Nonlabens ulvanivorans: R1T42_04680
Help
Entry
R1T42_04680 CDS
T09493
Name
(GenBank) mechanosensitive ion channel
KO
K16053
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
nul
Nonlabens ulvanivorans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nul00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
nul02000
]
R1T42_04680
Transporters [BR:
nul02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
R1T42_04680
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_2nd
Sld5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOI23752
LinkDB
All DBs
Position
complement(1013874..1015124)
Genome browser
AA seq
416 aa
AA seq
DB search
MSMKHFIYDYLVETGMTAVYAKYLNMLILLVALLVIAFLVDYIIKKIFIKLFTQFTVKTK
TNFDNFLVSNKVPQNIAHIIPLIFGLEFIPIVFQDFPYFENMVEKGFKVFAIILTLWIVR
SLLNALKDYFKTLPRLRDKPIDSYIQVFMIFAWALGLLSAFAIITSVEFIKFFTTLGAAS
AIIILVFRDTILGFVASIQVSINDMVRIGDWITFEKYGADGDVIEINLSTVKVQNFDKTI
TTIPTYALISDSFKNWRGMEVSDGRRIKRALNIKLDSVSYLTKDEVDTLKNISLISSYLE
TRQSDIDSYNSEQNTNKDILLNGRNLTNIGVFRKYLETYIEQHSGVNKDMMIMVRQLAPT
AHGIPIEIYAFSSDKRWKNYEYIMADIFDHTIAAVPYFNLEIFEYPSNSSFKDIKA
NT seq
1251 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtatgaaacactttatatatgattatctagtagagactggtatgactgcagtgtat
gctaagtatttaaatatgctcattcttcttgtagctttactggtcattgcatttttagtg
gattatatcattaaaaagatttttataaagctgttcacacagtttacggtaaagaccaag
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atagacagctatatacaggtgtttatgatctttgcttgggcactgggattattatctgcg
tttgctattataaccagtgttgagtttattaaattctttaccactctaggtgctgcatct
gctattattattttagtctttagagatactattttggggtttgtggccagtatacaagtc
tctattaacgatatggtgcgtataggtgactggatcacctttgaaaaatatggtgcagat
ggtgacgtgatagaaattaacttatctacggtgaaggttcaaaactttgataaaactatt
accacgatacctacttatgcgttaatatcagactcttttaaaaactggcgtggtatggaa
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ttaaatggccgcaacctgactaatatcggtgtatttagaaagtaccttgaaacctatatt
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gctcacggaattcctatagaaatctatgcctttagtagtgataagagatggaaaaattat
gaatatataatggcagatatatttgaccacacgattgcagctgttccttatttcaatctt
gagatttttgagtatcctagtaattcaagttttaaggatattaaggcataa
DBGET
integrated database retrieval system
