Nostoc sp. ATCC 53789: GJB62_30650
Help
Entry
GJB62_30650 CDS
T10687
Name
(GenBank) tandem-95 repeat protein
Organism
nost Nostoc sp. ATCC 53789
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_5
Big_9
Cadherin_4
FG-GAP_3
HemolysinCabind
FG-GAP
CshA_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QHG20298
LinkDB
All DBs
Position
pNsp_a:complement(127676..129901)
Genome browser
AA seq
741 aa
AA seq
DB search
MADPNFKDPITNPFGLTGVTLSSKPTLADIDGDGDLDAFVGNFYGNTAFYRNTGTTAAPS
FTFEANNPFGLTNVGNVADPTFADIDSDGDLDAFVGSGDGNTRFYRNTGTSAAPSFTFEA
TNPFGLTNVGLSAKPTFADIDNDGDLDVFVGSQNNGISFYRNTGTTAAPNFTLEGTNPFG
LANEFVASPAFADIDNDGDLDAFVGTFTTTAKFYRNTGNAGTPIFTFEATNPFGLTSVGN
ISSPTFADIDGDGDVDAFVGNVSGNTVFFENNNAPTGSPTATLSNTAEDTAINITAADLL
AGFSDLDGDTLSVINLTATNGALVDNLNGTYTFTPNANFNGAVNLTYDVTDGTATLNGQT
QTFSVTPVNDAPTGSPTATLSNTPEDTAINITAADLLAGFSDLDGDTLSVANLTATNGAL
VNNNNGTYTFTPTANFNGAVNLTYNVTDGTATLTGQTRSFSVTPVNDAPVAVDDSVSTFF
GTTVNIAVSSLLANDSDVDSTGLSITGVSDATNGTAVLNNNGTASNTADDFVSFTPNLLF
FGNASFNYTLSDGSLNDTATVTVAVGLNLFGTNFADNLIGTIGNDIINGGNGNDTIYGGA
GDDSLFGENGNDILYGDGLMDGGAGNDTLNGGNGDDTLYGGGGSDRLYGGNGNDLLYGGL
SSDTLTGNNGNDTFAFAAGEGTDTITDFTKGNDLIGLYNGLSFGQLSFSASNIKVTSTNE
ILATLTGINTTTLTAADFVTL
NT seq
2226 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgaccctaattttaaggacccaattaccaaccccttcggactgacgggtgtaaca
ctttcttctaaacccaccttagccgatatcgatggcgatggagacttggatgcttttgtg
gggaatttttacggcaataccgcgttctaccgcaacactggaactactgctgctcccagc
ttcacctttgaagccaacaatcccttcggactgacgaatgtagggaacgttgctgacccc
acctttgccgatatcgatagcgatggggacttggatgcttttgtgggtagtggtgatggc
aatacccggttctaccgcaacactggaacttcggctgctcccagcttcacctttgaagcc
accaatcccttcggactgacgaatgtgggactttctgctaaacccacctttgccgatatc
gataacgatggagacttggatgtttttgtgggtagtcagaacaacggtatcagcttctac
cgcaacactggaactactgctgctcccaatttcacccttgaaggcactaaccccttcgga
ctggcgaatgagtttgtagcttcacccgcctttgccgatatcgataacgatggggacttg
gatgcttttgtgggtactttcacgaccactgccaagttctaccgcaacactggaaatgcc
gggactcccatcttcacctttgaagccaccaaccccttcggactgacgagtgtgggtaat
atttcttcacccacctttgccgatatcgatggtgatggggacgtggatgcttttgtgggt
aatgttagcggcaataccgtgttcttcgagaataacaatgcgcccactggttcacccaca
gccacgttaagcaacaccgccgaagatacagccattaatattactgcggctgacttgtta
gcaggattcagcgatctggatggtgataccctctccgttattaacttaactgcgactaac
ggtgcattggtggacaacttgaatgggacttataccttcactccaaatgctaactttaac
ggcgcagttaatctgacctacgatgtcactgatggcacagcaaccttaaatggacaaact
cagactttctctgtaaccccagttaacgatgcgccaacaggttcacccactgcgacgtta
agcaatacaccagaagatacagccattaatattactgcggctgacttgttagcaggattc
agcgatctggatggtgataccctctctgttgccaacttaactgcgactaacggtgcattg
gtaaataacaataatgggacttataccttcaccccaactgccaactttaatggtgcagtt
aatctcacctacaatgtcactgatggcacagcaaccttaactggacaaacccgcagtttc
tctgtcacccccgttaatgatgcccctgttgctgttgatgacagtgtttccacattcttt
ggtactactgtcaacatcgcagttagtagcctactggcaaatgatagcgatgttgatagc
accggactcagcatcactggtgtcagcgatgctaccaacggtactgctgtcctgaacaat
aacggcacagccagcaacaccgcagatgatttcgtttcctttacaccaaatcttctgttc
tttggcaatgccagctttaactacaccctcagcgatggtagcctgaatgatactgctacg
gtgactgtggctgtcggtctgaacctgtttggcactaattttgctgataacctgattggc
accatcggtaacgacatcatcaacggcggcaatggcaacgataccatctacggcggcgca
ggtgatgatagcctctttggcgagaatggtaacgacatcttgtatggcgatggcctgatg
gatggcggcgcgggtaatgataccctcaacggtggtaatggcgatgataccctctacggg
ggtggcggtagcgatcgcctttacggcggcaatggcaacgatctcctctatggtggtctt
agcagcgataccctcactggtaacaatggtaatgatacatttgcctttgcggctggggaa
ggtactgataccattactgatttcactaagggcaatgatttaatcggactttacaatggt
ttgagctttgggcaactgagtttctcagctagcaatatcaaagtgacttccacgaatgaa
attttggcgacgctgacaggtattaatactacgacgctgactgctgctgatttcgtaacc
ctttaa
DBGET
integrated database retrieval system