Nonlabens tegetincola: BST91_04820
Help
Entry
BST91_04820 CDS
T04875
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
nsd
Nonlabens tegetincola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nsd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
nsd02000
]
BST91_04820
Transporters [BR:
nsd02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BST91_04820
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF903
Dockerin_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARN71018
LinkDB
All DBs
Position
complement(1015795..1021647)
Genome browser
AA seq
1950 aa
AA seq
DB search
MRSLVYFFIFLGSLYATSQVKIGDNPNSIDPFSILELESTSNVLVVTRVTTAEMNAITPL
NGAIVYNSTENCLYQYRSGNWESLCIGGTLTDNNDGSYTFTNINGGTVVIDTSANSDPYN
NVTSGLSALNVQDAIDELNTATRSIVLIDNADGTYTFSDANGNIVTIADTSISTLTDNGN
GTYTYTDETGTQTIIDTTFLETLTSLGLNASETALEYSDEDGVITTINLANVVQNLETLT
TIVENTDGTFTYTDEDGGTTIIDVTNLETLTSIALNADDTNIDYTDEDGVVTQLDLTALV
QNLETLTTIVENTDGTFTYTDEDGGTTIIDVTNLETLTSIALNADDTNIDYTDEDGVVTQ
LDLTALVQNLETLTTIVENTDGTFTYTDEDGGTTIIDVTNLETLTSIALNADDTNIDYTD
EDGVVTQLDLTALVQNLETLTTLVENTDGTFTYTDEDGGTTVIDVTNLETLTSIALNADD
TNIDYTDEDGVVTQLDLTALVQNLETLTTLVENTDGTFTYTDEDGGTTVIDVTNLETLTS
IALNADDTNIDYTDENGVVTQLDLTALVQNLETLTTIVENTDGTFTYTDEDGGTTVIDVT
NLETLTSIALNADNTNIDYTDEDGVVTQLDLTALVQNLETLTTIVENTDGTFTYTDEDGG
TTVIDVTNLETLTSIALNADDTNIDYTDEDGVVTQLDLTALVQNLETLTTIVENTDGTFT
YTDEDGGTTVIDVTNLETLTSIALNADDTNIDYTDEDGVVTQLDLTALVQNLETLTTLVE
NTDGTFTYTDEDGGTTVIDVTNLQTLTSIALNADDTNIDYTDEDGVVTQLDLTALVQNLE
TLTTIVENTDGTFTYTDEDGGTTIIDVTNLETLTSIALNADDTNIDYTDEDGVVTQLDLT
ALVQNLETLTTIVENTDGTFTYTDEDGGTTVIDVTNLETLTSIALNADDTNIDYTDEDGV
VTQLDLTALVQNLETVTTLGINAGELTYANEDATNANVNLISTDADNSITAGTDGALFVD
VSAAQTVTNLTDLNDGFVTYTNEDGTVQTVAKADITDNMNGTYTFTNNDGTDVTIDTNGI
VITNVIAGNRIATVTEADGTAVDIDETITTITGNAATGNTIATYENENGDTEDINETVTA
LGINAGELTYANEDATNANVNLISTDADNSITAGTDGALFVDVSAAQTVTNLTDLNDGFV
TYTNEDGTVQTVAKADITDNMNGTYTFTNNDGTDVTIDTNGIVITNVIAGNRIATVTEAD
GTAVDIDETITTITGNAATGNTIATYENENGDTEDINETVTALGINAGELTYANEDATNA
NVNLISTDADNSITAGTDGALFVDVSAAQTVTNLTDLNDGFVTYTNEDGTVQTVAKADIT
DNMNGTYTFTNNDGTDVTIDTNGIVITNVIAGNRIATVTEADGTAVDIDETITTITGNAA
TGNTIATYENENGDTEDINETVTALGINAGELTYANEDATNANVNLISADADNSITAGTD
GALFVDVSAAQTVTNLTDLGNGFVTYTNEDGTVQTVAKADITDNMNGTYTFTNNDGTDVT
IDTNGIVITNVIAGNRIATVTEADGTAVDIDETITTITGNAVTGNTIATYENENGDTEDI
NETVTALGINAGELTYDNEDATNANVNLISADADNSITAGTDGALFVDVSAAQTVTNLTD
LGNGFVTYTNEDGTVQTVAKADITDNMNGTYTFTNNDGTDVTIDTNGIVITNVIAGNRIA
TVTEADGTAVDIDETITTITGNAATGNTIATYENENGDTEDINETVTALGINAGELTYAN
EDATNANVNLISADADNSITAGTDGALFVDVSAAQTVTNLTDLGNGFVTYTNEDGTVQTV
AKADITDNMNGTYTFTNNDGTDVTIDTNGIVITNVIAGNRIATVTEADGTAVDIDEPLLP
SLVMQQRVIPLLLMKMKMVIQKILMKRLQL
NT seq
5853 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagatccctagtttattttttcatttttttaggttcactttacgccacttcacaagta
aaaattggtgataatccaaatagtattgatcctttttcgattttagaattggaaagtaca
tccaatgtacttgttgttacacgggtgacaactgccgagatgaatgcgattacaccgctt
aatggtgctatcgtatacaattctaccgaaaattgtttgtatcaatataggtctggaaac
tgggaaagtctttgtattggaggaactttgacagataacaatgacggtagttatactttt
acaaatatcaacggaggaaccgtcgttattgataccagtgcaaactctgatccctacaat
aatgttacatcaggtttgagtgcattgaacgtacaagatgctattgatgaattgaatacg
gcaactagaagtattgtattaattgataatgcggatggtacttacactttcagtgatgca
aatggaaatattgtcactattgcagatacgagtatctctactcttactgacaacggtaat
ggcacttatacctatacagatgaaactggcactcaaacgataatcgatactactttcttg
gaaactctcacttcgctaggccttaatgcaagtgaaacagccttggagtatagtgatgaa
gacggcgtaattactaccattaatttagccaatgttgtacaaaacttagagaccttaacc
actatcgttgaaaacacagacggtacttttacttacaccgatgaagatggtggtactacc
attattgatgtaacgaatctggaaactcttacctctattgcgttgaatgctgatgatact
aacatcgattacaccgatgaggatggtgtggttactcagcttgatcttacagctttagta
caaaacttggagaccttaaccactatcgttgaaaacacagacggtacgtttacttacacc
gatgaagatggtggtactaccattattgatgtaacgaatctggaaactcttacctctatt
gcgttgaatgctgatgatactaacatcgattacaccgatgaggatggtgtggttactcaa
cttgatcttacagctttagtacaaaacttggagaccttaaccactattgttgaaaacaca
gacggtacttttacttacaccgatgaagatggtggtactaccattattgatgtaacgaat
ctggaaactcttacctctattgcgttgaatgctgatgataccaatatcgactacaccgat
gaagatggtgtggttactcagcttgatcttacagctttagtacaaaacttagagacttta
accactttggttgaaaacacagacggtacgtttacctataccgatgaagatggtggcact
acagttattgatgttaccaatctggaaacactgacttctattgcgttaaatgctgatgat
actaacattgactacaccgatgaggatggtgtcgtaactcagcttgatcttacagcttta
gtacaaaacttagaaactttaaccactttagttgaaaacacagacggtacttttacttac
accgatgaagatggtggtactactgttattgatgttaccaatctggaaacgcttacctct
atcgcgttgaatgctgatgatactaacatcgattacaccgatgaaaatggtgtggttaca
cagcttgatcttacagctttagtacaaaacctagaaactttaaccactatcgttgaaaat
acagacggtacttttacttacaccgatgaagatggtggtactactgttattgatgtaacg
aatctggaaacgcttacctctatcgcgttgaatgctgataatactaacatcgattacacc
gatgaggatggtgtcgtaactcagcttgatcttacagctttagtacaaaacttagaaact
ttaactactatcgttgaaaacacagacggtacttttacttacaccgatgaagatggtggt
actactgttattgatgtcacaaatctggaaacactgacttctatcgcgttgaatgctgat
gatactaacatcgattacaccgatgaggatggtgtggttactcaacttgatcttacagct
ttagtacaaaacttagagactttaaccactatcgttgaaaacacagacggcacctttacc
tataccgatgaagatggtggtactactgttattgatgttaccaatttggaaacacttacc
tctatcgcgttgaatgctgatgatactaacatcgattacaccgatgaggatggtgtggtt
actcaacttgatcttacagctttagtacaaaacttagagactttaaccactttagttgaa
aacacagacggtacgtttacttacaccgatgaagatggtggtactaccgttattgatgtt
accaacctgcaaactcttacctctattgcgttgaatgctgatgatactaacattgactac
accgatgaggatggtgtggttactcaacttgatcttacagctttagtacaaaacttagag
actttaaccactatcgttgaaaacacagacggtacgtttacttacaccgatgaagatggt
ggtactaccattattgatgtcacgaatctggaaactcttacctctattgcgttgaatgct
gatgatactaacatcgactacaccgatgaggatggtgtggttactcagcttgatcttaca
gctttagtacaaaacttggagaccttaaccactatcgttgaaaacacagacggtacgttt
acctataccgatgaagatggtggtactactgttattgatgttactaatctggaaactctt
acctctattgcgttgaatgctgatgatactaacatcgattacaccgatgaagatggtgtg
gttacacagcttgatcttacagctttagtacagaacttggagacagttactacattagga
atcaatgctggtgaacttacttatgccaatgaagacgctacaaatgctaatgtaaatctg
atctctactgatgctgataacagcatcactgccggtactgacggtgccttattcgtagat
gtgtctgctgcacaaacagtaacgaatcttactgaccttaatgatgggtttgtaacctat
actaatgaagatggtacggtacaaactgttgctaaagctgatatcactgataacatgaat
ggtacctatacattcaccaataatgatggtaccgatgtgactattgacactaacggtatc
gttattactaatgtgatcgctggtaatcgtattgctactgtaactgaagctgatggtact
gctgtagatattgatgaaaccattactaccatcactggtaatgcagcaacgggtaatacc
attgctacttatgaaaatgaaaatggtgatacagaagatattaatgaaacggttacagct
ttaggaatcaatgctggtgaacttacttatgccaatgaagacgctaccaatgctaatgta
aatctgatttctactgatgctgataacagcatcactgctggaactgatggtgccctattc
gtagatgtgtctgctgcacaaacagtaacgaatcttaccgaccttaatgatgggtttgta
acctatactaatgaagatggtacggtacaaactgttgccaaagctgatatcactgataac
atgaatggaacctatacattcaccaataatgatggtaccgatgtgactattgacactaac
ggtatcgttattactaatgtgatcgctggtaatcgtattgctactgtaactgaagctgat
ggtactgctgtagatattgatgaaaccattactaccatcactggtaatgcagcaacgggt
aataccattgctacttatgaaaatgaaaatggtgatacagaagatattaatgaaacggtt
acagctttaggaatcaatgctggtgaacttacttatgccaatgaagacgctacgaatgct
aatgtaaatctgatctctactgatgctgataacagcatcactgctggtacagacggtgcc
ctattcgtagatgtgtctgctgcacaaacagtaacgaatcttactgaccttaatgatggg
tttgtaacctatactaatgaagatggtacggtacaaactgttgctaaagctgatatcact
gataacatgaatggtacctatacattcaccaataatgatggtaccgatgtgactattgac
actaacggtatcgttattactaatgtgatcgctggtaatcgtattgctactgtaactgaa
gctgatggtaccgctgtagatattgatgaaaccattactaccatcactggtaatgcagca
acgggtaataccattgctacttatgaaaatgaaaatggtgatacagaagatattaatgaa
acggttacagctttaggaatcaatgctggtgaacttacttatgccaatgaagacgctacc
aatgctaatgtaaatctgatttctgctgatgctgataacagcatcactgctggaactgat
ggtgccctattcgtagatgtgtctgctgcacaaacagtaacgaatcttactgaccttgga
aatggatttgtaacctatactaatgaagatggtacggtacaaactgttgctaaagctgat
atcactgataacatgaatggtacctatacattcaccaataatgatggtaccgatgtgact
attgacactaacggtatcgttattactaatgtgatcgctggtaatcgtattgcaacggta
actgaagctgatggtactgctgtagatattgatgaaaccattactaccatcactggtaat
gcagtaacgggtaataccattgctacttatgaaaatgaaaatggtgacacagaagatatt
aatgaaacggttacagctttgggaatcaatgctggtgaacttacttatgataatgaagac
gctacgaatgctaatgtaaatctgatctctgctgatgctgataacagcatcactgctggt
actgacggtgccctattcgtagatgtgtctgctgcacaaacagtaacgaatcttactgac
cttggaaatggatttgtaacctatactaatgaagatggtacggtacaaactgttgctaaa
gctgatatcactgataacatgaatggtacctatacattcaccaataatgatggtaccgat
gtgactattgacactaacggtatcgttattactaatgtgatcgctggtaatcgtattgct
actgtaactgaagctgatggtactgctgtagatattgatgaaaccattactaccatcact
ggtaatgcagcaacgggtaataccattgctacttatgaaaatgaaaatggtgatacagaa
gatattaatgaaacggttacagctttaggaatcaatgctggtgaacttacttatgccaat
gaagacgctaccaatgctaatgtaaatctgatctctgctgatgctgataacagcatcact
gctggaactgatggtgccctattcgtagatgtgtctgctgcacaaacagtaacgaatctt
actgaccttggaaatggatttgtaacctatactaatgaagatggtacggtacaaactgtt
gctaaagctgatatcactgataacatgaatggtacctatacattcaccaataatgatggt
accgatgtgactattgacactaacggtatcgttattactaatgtgatcgctggtaatcgt
attgctactgtaactgaagctgatggtactgctgtagatattgatgaaccattactacca
tcactggtaatgcagcaacgggtaataccattgctacttatgaaaatgaaaatggtgata
cagaagatattaatgaaacggttacagctttag
DBGET
integrated database retrieval system