Nostoc sp. NIES-3756: NOS3756_49470
Help
Entry
NOS3756_49470 CDS
T04170
Name
(GenBank) GntR family transcriptional regulator
Organism
non
Nostoc sp. NIES-3756
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Aminotran_1_2
GntR
Asp_aminotransf
HTH_11
HTH_41
HTH_36
DegT_DnrJ_EryC1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAT55950
LinkDB
All DBs
Position
complement(5789068..5790564)
Genome browser
AA seq
498 aa
AA seq
DB search
MNIVLERQSSKPIYLQIRDRISHLIKSGALKAGDRLPSIRALAESLQVNKLTIIEAYSVL
EADGIIAARQGSGYFVSSVTSSCNNLKSTFAPAQNVMVLEPLGKGSYYDTYTPLIHAQTQ
PGIINFGYGYPPPPKDINQIARRALKQEDTDILFRYDLPQGQVNLCRQIAQMLVQQGLEV
YPEDLIVTNGSQQGLSLAMNYYVQPGDWVIVESPTYYGAISILENLGAKIIGIPMTAEGI
NLDLLEQYLRSHSPKLIYTITTFHNPTGLTTTQTHRQQLLELAEKYECPILEDNAYEGLH
FEPVPAPIKALDKHDLVTYLGTFSKTLLPGLRVGYMVVTGKHYPAIIERKFLHDFHTSSI
SQAIVSEYLASGHHRRHLNRLRADNLQSRNAMLQALERYFPEEARWTIPQGGLFLWVQLP
DDIPIQTLRNEALAENVFIACSSAFFPDKQGYPAMRLTFRLSIEEIETGLEIVGKLLKKH
IRRGVKPVINYQSLAHSI
NT seq
1497 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacattgttttagaacgacaatcaagtaaaccgatttatttacaaatccgcgatcgc
atcagtcatctgatcaaatcaggcgcactcaaagcaggcgatcgcctcccgtcaattcgc
gccttagctgaaagtttacaagttaataagttgacaattatagaagcctacagcgtttta
gaagcagatggaattattgctgcgcgtcaaggttcaggatattttgtcagcagtgtcaca
tcttcttgtaataacttaaaatctacctttgcccctgcacaaaacgtcatggttttagaa
ccattaggtaaaggttcttattacgatacttacacacctttaattcatgcacaaacacag
ccaggaataattaattttggttatggttatcctccgccaccaaaagatattaaccagata
gctagacgcgcattaaaacaagaagacacagatattttatttcgctatgatttgccccaa
ggacaagtaaacctctgtagacaaattgcccagatgcttgtacagcagggactagaagtt
tatccagaggatttaattgttactaatggctctcaacaagggttgtcattagctatgaat
tattatgtacaaccaggggattgggtaattgtcgaatctcccacttattacggtgcaatt
tctattttagaaaacttgggagccaaaattattggtattcccatgacggctgaggggata
aatttagatttattagaacagtatttacgcagtcatagcccaaaattaatctacactatc
accacctttcacaatcctacaggcttaaccacaactcaaacccacagacaacaactatta
gagttagcagaaaaatacgaatgtccaattttggaagataacgcctacgaaggtttgcat
tttgaaccagtaccagcaccaatcaaagcattagataaacatgatttggtaacatattta
ggcacattttctaaaacattattacctggattacgtgtaggttatatggtagtcaccggt
aaacattatccagcaataattgagcgtaagttcctgcacgactttcacacctccagtatt
tcccaagcaattgttagcgaatatcttgcttcaggacatcatcggcgacatctcaaccga
ctccgcgcagataatctgcaaagccgcaacgctatgctgcaagcattagaacgttatttt
cctgaagaagcacggtggacaattccccaaggaggtttgtttctttgggtgcagttacca
gatgatattccaattcaaacactgcgtaatgaagccttagcagaaaacgtttttattgct
tgtagttcggcttttttcccagataagcaaggttatcctgctatgcgtttaactttccgt
ttatcaatagaagagattgaaacaggtttggaaattgtaggtaagttgttgaaaaagcat
attcgcaggggagttaaaccagtaataaattatcaatcactagctcatagtatttag
DBGET
integrated database retrieval system
