Nostoc sp. UHCC 0302: WKK05_37935
Help
Entry
WKK05_37935 CDS
T11286
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
nosz Nostoc sp. UHCC 0302
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WZF21860
LinkDB
All DBs
Position
unnamed5:complement(16475..21475)
Genome browser
AA seq
1666 aa
AA seq
DB search
MVLNSPTYIDDSGLVLNDSSNTQLPESSNDTSTSAINNNSLESINTSSPSVSAQPNIDAN
STPKNQISLADTQIAELKQITNNLTTNFPEGYRYIYKIIKDNSNVSDKTQYWFSKAPEIN
SNDPNSSGNIYIRSVTANGLIYDGKSPENIQAISDSIARAVLSDIVAQSGIPEFGLMLSR
DIENSLAVGGQTIGGWGGAFYYWNAPLSDGRTVGQTILQDPNEYEKFLTLNSKAISDARS
KTPFWEALETAVGAEAPLSVKQEIFTRWLSGNYTGNPNLVNGWFYSPSEQKWFLQPISSD
ILPSFTIEADPDTANRLNQIRDIRLQHGGKISSLEPTIIDNPDGSTTFAFTDTSEIEDWS
TINLSFDVEDRPQKVLLTLNDNTVTDVVYDTDNSEEWNSYSVEYNALGQVSEQTVERDDG
STYSITFTSTDITDPSNPRQYQLPGQSLTTTLDSLNFIKAIQNGQPTSIAISGLSIATKL
SPDNALLIGASAASGAIINLINLENLLRNGDKVAAITTGTQIVSYAANLYKEYLIAQYGG
DGIAALADNIDFWNFADDVDKTIPYISIFNSLYHEDYFNAALGVLSLIPAFQPFVIGVEI
VEIIVDLFSDPPEPWGDSNFIWQGNQIGLSIVGDHGGDESVQNVANQLLTALNKIVSDAQ
SSSPNFQLGLIANRIPGLSLRNGSFILHEIDLISGQAKDIYYDRDGYSNAVIGSSQYFTN
LGQDYTIATFKRGAIAPQWEVDTARLQTEIGSYNAGLTEEERAAKNGKLPPALTSNATTE
SFKPIILDLNGDGVGIVDRDHSNVAFDVDDSGFIKQTGWIDKNDGFLVLDRNFDGDVTSG
KELFSNIEVAVDVRGLASLDWVDANADSQITAADPVYNQLRVWHDANSNGVTDQDETKTL
AELGISSINYTIGSYNVSDTTREISSPELAADTQGSQFQLVENGTLITSTDGHASLVVNH
VDDLSNLQPNSDGVTTYENLGVDIFLGDLLANDITSSNKLTITGVGNTRHGTAALQNGIV
HFVPEIDYSGTDAGFDYYTSTNDNADSSTTLVAVNVIHQNRAPVIDGVVYDQVQVQVPSD
SDSQQSNFLLQDDPYNGRILVHDIDDATESLTFSIKNQARYGYATIDEHIGHFSFSPSAA
LGIQDAFVVEIKDPHGAVADHTFIVSLPIPVPNDTGGGDAPSGDSPGTAPGDSPGTAPGD
SPGTAPGDSPGTAPGDSPGTAPGDSPGTAPGDSPGTAPGDSPGTAPGDSPGTAPGDSDGS
AGTGSSGDGSAGAGSSGDGSAGAGSSGDGSAGAGSSGDGGAGAGSSGDGGGGGGGDGGGG
GGGDGGGGGGGDGGGGGGGGDPIVLDLLGTGFHLTNAHTSQSFFNILGDGWRHHTGWVSS
GNGILAYDYNSDHIINHRGEIAFIDYKPGAKTDLEGLSAFDFNDDGIFSNLDNKWNQFGV
WVDNNSDAVTDAGEFKTLDSLGINSINLTSDHQRTTVNGNIIHGVTQVKLKDGRQIKAAD
VSFQVTNQVLLVHSDGTSEVFNLPTHTPTLSSKNQENDSLTGRGNNTLAGNFEGDVLTGS
LSADQFIFTDLNHAVDPIINSTLTQKDLILVSATGFGGGLTSGQVINFNQFVLGTKAQNP
VERFIYNSNDGSLWFDVDGSGATPAVQIATFNNNPLLNHEQIFVTY
NT seq
5001 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgttaaattctccaacttatattgatgattctggcttagtcctcaatgatagtagc
aatactcagttaccagaatctagtaatgatacttctacatcagccatcaacaataattct
ttagaaagtattaatacttcttcccctagtgtttctgcacaacctaatattgacgctaat
tcaacaccaaaaaatcaaatttctctggctgacacgcagattgcagaattaaagcagatt
acaaataatttaacaacgaactttccagaaggataccgttacatttataaaattatcaaa
gacaattctaatgttagtgataaaacacaatattggttcagcaaagcaccagaaatcaat
tctaacgatcccaacagttccggtaatatttatattcgttcagtaacagctaatggatta
atttatgacggcaagtcacctgaaaacattcaagccatatccgacagtattgccagggca
gttttatctgatattgttgcccaaagcggaattccagaatttggtttaatgctgagtaga
gatatcgaaaactcgctcgcagtcggtgggcaaacaataggtggttggggaggagcattt
tactattggaacgctccgctatctgatggccgcacagttggccaaacaattttacaagac
ccgaatgaatatgaaaaatttctgacactcaatagcaaagcgatctctgatgctcgtagt
aaaaccccattttgggaagcgctcgaaacagcagtgggtgcagaagctcctttatctgtc
aaacaagaaatttttacacgctggttatctggaaattatactggaaatcctaatttggta
aatggttggttttatagcccatctgagcaaaagtggtttttacagcccataagttcagac
atactaccttcttttactatcgaagcagatccagatacggcaaataggcttaatcaaatt
cgagatattcgccttcagcatggaggaaagatatcgagtcttgagccaactatcattgat
aatcctgatggaagcaccacatttgcttttacagacacttctgaaattgaagattggtca
actatcaacctatcgtttgatgtagaagatagaccacaaaaagtacttcttaccttgaat
gacaacactgttacagatgtagtttatgatactgataatagtgaagagtggaatagttac
tcggtcgaatataatgctttaggtcaggtaagtgagcaaactgttgagcgagacgatggc
tcgacttacagcattacttttacctcaacagatattaccgatccctctaatccccgccaa
tatcaactacctggacagtcgttgacaactacacttgattctctcaattttattaaagca
atccagaatggacaacctacatccatagcaatttctggactgagtatagctaccaaactt
tcccccgacaatgcacttctaataggtgcttctgcggctagtggtgcaattatcaatctc
atcaatctggaaaatttgctccgcaatggcgataaagtagctgcaattaccacgggtaca
caaattgtttcttatgcagctaatctatataaagaatacttgatagctcagtatggaggt
gatggtattgcagcactggctgataatattgatttctggaactttgcagatgatgttgac
aagaccataccttatattagtatctttaatagtctctatcacgaagattatttcaatgct
gctcttggtgtcctgtctctcatccctgcatttcaaccatttgttatcggggtggaaatt
gttgaaattatagtcgatctcttcagcgatccaccagagccttggggtgatagcaatttt
atttggcaaggtaaccaaattgggctttcaattgtaggtgatcatggtggcgatgaatcc
gtacagaatgtagccaatcaacttcttactgctctcaataaaatagtttcagatgctcag
agtagctctccaaatttccaacttgggctaattgccaatcgaattccaggattatctcta
agaaatggctcattcattttacatgaaatcgatttgattagtgggcaagctaaagatatt
tactatgatcgcgatggatattccaatgctgtaataggaagctcccaatatttcaccaat
ctcggtcaagattatacaattgccactttcaagcgcggagcgatcgcaccacaatgggaa
gtagacactgctaggctacagacagaaatcggtagctataatgccggattgactgaagaa
gaacgagcagccaaaaatggcaagttgcctccggcattaacttctaatgctactactgag
tctttcaaaccgattatcttagatttgaatggtgatggagtaggaatagttgatcgagat
cacagcaacgttgcttttgatgtagatgacagtggttttatcaaacaaacgggttggata
gataaaaatgatggtttcttagtacttgatcggaacttcgatggcgatgtcacctctggc
aaagagctattctccaatattgaagtcgcagtagatgttcgtggtttagcaagcctagat
tgggtggatgctaatgccgatagtcaaatcaccgcagcagatccagtttacaatcagcta
cgggtttggcacgatgctaatagtaatggagttactgatcaagatgaaaccaagacttta
gcagaacttgggattagttcaatcaactatacaattggtagttataacgttagcgataca
acacgcgagatatcttctcccgaactcgccgcagatactcaaggttctcagtttcagctt
gttgaaaatggtaccctgattaccagtaccgatggtcatgcttcgctggtggtaaatcat
gttgatgacttatctaatcttcagccgaatagtgacggcgtgacgacatatgaaaattta
ggtgtagatatttttctcggtgatttgctcgcaaacgacattacctcatctaataaatta
actatcactggtgtaggtaatacgcgtcatggcacagcagctttgcaaaatgggatagta
cacttcgttccagagatcgactattccggtactgatgccggatttgactattacacaagc
actaatgataacgcagattccagcacaacattagttgcagtgaacgttatccaccaaaac
cgagcgcctgtaattgatggtgtagtatacgatcaagtacaagtacaagttccgtctgat
tctgactctcaacagtctaattttttactacaagatgacccgtataatggacgaatcctt
gtacacgatattgacgatgccaccgaaagtctaacattctcgattaaaaatcaggctcgg
tacggttatgctaccattgacgagcatatagggcatttcagtttttcgccaagtgcggca
ctgggaattcaagatgcatttgttgttgagattaaagacccacacggtgcagtagctgat
cacaccttcattgtgtccctacctattccagtaccaaatgatactggtggtggcgatgct
cctagcggcgacagtcctggcactgctccaggcgacagtcctggcactgctccaggcgac
agtcccggcactgctccaggcgacagtcctggcactgctccaggcgatagtcctggcact
gctccaggcgatagtcctggcactgctccaggcgacagtcccggcactgctccaggcgac
agtcccggcactgctccaggcgacagtcccggcactgctccaggtgatagtgatggtagt
gctggtactggtagcagtggtgatggcagtgctggtgctggtagcagtggtgatggtagt
gctggtgctggtagcagtggtgatggcagtgctggtgctggtagcagtggtgatggtggt
gctggtgctggtagcagtggtgatggtggtggcggtggcggtggcgatggtggtggcggt
ggcggtggcgatggtggtggcggtggcggtggcgatggtggtggcggtggcggtggtggc
gaccctatcgtcctcgatctattagggactggcttccatcttactaatgctcatacctct
caatctttctttaatatacttggtgacggctggcgtcaccatactggctgggttagttct
ggcaacggcatcctagcttacgattacaatagtgatcacatcattaatcacaggggcgaa
atcgcatttattgattataagccaggagcaaaaaccgatcttgaaggtttatctgctttt
gactttaacgatgatgggatatttagcaacctcgacaacaaatggaatcagtttggagtt
tgggtagacaataacagtgatgccgtgactgatgctggcgagtttaagactttagatagc
ttaggtattaactctattaacctgacaagtgaccatcagcgtacaactgttaatggtaat
ataattcatggcgtaactcaggttaagctgaaagacggacggcagattaaagctgctgat
gtgagttttcaggtaactaatcaagtattgctggtacattccgatggtactagcgaagtt
ttcaaccttcccacccatacccccaccctatcatcaaagaatcaggaaaacgattcgctc
actggtagaggtaataataccttagcaggaaattttgaaggcgatgttctgacaggtagt
ctcagtgctgaccagtttatctttacagatttaaatcatgctgttgatcccatcattaat
tccactttgacccagaaagacttgattctagtttctgcgactggttttggtggggggctg
acatcaggacaggtaattaactttaatcaattcgttttgggtactaaagctcagaatcca
gttgagcgattcatctacaattcaaatgatggctctttatggtttgatgtagacgggagc
ggagccactcccgctgtgcaaattgcaacttttaataacaatcctttgcttaatcacgag
caaatatttgtaacatattga
DBGET
integrated database retrieval system
