Nodularia spumigena: BMF81_03451
Help
Entry
BMF81_03451 CDS
T05403
Symbol
clcA
Name
(GenBank) H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA
KO
K03281
chloride channel protein, CIC family
Organism
nsp
Nodularia spumigena
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nsp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
nsp02000
]
BMF81_03451 (clcA)
Transporters [BR:
nsp02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
BMF81_03451 (clcA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Voltage_CLC
CBS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVZ31095
UniProt:
A0A2S0Q8S4
LinkDB
All DBs
Position
complement(3938691..3940565)
Genome browser
AA seq
624 aa
AA seq
DB search
MTLLPKSELRKVTEQPIFPKPSTRLTQLINRFQLSPETVVLFLALLIGGGTGMGVVTFHY
LIELIDHLMREKFIGAIGVWGEWTFACIPILGGLIVGLMRWYAQDFGPGLSSMIAASQGT
ELKQQLRPVTKMLAASVSLGSGASLGTEGPSVEIGANFGMLLSVILKVSQERQRLLLGAG
AAAGLAAGFNAPIAGVFFALEVVMGATSFATSAVSVVLLAAVVAALIAQIGLGAQPAFDL
PVYQVRSLLELPLYLGLGLGASLVSLTYTSTIRLAKAGFAGLVSGFGLLGSIPQPVHPLI
GGVILGAVALQFPQILGIGYETVEAMLQDVEFSLHLLIILLVLKLLMTAISTASGFVGGL
FAPAMFLGASFGAAYAQIITLLFPAIGEVMAAPPAYAMVGMAAVLAASVRAPLTAILMLF
ELTRDYRIVLPLMAAVGLSVWITEQFQPNFNSNSNLQQIGLSELKDEQAEIVQQILVEDA
MVISPKKLPATLGVLEAALEMISSRCRSALVIDEAEQLVGILSLEDINRVLRLSQNHSPS
SSEIPSNLANQTLIDICTTEIIYAWQDELLSEALDRMTLRGLHQLPVVARDNSEYILGLI
EREQVKLICSLAVTQKALQEVISH
NT seq
1875 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactctcttgcctaagagcgaactgaggaaggtaacggaacaacctatatttcctaaa
ccttctactcgtttaacacaactgattaaccgttttcaactatccccggaaaccgttgta
ctatttttagccctgctcattggcggtggtactggtatgggcgtagtcacatttcactat
ttaattgagctaattgatcacctgatgcgagaaaaattcatcggtgcaattggtgtttgg
ggtgagtggactttcgcctgtattcccattttgggtgggttaattgtgggattgatgcgt
tggtatgctcaagactttggccctggactttcatcgatgattgcggcctctcagggaaca
gaactcaaacaacaattacgaccagtcacaaaaatgttagctgcatctgtttccttggga
agtggggcttccttggggacagaagggccaagtgtagaaattggggcaaattttggaatg
ctgttgtccgtaattctcaaagtatctcaagagcgacaacggttacttttaggtgctggt
gcggcggctgggttagcggcgggatttaacgcgcccattgctggagtattttttgctcta
gaagtagtcatgggcgcaacatcttttgctacttctgccgtgagtgtggtattgctagcc
gcagtcgtagcagcattaattgctcaaattggcttgggcgcacaacctgcttttgattta
cctgtttaccaagtccgcagtcttttagaattaccgctttatctggggttaggtttaggt
gcaagtttagtttctctgacttatacaagcacaattcgtttagcaaaagctggctttgct
gggttagtttctggttttggcttattagggagcattcctcaacccgttcatcccttgatt
ggcggcgtaattctcggcgcagtcgctttacaatttccccaaattttaggcattggttac
gaaactgtggaagccatgcttcaggatgtagagttttctctgcatctattaattatattg
ttagtgctgaaattattgatgaccgcaatcagtaccgctagtggttttgttggtggttta
tttgcaccagccatgtttttaggtgcttcttttggagcagcttacgctcaaatcattacc
ctgttatttccggcaattggtgaggtgatggcggctcccccagcctatgcaatggtaggg
atggcagcagttttagcggccagtgtcagagcgccattaacagctattttgatgttattt
gaattaacccgtgactaccgcattgttttacctttaatggcagcagtcggtttaagtgtc
tggataacagaacagtttcagccaaattttaactctaattctaatctgcaacaaattggt
ctttctgagttgaaagacgaacaggcggaaattgtccagcaaattttggtagaagatgct
atggtgattagccccaaaaagttgcccgcaaccttgggagtgttagaagcagctctagaa
atgatcagctcgcgctgtcgtagtgctttagtaattgatgaagcagagcaattagttggt
atcctatctctagaagacattaatcgtgttttgcgtctttctcaaaatcactcgccttct
tccagtgaaattcccagtaatttagctaatcaaactctgattgatatttgtaccactgaa
attatctatgcttggcaagatgaactgttgtctgaagctttagatcgcatgactcttcga
ggtttgcaccagttacctgtggtagcacgagataattctgagtacattttaggcttaata
gaacgagagcaagttaaattaatatgcagcttggctgtcacgcagaaagcactacaggaa
gtcattagtcattag
DBGET
integrated database retrieval system
