Nicotiana tomentosiformis: 104105820
Help
Entry
104105820 CDS
T05025
Name
(RefSeq) extensin-2-like
Organism
nto
Nicotiana tomentosiformis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Pollen_Ole_e_1
MS_channel_1st_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104105820
NCBI-ProteinID:
XP_070038073
LinkDB
All DBs
Position
8:4304931..4308495
Genome browser
AA seq
925 aa
AA seq
DB search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NT seq
2778 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcggtttcacggtggcggccccgccaagggtcgtcgatatttgccacaaatctta
gtggcattggccatattggcagttgctaatgtagtgtcagcagatccttatatatattct
tctccaccacctccagcatacgagtacaagtcaccaccacctccgtctccttctccgcca
ccaccttatgtgtacaaatctccacctcctccatcaccttctcccccgccaccatatgtg
tataaatcaccacctcctccttcgccatctcccccgcctccatatgtgtataagtctcct
ccacctccatcacctttacccccaccgccttatgtgtataaatcaccacctcctccttcg
ccatctcccccgcctccatatgtgtataagtctcctccacctccatcacctttaccccca
ccgccttatgtgtataaatcaccacctcctccttcgccatctcccccgcctccgtatgtg
tacaaatctcctcctccaccatcaccttcgccaccacctccatattattataagtcgcca
cctccaccttcaccatcacctccaccaccatattattataaatctccgccaccacccttg
ccatctccacctccaccttactattataagtctccaccaccaccttctccttcacctcct
ccaccatactactataaatctccaccacctccttctccttcacctccgccatcttattat
tacaagtctccgcctcctccatcaccatcaccatcaccatcatactattataagtcccca
ccaccacctgctaagtcacctcctcccccatactattatagttatccaccaccaccagta
aagtctcctcctccaccatattattattcctcaccgccaccaccaaagaaatcacccccg
ccaccatatcactatacttccccaccaccaccagttaagtctcctcctccaccatattac
tattcctcaccaccaccacccaagaaatcacctcctcccccatatcactatagttcccca
ccgccaccagttaagtctcctcctccaccatattactattcctcaccaccaccacctaag
aaatcacctcctccaccatattactactcttcttcaccaccaccaaagaaatcaccaccg
ccaccataccactactcttccccaccactaccagtaaagtcacctccaactccatactac
tacacctccccaccaccaccaaagaagtcttctcccccatcatactattacacttcaccg
ccaccacctactcattactatcctccacatcatcatttggtggtcaaggttgtcggaaag
gtctactgttttagatgctatgatttaaaatacccagaaaagtctcatggcaagaaacac
ctgaaaggtgccgttgttaaggtaacttgtaaggctggtgacaagaaaattgtgagttat
ggtatcacaaagatcaacggcaaatttagcattactgttaaaggatttgaatatgccaaa
tatggagcaaaggcttgcaaggctaaactacacaatgctccaaaggattcaaattgtgac
attcctacaaatcttcattggggagtaaagggtgctaaccttaaagtgaagtcaaagaac
cattatgaagttgtactttatgcaaaaccatttgcttatggctctaagacaccttatgca
aaatgcacaaaacctatgcctacgcctactccatactactacaaatctcctccacctcca
tcgccgacttatatttacaagtcaccacctcccccaaccccgacatacgtttacaaatct
tcgccgccaccaaccccgacatacgtttacaaatcttcgccgccaccaactaagtctcca
ccatctccttattactacaagtctccacctccaccatcaccaaaacatgcccatgtatac
tattataaatcaccaccgcctccatcttcatcgcctccaccttcttactattataaatcc
cctccaccaccatcaccttctcctcctcctccatattactacaagtcgccaccactccca
tcaccatcacctccaccaccatactactataagtcaccaccaccgccatccccatcacca
cccccaccttattattacaagtctccacctccaccatcaccaaaacctgcacatgtatac
tattataaatcaccaccacccccatcgccatcacctccacctccttactattacaaatct
cctccaccgccatcacattctcctcctcctcctccatattactacaagtcaccaccaccc
ccatcaccatcacccccaccaccgtactactataagtcactaccaccaccttccccatca
ccacccccaccttattactataagtctcctccaccaccatcaccatctcctccaccaccc
tattactataaatcaccaccacctccatcgccatcaccgccaccaccctattactataaa
tcaccaccacctccatcgccatcaccgccaccaccctattattacaagtctccaccaccg
ccatctccatcaccgccaccaccctattattacaagtctccaccaccgccatctccatca
ccgccaccaccctattactacaagtcccttcctccaccgtcgtcttctcctccacctcca
tactattaccactctccacctccaccagtaaagtctcctcctcctccctattactacagc
tcacctcctccacccgtaaaatcaccacctccgccagtatacatttatgcttctccgcca
cctccaatccactactaa
DBGET
integrated database retrieval system
