Nicotiana tomentosiformis: 104116394
Help
Entry
104116394 CDS
T05025
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
nto
Nicotiana tomentosiformis
Pathway
nto03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nto00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
104116394
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
nto03019
]
104116394
Messenger RNA biogenesis [BR:
nto03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
104116394
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104116394
NCBI-ProteinID:
XP_009625541
LinkDB
All DBs
Position
9:complement(18641374..18645040)
Genome browser
AA seq
473 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEEKLKDYFQGYGDVLQTVVMRDKISGKPRGFGFVVFADPNVL
DRVLQDEHVIDGRTVDAKRALSREEQQGSKSGNANSARNFGGGGNTRTKKIFVGGLPPTL
AEDGFRQYFEAFGSVTDVVIMYDQQTNRPRGFGFISFDSEDAVDRVLQKTFHDLNGKQVE
VKRALPKDANPGAGGRSMGGGGGSGMGGGSYQGYGASGNNPSSYDSRMDSSRYMQSQNAG
GGYPYGSSGYGTPGYGYGPSNNGMGYGGYGSYGGANPGYGSATPGYGAAAVAAYGNPNAP
STGYGTVPAGGPRSTWGSQAPSGYGNVGYGNAPWGASNAGGGGGPASGGSGQSPTGTTGY
GNQGYGYGGYAGNDGAYGNPSGYGAVGRASGAPSGNSPVGGGAAGDMQSGAGGYMSGGYG
DASGNSGYGNSAWRSDNSQGSGNYGAPPNGAHGGQAGYGGGYGGAPSRQAQQQ
NT seq
1422 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaagggaagctgtttatcggaggaatatcatgggagacaagtgaggag
aaactgaaagactattttcaaggatacggcgacgttttgcagactgttgttatgagagat
aagatttccgggaagccacgtggctttggtttcgttgtctttgcagatcctaatgttctt
gatagggttcttcaagatgaacacgttattgatggccgtaccgttgatgctaagagggcc
ttgtcgagagaggagcagcagggttcaaaatctggaaatgctaatagtgccagaaatttt
ggaggtggtggaaataccaggaccaagaaaatttttgttgggggattgcctcccactttg
gccgaggatggatttaggcaatattttgaagcttttggtagcgtcactgatgtagtaatt
atgtatgaccagcagaccaaccgacctcgtgggtttggcttcatttcatttgattctgaa
gatgcagtagatagagttttacagaagacctttcatgatctgaatggaaagcaggtagaa
gtgaagcgtgctcttcctaaagatgctaatcctggtgctggtggccgttccatgggcggc
ggaggcggtagtggtatgggtggcggaagttatcagggatatggtgcatcaggtaacaat
cctagttcttatgacagcagaatggattccagcaggtacatgcagtctcaaaatgctgga
ggtggctatccatatggttcatcaggatatggtaccccaggttacggttatggaccatcc
aacaatggtatgggctatggtggttatggaagttatggtggagccaatcctggctatggc
agtgccactcctggctatggagctgctgcagttgctgcctatggaaatccaaatgcaccc
agtactggttatggaactgttcctgcgggtggaccgagaagcacatggggttctcaggct
ccttctggatatgggaacgtgggctatggtaatgctccttggggtgcttcaaatgctggt
ggtggcggtgggcctgctagtggaggatccggtcaatctccaactggtaccacaggatat
gggaatcaaggttatggttatggcggttatgctggaaatgatggtgcttatggaaatcca
tctgggtatggggctgttggacgtgccagtggtgctccaagtggtaattcacctgttgga
ggtggtgctgcaggagacatgcaatcaggtgctgggggttacatgagcggtggctatggt
gatgccagtggaaactctggctatgggaattcagcatggaggtctgataactcgcagggt
tccggtaattatggtgctccaccaaacggagctcatggtggccaagctggatatggtggt
ggatatggaggtgctcccagtcggcaagcccaacagcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
