Candidatus Nitrosacidococcus tergens: NSCAC_1348
Help
Entry
NSCAC_1348 CDS
T06962
Name
(GenBank) PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein
Organism
ntg
Candidatus Nitrosacidococcus tergens
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_19
TPR_16
TPR_14
TPR_2
TPR_CcmH_CycH
TPR_8
TPR_1
TPR_6
TPR_17
TPR_12
TPR_9
ANAPC3
TPR_11
ARM_TT21_N
ARM_TT21_5th
TPR_Slam
TPR_21
ARM_TT21
TPR_15
ARM_TT21_C
TPR_20
ARM_TT21_2nd
PknG_TPR
HAT_PRP39_C
Fis1_TPR_C
ChAPs
TPR_10
HEAT_Nup120
Alkyl_sulf_dimr
HrpB1_HrpK
NatA_aux_su
TPR_NUP160_120_M
DUF7017
HAT_PRP39_N
NatB_MDM20
ATP13
DUF4919
Suf
BTAD
TPPII_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAB1276791
UniProt:
A0A7G1QAZ7
LinkDB
All DBs
Position
1:1375225..1378011
Genome browser
AA seq
928 aa
AA seq
DB search
MVTFRINRKLNAVLLLSLFLISCSKDFTPEEYIARAKEYQEKQDISSAIIELKNALQKSP
DNAEARLLLGKAYIQTSNGAASEKELEKAIKFGLPSQDGVIPLTRALFLQGKFQEAIDSI
AKYPDLPKNIEEELLPLQGEAYLGLNNLEEAKRYYNAALKINPNNRDANLGKAKIEAAQG
EFDSARNGINKVLENSPEFAPAWNLLGNLERYQGNAEAAEQAYGKAIEFRKNNEDDRLNR
ALVRIFLKNYEGAAQDLDILKKKNPNHPTVNYGYGLLNFEQKKYPDAEEDFQKVLNVQEY
TPALFYLGLTQYRLGKIEQAEKNLAQFVAQSPDNSTGAKLLGEIRLSKGDYNGAKSILSK
VLTKTPNDSQALALMGDVALKQGNPKESAEYFRRVTVENPESALAYSKLGLSLDLLGKHN
EGTAALEKARDLNNQTPQADLLVILSYLRAHEFDKAIENAQLMRQKYPENPTPFTLMGGA
YLGKGDNDKAKASFEEALKIAPGDPNASHQLASLAILKNNLEEATTLYKKVLKEYPNDLQ
TMLRLADLEQKKGQVKKTKKLIEQAIETNPKALAPRMILADYYIKAKQPKQALETLADVQ
VDNSENPALVALTGKAQLAAGQTGTALDLFKKLVRLQPESAAAHYELAKAYNQMGQATEV
KKSLKNTLDLDPHYLAAQLQMAYIAMSEEKMDKANEYLQSAEKDYPDNREVINLRAGFAI
KENQPEKAIEIYQQAQNRFPDSNYWPIQLSQLYWRTNQQQKSLTTLEAWLKKHPDDFSAR
LILANNYLISGKNDQARTSFTKLHDQAPEDIIVLNNLAWLMRDENPKRALGYAQQALTLD
PENPEVMDTLGTLLLKQGEPAKALKLLEKAAEKLPKNQTIQFHKVQALIQSKRTDTMGAK
KLLRDLLSSDDSFLERDEAESLLEKLGS
NT seq
2787 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttacatttcgtattaataggaaattaaatgctgttctattactatcgcttttctta
ataagctgtagtaaagactttactcctgaagaatatattgctcgtgctaaggagtatcaa
gaaaaacaagacataagttcagcaattatagagctaaaaaatgcattacaaaaatctcca
gataacgctgaggcacgtctcttgcttggaaaagcttatatacaaacgagtaatggagca
gctagtgagaaggagctagaaaaagcaattaaatttggattgccttcacaggatggagtt
attcctctgactcgtgctctatttttgcaaggtaagtttcaggaagcgatagatagtatt
gccaaatatccagacttacctaaaaatattgaagaggagttattacctctacaaggagag
gcttacttagggttaaataatttagaagaagcaaagagatattataatgctgcacttaaa
attaatcctaataatcgagatgctaatcttgggaaagctaaaatagaagctgctcaaggt
gagtttgatagtgcacgtaatggaataaataaagtcttagaaaattcccctgaatttgct
cccgcatggaatttattaggaaacctagaaaggtatcaaggaaatgcagaagctgctgaa
caagcttatggaaaagctattgaattcaggaaaaacaatgaggatgatcgtttaaataga
gcactcgtacgtatttttcttaaaaactatgaaggtgcagcacaagatcttgacatatta
aaaaagaaaaaccctaatcatcctactgttaattatggttatggcttattaaattttgaa
caaaaaaaataccctgatgctgaggaggattttcaaaaagtacttaatgttcaagaatac
actcctgctcttttttatttaggattaacccaatataggttaggtaaaatagaacaggca
gaaaaaaacttagctcagtttgtagctcaatcaccagataatagcactggtgcaaaacta
ttaggagagatacgccttagtaaaggtgattacaatggtgctaaatcaatactgagcaaa
gtactcactaaaacacctaatgattcacaggcacttgctttaatgggagatgttgcttta
aagcaaggtaacccaaaagaaagtgcagagtatttccgtagagtaaccgttgaaaacccg
gaatcagctcttgcttattcaaagctagggttaagcttagatttattaggaaagcataat
gaaggtactgcagcactagagaaagcaagggatttaaataaccaaacacctcaagcagat
ctgttagtgattctaagttatttacgtgctcatgagtttgataaagctatagaaaatgca
cagttaatgcgccaaaaatatccagaaaaccctacgccattcaccctaatgggaggagca
tatcttggaaaaggagataacgacaaagcaaaagcctcttttgaagaagcactaaaaatt
gcccctggagatcctaatgcgtcgcatcaattagcaagcctggcgattttaaagaataat
cttgaagaggcaactactctttataagaaagtgcttaaagaatatcctaatgacttacaa
actatgctcaggcttgcagatctggaacagaaaaaaggacaggttaaaaaaactaagaag
cttattgagcaagctatagaaactaaccctaaggcactagcacctcgaatgattttggct
gattattatattaaagcaaaacagccaaaacaagctctagaaacccttgctgatgtacag
gtagataattctgaaaatcctgcactagttgcactgactggaaaagcacagcttgcagca
ggacaaactggtaccgcattggatttatttaaaaaattagttcgattacaacctgaatca
gcggcagcacactatgagcttgctaaagcatataaccaaatggggcaagctactgaagtt
aaaaaatctcttaaaaatacgctagatttagaccctcactacctagctgctcagttacag
atggcctatattgcaatgagcgaagagaaaatggataaagctaatgaatacctacaaagt
gcggaaaaagactatcctgataatcgagaagtcatcaatttaagggcaggctttgctatc
aaagaaaatcagcctgaaaaagcaatagaaatttatcagcaagcacaaaatcgctttcct
gatagcaactattggccaatacagctttcccaactttattggcgaactaatcaacagcaa
aaaagcctaactactctagaggcatggctaaaaaaacatcctgatgatttcagtgcaaga
cttatattagctaataattaccttatctctggtaaaaatgatcaagctagaacatcgttt
actaaactccatgatcaagcaccagaagatatcattgtacttaacaatttagcttggcta
atgcgagatgagaatccaaagagagcacttggctatgcacaacaggccttaactttagat
ccagaaaatcctgaagttatggatactcttggtacactactgttaaaacaaggtgagcca
gcaaaagccttaaagttactggaaaaagcagcagaaaaactacctaagaatcagacaatt
caatttcataaggttcaagcacttatacagagtaaacgtactgatactatgggtgctaaa
aagctactgcgggatttactttcttctgatgattcgtttttagagcgcgatgaagcagaa
tctctattagagaaattaggaagttaa
DBGET
integrated database retrieval system