Nodularia sphaerocarpa: BDGGKGIB_02234
Help
Entry
BDGGKGIB_02234 CDS
T08134
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K07114
Ca-activated chloride channel homolog
Organism
nsph
Nodularia sphaerocarpa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nsph00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
nsph02000
]
BDGGKGIB_02234
Transporters [BR:
nsph02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BDGGKGIB_02234
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VWA
VWA_2
VWA_3
DUF2201
CobT_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ULP72590
LinkDB
All DBs
Position
2728766..2730613
Genome browser
AA seq
615 aa
AA seq
DB search
MINTSYDFDQAILPTGSSLKTNILLRFRADIAESPRRNLNLSLVIDRSGSMAGGALHHAL
KAAESVVDQLESNDILSVVVYDDEVNTVISPQPVTDKSELKKSIRKVRVGGITNLSGGWL
KGCEYVKTQLDPQKINRVLLLTDGHANMGIVDPKVLTATSAKKAEEGITTTTLGFAQGFN
EDLLIGMARAANGNFYFIQSIDDATEVFNIELDSLRAVVGQNLTVTLELADGVSLVDTLS
LSTVSHNQAGQAVISLGELYEGEDKLLGLSLDISSPPVGDLPVMKLHYRADVVQDNVISS
VSGTADVVAKVGTIEEAAAASSSHVILELSRLTIAKAKEIALDLAEHGRHEEAEQTLRIL
VKDLQDKGLNENFEIAEEIDQLEYFAGRIAQKALGNAGRKELRDQTYQTMTRNRSDLAGR
GVTAGDEVYAIPVVNEVGSGVELRCVREGGKLRVKVVSEGYDTSKNVQFPRGIRAEGARY
VVEGLELSSDRTFYRVCGDITRFAQAGVADTFANRRTTQRVSTGKASKGPASAADLETTD
TVDHQVLVQCVKDGSKLRARVVSDGYEPDWNMRFPRSVREEGMLYVVDEVKTAPDGKSYI
ACGDIKRFVQPTINN
NT seq
1848 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaataccagttacgactttgaccaagctatcctacctacaggttcttcattaaaa
acaaatattttgctgcgttttcgggctgatattgcggaatctccccgacgtaacctgaat
ctttctttggtaattgaccgttccggctctatggctggtggtgctttgcatcacgcactt
aaagctgctgagtctgtcgtggatcaactcgaatcaaatgatattctttcagtggtggtt
tacgatgatgaagtaaataccgttatttcaccccaacctgtaactgacaagtctgaactg
aaaaaatccatccgcaaagtcagagtcggcggtattactaatttatctgggggttggctc
aaaggttgcgaatatgtgaaaacgcaacttgatccgcaaaaaattaaccgtgtgcttcta
cttaccgatggtcacgccaatatgggtattgtagaccccaaggtgctgacagcgacatca
gcaaaaaaagctgaggaaggtatcactacaactacattgggatttgctcaaggttttaat
gaagatttgttaattggtatggcgagagccgccaatggtaatttctactttattcaaagc
attgacgatgcaacggaagtttttaacattgagttagacagtcttagagccgtggtaggt
caaaatctgacagtaactctggaattggctgatggtgttagcctcgttgatactttaagt
ttatctacagttagtcacaatcaagctggtcaagcggtgattagtttgggcgaactttac
gaaggggaagataaacttttggggctgagtctggatatatcctcaccaccagttggtgat
ttacctgtaatgaagctgcattaccgcgctgatgttgtccaagataacgtgatttcaagt
gtgtcaggtacagccgatgtggtcgctaaagttggtactatcgaggaagctgcggctgcg
tcttcgagccatgttatcctggaactgagtcgcctgactattgctaaagctaaagaaata
gcccttgatttagctgaacatggcagacatgaggaagctgaacaaaccctgcggatatta
gtcaaagaccttcaggataaagggttaaatgagaattttgaaattgctgaagagatagat
cagctagagtatttcgctggtagaattgctcaaaaagctttgggtaatgcgggacgtaaa
gaactgcgagaccaaacttaccagacaatgacacgcaatcgcagtgatttggcgggacgt
ggtgtgactgctggcgatgaagtctatgcaatcccggtggtgaatgaagtcggttctggg
gtagaactgcgctgtgttcgcgaaggtggtaaattgcgggttaaagttgtgtctgagggt
tacgataccagtaagaatgtccagtttccgcgcgggattcgggctgaaggcgcacgctat
gtggtggaaggattggaattgtcgagcgatcgcactttttaccgtgtctgtggagacatt
actcgttttgctcaagcgggtgtcgcagatacttttgctaaccgtagaactacgcaacgc
gttagcactggtaaagcttccaaaggtccggccagtgctgctgacttggaaacaactgat
actgtggatcatcaggttttagtgcagtgtgtcaaagatggtagtaagctcagagccagg
gtggtttctgacggttatgaaccagattggaatatgcgttttcctcgttcggtgcgggaa
gaaggaatgctttacgttgttgatgaggtgaagacagcgcctgatggtaagtcttatatt
gcttgtggggatattaagcgttttgtgcaacctacgattaataattag
DBGET
integrated database retrieval system
