Nostoc sp. PCC 7524: Nos7524_1255
Help
Entry
Nos7524_1255 CDS
T02363
Name
(GenBank) filamentous haemagglutinin family N-terminal domain protein
Organism
nop
Nostoc sp. PCC 7524
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHAT
TPS
Glycos_transf_2
Glyco_tranf_2_3
Glyco_tranf_2_2
Glyco_tranf_2_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY47137
UniProt:
K9QQN8
LinkDB
All DBs
Position
1433780..1439116
Genome browser
AA seq
1778 aa
AA seq
DB search
MSPLISIVIVNYNRERYIGEAIASVLQQTWQDLELVVWDDGSTDGSVAIAQKYAQQDRRV
RVIAAPHQGTVKARQGAIAQTQGAYLGWVDSDDILAPTALAQTAAVLHRHPEVGLVYTDY
IDINPDGQVLGYGHRCRIPYSPQRLLVDFMTFQFRLLRRSVYEQVGGVHISASDYAYDYD
LCLRLSEVTQVRRVKQPLYLCRIHNQSISATNRTEQILWSQKAIAQALQRRGLAHQCRID
VELPAGRFILRRKPTLGTTLANIKGVFAQTTVCAGIAGLGMLSLWGMNTEIAQAQQILPA
ADGTNTIVTPNGNRIDITGGTTSSNGLNLFHSFQQFGVSPEQIANFQANPALQNILGRVT
GGNASVINGLIQVTGGSANLFLMNPAGFIFGGNASLNVSGAFTATTANGIKFGNDWFNAV
GNNNYANLVGNPTGFAFTMNQPGAIINAGNLGVGTGQSLSLLGGTVVNTGQLSAPAGQIV
VTSVPGQNWVRLSQPGNILSLELPALTPDSSQPNSWTVAIASLPELLTVGNTNTGLTTNP
DGSVKLTNSNVTIPTTPGTTIVSGNVNVSGETGGTVNVLGTKVGLVDANINASGTNGGGT
VLIGGDYKGGGTVPNATQTYINSNTVINADSLQNGNGGRVIAWADDATQFFGNISARGGA
NSGDGGFVEVSGKNFLTFQGQVDVSAPNGQFGTLLLDPSSLTIIDATFGGTFDATFSGSI
LADTPDIGANTISWGALVSLGSGANINLEATGDITIDNITGVVSGENNLITLDSSNSGSF
TLNSTNGAVRFVDTNDTIATNGGAINISGAGDILLGNIITTGGGYASNITVTSSNGSINT
GNLQTRPSDSPAFSSNEYGNVSLSAFGNISTGNIIASGDGYSPGNITVNSSNGAINLGNL
DTRSIFEDGTITFIFDDSGDVTLSASGNISVGNIIASGDGYSPGNVSVDSSNGNINIGNL
DTSVINQSDATAGTVTLSAAGNIFTGDINSYSDEGFDSGQGGAVEITTSGGSITTGDINS
YVFKNIGGDFTGTGGQVTLTASNNIIVGDIDASAEVTEIDGTAEAIGGNVTLQTTNTAGS
IIRFNSINTSATTDEDSSIQAGNVEVLTNGLVQGTGTGNTINTGEFYLVFDEIEQVPFTT
PLSSGGTVTIQHDGGPGNVPFTVGNSSINGTAGAIYAGSASNNLSSGSFPVLPTGGEASG
TPSNITIRSVNTPPTLTANSPISLNAQPGVPFNFTFTGSVGDVNIDNTTVEIVSILPGGI
LRRGNTVLEPGNTITIGETLNFTPPENITTSGSIQAFTVRASDGVSESNVIPVAAGIEVT
PPLDNCQILPSACKPINGNGNKKDVVINGGTYTPYPEDKFTDKFASQLGISRPKVKTTED
AIDLVRQIEKATGVKPALIYLSFVPVEIAPNTATGNTKSNKVLDTVGESDRDQLEIVVVT
GQGNPIRKRVPSATRAKVLQVAQEFRDQIVNPQNRRTTGYLQPSQQLYSWIIAPIQQELQ
AEGIDNLVFLPDVGLRSTPMAALHDGKQFLVEQYSLGLMPSLSLTNTAYTDIKQSQILAL
GISQSTQGQQPLPAVPVELSTLVSKLWPGKLLLDQQATLENLKMIRRQQPFGIIHLATHA
DFIPGPLSNSYIQLWEDKLHLNQLRQLRLNEPQVEMMVLSACRTALGDEEVEIGFAGLAV
LAGVKTSIASMWAVNDTGTAALMTKFYESLRTAPIRAEALRDAQMAMVKGQVFIKDGRVQ
GLETVPSIPLPAESIQETDLKLTHPYYWAAFTMVGNPW
NT seq
5337 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaccactgatctccattgttatcgttaattacaatcgggaacgttatattggggaa
gcgatcgccagcgtcttacaacagacctggcaagatttagagttagtggtgtgggatgat
ggctctacagatgggtcagtggcgatcgctcaaaagtatgcccagcaagatagacgcgtg
cgggtaatagcagcaccccatcaaggaactgtgaaagcccgccaaggtgcgatcgctcaa
actcaaggagcttacctgggttgggtagatagtgacgatatcctagcgcctaccgctttg
gctcaaaccgccgccgttcttcatcgtcacccagaagttggattagtttataccgattac
atagatattaatcctgatggtcaagtgctgggctatggtcatcgttgtcggattccctac
tctccccaaaggctgttggtagattttatgaccttccaattccgcttattgcggcgttca
gtttatgaacaggtggggggtgtgcatatatccgcttctgactatgcctatgattatgat
ctgtgtttgcgactttccgaagtaacgcaagtgcggcgggtgaaacagccgctttatctg
tgccgcattcacaaccaaagcatctctgcaactaacagaacagagcaaattctttggtca
caaaaggcgatcgctcaagccttgcaacggcggggactggctcatcaatgtcgcattgac
gtagaattacccgcaggtcgcttcatcttgcggcgtaagccaaccttgggaacaactctc
gccaatattaagggtgtgtttgcccaaactacagtctgtgcaggtatagccggcttagga
atgttgtcgttatggggaatgaatacggagatagcccaagctcaacagattcttcccgcc
gccgatggtacaaataccattgtcacacccaacggtaacagaattgacattacaggtggc
acaacttccagcaatggtctgaacctcttccatagctttcaacagtttggagtcagcccc
gaacaaatagccaactttcaagccaatcccgccttgcaaaatattctggggcgggtaaca
ggtggtaatgcttcggttatcaatggcttaatccaggtgacagggggcagtgctaactta
ttcttgatgaatcccgccggatttatttttggtggtaatgccagtttaaatgtctcaggt
gcgtttacagccaccactgccaatggtataaaatttggcaatgattggttcaatgctgtc
ggtaataataactatgccaacttagtaggcaaccccaccggatttgcctttaccatgaat
cagccaggggcaatcatcaatgctggtaacttgggagtaggtactgggcagagtttgagc
ttattgggtgggacagtagttaatactggacaactctcagcaccagccggacagattgtt
gttacctccgtacctgggcagaattgggtgcgcctcagccaaccaggaaatatcttgagt
ttggaattgccagcactaacgccggatagtagccaacccaacagttggacagtggcgatc
gcatctttaccagaattgctcaccgtcggtaacactaacacaggtttaactactaaccct
gatggtagcgtgaaactgaccaactccaatgtcaccatccccaccaccccaggcacaact
attgtgagtggaaatgtcaatgtttccggggaaacaggcggaacagttaatgttttgggg
acaaaggtaggtttagttgacgctaatattaacgcctccggtactaatggtggtgggact
gtgttaattggcggcgattacaaaggcggcggtacagtacccaacgcaacgcagacatat
attaattccaataccgttattaacgccgatagtctgcaaaatggcaacggtggacgcgtg
attgcttgggcggatgatgccacacagttttttggtaacatttcagcccgtggtggcgca
aatagcggcgatggtggttttgtcgaagtatccggtaagaatttcttgactttccaagga
caggtagatgtttctgcccccaacggtcaatttggtactttattattagaccccagtagt
ttaactatcatcgatgccacatttggaggaacattcgatgctacttttagtggcagtatt
ttagctgacactcctgatattggtgcaaatactatttcttggggggcgctagtaagtctc
ggtagtggtgcaaatattaacttagaggccactggtgatattaccatcgacaacatcacg
ggcgttgtgtcaggtgaaaacaatttaattacattagattcaagtaatagcggcagtttt
accctaaattccactaatggtgcagttagatttgttgataccaatgacaccatcgccaca
aatgggggagcaatcaatatttctggggctggtgatatcttgctgggtaatattattact
actggtggtggctatgcaagtaatattacagtcaccagtagtaatggtagtatcaataca
ggcaacctgcaaacccgacccagcgatagtccagcattcagttctaacgagtatggcaat
gtgagtttatctgcatttggtaacatctctactggcaatattattgctagtggtgatggc
tattctccgggtaacattacagttaacagtagtaatggtgccatcaacttaggcaacctt
gacactagaagtatttttgaagacggcaccataacatttatttttgatgatagtggtgat
gttacattatctgcaagtggcaacatttcagtaggtaatattattgctagtggtgatggc
tattctccaggcaatgtcagcgtagacagtagtaatggcaacattaatataggaaatctg
gataccagcgtcatcaaccagtctgacgctacagctggaacagtaactttgagtgccgca
ggtaatatttttacaggtgatattaattcttattcagatgaaggttttgatagtggtcaa
ggtggtgcagtagagatcactacatcaggaggtagcattaccacaggtgatattaattct
tatgtcttcaagaatattggtggtgactttacaggaacaggtggtcaagttaccctaacg
gctagtaataatattattgttggtgatattgatgcttccgcagaagttacagaaattgat
gggacggctgaagctataggtggcaatgttaccctccagacaactaatactgcgggcagt
atcatccgttttaatagcattaacaccagtgccacaacagacgaagacagcagtattcaa
gctggtaatgtagaagtcctaaccaacgggttagtacaaggaacaggtacaggtaatacc
atcaacacgggtgaattctacttagtatttgatgagattgagcaggttcctttcactact
ccacttagtagtggtggtacagtcaccattcaacacgatggtgggccgggtaatgtgcca
tttactgtaggtaatagtagtattaatggcacagcaggagcaatttatgctggtagtgct
tctaacaacctatcttctggtagtttcccagtcttgcctactggtggagaagccagtggt
acacccagtaatataactattaggtctgttaacacaccgcctacactaaccgcaaattcc
cctatctccttaaatgctcaaccaggagtaccctttaactttacgtttacaggcagcgtt
ggggatgtcaatatcgataacactactgttgagattgtttctattttgcctggggggata
ttgaggcgaggcaatacagtattagaacctggaaacacgataactataggcgaaacgtta
aattttacgccaccagaaaatatcactactagcgggagcattcaggcttttaccgttaga
gctagtgatggggtttctgagtcaaatgttatccctgtagcagcaggcatagaagtcact
ccaccactagacaattgccaaattttgccgtcggcttgtaaaccaataaatggtaatggt
aataagaaggatgtagttatcaatggcggtacatatacaccctatccagaagacaaattt
actgataagtttgctagccaattaggtatatctagacctaaagtcaaaaccacagaagat
gcgattgatttggttcgccagatagaaaaagcgactggtgtgaaacctgccttaatttac
ctcagttttgtacctgtggaaattgcacccaacacagctacagggaacaccaaatctaat
aaagttttggacaccgtaggcgagagcgatcgcgatcagttagaaatagtagtagttacc
ggtcaaggtaatcccatccgtaagcgtgtccccagcgccactagagctaaagttttgcaa
gtagcgcaagaatttcgggatcaaatcgtcaatccccaaaaccgccgcaccacgggttac
ttacagccatctcagcaactttatagttggataattgcaccaatacagcaggaattacag
gcggaaggaattgataacttagtctttttgccagacgtgggcttacgttccacgccaatg
gcagctctccatgatgggaaacagtttcttgtagaacaatatagcctgggcttgatgcct
agtttgagcttaactaacaccgcttataccgacattaaacaatcccaaattttagctttg
ggtatttctcaaagcactcagggacaacaaccattaccagctgttcccgttgagttatca
actttagtctctaaactttggcctggcaagttgttgttagatcagcaagcgacattagaa
aatctgaaaatgattcgtcgccaacaacctttcggcattattcatctagccacccatgcc
gattttattccaggccccttgagcaattcctatattcaattatgggaagacaaattacac
ttaaaccaactacggcaattaagattgaatgaaccccaagttgagatgatggtgctgagt
gcttgtagaaccgctttaggtgatgaagaagtagaaattgggtttgcaggtttagctgta
ctagcaggtgtgaaaacctctattgccagtatgtgggcagttaatgatactggtacggcg
gctttgatgacgaaattctatgaatctctcagaactgctcccatccgtgcagaagccctg
agagacgctcaaatggctatggtaaaaggacaggttttcatcaaagatgggcgggtgcaa
ggtttagaaacagttcccagtatacctttacctgctgagagtattcaggaaactgattta
aaactcacccatccttactattgggcagcattcacgatggtaggtaatccttggtag
DBGET
integrated database retrieval system