacgcttcgcaaattcaactcaaccgcttctcaccccaactacgc
ggacgactcaatagtaatgttcagttggcaggaactacagcatcgttccaactggcagat
atacgcgcagccggagaaattaatgcttctcaagggatagcacagttagctcaaccaatt
aacgcccagtttcagtggaatgggcaacaaattatcgtgcaacgtgccactaccccagga
ttgagtgcgagtggtgcgatcgcagtacaattaccagaatcaggtacaccccaaatagca
ggcttgaatttgaatgtccaagctcagaattttgacctcagcaagactggctttcaaact
cctggtgatatagcaattgccgggttactcaattttaatggacgagttacaggcactctt
aatactccccaagctactggtaatatccgcttacgcaatttctacgtcggtaacttggca
tttgacccagttttaactggtaacgttaatttccaaggaggacaaggggcaagtctacga
ctcgcaggcacacaagataagatagctctaaacttgaatgctaattatcgccccacttcg
tttttagttcaacgagctggcgctgtgactacaggcagaactgagggagataatttaatt
atcaacgcccaacagttccccatagctctggccagtgcttttttacctaataatcaactc
agaccattaggtgggacattatcagggaatttaactgtcaatctcaataattatgcctta
gctggtgatgtggctctagctaatcctcgaatagctagagcctcagccgatgagtttcgc
ggtaatataaattacgcagatggtactgctagtttaagtaatggactactacgtgtaggt
gatagtaacattgctgtcagtggcagtttgcaagcaggcaatgaccccaaatttcgactc
caagcgaatcttaatcaaacgcgagttgaaaatttattacaagcattcaacatttttgac
ttccgagattttggcggtggcttagaagcacccaccctcgcgggagcggaagcactcaac
actacacctgtgcgtttacctaatgcagatttgcaaacccagttggactatttccgccaa
attcagacgacagtagcacaacaacagcaacaagatagacaacaacaaccacctttaccc
agcctacaacaattaacaggtgcgttgagtggggcaattacagccagtggttccttacga
actgggttaaatgtcggctttaattttcagggagataactggcaatggggtgattactca
atcaatcaagtcattgctgatggcaattttgctgatggtgttcttaccctatcaccttta
cgtgtaggtattaatgggggattagttgcttttgccggacagttaagtcctgagcagtta
tcaggacagttgagtgtcaacagtttaccgctatcactattagatccgtttattgcccga
tatcctgtagatattaccggacaagtgaatgcgatcgctaatttaacaggtagtttagaa
aatcccagagcaacaggggaactaaccctagccaacgccaccttaaaccagcaacctgtg
caaacagggcaactcagctttgactacaacaatgcccgcctcaattttgacagtacctta
ctactgacaggtacacaacccattgctattaacggtagtatccctgcggccttacctttt
gccactcagccaacaaataacaatattaatattaatgccaatgtcagcaatgaaggtttg
tcgttgttgaacctgttaaccaataatcaagttgcttgggtggatggacaaggacaagtg
aacgtcaacgtccaaggtactttcaaccagccagttattaatggtaatgccacaattaac
aacgcaactattagcgcccaagccttaaccaatcccctcacaaatgtcacaggcacagta
caattcaatggcgatatattgaatgtacaaggtattcaagcaacatataatcagggtttg
ataactgcatcgggaagcctaccgatttttacggctgcggacatcagtaatcccctgagt
gtagccatacaagataaacttaatcttcaagttgcagaattatatacaggtgatgttagt
ggtaatgctgtgattaggggaacagccctaaaaccgcgaattggtggtgagattacactc
agtgatggtcaggttactatcggtaacacaagtgataataagtcacaaagagcaaataca
acaaataatcctacaactattcaattagagcgaaatcagccagcaacaacagcaactaac
actacaactattcaatcaaatggaaatcaatcagaaacaacagttacccaaccagcacca
actagacctaatttaccaatagagtttgcagatttacgcttaaatctgggtgatgatgtg
cgtgttactagtcagccactactaagttttgtacctgggggagccgagtttattcagcca
ctactaaggtttgatgccgaaggtgacttgactatcaacggcactttagctcaaccccgt
cctcaaggagtcatccgtttgacagggggacgaattagcttatttacaactgagtttact
ttagagcggggctatgaacatactgcccagtttacaccaagtcaagggcttgatcctacc
ttagatgtgcggctagtggcaattgtaccagaggcatcgaatcggagcgatcgcatttta
gaatcacctttatctgcggagattagtgatgtttctcctaccacctttgggacattacgt
acagtccgtatccaagcaagagccacagggcctgctagtcaattagctaataatctggaa
ttaaccagtcaacctagccgtagtcgaggcgaaattgttgctttgttaggtggttcaatt
ttgaataactttgctcaaggagatgctggccaagggttaactagttttgccagttctact
attttaggcagtttgcaaggcacaattacagcgatcggtcagactattggctttagtgaa
tttcgtatctttcccacccctacaactagtcgagaatcaagtagagcttcagtgcttgat
ttatcagcagagggtgtgtttgatatcaatcgcaatttctctgtctctttatcaagtcct
ctgtccaccactacctctttgcgttacaacgtactctaccgtctcaatgatgatattctt
gtgcgtggctcaactaatctaggagatgacagtcaattatttgtagaatatgaaactcga
ttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
