Nostoc sp. PCC 7107: Nos7107_1237
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Entry
Nos7107_1237 CDS
T02362
Name
(GenBank) filamentous hemagglutinin family outer membrane protein
Organism
nos
Nostoc sp. PCC 7107
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
CHAT
TPS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY41887
LinkDB
All DBs
Position
1430658..1434173
Genome browser
AA seq
1171 aa
AA seq
DB search
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DBGET
integrated database retrieval system