Entry |
|
Symbol |
COL1A2
|
Name |
(RefSeq) collagen alpha-2(I) chain
|
KO |
|
Organism |
nss Notechis scutatus (mainland tiger snake)
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:nss00001]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
113417338 (COL1A2)
09140 Cellular Processes
09144 Cellular community - eukaryotes
04510 Focal adhesion
113417338 (COL1A2)
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
113417338 (COL1A2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:nss00536]
113417338 (COL1A2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:nss00536]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
113417338 (COL1A2)
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
Unknown
|
AA seq |
1363 aa
MLSFVDTRILLLLAVTSCLATSQYVNEATEVRRGPRGDRGPRGERGPAGPPGIDGEDGPP
GPPGPPGPPGLGGNFAAQYDMSKSADMGPGPMGLMGPRGPPGTNGPPGSPGFQGPPGEPG
EPGQTGPQGSRGPMGPPGKSGEDGHPGKPGRSGERGVPGPQGARGFPGTPGLPGFKGIRG
HNGLDGRKGEPGSAGNKGEPGAPGENGTPGQSGARGLPGERGRIGGPGPVGARGSDGSAG
PVGPAGPIGAAGPSGFPGAPGAKGEIGSAGNVGPSGPAGPRGDIGLPGAAGPVGPAGNPG
TNGLAGAKGAAGLPGVSGAPGLPGPRGIPGPTGPSGAAGARGLAGEPGPPGSKGETGSKG
EPGVAGPTGPAGPSGEEGKKGSNGEPGSSGLPGSAGLRGVPGSRGLPGSDGRAGGLGPAG
SRGATGPAGAKGPSGDSGRPGEPGLMGARGLPGQSGSPGPAGKEGPSGPAGPDGRPGPTG
PAGPRGEPGNIGFPGPKGPNGEPGKPGDRGSVGLTGPQGAPGPDGNNGAQGAPGLSGNAG
PKGDTGPAGAPGFQGLPGPSGSVGEAGKPGERGAHGDFGLPGPAGSRGERGAPGESGAAG
PAGPLGSRGPSGSPGADGNKGEPGSVGALGSAGPSGPSGVHGERGAAGSPGGKGEKGPSG
FRGDPGASGRDGGRGAPGAIGAPGPAGATGERGEGGSAGPAGPAGARGSPGERGEAGPAG
PPGFAGPSGAAGQTGVKGERGQRGPKGDSGPQGAIGAVGSAGPAGPVGQAGQAGARGDGG
PPGPNGFPGNAGRPGPPGPAGITGPSGPPGPAGKEGIRGPRGDTGPLGRTGETGIAGPPG
FSGEKGPSGEAGAAGAPGSSGPQGILGAPGILGLPGSRGERGLPGLSGALGEHGPVGISG
PSGARGPSGPIGSSGVNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGSPGYKGERGAPGNTGPAGSLG
APGPHGSVGPVGKSGNRGERGPAGVTGPSGPAGSRGPAGPQGARGEKGVAGDKGARGLPG
FKGHNGLQGLPGISGHHGEQGSSGVTGPAGPRGPSGPSGPAGKDGRNGLPGAVGPAGVRG
SHGSQGPSGPPGPPGLPGPPGPNGGGYEIGYDMEYYRADQPSLRPKDYEVDATLKTLNNQ
IETLLTPEGSKKNPARTCRDLKLSHPDWNNGFYWIDPNQGCTMDAINAYCDFSTGESCIS
ANPGNFPAKNWYIGKQPDERKLVWFGETINGGTQFEYNAEGMSTKDMATQLAFLRLLANH
ASQNITYHCKNSIAYMDEETGNLKKAVVLQGSNDVEFRAEGNGRFTFTVIEDGCSRKTNE
WGKTVIEYRTNKPSRLPFLDIAPLDIGGADQEFRLDVGPVCFK |
NT seq |
4092 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgctcagctttgtggatacacggattttgttgctgcttgcagtaacttcatgcctagca
accagtcaatatgtaaatgaggcaacggaagtacggaggggtccaagaggagatagaggg
ccacgaggagaaaggggtccagcaggtccaccaggcatagatggtgaagatggtccacca
ggtcctccagggccccctggacctcctggccttggtggaaactttgctgctcaatatgac
atgtccaaatcagctgatatgggccctggacctatgggattaatgggacctagaggccca
cctggaaccaatggacctcctgggtctcctggcttccaaggacctccaggtgaaccgggt
gaacctggtcaaacaggacctcaaggttctcgtggtccaatgggtcctcctggaaaatct
ggtgaagatggccatcctggaaaacctggaagatctggagagagaggtgttcctggacct
cagggtgctcgtggctttcctggaactcctggtctgcctggattcaaaggaataagggga
cacaatggtttggatggtcgcaaaggagaacctggatctgccggtaacaagggtgaacct
ggtgcccctggcgaaaatggtaccccaggacaatctggagctcgtggtcttcctggtgaa
agaggaagaattggtggtcctggtcctgttggtgctcgtggcagtgatggaagcgctggc
cctgttggtcctgctggtcctattggtgctgctgggccttctggattccctggtgctcct
ggagccaagggtgaaatcggttctgctggaaatgttggcccaagtggacctgctggtccc
cgtggtgatattggactccctggtgctgctggacctgttggccctgctggtaaccctggt
accaatgggcttgctggtgctaaaggtgctgctggtcttcctggtgtgtctggtgctccc
ggcctgcctggtcctcgtggtatacctggtccaacaggtccctctggcgcagctggtgca
agaggacttgctggtgaacctggtccccctggatccaagggagagactggtagcaagggt
gagcctggtgttgctggccctactggcccagctggtccatctggtgaggaaggcaaaaaa
ggctccaatggtgaacctggctcatctggtctaccaggatctgcaggtttaagaggtgtt
cctggatctcgtggtctcccaggatctgatggcagagctggtggtttaggcccagctggc
agtcgtggtgctactggtcctgctggtgctaaaggtcccagtggagactcaggtcgtcct
ggtgagcctggactcatgggtgcaagaggcctcccgggacagtctggaagcccaggccca
gctgggaaagaaggtccttctggtccagctggacctgatggtcgccctggcccaaccggc
ccagctggtccacgaggtgaacctggaaatatcggattcccaggaccaaaaggtccaaat
ggtgaacctggcaaacctggtgacagaggcagtgtaggtctgactggtccacagggtgct
cctggtcctgatggaaacaatggagctcaaggtgcacctggtctcagtggcaatgcaggt
ccaaaaggtgacactggtccagctggtgctcctggcttccaaggtcttcctggtccctct
ggttcagttggtgaagctggcaaaccaggtgaaaggggcgctcatggtgactttggtctt
cctggtcctgctggctcaagaggtgaacgtggtgcaccaggtgaaagcggtgctgctggt
cctgcaggccctctgggaagccgtggcccatcaggttcaccaggtgctgatggtaataag
ggtgaacctggatctgtcggtgcacttggtagtgcaggcccatctggtcccagtggagtt
catggtgagagaggtgctgctggtagcccaggtggcaaaggtgaaaagggtccatctggc
ttcagaggagatcctggagcatcaggaagagatggtggacggggagcccctggcgctatt
ggtgccccaggacctgctggtgctactggcgaaagaggcgaaggtggttctgctggaccc
gccggacctgctggagctcgtggatcccctggtgagcgtggtgaagccgggcctgctggt
cctcctggatttgctggtccttctggtgcagctggtcagacaggtgttaaaggagaaaga
ggacagagaggtcctaagggtgattcaggtccccaaggtgctattggtgctgtcggtagc
gctggtcctgctggccctgttggtcaagctggtcaagctggagcccgtggtgatggtggt
ccacctggacccaatggttttcctgggaatgctggcagacctggacctcctggccctgct
ggtatcactggtccatctggtccccctggtcctgctggcaaagagggaattcgaggccca
cgtggtgatactggcccattaggtcgtactggtgaaactggcattgctggaccccctggt
ttcagtggagagaaaggcccatcaggagaagctggtgctgctggtgctcctggctcctca
ggtccccaaggtatccttggagcacctggtatccttggtcttcctggctcaagaggagaa
cgtggtcttccaggcttgtctggagcacttggtgaacatggacctgttggcatttctggt
ccctcaggtgcccgtggcccatctggtcccattggttcctctggtgtaaatggtgctcct
ggtgaagctggacgtgatggaaatccaggtaacgatggtcctcctggccgtgatggttcc
cctggttacaagggtgaacgtggtgctcctggcaacaccggtcctgctggtagtcttggt
gctcctggtcctcatggctctgttggtcctgttggcaaatctggaaatcgtggtgaacgt
ggtcctgctggagttactggccctagcggtcctgctggttcaagaggtcctgctggccca
caaggtgcacgtggtgagaaaggtgttgctggtgacaagggtgccagaggcttgccaggt
ttcaaaggacataatggacttcagggactgcctggtatctctggtcatcacggagaacaa
ggttcctctggtgttactggtcccgctggcccaaggggtccttccggtccttctggccct
gctgggaaagatggtcgcaatggtctgcctggagctgttggccctgctggtgtgcgagga
tctcatggtagccaaggaccatctggtccaccaggaccacctggtcttcctggcccacct
ggccccaatggtggtggttatgaaattggctacgacatggaatattatcgtgcagatcag
ccatctctgagacccaaggactacgaagttgatgccactctgaaaaccctgaacaatcag
attgagaccctcttgactccagaaggctctaagaagaatccagctcgcacttgccgtgac
ttaaaactcagtcatcctgattggaacaatggtttctactggattgatcctaatcaaggc
tgcacaatggatgctattaatgcatattgcgatttctccactggtgagagttgtatctct
gctaatcctggaaacttcccagccaagaactggtacattggcaagcaacctgatgagagg
aaacttgtttggtttggagaaactatcaatggtggtactcagtttgaatataatgcagaa
ggtatgtctaccaaggacatggctacccaacttgctttcctgaggctactggctaaccat
gcttcccagaacattacttaccattgcaagaacagcattgcttatatggatgaggaaaca
ggcaatcttaagaaggctgtggtgctacagggctccaatgatgttgaattccgagctgaa
ggcaatggccggtttactttcactgttatcgaagatggctgctctagaaagaccaatgaa
tggggcaaaacagtgattgaatacagaacaaacaagccttctcgtttgcccttccttgac
attgcacctttggacattggtggtgctgaccaagaattccgtttggacgttggccccgtc
tgtttcaaatga |