Nostoc sp. NIES-3756: NOS3756_33160
Help
Entry
NOS3756_33160 CDS
T04170
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)
Organism
non
Nostoc sp. NIES-3756
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
PAS_9
GGDEF
PAS_3
PAS
PAS_4
PAS_8
PAS_10
dCache_2
PAS_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAT54347
LinkDB
All DBs
Position
complement(3843623..3846694)
Genome browser
AA seq
1023 aa
AA seq
DB search
MAFTRGKVYKNQVHLQKKNKGFSQATEDYLCAYDAGNIPLIQEFQPYEKSILDLQEVINL
LVDINPFPVIVICLETNQVLLKNKLVEIPIVKEIIAAFFADSDLYNFLINKLQNKNFLNE
LAVEVKRNDKENIVAKISGKLVNYEDKLAALLVFTDIDTVIETATEKENIWRQLKSANFP
FDTSDTQQSPTPSHLMERALAATSNGIVLTDANQPDNPIIYVNSGFEAISGYSADEVIGK
NCRFLQGDETNQPGLEELRSALRERRECHVTVKNFRKDGTPFWNELYISPVLDANGQVTH
FIGVQNDITQNLQAQEKLREQEEKYRQIVETATEGIWLLNQDNETTFVNQQMATMLGYTV
EEMVGKTLFSFMDTEGIKISQKNLSRRRQGIHEKHNFKFRRKDGSDLWVVISCAPLLDEQ
GNYVGALGMVTDISDALDELRLRKQAEAALQESQKRLDGILNSLEVVIWSIAADTFETLY
LNPAVVQVYGRSVDQFQDNPNLWFDVIHPEDQQRVSQTIEPLLLLGSQELEYRIVRPDGQ
VRWICNRSHVIYDTVGKPNRIEGITTDITERKNMEEKLVHHAFYDNLTGLPNRVLFMERL
TQAITKIKEDPDELFAVLFLDLDRFKVVNDSLGHLVGDQLLVSFAQRLQSCLQPEDTFAR
LGGDEFTILLSRINSIDDATCIAEKIHQVLKLPFNLSGYEVFTSASIGIALGTNQYVQAA
DVLRDADAALYGAKEQGKAWHIVFDPAMYDRAVALLQLETDLRWAIARQELQVAYQPIVS
VATGKITGFEALVRWQHPEKGLISPAEFIPIAEETGLIIQIGQFVLRESCQQLKRWHQEF
PQFQHLSMNVNLSGRQFSQPYLVEEIQQLLQEFELEPSSIKLEITESAIMSSPEQAAIIL
QQLKTLGINLCIDDFGTGYSSLAYLHCFPIDVLKIDRSFTNRIDSDGEQLAIVRAIVTLA
SNLGMSVVAEGVETINQLVQLRLLKCDQAQGYLFSKALSSDKISFLLATRGERLDWGVSS
SRE
NT seq
3072 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcttttacccgtgggaaagtgtacaagaatcaggtgcatcttcagaaaaaaaataag
ggcttttcccaagcaacagaagattacctctgtgcttacgatgctggaaatatcccatta
atacaggaatttcagccttatgaaaagtcaatactagacttgcaggaagtaattaactta
ttagttgatatcaacccatttcctgtcatagttatttgtttggaaactaatcaagtatta
ttaaaaaataagcttgttgaaatccccatagttaaagaaataattgcagctttttttgct
gactcagatttatacaattttttaattaacaaattacaaaataagaattttcttaatgaa
ttagcggtagaagtcaaacgtaacgataaagaaaatattgtagcgaaaatctccggtaag
ttagttaattatgaagataaactagctgcattactggtttttacagatatagatactgtg
atcgaaaccgccacagagaaagaaaatatttggagacaactaaaatctgcgaattttcct
tttgataccagtgatacccaacaatctccaaccccttcacatctaatggaacgggcgtta
gctgctacgagtaatggaattgtgttaacggatgccaatcaaccagataaccccattatc
tacgttaattctggctttgaagctattagtggctactcggctgatgaagttattggtaaa
aactgccgctttttacaaggtgacgaaactaatcagccaggtttggaagagttgcgttct
gccctgcgagaaaggagagaatgtcatgtcacagtcaaaaatttccgtaaagatggcact
cctttttggaatgaactctacatttcaccagtgcttgatgccaatgggcaagtaactcat
tttatcggcgtgcagaatgatattactcaaaacttacaagcgcaagaaaaattacgagag
caagaagaaaaatatcgtcagattgtagaaaccgcaactgagggaatttggctactcaat
caagataacgaaactacctttgttaaccaacaaatggcgacaatgttgggttacacagta
gaagaaatggttggtaaaaccttgttttccttcatggatactgaaggcataaaaatttct
caaaagaacctctcacgtcgtcggcaaggcattcatgagaaacataattttaaattccgt
cgcaaagatggctcagatttatgggtagttatttcctgtgcgccgttgcttgatgaacaa
ggaaactatgttggtgcattgggcatggtaactgatattagcgatgcccttgacgagctg
cgcttacgcaaacaagcagaagcagcattacaggaaagccaaaaacgtttagacggaatt
ttaaattctttggaagttgtcatctggtcaattgccgcagatactttcgagactctttat
ctcaatccggctgtagttcaagtgtatggccgttcggttgatcaattccaagataatccc
aacctatggtttgatgtaattcatccagaagaccaacaacgggtcagtcaaacaattgaa
cccttgctgttgcttggtagtcaagaattagaatacagaattgtccgtcccgacggacag
gtacgttggatttgtaaccgcagccatgtgatttacgataccgttggtaaacctaaccgc
atcgaaggtattaccaccgatattactgaacggaagaacatggaagaaaagttagttcac
catgctttttacgataacctgacgggtctacctaaccgcgttttatttatggagcggctg
acgcaagccataaccaaaattaaggaagacccagatgaattatttgccgtcttattttta
gaccttgaccgttttaaagttgtgaatgatagtttaggtcatttggtgggtgatcaacta
ttggtaagtttcgcccaacgtctgcaaagttgcttgcaaccggaagatacctttgctcgt
ttaggcggggatgagtttaccatattactttctcgcattaactccatagatgatgcaacc
tgcatagccgagaaaattcatcaggtactcaaattaccatttaacttgagtgggtatgaa
gtatttacatctgctagtattggcattgctttaggtacaaatcaatatgttcaagccgcc
gatgtgttgcgagatgcagatgctgctctttacggtgcaaaagagcaaggtaaagcttgg
cacatagtatttgaccccgctatgtacgaccgagctgtagcccttttgcaattggagact
gacttgcgctgggcgatcgccagacaagaattgcaagtggcctaccaaccaattgtttca
gtagcaacaggtaaaattactggatttgaagcactagttcgctggcaacacccagaaaaa
ggcttaatttccccagcagagtttatacccatagccgaagaaacaggactaattatccag
attggtcaatttgtcttgcgcgaatcttgccagcaattaaaaagatggcatcaagaattt
cctcagttccagcatttgagtatgaacgtcaacctatctggtagacagttttctcaaccc
tatctagttgaggagattcagcaactcttgcaggaatttgagcttgagcctagcagcatc
aaactagaaattacagaaagcgccatcatgtctagccctgaacaggctgctatcattctt
caacaattaaaaaccttagggataaatttatgtatcgatgactttggtacaggttattca
tctctagcttatttacactgctttccgattgatgttttaaaaattgaccgttcctttact
aaccgcattgatagcgacggtgaacaactggccatcgttcgtgcaattgtcaccttagcc
agcaatttaggcatgagtgtagtagctgaaggagtagaaacaatcaaccagttagtacaa
ctcagattattaaaatgtgaccaagctcagggatacttattttccaaagccttaagtagc
gacaaaatcagctttttactagccactaggggggagaggttagattggggagtaagcagt
agtagggagtag
DBGET
integrated database retrieval system