Nicotiana tomentosiformis: 104088084
Help
Entry
104088084 CDS
T05025
Name
(RefSeq) probable manganese-transporting ATPase PDR2
KO
K14950
manganese-transporting P-type ATPase [EC:7.2.2.-]
Organism
nto
Nicotiana tomentosiformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nto00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
nto02000
]
104088084
Transporters [BR:
nto02000
]
Other transporters
Primary active transporters [TC:
3
]
104088084
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
2TM_P5A-ATPase
E1-E2_ATPase
Hydrolase
Cation_ATPase
Hydrolase_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104088084
NCBI-ProteinID:
XP_009590998
LinkDB
All DBs
Position
1:39877042..39901882
Genome browser
AA seq
1177 aa
AA seq
DB search
MTRFQVGGKVVESVDLLKKRHWSWRFDVWPFFILYGVWLLTIVPSLDIADGFIVLGALVA
FHVLVFLFTVWSVDFKRFVHYSKVDDIHQADSCKVTPAKFSGSKEVVPLHFRKLAGSSSS
EDLEEIYFDFRKQRYIYSKEKGTFSKLSYPSKETFGYYLKNTGHGTEAKIVAATEKWGRN
VFEYPQPTFQKLMKEQVMEPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYSLFTLFMLFMFESTMAKSRL
KTLSELRRVRVDTQTLMVYRCGKWVKLSGTELLPGDVVSIGRSVGQNGEDKSVPADMLLL
AGTAIVNEAILTGESTPQWKVSIMARGTGETLSARRDKAHVLFGGTKILQHTADKTYPMK
TPDGGCLAVVLRTGFETSQGKLMRTILFSTERVTANSWESGLFILFLVVFALIAAGYVLK
KGLEDPTRSKYKLFLSCSLIITSVIPPELPMELSIAVNTSLIALARRGIFCTEPFRIPFA
GKVDICCFDKTGTLTSDDMEFSGVGGLTDSEDLEKEMTKVPTRTQEILASCHSLVFVDNK
LVGDPLEKAALKGIDWGYKSDEKAMPKKGGGDAVQIVQRHHFASHLKRMAVVVRVQEQFF
AFVKGAPETIQERLIDVPPSYVPTYKKYTRQGSRVLALAFKSLPDMTVSEARSLERDMVE
SGLTFAGFAVFNCPIRGDSATVLTELKQSSHDLVMITGDQALTACHVAQQVHIISKPALI
LGRTKNKQGYDWVSPDETEIVSYSENEVEALSEAYDLCIGGECIEMLQQTSAVPKVVPYV
KVFARVAPEQKELILTTFKSVGRMTLMCGDGTNDVGALKQAHVGVALLNAIPPPKKEKSS
DGSSKNDTTKPAKAKKLKPATENGEGTSKSRATSSQATNRHLTPAEMQKQKLKKLMDELN
EGGGDGQAPIVKLGDASMASPFTAKHASVCPTTDIIRQGRSTLVTTLQMFKILGLNCLAT
AYVLSVMYLDGVKLGDVQATISGVFTAAFFLFISHARPLPTLSAERPHPNIFCAYVLLSL
LGQFAIHLLFLISSVNEASKYMPDECIEPDSNFHPNLVNTVSYMVGLMLQVATFAVNYMG
HPFNQSIPENKPFLYALLAAVGFFTAITSDLFRDLNDWLKLVPMPRGLRDKLLLWAFLTF
LVCYAWEKSLRWAFPGKMPAWKQRQRRLAANLEKKRN
NT seq
3534 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgcgattccaagtgggcgggaaagtggtggagagtgtggatttgctgaagaagaga
cactggtcttggcgtttcgatgtttggcccttctttattctctacggcgtttggctccta
actatagtacctagtttagacattgccgatggcttcatagttcttggtgcccttgttgcc
tttcatgttctcgtcttccttttcactgtttggtccgttgatttcaagcgctttgttcac
tattccaaggtggatgacatacatcaagcagattcttgtaaagtcactccagctaagttc
tctggaagtaaagaagtcgtgcctcttcactttcgaaagttggctggttcctcgtcctct
gaggatctggaggagatttattttgattttaggaagcaacggtacatctattcaaaggag
aaaggaactttcagcaaactttcgtatccttcaaaagagacatttggatactaccttaag
aatactggccatggaactgaagctaaaattgttgctgcaactgagaagtggggccggaac
gtgttcgaatatcctcagccaacatttcagaaattaatgaaagagcaggtcatggagcct
ttctttgtattccaggtcttttgtgtgggtttatggtgcttagatgaatactggtattac
agtttgttcactctctttatgctgtttatgtttgagtcaacaatggctaagagccggttg
aagaccctgtctgaattaagacgcgtaagagttgacacccagaccttgatggtgtatcgc
tgtggaaagtgggtgaaactctctggcactgaattgttacctggagatgttgtgtctatc
gggcgttctgttggtcaaaatggagaagacaagtccgtacctgctgacatgcttttgcta
gctggaactgctattgtgaatgaagctattttgacaggcgaatctactccacagtggaag
gtttcaatcatggctagaggaacaggggagacattgtctgctaggcgagataaagcccac
gtacttttcggtggaaccaaaattttgcagcatacggccgataagacctatccaatgaag
acccctgatggtggatgcttggctgttgttctacgaactgggtttgaaacaagtcaaggc
aaacttatgcggactattttattttcaacggagagggttactgctaacagctgggaaagt
gggctttttattcttttcttagtcgtatttgcattaatagcagccggctatgttcttaaa
aaggggctcgaggacccaacaagaagtaaatacaaactgtttctgagttgttcattgata
attacttctgttatccctcccgagctgccaatggagttatcaatagctgttaatacatct
ttaattgctctagcacgacgagggatattctgtacagaaccttttcggattccatttgct
gggaaggttgatatttgttgtttcgataagactggaaccttaacatccgatgacatggag
ttctcaggggttggtggattgactgacagtgaggacttagaaaaagaaatgactaaagtt
ccaactcgtacgcaggaaattcttgcttcttgccattctttggtttttgtggacaataag
ctggtgggtgatcctcttgagaaggccgcccttaaagggattgattggggatataaatca
gatgaaaaagccatgccaaaaaagggtggaggtgatgctgttcagattgtgcagcgacat
cattttgcatctcacttgaaaagaatggctgtagttgttcgtgttcaggagcaatttttt
gcttttgtcaagggtgcaccagagacaattcaggaaagactcattgatgtcccaccatcc
tacgtgccaacctacaagaaatacacccgtcaaggatcacgtgtattggctctggctttc
aagtctctgccagacatgacagttagtgaagccagaagcctggagagagatatggtggaa
agtgggcttacttttgctggttttgcggtgttcaattgccccatcagaggagactcggcc
actgtcttgactgaattaaaacaatcatctcatgacttggtcatgattactggtgatcaa
gctttgacagcttgccacgtggctcaacaagtacacattatctcaaaaccagcactgatt
ctgggacgtacaaaaaacaaacaaggatatgactgggtttctcctgatgagacagagata
gtcagctacagtgagaatgaagttgaagctttatcagaagcttacgatctctgtattgga
ggcgagtgcattgagatgttgcagcagacatctgctgtccccaaagttgttccttatgtg
aaggtatttgcaagagttgcccctgagcaaaaagaacttatattaaccacctttaagtca
gtgggaaggatgacgttgatgtgtggtgatgggactaatgatgttggagctctaaagcag
gcacatgtgggagtagctcttcttaatgcaatacctccccctaagaaggaaaaatcatct
gatggatcgtctaagaatgatactacaaaacctgccaaggcgaagaaacttaaacctgct
acagaaaatggagaaggcacttcaaaaagtagagctaccagcagccaagccactaatcgc
catcttacacctgcagagatgcagaagcagaagctcaagaaacttatggatgagcttaat
gagggaggaggtgatggtcaggcaccaattgtgaaacttggggatgcctcgatggcatcg
ccattcactgcaaagcatgcttcagtgtgccctaccactgacatcatccgtcaaggtcgt
agtaccctagtaaccactctgcagatgtttaagattcttggacttaactgccttgctact
gcctatgtcctgagtgtaatgtacttagatggtgtcaagttaggtgatgttcaggctaca
atcagtggggtcttcacagcagccttctttctatttatctcacatgctcggccccttcca
accctctcagccgaacgacctcatcccaatattttctgcgcctatgtcttgctctccctc
ctgggacaatttgctatccatctgcttttcttaatttcttctgttaacgaggctagcaag
tacatgcctgatgagtgcattgagccagactccaattttcatccaaaccttgtcaataca
gtttcatacatggtggggttgatgctacaggtagcaacctttgctgtgaactacatgggc
caccccttcaaccaaagcatacccgaaaacaagccattcttatacgcccttttggctgct
gtgggcttcttcacagctatcacctctgatttgtttagggacttaaatgactggttgaag
ttagttcctatgccaagaggtttgagagataagctgctgctttgggcattcctgacattt
ttggtctgctatgcctgggagaagtcattgaggtgggctttccctggtaagatgcctgcc
tggaagcaaaggcaacgtcgtcttgcagcaaatttagaaaagaagcgcaattag
DBGET
integrated database retrieval system
