Nodularia sphaerocarpa: BDGGKGIB_04236
Help
Entry
BDGGKGIB_04236 CDS
T08134
Symbol
cirA
Name
(GenBank) Colicin I receptor
Organism
nsph
Nodularia sphaerocarpa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
KTSC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ULP74567
LinkDB
All DBs
Position
complement(5041671..5043743)
Genome browser
AA seq
690 aa
AA seq
DB search
MKYFFLLPVALPSLFIAFPVLANDTEQVNSSILNLSQIELPMTQAELLTQQSIPIEVNPE
TQPEIESIPNEDADISLEVIGEKDPLPESTPVYVIDQEEIQKQGATSVADVLKRMPGFAI
NDVGPGADIHTGTYYRGASINQSVFLINGRPINNNVNTYHGGTDLNSIPVEAIERVELYS
GVTSALYGSSAFGGVVNIITKAGYGQPKLTGSTEFGSLNLNNQQVSYSGSVGDARYNFSF
ERYFIDNRYRVPVGAANRDPEGFLSNADTATSTYFGSIGLDLDSKNTLNLDVKTLSSRRG
LVYFGFPLQRDRLDHDGLNVGLSWKTRLGEGESSNLTTTVGYNQDYFSTYGPTVFAGQEF
NRTGVLDTQQLTARVDHAWKLTPSYQLRWGLDLKNTNLNGDTFSTRPDRIANNGTENRNL
LNTALFAVNTFNISNNFQVDLGLRQSFDGEFGNYFNPSAGLRYALSPTVAMRGSWAGGQR
NPGLDQLYVYDTVHGWEQNPDLIPETGSSWTAGVDVKLTNNLIGQFTYFGSSLDNRLGII
AGRWENIGLVNTNGLEAALRLQLARGWSTFVNYTYTDAQIKTGTEAGLQLGFIPYSVAQA
GVGYQNSGWNANLYVTYNSGTRRAFFNVPGETSRDFAPSFLNLDLSGRIPVTRNLGLTVY
LENLLGEQYERVNRIYSPGLTFRVGLTSNF
NT seq
2073 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaagtatttttttctcctaccagttgccttaccgagtttattcatcgcttttcctgtc
cttgctaatgatacagaacaggtaaattccagcattcttaacttaagtcaaattgagtta
ccgatgactcaggctgaattgttaactcaacaatctatcccaattgaagttaacccagaa
actcagccagaaatagaatcaattcccaacgaagatgcagatatttctctagaagtcatc
ggtgaaaaagaccctttacctgagtctacccctgtttacgtaatcgatcaagaagaaatt
caaaagcagggtgcgacaagtgtagctgatgtattaaaaagaatgcctggtttcgccatc
aatgatgtcggacctggtgcagatattcacacaggtacatactatcggggagcttcaatt
aatcaatctgtatttttgattaatggtagaccaattaataataacgtcaacacctatcat
ggtggaactgatttaaatagcattcctgtagaggcgattgaacgagtagaattatatagt
ggtgtcacctccgctttgtatggttcatcagcctttgggggtgtggtgaatattatcaca
aaagcaggttatggtcaaccgaaattaactggaagtacagaatttggctcattaaattta
aataatcaacaggtaagttatagtggctcagttggtgatgctcgctataacttcagcttt
gaaaggtattttatagataatcgttatcgcgttcccgttggtgcagccaatcgtgatcct
gaaggatttttatcaaatgcagacacagccactagtacttactttggcagcattggtcta
gatttagatagtaaaaacactttgaatttagatgtaaaaaccctgagcagtcgtcgcggc
ttagtttatttcggttttcctctgcaaagagatagattagaccatgatggcttaaatgtg
ggcttatcttggaaaactcgcttgggtgaaggcgaaagttctaatctcaccaccacagtc
ggttacaaccaagattattttagcacttatggtcccacagtatttgccgggcaggaattt
aaccgtacaggtgttttagatacacaacagcttacagctagggtagatcatgcgtggaaa
ttaacccccagttatcagttacgctggggattagatttaaaaaatactaacttaaacggc
gacacttttagtaccagacctgatagaattgctaataacggcacggaaaatagaaacctg
ttaaatacagctttatttgcagttaacactttcaatattagcaacaattttcaggttgat
ttaggactaagacaaagctttgatggggagtttggtaattatttcaaccctagtgctggc
ttacgttatgcgctctctcccacagtagccatgcgcggaagttgggctgggggacagcgc
aatcctgggttagatcaattatatgtttatgatactgttcacggttgggaacaaaaccct
gatttaatccctgaaacaggctcatcttggactgcgggcgtggatgtgaaactgacaaat
aatttaattggacagtttacttatttcggcagtagtttagataatcgcttgggaattatc
gccggaagatgggaaaatattggtttagtaaatacgaatggtttagaggcagctttacga
ttacaacttgctcgtggctggtcaacttttgttaactatacttatacagatgctcaaatc
aaaacaggcacagaagcaggtttacagttaggttttattccttattctgtcgcccaagct
ggtgtaggttatcaaaattctggctggaatgctaatttgtatgttacctataacagtggc
actcggcgtgctttttttaatgtccctggtgaaacgagccgagattttgcgccttctttt
ttaaatttagatttgagtggtcggattcctgtaacccgcaatttgggactgacggtttat
ctcgaaaatttactcggtgagcaatatgaacgagttaatcggatatacagtcctggcttg
acttttcgtgtgggtttaacctcaaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system