Nicotiana tomentosiformis: 104093653
Help
Entry
104093653 CDS
T05025
Name
(RefSeq) pumilio homolog 1-like isoform X1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
nto
Nicotiana tomentosiformis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
MAP_Futsch
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104093653
NCBI-ProteinID:
XP_009597728
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(10894686..10903448)
Genome browser
AA seq
1010 aa
AA seq
DB search
MITDSYAKMMSEMGMRSMLGGNNDFSSNDFSEELGFLLREQRRQQQEVSDQERELSIFRS
GSAPPTVEGSLNALIGGGSGGGNGSDISGLSEEELRSDPAYISYYYSNVNLNPRLPPPLL
SKEDWRFAQRLQGGGGGGSGGSSPALGGIGDRRKGNRGGCDVESLFSKPIGFGGENEENG
SEAGKEWGGDGLIGLPGLGLGSRQKSIAEMIQDNMSQPTSTSRHPSRPASRAYDDIVDPS
ESQFVHLHHEMATLDALHSRGKVQGMSTLQNVSASGSQSYASAVGGSLSRSTTPDPQLVA
RAPSPRIPSAGGGRIASLENVSSHMGEHTDLAAALSGMSLSGNNRGDEGKHPKSQIHNEM
DDHQNLFRLQNGQNPMKQHPYAKKSESVQFHKSAGSPAAYLNGPSTPTRNCARGSPSQYP
TIDSPNSTFSAYALGGYGMNPSSPSMLENQLGVGNFPSVLGNIASPVGACGIDARATGGS
LSLGPNLLAAAAELQNLRLGNQTLGGSLQMSQMDPLYLQYLRSTEYHAAQLAALNDPTVN
RESLGTSYMDLIELQKAYLETLLASQNSQYGLPYLGKSGGLNHGYYGNTANGLNMSYPGS
PLAGAVLPNSPFGPGSPVRYGERNMHFPSGMRNLAGGVMGAWHSESVSNLGESFASSLLD
EFKSNKSKCFELSEIEGHVVQFSADQYGSRFIQQKLETATTEEKNMVFHEIMPQALSLMT
DVFGNYVIQKFFEHGSASQIRELAEQLNGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVELDQQTKMV
AELDGHVMRCVRDQNGNHVIQKCIECIPEEAIQFIVSTFHDQVVTLSTHPYGCRVIQRVL
EHCHNPETQSIVMNEIMQSICMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPEERSSIISKLMGQIVQMS
QQKFASNVVEKCLCFGTPEERQTLVDEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDD
QQLELILNRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRISFLASYSAA
NT seq
3033 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattactgatagctatgcgaaaatgatgtcggaaatgggaatgcgatcaatgttagga
ggaaacaacgattttagtagcaacgattttagcgaagagttagggtttttgctgagagaa
caaaggcggcagcaacaagaggtgagtgatcaagagagagaactcagcattttccgtagc
ggttcagctccgccgactgtcgaaggatcgcttaacgctttgataggcggcggaagtggc
ggcgggaatggtagtgatattagtggactttcagaagaggagttaaggtctgatccagcg
tacatttcctattattactcgaatgtgaatctaaaccctaggcttccgccgcctcttttg
tctaaagaggactggaggttcgcccagcgtctacagggtggcggtggaggtggtagtggt
ggtagttcaccggcattaggagggattggagataggaggaaaggaaaccgtggtggttgt
gatgttgagtcgcttttttcaaagccgataggatttggtggggaaaatgaggaaaatgga
agtgaggcggggaaggagtggggcggggatggacttattggattgcctggattaggatta
ggaagccgacaaaagagcattgccgagatgattcaggacaatatgagccagccaacatct
acttcgaggcatccatcacgtcctgcttcccgtgcatatgatgatattgttgatccttct
gagtcccaatttgttcatctccatcatgagatggcaactttggacgcactacattctcgg
ggaaaggttcaaggtatgtctacccttcaaaatgtcagcgcatctggctctcagtcttat
gcttcagccgtgggtggatcactgtcacgaagtaccacccctgaccctcagcttgtggct
agagctcctagtcctcgtattccttctgctggaggagggaggatagcatcactagagaat
gtttcatctcatatgggtgagcatactgatttggctgctgcattgtctggcatgagtcta
tcagggaacaataggggagacgaagggaaacatccaaagtctcagattcataatgagatg
gatgatcatcagaacctctttcgattgcagaatggtcagaatcctatgaagcaacatcca
tatgcaaaaaagtctgaatctgttcagtttcacaagtctgcaggatcccctgctgcatac
ttgaatgggccctctacgccaactcgcaactgtgcaagaggttctccatctcaatatcca
actattgatagtcctaactcaacgttttctgcctatgctttagggggttatggtatgaac
ccttcatcaccatctatgttggaaaaccagcttggggtaggtaattttccttctgtactg
ggaaatatagcgtccccagtgggtgcatgtggaattgatgctcgagcaacaggaggaagt
ttgagtttgggtcctaatttattggctgccgcagctgaactgcagaaccttagacttggt
aatcagaccttgggaggttctctgcaaatgtctcagatggatccattgtacctgcagtac
ttgagatcaactgagtatcatgctgctcagctagcagctctcaatgacccaacagttaac
agggaatctttggggacttcatacatggatttgattgagcttcagaaagcttatctggag
acgttgcttgcatctcagaattcccaatatggtcttccttatcttggcaaatctggtggc
ctaaatcatggttactatgggaacacagcaaatggccttaatatgtcatatccaggaagc
cctttggcaggtgcagttcttccaaattccccttttggacctggtagtcctgtaaggtat
ggggaaaggaacatgcattttccatcagggatgagaaacttagctggtggtgtcatggga
gcttggcattccgagtctgtttctaacttgggtgaaagctttgcttcctcgttattggat
gagtttaagagcaataagagtaagtgttttgagctatcagagattgaaggccacgttgtt
cagttcagcgcggaccagtatgggagccggttcattcaacaaaaacttgagactgctact
acagaagagaaaaacatggtcttccatgaaattatgccgcaagccctttctttgatgact
gatgtgtttggtaattatgtgatccagaagtttttcgaacatggaagtgcatcccagata
agagaactggctgagcagctcaatgggcatgtactcacccttagccttcagatgtatggt
tgccgagtgatccagaaggccatagaggtggttgaactggatcaacagactaaaatggtc
gctgagcttgatggccatgttatgcgctgtgttagagatcagaatgggaatcatgtaatc
cagaagtgtatcgaatgcattccagaggaagctatccagttcattgtttccacatttcat
gatcaagttgtgacattgtccactcatccatatggatgtcgggtcatacagagagtcttg
gaacattgccataatcctgaaacccagagcattgtgatgaatgagattatgcaatcgatt
tgcatgttggcgcaagatcaatatgggaattatgttgttcagcatgtactggaacatggg
aagccagaggagcgttcgtctataattagtaagctgatgggacagatagttcagatgagc
cagcaaaaatttgcctccaatgttgtggagaagtgcttatgcttcggaactcccgaagaa
cgtcagaccttggtagacgagatgcttggcacaactgatgaaaatgaacctcttcaggca
atgatgaaagatcagtttgccaactacgttgtacagaaagtgctggagacttgtgacgac
cagcaacttgaactcattctcaaccgaatcaaggttcatctaaatgccctgaagaaatat
acttacggaaagcatatagttgcccgtgtagagaagctggttgctgctggagagaggagg
atcagcttcctggcgtcatattctgctgcttag
DBGET
integrated database retrieval system
