KEGG   Notechis scutatus (mainland tiger snake): 113417338
Entry
113417338         CDS       T09026                                 
Symbol
COL1A2
Name
(RefSeq) collagen alpha-2(I) chain
  KO
K06236  collagen type I alpha
Organism
nss  Notechis scutatus (mainland tiger snake)
Pathway
nss04510  Focal adhesion
nss04512  ECM-receptor interaction
nss04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:nss00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    113417338 (COL1A2)
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    113417338 (COL1A2)
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    113417338 (COL1A2)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:nss00536]
    113417338 (COL1A2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:nss00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   113417338 (COL1A2)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI
Other DBs
NCBI-GeneID: 113417338
NCBI-ProteinID: XP_026531462
UniProt: A0A6J1UKN5
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1363 aa
MLSFVDTRILLLLAVTSCLATSQYVNEATEVRRGPRGDRGPRGERGPAGPPGIDGEDGPP
GPPGPPGPPGLGGNFAAQYDMSKSADMGPGPMGLMGPRGPPGTNGPPGSPGFQGPPGEPG
EPGQTGPQGSRGPMGPPGKSGEDGHPGKPGRSGERGVPGPQGARGFPGTPGLPGFKGIRG
HNGLDGRKGEPGSAGNKGEPGAPGENGTPGQSGARGLPGERGRIGGPGPVGARGSDGSAG
PVGPAGPIGAAGPSGFPGAPGAKGEIGSAGNVGPSGPAGPRGDIGLPGAAGPVGPAGNPG
TNGLAGAKGAAGLPGVSGAPGLPGPRGIPGPTGPSGAAGARGLAGEPGPPGSKGETGSKG
EPGVAGPTGPAGPSGEEGKKGSNGEPGSSGLPGSAGLRGVPGSRGLPGSDGRAGGLGPAG
SRGATGPAGAKGPSGDSGRPGEPGLMGARGLPGQSGSPGPAGKEGPSGPAGPDGRPGPTG
PAGPRGEPGNIGFPGPKGPNGEPGKPGDRGSVGLTGPQGAPGPDGNNGAQGAPGLSGNAG
PKGDTGPAGAPGFQGLPGPSGSVGEAGKPGERGAHGDFGLPGPAGSRGERGAPGESGAAG
PAGPLGSRGPSGSPGADGNKGEPGSVGALGSAGPSGPSGVHGERGAAGSPGGKGEKGPSG
FRGDPGASGRDGGRGAPGAIGAPGPAGATGERGEGGSAGPAGPAGARGSPGERGEAGPAG
PPGFAGPSGAAGQTGVKGERGQRGPKGDSGPQGAIGAVGSAGPAGPVGQAGQAGARGDGG
PPGPNGFPGNAGRPGPPGPAGITGPSGPPGPAGKEGIRGPRGDTGPLGRTGETGIAGPPG
FSGEKGPSGEAGAAGAPGSSGPQGILGAPGILGLPGSRGERGLPGLSGALGEHGPVGISG
PSGARGPSGPIGSSGVNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGSPGYKGERGAPGNTGPAGSLG
APGPHGSVGPVGKSGNRGERGPAGVTGPSGPAGSRGPAGPQGARGEKGVAGDKGARGLPG
FKGHNGLQGLPGISGHHGEQGSSGVTGPAGPRGPSGPSGPAGKDGRNGLPGAVGPAGVRG
SHGSQGPSGPPGPPGLPGPPGPNGGGYEIGYDMEYYRADQPSLRPKDYEVDATLKTLNNQ
IETLLTPEGSKKNPARTCRDLKLSHPDWNNGFYWIDPNQGCTMDAINAYCDFSTGESCIS
ANPGNFPAKNWYIGKQPDERKLVWFGETINGGTQFEYNAEGMSTKDMATQLAFLRLLANH
ASQNITYHCKNSIAYMDEETGNLKKAVVLQGSNDVEFRAEGNGRFTFTVIEDGCSRKTNE
WGKTVIEYRTNKPSRLPFLDIAPLDIGGADQEFRLDVGPVCFK
NT seq 4092 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctcagctttgtggatacacggattttgttgctgcttgcagtaacttcatgcctagca
accagtcaatatgtaaatgaggcaacggaagtacggaggggtccaagaggagatagaggg
ccacgaggagaaaggggtccagcaggtccaccaggcatagatggtgaagatggtccacca
ggtcctccagggccccctggacctcctggccttggtggaaactttgctgctcaatatgac
atgtccaaatcagctgatatgggccctggacctatgggattaatgggacctagaggccca
cctggaaccaatggacctcctgggtctcctggcttccaaggacctccaggtgaaccgggt
gaacctggtcaaacaggacctcaaggttctcgtggtccaatgggtcctcctggaaaatct
ggtgaagatggccatcctggaaaacctggaagatctggagagagaggtgttcctggacct
cagggtgctcgtggctttcctggaactcctggtctgcctggattcaaaggaataagggga
cacaatggtttggatggtcgcaaaggagaacctggatctgccggtaacaagggtgaacct
ggtgcccctggcgaaaatggtaccccaggacaatctggagctcgtggtcttcctggtgaa
agaggaagaattggtggtcctggtcctgttggtgctcgtggcagtgatggaagcgctggc
cctgttggtcctgctggtcctattggtgctgctgggccttctggattccctggtgctcct
ggagccaagggtgaaatcggttctgctggaaatgttggcccaagtggacctgctggtccc
cgtggtgatattggactccctggtgctgctggacctgttggccctgctggtaaccctggt
accaatgggcttgctggtgctaaaggtgctgctggtcttcctggtgtgtctggtgctccc
ggcctgcctggtcctcgtggtatacctggtccaacaggtccctctggcgcagctggtgca
agaggacttgctggtgaacctggtccccctggatccaagggagagactggtagcaagggt
gagcctggtgttgctggccctactggcccagctggtccatctggtgaggaaggcaaaaaa
ggctccaatggtgaacctggctcatctggtctaccaggatctgcaggtttaagaggtgtt
cctggatctcgtggtctcccaggatctgatggcagagctggtggtttaggcccagctggc
agtcgtggtgctactggtcctgctggtgctaaaggtcccagtggagactcaggtcgtcct
ggtgagcctggactcatgggtgcaagaggcctcccgggacagtctggaagcccaggccca
gctgggaaagaaggtccttctggtccagctggacctgatggtcgccctggcccaaccggc
ccagctggtccacgaggtgaacctggaaatatcggattcccaggaccaaaaggtccaaat
ggtgaacctggcaaacctggtgacagaggcagtgtaggtctgactggtccacagggtgct
cctggtcctgatggaaacaatggagctcaaggtgcacctggtctcagtggcaatgcaggt
ccaaaaggtgacactggtccagctggtgctcctggcttccaaggtcttcctggtccctct
ggttcagttggtgaagctggcaaaccaggtgaaaggggcgctcatggtgactttggtctt
cctggtcctgctggctcaagaggtgaacgtggtgcaccaggtgaaagcggtgctgctggt
cctgcaggccctctgggaagccgtggcccatcaggttcaccaggtgctgatggtaataag
ggtgaacctggatctgtcggtgcacttggtagtgcaggcccatctggtcccagtggagtt
catggtgagagaggtgctgctggtagcccaggtggcaaaggtgaaaagggtccatctggc
ttcagaggagatcctggagcatcaggaagagatggtggacggggagcccctggcgctatt
ggtgccccaggacctgctggtgctactggcgaaagaggcgaaggtggttctgctggaccc
gccggacctgctggagctcgtggatcccctggtgagcgtggtgaagccgggcctgctggt
cctcctggatttgctggtccttctggtgcagctggtcagacaggtgttaaaggagaaaga
ggacagagaggtcctaagggtgattcaggtccccaaggtgctattggtgctgtcggtagc
gctggtcctgctggccctgttggtcaagctggtcaagctggagcccgtggtgatggtggt
ccacctggacccaatggttttcctgggaatgctggcagacctggacctcctggccctgct
ggtatcactggtccatctggtccccctggtcctgctggcaaagagggaattcgaggccca
cgtggtgatactggcccattaggtcgtactggtgaaactggcattgctggaccccctggt
ttcagtggagagaaaggcccatcaggagaagctggtgctgctggtgctcctggctcctca
ggtccccaaggtatccttggagcacctggtatccttggtcttcctggctcaagaggagaa
cgtggtcttccaggcttgtctggagcacttggtgaacatggacctgttggcatttctggt
ccctcaggtgcccgtggcccatctggtcccattggttcctctggtgtaaatggtgctcct
ggtgaagctggacgtgatggaaatccaggtaacgatggtcctcctggccgtgatggttcc
cctggttacaagggtgaacgtggtgctcctggcaacaccggtcctgctggtagtcttggt
gctcctggtcctcatggctctgttggtcctgttggcaaatctggaaatcgtggtgaacgt
ggtcctgctggagttactggccctagcggtcctgctggttcaagaggtcctgctggccca
caaggtgcacgtggtgagaaaggtgttgctggtgacaagggtgccagaggcttgccaggt
ttcaaaggacataatggacttcagggactgcctggtatctctggtcatcacggagaacaa
ggttcctctggtgttactggtcccgctggcccaaggggtccttccggtccttctggccct
gctgggaaagatggtcgcaatggtctgcctggagctgttggccctgctggtgtgcgagga
tctcatggtagccaaggaccatctggtccaccaggaccacctggtcttcctggcccacct
ggccccaatggtggtggttatgaaattggctacgacatggaatattatcgtgcagatcag
ccatctctgagacccaaggactacgaagttgatgccactctgaaaaccctgaacaatcag
attgagaccctcttgactccagaaggctctaagaagaatccagctcgcacttgccgtgac
ttaaaactcagtcatcctgattggaacaatggtttctactggattgatcctaatcaaggc
tgcacaatggatgctattaatgcatattgcgatttctccactggtgagagttgtatctct
gctaatcctggaaacttcccagccaagaactggtacattggcaagcaacctgatgagagg
aaacttgtttggtttggagaaactatcaatggtggtactcagtttgaatataatgcagaa
ggtatgtctaccaaggacatggctacccaacttgctttcctgaggctactggctaaccat
gcttcccagaacattacttaccattgcaagaacagcattgcttatatggatgaggaaaca
ggcaatcttaagaaggctgtggtgctacagggctccaatgatgttgaattccgagctgaa
ggcaatggccggtttactttcactgttatcgaagatggctgctctagaaagaccaatgaa
tggggcaaaacagtgattgaatacagaacaaacaagccttctcgtttgcccttccttgac
attgcacctttggacattggtggtgctgaccaagaattccgtttggacgttggccccgtc
tgtttcaaatga

DBGET integrated database retrieval system