| Entry |
|
| Name |
(RefSeq) ABC transporter C family member 13 isoform X1
|
| KO |
| K05674 | ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 10 |
|
| Organism |
nsy Nicotiana sylvestris (wood tobacco)
|
| Pathway |
|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:nsy00001]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
104250068
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:nsy02000]
104250068
Transporters [BR:nsy02000]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCC (CFTR/MRP) subfamily
ABCC1, 2, 3, 4, 5, 6, 10, 11, 12, 13 subgroups
104250068
|
| SSDB |
|
| Motif |
|
| Other DBs |
|
| LinkDB |
|
| Position |
3:complement(211743491..211778249)
|
| AA seq |
1463 aa
MELMKRVCPESPYVWDSNGVSQCFSNLVLGFGANIVTIVLVAAIGAGKRSAKDGKRVPRL
LTVSLHLLPALGASMALFDMIVLIKKRLDSFPEPYHEWLFRFSQFSVWATILLVLKCGYC
YVICCNPIICVWWMLKFILLVPHLQRDFSSLQVLLCLKESCSALLDVSFAVLINIIRTTA
RPQNRSSMEELLLPSKMDTAQGRFGGVPNGIICNCWDLIGFKSIKPVMECGVKRQLDFED
LLELPIDMDPSSCHTLLLTSWKAQERNEYSHPSLIKAICLAYGWPYFRLGLLKVLNDCLG
FAGPLLLNKLIHFLQQGSRDYDGYILALSLGLSSVLKSFLDTQYTFHLSKLKLKLRSSIM
SLIYQKCLSVSLAERSKFSEGEIQTFMSVDADRVANLCNSFHDIWSLPLQIGIALYLLYK
QVKFAFLSGIAITILLIPVNKWIANVIANATKSMMEQKDERVRMTAEILTHIRTLKMYSW
ELLFASWLMKTRSEEVKYLSTRKYLDSWCVFFWATTPTLFSLFTFGLYTLMGHQLDAATV
FTCVALFNNLISPLNSFPWVINGLIDAVISSRRLCKYLSCFERETNMEQPSNCSFFSSSD
KQTELQDVAVVIRDASCTWSCHDQKEMDLVLDPVNLLIPKGLVVAVVGEVGSGKSSLLNL
ILGETRLINGSVYQTGSIAYVPQVAWILSGTIRDNILFGRDYDPRRYSEVLQACSLDFDI
SRMMGGDMASVGEKGFNLSGGQRARLALARAIYHDAEIYLLDDILSAVDVHVGFSILHNA
ILGPLMSQHTRILCTHNFQAISAADLVIVMDKGRVQWVGNPTEFSCSSDVAFSTIDELST
CSEVQRQDKKSNISSEIQQKVSEGDFICTPGGNQVTDESEARKEGKVELTVYKSYAAFVG
WFITALTCLSAVLMQASRNGNDMWLSYWVDASGRNQKAYSTNFYLATLSLFCLANSLLTL
VRAFSFAFGGLRAAVKVHDRLLEKLISAPISFFDLNPTGRIINRLSSDLYTIDDSLPFIL
NILLANFVGLLGIAVVLSYVQVMFLFLLMPFWYIYRKLQLYYRSTSRELRRLDSVSRSPI
YASFTETLDGSSTIRGFKCEFFFLLKFNQHLMTYQRTSYSEVTASLWLSLRLQLLAAFIV
SFIAVMAVIGSHGYLPISLGTPGLIGLALSYAAPIVSLLGSFLTSFTETEKEMVSIERIL
QYMDVPQEEDVGGHPLHPQWPHQGEINFVNVTLKYKPQLPPALCGVSFDIAGGTQVGIIG
RTGAGKSSILNALFRLYPTCGGSIMVDGVNIAGVSVRCLRSSFAVVPQAPFLFEGSIRKN
LDPLQENMDFEIWNVLEKCHIKEEVEAVGGLDVQLKGSGTAFSVGQKQLICLARALLKSC
KVLCLDECTANVDTETTSKLQKTLATECQGTTVITIAHRISTVLNVDNILILDRGFLVEQ
GNPRILLEDQSSIFFSFAKASNV |
| NT seq |
4392 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggaattgatgaagcgcgtctgccctgagtctccatatgtatgggatagcaacggagtt
tcacagtgtttcagcaacttagttctgggctttggagctaatatcgtgactattgtcctt
gttgctgccatcggagcaggtaaaaggagtgccaaagatggaaaaagggtaccccgtcta
ctaacggtttccttacatcttctacctgcattgggtgcaagcatggcactctttgacatg
attgtgctaatcaagaaaagacttgacagttttcctgaaccatatcatgaatggctcttc
agattctcgcaattctcagtttgggccaccattctgctggtccttaagtgtgggtactgc
tatgtcatttgctgcaaccccatcatatgcgtttggtggatgttgaaatttattcttttg
gtaccccatttacaaagagatttttcttctcttcaggttctactatgtcttaaagaaagc
tgcagtgctttattggatgtgagttttgcagttttgattaatattatcagaactacagca
cggcctcagaatagaagttccatggaggaattgcttctgccaagtaaaatggacactgct
caaggtcgcttcggaggagtgccaaatggaattatatgcaactgctgggacctgatagga
ttcaaatctatcaaacctgtaatggaatgcggagtcaaaaggcagcttgactttgaagat
ttgcttgagctacccattgatatggatccttcatcctgccacactttgctgttaactagc
tggaaagctcaagaaagaaatgaatattctcatccttcactaatcaaagcaatttgtctt
gcatatggatggccatatttccgtcttggtcttttgaaggtgcttaatgactgtcttggt
tttgcgggtccattgctactcaataagttgattcactttcttcagcaaggttcaagagac
tatgatggctatattcttgcactatccttgggcctttcttctgtcttgaaatcgtttctt
gatacacaatatacttttcatctttcaaagctcaagctcaagctaagatccagtatcatg
agtcttatttaccaaaagtgtctttctgttagtttggccgagagatcaaaattttctgaa
ggagaaattcagacatttatgtctgtggatgctgatcgagttgcgaacctgtgtaatagt
tttcatgatatatggagtttgccattgcagattggaattgctctttatctgctgtataaa
caagtcaagtttgcatttctgtctggaatagctataacaattctgctaataccagttaat
aagtggattgcaaatgtgattgcaaatgctacaaagagcatgatggagcagaaggatgaa
agggttagaatgacagcggagattttaacacatatacgtactttgaaaatgtatagttgg
gagctactttttgcaagttggctgatgaagacgagatcggaagaagtgaaatacctatca
actaggaaatacttggattcatggtgcgttttcttctgggcaacaacaccaacacttttc
tcgttgttcacatttggactctatactttgatgggccatcaacttgatgcagcaacggtt
ttcacttgtgtcgcactgtttaataacttgatttctccattaaactcattcccttgggtc
atcaatgggttaattgatgctgtaatatcttccaggaggttatgcaagtatctatcctgt
tttgagcgggagacaaacatggaacaaccaagcaattgttcgtttttctcttcctctgat
aagcagaccgaattgcaagatgtggctgttgtcatccgtgatgcatcttgcacatggtcg
tgccatgaccagaaggaaatggatttggttttggatcctgttaatcttcttattccgaaa
ggtttagtggttgcagtagttggagaggttgggtctggtaaatcatccttgttgaatttg
attttgggggagacgaggttaattaacggatctgtgtaccagactggttcaattgcatat
gtaccgcaggttgcttggattctctcaggaaccatacgtgataacattttgtttgggaga
gactatgacccaaggagatactcggaagtattacaagcttgttccttggacttcgatatt
tccagaatgatgggaggtgatatggcctctgttggagaaaaaggatttaacttatctggc
ggacagagagctcgtcttgctcttgccagagccatctatcatgatgcggaaatttaccta
cttgatgatatcctcagtgcagttgatgtacatgttggtttttcaattttacataatgca
attctcggccctctaatgagtcagcatacgcgcatcctttgcacacataactttcaggca
atatctgccgcagacttggtaattgtgatggataaaggacgtgtgcagtgggtggggaat
ccaactgagttttcttgttcttctgatgtagcattctcaacaatcgatgaacttagcact
tgttctgaagttcaacggcaggataaaaaatcaaatatttctagtgagatccagcagaaa
gtttcagagggcgattttatatgtactcctggtggaaatcaagtgactgatgaatcagag
gctcggaaagaaggaaaagtcgaactcactgtatacaagagctatgctgcttttgttggt
tggttcatcacagctttaacatgtctctctgcggttttgatgcaagcttctcgtaatgga
aatgatatgtggctctcgtattgggttgatgcaagtggaagaaaccagaaagcatattca
acaaacttttacctggctacactctctcttttctgtctggcaaattccttgctaacttta
gtgagggcattttcatttgcatttggtgggctacgcgccgctgttaaggtgcatgatcga
ttattagagaagcttataagtgcacctattagcttctttgatctgaacccaactgggaga
attataaacagattgtcttcagatctctacacaattgacgattctcttccctttattctc
aatattctgctagctaattttgttggccttttggggattgctgtagttctttcatacgtg
caggtcatgtttttgtttctcttaatgcctttctggtacatctacagaaaattacagctg
tactataggtcaacatcacgtgagttgcgtagacttgacagtgtatctcggtcacctata
tatgcatcttttacggagactctggatggatcatcaacaataagaggctttaaatgtgag
tttttttttctgctcaaatttaatcagcatctgatgacatatcagaggacttcgtattca
gaagtaacagcgagtttgtggctctccctgcgccttcagttgctcgcagcttttatcgtg
tcattcatcgcggtgatggcagttattggttctcatggatacctccccatcagtttaggt
acgccagggttgattggcttggctctctcatatgcggctccaattgtatctttacttgga
agcttcttaacaagtttcacggaaacagagaaagagatggtttctattgagaggatccta
cagtatatggatgttcctcaagaagaagatgttggaggacatcccttacatccacaatgg
ccacatcaaggagagatcaattttgtcaatgtgactcttaagtacaagccacaactgcct
cctgctttgtgtggtgtttctttcgacattgctgggggaacacaggttggtataattgga
agaacaggtgcaggaaaatcaagtattttgaacgccctatttcggctctacccaacatgt
ggaggatcaatcatggttgatggcgtaaacattgctggtgtttctgtcagatgtctccgt
tcaagcttcgctgttgttcctcaggctccattcttgtttgaaggatcgataaggaaaaat
ctagatccattgcaagagaacatggattttgagatctggaatgtcctagaaaaatgccac
atcaaggaggaggtagaagcagtaggtggactggatgttcaactgaaagggtctggaaca
gcattctccgttggtcaaaagcagctaatctgccttgcacgtgctctcctcaagtcttgt
aaggtactttgcttggatgaatgcacggcaaatgtggacactgaaacaacttcaaaacta
cagaaaactctagccactgaatgccagggaacaacggttatcacaattgcccatcgcatt
tccacagttttgaacgtggacaatatcctgattttggatagagggtttctggttgaacag
ggtaacccgcggattcttctagaagatcagtcatccatatttttcagcttcgccaaagct
tcaaatgtgtga |