Nostoc sp. ATCC 53789: GJB62_35825
Help
Entry
GJB62_35825 CDS
T10687
Name
(GenBank) CHAT domain-containing protein
Organism
nost Nostoc sp. ATCC 53789
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_14
LRR_4
LRR_8
LRR_1
COR-B
COR-A
CHAT
Roc
LRR_LRWD1
LRR_R13L1-DRL21
Ras
Arf
Gtr1_RagA
MMR_HSR1
PduV-EutP
NB-ARC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QHG21222
LinkDB
All DBs
Position
pNsp_j:complement(12623..17230)
Genome browser
AA seq
1535 aa
AA seq
DB search
MTEEELLQVIEQAATESVTELDLCSNQLTALPPEIGQLTNLEFLYLSDNKLSSLPSEIGQ
LTNLQTLHLSNNKLSSLPNEIGQLTNLQTLHLYMNQLSSLPSEIGQLTNLEILYLYNNQL
SSLPSEIGQLTNLQTLHLYMNQLSSFPIEIGNLSNLQMLNIERNKLSSFPIEIGNLSNLQ
MLNIERNKLSSFPIEIGQLTNLQTLNLEYNQLRSLPSEIGQLTNLQTLNLEYNQLSSVPS
EIGQLTNLKILYLSNNQLSSVPSEIGQLTNLEILYLSNNQLSSVPSEIGQLTNLQTLDLN
NNQLSSVPSEIGQLTNLQTLDLNNNQLSSVPSEIGQLTNLQTLDLNNNQLSSVPSEIGQL
TNLQTLDLNNNQLSSVPSEIGQLTNLQTLDLNYNQLSSVPSEIGQLTNLKILYLSNNQLS
SVPSEIGQLTNLQTLDLDSNQLSSVPSEIGQLTNLQTLDLDSNQLSSVPSEIGQLTNLQT
LDLNNNQLSSFPIEIGQLTNLQTLHLDSNQLSSLPSEIGQLTNLQMLHLDSNQLSSLPSE
IGQLTNLQILHLNNNQRSSLPSEIGQILNLRKFFLENNRQRNNTTFLRKNWKNTNFTNSI
SDGNKISILPREIGQLTNLKMLLIEGNQLSSLPSEIKQLRNLKILRLQQNPLPIPPEILE
LNDVNEIIDFYFRVQDPAETEPFYEAKFLIIGEGGAGKTSLAKKIENENYELQSDEESTQ
GIDVIQWHFTQPNGKEFRVNIWDFGGQEIYHQTHQFFLTERSLYALVVDTRQENTDFYWW
LKVVELLSDNSPVIIIKNEKQGRQCEVNERQLRGEFTNLKEVLVTNLADNRGLAEIKNTI
QLYMSKLTHIGTPLPKLWVKVRVAIENYPRNYISLEEYCRLCRVNNLTDPQDMLRLSRYL
HDLGVCLHFQDDPTLKHYVILKPEWGTVAVYKVLDNSTVKKNLGCFTKENLKDIWQEVEY
AEMRDELLQLMMRFKLCYPIPNRHDHYIAPQLLDLNQPEYSWETSNNLILRYKYEFMPKG
VLTRFIVETHPWVEQQKLVWRTGVVLNKDQTRAEIIEQYNQKEIKIRVTGNRKKELLAVV
THELEKIHQSFERLQYHTLVPCNCKKCEGSPKPYSYPLENLHKRLKAGRYQIECDNSYEM
VDVRKLIDDVNLQPLGAEQELNPGSVILQQELSKDRDKSFKNQTIMNYHDFQILVTEDST
IRASSEQGEESGKLQLDRNAIELALGLMESRQTNAKLLKGVGSQLYQALFPTKIHGQLRA
TIAGAQADGYEVRLRLVFKSAELAALPWEFLYDEATNTFLANNTQTVLSRYIDVPLQKRD
LKAASLPLKILLVISSPTNLPQLDVLEEERLIREALAKHIDAGQIELDVLQEATIRNINQ
KLREKPYNVFHFIGHGVFENHKGSIALVDTDGKNKLLNEEDFANFFLGNRSLGLAVLNSC
QGAAVSSQQVFAGIAPNLVRRGISAVVAMQYSILDTTAKLFADEFYRTLALGWPVDAAIQ
TTRNAISIEVGVEKPDFGTPVLYMRAKDGIILSGL
NT seq
4608 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccgaggaagaactgctacaggtgattgaacaagcagcaacagagagtgtaacggaa
cttgacctctgtagtaaccagttaactgctttaccgcctgagattggacaacttacaaat
ttggaattcctttatctcagtgacaataaattaagcagcctgccaagtgaaattggtcaa
ctcactaacttgcaaacgctccatcttagtaacaataaactaagcagcctgccaaatgaa
attggtcaactcactaacttgcaaacgctccatctttacatgaatcaactgagcagcttg
ccaagtgagattggtcaactcactaacttggaaatactctacttatacaacaatcaatta
agcagtctgccaagcgaaattggtcaactcactaacttgcaaacgctccatctttacatg
aatcaactgagcagttttcccattgaaattggaaacctcagtaacttgcaaatgctcaat
attgaacgcaataaattaagcagttttcccattgaaattggaaacctcagtaacttgcaa
atgctcaatattgaacgcaataaattaagcagttttcccattgaaattggtcaactgact
aatttgcaaacgcttaatcttgaatacaatcaactaaggagtctgccaagcgaaattggt
caactcactaacttgcaaacgcttaatcttgaatacaatcaattaagtagtgtgccaagc
gaaattggtcaactcactaacttgaaaatactctacttatccaacaatcaattaagtagt
gtgccaagcgaaattggtcaactgactaacttggaaatactctacttatccaacaatcaa
ttaagtagtgtgccaagcgaaattggtcaactgactaacttgcaaacgctagacctaaat
aacaatcaactaagtagtgtgccaagcgaaattggtcaactgactaacttgcaaacgcta
gacctaaataacaatcaactaagtagtgtgccaagcgaaattggtcaactgactaacttg
caaacgctagacctaaataacaatcaactaagtagtgtgccaagcgaaattggtcaactg
actaacttgcaaacgctagacctaaataacaatcaactaagtagtgtgccaagcgaaatt
ggtcaactgactaacttgcaaacgctagacctcaattacaatcaactaagtagtgtgcca
agcgaaattggtcaactcactaacttgaaaatactctacttatccaacaatcaattaagt
agtgtgccaagcgaaattggtcaactgactaacttgcaaacgctagacctcgattccaat
caactaagtagtgtgccaagcgaaattggccaactgactaacttgcaaacgctagacctc
gattccaatcaactaagtagtgtgccaagcgaaattggtcaactgactaacttgcaaacg
ctagacctaaataacaatcaactaagcagttttcccattgaaattggtcaactaactaac
ttgcaaacgctacacctcgattccaatcaactaagcagtctgccaagcgaaattggtcaa
ctaactaacttgcaaatgctacacctcgattccaatcaactaagcagtctgccaagcgaa
attggtcaactaactaacttgcaaatactacacctaaataacaatcaacggagcagtctg
ccaagcgaaattggtcaaatacttaatttaagaaagttttttctagagaataaccgacaa
aggaacaacactacatttttaaggaaaaactggaaaaatactaactttactaatagtatt
tctgatgggaataaaattagtattttacctagagaaattggacaacttactaacttaaaa
atgcttttaattgaaggcaatcaactaagcagtttaccaagcgaaatcaaacaattgcga
aatttaaagatcctgcgtcttcagcagaatccacttcctattccaccggaaattttggag
ttgaacgatgtaaacgaaattattgatttttattttcgagtacaagatccagccgaaact
gaacccttctacgaagcaaaattcttgattatcggcgaagggggagccggtaaaacctcc
ttagctaaaaaaattgaaaacgaaaattacgaacttcaatcagatgaggaatcaacccaa
ggtatcgatgtaattcaatggcattttacacaacctaatggcaaagaatttcgcgttaat
atatgggattttggtggtcaagaaatttaccaccaaacccaccagttttttctcactgag
cgttctctctatgctttagtggtagatactcgtcaagaaaacacagatttttactggtgg
ctaaaagttgttgagcttttgagcgataatagcccagttataattattaaaaatgaaaaa
caaggccgtcagtgtgaagtcaatgaacgccagttgcgaggagaattcactaatttaaaa
gaagttttagtaactaacttagctgataatcgcggtttagccgaaatcaaaaacacaatt
cagctttacatgagcaagcttacccatattggtacacccttaccaaaactttgggtgaaa
gttagagtagccatagaaaattaccctcgcaactatattagtcttgaagaatattgtcgg
ctttgtcgagtcaataatttaactgatcctcaagatatgctgcggctgagtcgctatcta
catgaccttggtgtttgtctgcactttcaagacgatcctacacttaaacactatgttatt
cttaaaccagaatggggtactgttgctgtctacaaagtattagacaatagcacagttaag
aaaaacttgggctgttttaccaaagagaatcttaaagatatttggcaagaggttgaatat
gccgagatgcgagatgaactgctgcaactaatgatgcggttcaaactttgctatccaatt
cctaatcgccacgaccactatattgcgccccaattacttgatctaaaccaacctgaatac
tcttgggaaacttccaataatttaattttgcgctacaaatacgaatttatgcctaaaggt
gttctcacgcgcttcattgttgaaacacacccttgggttgaacagcaaaaactcgtttgg
agaacaggtgttgtcctcaacaaagatcaaactcgtgctgaaataattgaacaatataat
cagaaagaaattaaaatccgtgtaacaggaaatcgtaagaaagaattactggcagttgtc
actcatgaattagaaaaaatccaccaatcttttgagcgtttacagtatcacactcttgtt
ccttgtaactgtaaaaagtgtgaaggaagcccaaaaccttattcctaccctttggaaaat
ttacataaacgattgaaagctggtcgctatcagattgagtgcgataatagctatgaaatg
gttgatgtccgtaagctcattgatgatgtcaatttgcaaccactgggtgcagaacaggaa
ttaaatcccggatctgtaatactacaacaagaattgtccaaggatagagataaatcattc
aaaaatcaaaccattatgaattatcacgattttcaaatattagtgaccgaagacagcacg
attcgcgcttcctcagaacaaggcgaagagtcaggaaaattgcaattagataggaatgca
attgaattagcattggggctgatggagtctcgacagacaaatgctaagttactcaaagga
gtaggtagccaactttaccaagcactttttcccacaaagattcacggtcaattgcgagcg
acaattgcaggtgcacaagctgatggatatgaagtgcgtttgcgtttagtattcaaatct
gcggagctagctgccttaccttgggaatttctttacgatgaagcaactaacactttccta
gctaataatacccaaaccgttctctcgcgttatattgacgttccattacagaagcgtgac
cttaaagccgctagtctaccactcaaaatcttgctagttatctctagtcctactaactta
ccccagttggatgttcttgaggaagaacgcctgatccgtgaagcactggcaaaacacata
gatgcaggtcaaattgagttagatgtactacaagaagccaccatccgcaacatcaatcaa
aagctgcgcgaaaagccctataacgttttccactttattggtcacggtgtctttgaaaac
cacaaaggctccattgctttggtagatactgatggtaaaaacaagttgttaaatgaagag
gatttcgctaatttcttcttaggcaaccgtagtctggggttagctgtactaaattcttgt
caaggtgcagcggtgtcttctcagcaagtatttgcaggtatagcacctaacctagtgcgg
cgaggaatatccgcagtagttgccatgcaatattctatcctcgacaccactgcaaagctg
tttgctgatgagttttaccgcacactcgcactaggttggcccgtagacgcagccatccaa
acaacccgcaatgctatttctatagaagtcggagtagagaaacctgactttggaacacca
gtactttatatgcgggctaaagatggaattatcctgagtgggttatag
DBGET
integrated database retrieval system