KEGG   Nicotiana tomentosiformis: 104108046
Entry
104108046         CDS       T05025                                 
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like isoform X1
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
nto  Nicotiana tomentosiformis
Pathway
nto03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:nto00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    104108046
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:nto03019]
    104108046
   03041 Spliceosome [BR:nto03041]
    104108046
Messenger RNA biogenesis [BR:nto03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     104108046
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     104108046
Spliceosome [BR:nto03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    104108046
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_PARP14_3
Other DBs
NCBI-GeneID: 104108046
NCBI-ProteinID: XP_070053925
LinkDB
Position
3:148477034..148480205
AA seq 372 aa
MDYDVAEQNDGNYQPLQPYSETRGDNSAGRELKHSIDDSSAGKLFVGGIAWETNEESFRK
YFSRFGETTDCVIMMDKVSGRPRGFGFVTFADPEVVNKVLEEDHVIDGRTVEVKRTVPKE
DMQVKGAPKTKKIFVGGLPLSLTEDELKEYFSSYGYVLEHQIMLDRETGRSRGFGFVTFD
SEHAIEKVLNNGRMHEICGKQVEIKRAEPKRAGPEYANGSRQHLGGSGSKSYSGFGGSEG
GFGGGYGGMMGRGYGGYGGYGGYGNIGGSYGGGAAGFYSGYGGYGYGFGFSGPMYGAGGY
GGTSYAAPGSYGGPTGYAGGRGYTSGDGSWYGGAKGSVSGNAKGYGVGGSTGGAKAYGNG
GAASGRFHPYQK
NT seq 1119 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggattatgatgtagctgaacaaaatgatggtaactatcaaccactacagccgtattca
gaaacccgtggagataatagtgcaggccgtgaattaaagcattcaatcgatgattcttct
gcaggaaagcttttcgttggaggcattgcttgggagaccaatgaagaatcttttaggaaa
tatttcagcaggtttggagagacaactgattgtgtgataatgatggataaggtctctgga
aggccgcgaggatttggatttgtaacatttgctgacccagaagttgtgaataaggtttta
gaggaagaccacgtcatagatggtagaacggtggaagtgaagaggacagtacctaaggag
gacatgcaagttaaaggagctcccaaaacaaagaaaatttttgtcggcggtcttccatta
tctttaaccgaagatgagttgaaggaatatttttcttcttatggctatgttctggagcac
caaatcatgctggaccgcgagactggtcggtcccgaggctttggcttcgtgacttttgat
agtgaacatgccattgaaaaagttttaaacaatggccgtatgcatgaaatctgtggcaaa
caagttgaaattaagagggctgagccaaaaagagctggtcctgaatatgcaaacgggagc
aggcagcatcttggtggtagtggctcgaaatcatacagtggctttggtgggtctgaagga
gggtttggtggtggatatggtggaatgatgggtagagggtatggtggatatggcggctat
ggtggttatggaaacattggaggaagttatggtgggggtgctgcaggattctactctggg
tatggtggatatggttatggatttgggtttagtggacctatgtatggggcaggtggatac
ggaggcactagctatgcggctcctggtagctatggtggtcccactgggtatgctggcggt
agaggatatacaagcggcgatggtagctggtatggtggggctaaaggctccgtatctggc
aatgctaaagggtatggtgttggtggtagcactggaggtgctaaagcatatgggaatggt
ggtgctgcaagcggaaggtttcatccctaccagaagtga

DBGET integrated database retrieval system