Nodularia sphaerocarpa: BDGGKGIB_02542
Help
Entry
BDGGKGIB_02542 CDS
T08134
Symbol
mdeA
Name
(GenBank) L-methionine gamma-lyase
Organism
nsph
Nodularia sphaerocarpa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Met_gamma_lyase
Cys_Met_Meta_PP
Aminotran_1_2
Aminotran_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ULP72890
LinkDB
All DBs
Position
3064600..3065832
Genome browser
AA seq
410 aa
AA seq
DB search
MNSLEQLRQAEQALIEIFSGIDAQVKHNLKRVLDAFRNHRVGAHHFAGVSGYGHDDLGRE
TLDKVFAEVMGAEAAAVRVQFVSGTHAIACGLFGVLRPGDEMLAVVGSPYDTLEEVIGLR
GKGQGSLIEFGINYRQLELTAQGTIDWETLSHSVADHTRLVLIQRSCGYSWRPSLSIADI
EKIVHLVKQQNPNTVCFVDNCYGEFIETKEPTDVGVDLMAGSLIKNPGGTIVTAGGYIAG
RADLVEAAACRLTAPGIGSYGGATFDQNRLLFQGLFLAPQMVGEAMKGTHLTGYVFDKLG
YPVNPAPLAPRGDVIQAIKLGSAAKLIAFCKAIQQHSPVGSYLEPIPDEIPGYESQVVMA
GGTFIEGSTLEFSADGPLREPYVVYCQGGTHWTHVAIALEAAMDSVGFKS
NT seq
1233 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacagcttagaacaactgcggcaagcagaacaggcattaatagagattttttctgga
attgatgctcaggtcaagcataatctcaaaagagtcctagatgcctttcgtaatcaccgt
gtaggcgcacaccattttgctggtgttagtggctatggtcacgatgatctaggacgagaa
actttagataaagtttttgccgaagttatgggcgctgaagctgcggccgtgcgggtgcag
tttgtttctggaactcatgcgatcgcttgcggcttatttggtgttctccgtcctggagat
gaaatgttagcagtggtcggttctccctacgatacgctcgaagaagtcattggtttacgg
ggtaaaggccaaggctcccttattgagtttggcataaattaccgccaattggagctaacc
gcccaaggaactatagattgggaaaccttaagtcatagcgtagctgaccatacgcgttta
gtattaattcaacgctcttgtggttattcctggcggccgagtttatcaatagccgatata
gaaaaaatcgttcatttagttaaacagcaaaaccccaacaccgtctgctttgtcgataac
tgttacggcgaattcattgaaaccaaagaacccacagatgttggtgtggatttaatggcg
gggtcattgattaaaaatcctggggggacaattgtcacagcaggtggttatatagctgga
cgggctgatttagtagaagcagccgcttgtcgtttaactgcgcctgggattggtagttat
ggtggcgcgacctttgaccaaaatcggctgctgttccaaggcttatttttagctccccaa
atggtaggggaggcgatgaaggggactcacttaactggttatgtgtttgataaattgggt
tatcccgtaaatcccgcaccccttgcgcctcgtggagatgtgattcaggcgattaaattg
ggttctgcggccaagttaattgctttctgtaaggcgattcagcagcattcacctgttggt
tcttatctggaacctattcccgatgagataccggggtatgagagccaggtagtgatggct
ggggggacgtttattgaggggagtaccttggagttttcggcggatggacctttaagagag
ccttatgtggtttattgtcagggggggactcattggactcatgtggcgatcgcattagaa
gcggcgatggattcggtgggttttaagagttag
DBGET
integrated database retrieval system