Nostoc sphaeroides: GXM_01001
Help
Entry
GXM_01001 CDS
T06325
Name
(GenBank) type I secretion target repeat protein
Organism
nsh
Nostoc sphaeroides
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Glyco_hydro_16
SKN1_KRE6_Sbg1
GH16_PorA-D
GH16_XgeA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QFS43528
UniProt:
A0A5P8VSV3
LinkDB
All DBs
Position
Gxm1:905015..910543
Genome browser
AA seq
1842 aa
AA seq
DB search
MAKKTIFLTENSDVWGGWESGVDYEISAFDGNDKLYGYSGNDTLNGGEGNDQIYGGSGDD
ILIGGQGQDLLDGGDGNDILDGGGGDDTLIGGNGNDVINGGDGNDVINGGDGNDVINGGD
GDDGWIFGGAGADNINGGTGNDTLDSGEGDDTLIGGGGNDLLMGHNGNDLIDAGVGNDVI
EAGAGNDIIYGGEGDDRINGGADNDNIWGDVGNDYISGGTGNDTIGGGIGNDILDGGDGN
DVIYGGEGNDIWIFGGLGADKIDGGAGNDILDGGEGDDTLTGGDGNDLLMGSNGNDALYG
ESGNDNIDGASGVDTIGGGDGDDKINGGADDDTIWGDAGNDYISGASGIDNIAGGSGVDT
IAGGDGDDKINGGADDDTIWGDAGNDYINGGSGIDTIFGGVGNDIIDGSDGNDIIYGGDG
DDAWIFGGLGADKIDGGAGNDILDGGEGDDTLTGGEHSDVLRGSNGNDALYGENGNDNID
GGSGIDTIGGGNGDDKINGGADDDTIWGDAGNDSINGGSGIDTIFGGVGNDIIDGSDGND
IIYGGDGDDAWIFGGLGADKIDGGAGNDILDGGEGDDTLTGGEHSDVLRGSNGNDALYGE
NGNDSIDGGSGIDTIGGGNGDDKINGAADDDIIWGDAGNDSINGGSGIDTIFGGVGNDII
DGSDGNDVISGGDGDDSWIFGGLGADKIDGGAGNDILDGGEGDDTLTGGEHSDVLRGSNG
NDALYGENGNDSIDGGSGIDTIGGGNGDDKINGGADDDIIWGDAGNDSINGGSGIDTIFG
GVGNDIIDGSDGNDVISGGDGDDSWIFGGLGADKIDGGAGNDILDGGEGDDTLTGGEHSD
VLRGSNGNDALYGENGNDSIDGGSGIDTIGGGNGDDKINGDADDDIIWGDAGNDSINGGS
GIDTIFGGVGNDIIDGSDGNDIIYGGDGDDAWIFGGLGADKIDGGAENDILDGGEGDDTL
TGGEHSDVLRGSNGNDALYGENGNDSIDGGSGIDTIGGGNGDDKINGDADDDIIWGDAGN
DSINGGSGIDTIFGGVGNDIIDGSDGNDIIYGGDGDDAWIFGGLGADKIDGGAENDILDG
GEGDDTLTGGEGNDVLIGNYGNDVLYGGEADDKIYGGADNDIIWGDAGNDYINGGTGNDT
IFGGVGNDIIDGSDGNDIISGGDGDDSWIFGGLGADKIDGGAENDILDGGEGDDTLTGGE
GNDVLSGNNGNDALYGGAGSNILDGGEGDDILIGGDSNDILKGANGNDSIESGAGNDIIN
GGAGNDVLKGGNDNDTLDGAGISSINSIDILVGGMNADTFILGDNIKAYYDDENTTTGGV
IDYALIEDFNRFEDVIRLHGSASEYVVDAIPAQLTTAFTASNASGIYLDTDKSGSWSNTD
ELIAVVKNLTPDQLVLDADYFQYTETPNAGYWHPTKDSEWELVFSDEFNGTELSLNNWNT
RYTLQNFYGGRNNPWNNELQYYVGDNEVINGKVYDGFEFKNGIVSIVGKKLEQPINAEIS
EFSLGFDQVKTFDYTSGMLNTENKEAFTYGYMEIRAKVPGGKGLWPAFWMLPSSGKWPPE
IDVMETVGQNKDTVINSVHYLNSEGLNQHTASQTFSEIDFTQDFHTYAVKWESNKLTWYI
DQHAVFETKNNVPDVPMYLLANLAIGGKFPGSTDETTPLINNLDIDYIRVYQNASGSLYG
GSKDDVLEKQLGSIFGLAGNDILKGGIGNNALDGGDGNDVLIGVNNTVIQPGVGEMDILT
GGAGKDKFVLGDATKFYYDDRNNLVAGLGDYALIKDFNAAQDVIQLNGKASDYLLGAVSS
LTGTAIYRDTNTDITLSLTDELIAVVQGDTGLNLTQNYFLYV
NT seq
5529 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaagaaaacaatttttttaactgaaaattccgatgtttggggaggctgggaaagt
ggtgttgactatgagatatccgccttcgatggcaacgacaaactttatggctatagtggc
aatgacactctaaatggtggtgaaggtaacgatcaaatttatggcggtagtggtgatgat
attttaattggtggacagggacaagatttgttagatggtggcgacgggaatgacatcctc
gatggtggtggaggtgacgatactcttattggcggtaatggcaatgatgtaattaatggt
ggcgatggcaatgatgtaattaatggtggcgatggcaatgatgtaattaatggtggtgat
ggcgatgatggctggatatttggtggtgctggtgcggacaacataaatggtggtacaggg
aatgacaccctagatagtggcgaaggcgatgatacccttattggcggtggtggcaatgat
ctgctcatgggtcataatggcaatgatctcatagatgctggcgtgggtaatgatgtgata
gaagcgggtgctggaaatgacatcatttatggtggagaaggcgacgatagaattaatggc
ggcgctgacaatgacaacatctggggcgatgtcggcaatgattacattagcggtggtaca
ggaaatgacaccattggtgggggtatcggtaatgacatccttgatggtggcgatggcaat
gatgtcatctatggtggggagggtaatgatatttggatattcggtggtttaggtgcagac
aagatagatggtggtgcaggtaatgacatccttgatggtggtgaaggtgatgataccctc
acaggtggtgatggcaacgatctgctcatgggtagtaatggcaatgatgccctctatggt
gaaagcggtaatgacaacatcgatggtgcttctggagttgacaccattggcggtggtgac
ggtgatgataaaatcaatggcggcgctgatgacgataccatctggggtgatgccggcaat
gattacattagcggtgcttctggaattgacaacattgctggtggttctggagttgacacc
attgctggtggtgacggcgatgataaaatcaatggcggcgctgatgacgataccatctgg
ggtgatgcaggtaatgattacattaacggtggttctggaattgacaccatttttggcggt
gtcgggaatgacattatagatggtagtgacggcaatgacatcatctatggtggtgacggc
gatgatgcttggatattcggtggtttaggtgcagacaagatagatggtggtgctggaaat
gacatcctagatggtggcgaaggcgatgataccctcacaggtggtgaacacagtgatgtt
ctcaggggtagtaatggcaatgatgcgctctatggtgaaaacggcaatgacaacatcgat
ggtggttctggaattgacaccattggcggtggtaacggcgatgataaaatcaatggcggc
gccgacgacgataccatttggggcgatgcaggtaatgattctattaacggtggttctgga
attgacaccatttttggcggtgtcgggaatgacattatagatggtagtgacggcaatgac
atcatctatggtggtgacggcgatgatgcttggatattcggtggtttaggtgcagacaag
atagatggtggtgctggaaatgacatcctagatggtggcgaaggcgatgataccctcaca
ggtggtgaacacagtgatgttctcaggggtagtaatggcaatgatgcgctctatggtgaa
aacggcaatgacagcatcgatggtggttctggaattgacaccattggcggtggtaacggc
gatgataaaatcaatggcgccgccgacgacgatatcatttggggcgatgcaggtaatgat
tctattaacggtggttctggaattgacaccatttttggcggtgtcgggaatgacattata
gatggtagtgacggcaatgatgtcatctctggtggtgacggcgatgatagctggatattt
ggtggtttaggtgcagacaagatagatggtggtgctggaaatgacatcctagatggtggc
gaaggcgatgataccctcacaggtggtgaacacagtgatgttctcaggggtagtaatggc
aatgatgcgctctatggtgaaaacggcaatgacagcatcgatggtggttctggaattgac
accattggcggtggtaacggcgatgataaaatcaatggcggcgccgacgacgatatcatt
tggggcgatgcaggtaatgattctattaacggtggttctggaattgacaccatttttggc
ggtgtcgggaatgacattatagatggtagtgacggcaatgatgtcatctctggtggtgac
ggcgatgatagctggatatttggtggtttaggtgcagacaagatagatggtggtgctgga
aatgacatcctagatggtggcgaaggcgatgataccctcacaggtggtgaacacagtgat
gttctcaggggtagtaatggcaatgatgcgctctatggtgaaaacggcaatgacagcatc
gatggtggttctggaattgacaccattggcggtggtaacggcgatgataaaatcaatggc
gacgccgatgacgatatcatttggggcgatgcaggtaatgattctattaacggtggttct
ggaattgacaccatttttggcggtgtcgggaatgacattatagatggtagtgacggcaat
gacatcatctatggtggtgacggcgatgatgcttggatattcggtggtttaggtgcagac
aagatagatggtggtgctgaaaatgacatcctagatggtggcgaaggcgatgataccctc
acaggtggtgaacacagtgatgttctcaggggtagtaatggcaatgatgcgctctatggt
gaaaacggcaatgacagcatcgatggtggttctggaattgacaccattggcggtggtaac
ggcgatgataaaatcaatggcgacgccgatgacgatatcatttggggcgatgcaggtaat
gattctattaacggtggttctggaattgacaccatttttggcggtgtcgggaatgacatt
atagatggtagtgacggcaatgacatcatctatggtggtgacggcgatgatgcttggata
ttcggtggtttaggtgcagacaagatagatggtggtgctgaaaatgacatcctagatggt
ggcgaaggcgatgataccctcacaggtggtgaaggcaatgatgtcctcataggtaattat
ggcaatgatgtcctttatggtggggaagcagacgataaaatttatggcggcgctgacaac
gacatcatctggggtgatgcagggaatgattacattaacggcggtacaggaaatgacacc
atttttggcggtgtcgggaatgacattatagatggtagtgacggcaatgacatcatctct
ggtggtgacggcgatgatagctggatattcggtggtttaggtgcagacaagatagatggt
ggtgctgaaaatgacatcctagatggtggcgaaggcgatgataccctcacaggtggtgaa
ggtaatgatgtcttgtcaggtaataatggcaatgatgccctttatggtggtgctggaagt
aacatcctagatggtggtgaaggtgatgatatcctcataggcggtgacagcaatgatatc
ctcaaaggtgctaatggtaatgacagcatagagagtggtgctggtaatgacattattaat
ggcggcgccgggaatgatgtcctcaaaggtgggaatgataatgacacccttgatggagca
ggtatctctagtattaactcaattgatattctagttggtggaatgaatgctgatacattt
attctgggcgacaacatcaaggcttactatgatgatgaaaacactactacaggtggggta
atagattacgctctcattgaggatttcaaccgttttgaagacgtgattcgccttcatggt
tcagccagtgaatatgttgttgatgctattcccgctcaactcacgactgcctttactgct
agtaatgcatcgggtatttatttagataccgataaaagtgggagttggagtaatacagac
gaattaattgcagttgtgaaaaatcttactcccgatcagttggtgctggatgcagattac
tttcaatacactgagacaccaaatgcaggttactggcatccaactaaagattcggaatgg
gaactagtatttagtgacgaatttaacggaactgagctatctctaaataattggaatacc
cgctatactctccaaaatttctacggaggtagaaataacccttggaataacgaattgcag
tactacgttggtgataatgaagtcatcaatggcaaagtttatgacggttttgaatttaag
aacggcattgttagtattgttggaaaaaaacttgaacagcccatcaacgcagaaattagt
gagttttctctaggttttgaccaagtgaaaacattcgattacacttccggtatgctcaac
actgaaaataaggaagctttcacctacggctatatggagattcgcgctaaagtacctggc
ggaaaaggactttggccagccttttggatgttaccctcttcaggaaaatggcctccagaa
attgacgttatggaaacagtgggacaaaacaaagatactgtaattaactcagtccactat
ctaaactccgaaggattaaaccaacatacggcatctcagacattttctgaaattgatttt
actcaggatttccacacctatgcagtcaaatgggaatcaaacaaattaacttggtacatc
gatcagcatgctgtgtttgagacgaaaaataatgttcccgatgtacctatgtacttgcta
gcaaatcttgccattggtggtaagttcccaggttctacagatgaaactactcctctgatc
aataatttagatattgattacattcgtgtttaccaaaatgcatcaggtagtctgtacggt
ggctctaaagatgacgtattggaaaagcaattgggcagtatttttggactagcaggaaat
gacattcttaaaggcgggataggtaataatgccctggatggtggagatggcaatgatgtt
ttgattggcgtgaataatacagttattcaacctggtgtaggtgagatggatatattaaca
ggtggagcaggtaaagataaattcgtcttaggtgatgctaccaagttctactatgacgat
cgcaataatttagtagctggtttaggagactatgctctaattaaagatttcaatgctgcc
caagatgtcatccagttgaatggtaaagccagtgattatttacttggtgctgtatcttcc
ctgactggtactgcaatttatcgagatactaacactgatataactctcagtttgacagat
gaattaattgcggtggtgcaaggcgatactggattgaacttgacacagaattacttcctt
tacgtttag
DBGET
integrated database retrieval system
