Nonlabens ulvanivorans: R1T42_06275
Help
Entry
R1T42_06275 CDS
T09493
Name
(GenBank) LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein
Organism
nul
Nonlabens ulvanivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
LysM_MltD
Peripla_BP_6
MgpC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOI24060
LinkDB
All DBs
Position
complement(1381629..1383554)
Genome browser
AA seq
641 aa
AA seq
DB search
MKNIILVVFVFFAFAKANATVLQNYKQHVVQKGETVFSIVGKYRINATELTQLNPDIKSG
LKEGSILLIPASSNVLTQRKIVEYKKHKVRRRETLYGIAKKYDVTELDIKEANKELYSKG
LRKGDRIQIPVFEEVEIPVTVTTPVDVVSADTPLGDGKYRIMSKDTKFGIATKYGIKVPA
LESLNPDMKDLHPGMIINVPVMTPVIVDSSISNSDNAVVNKFVNYEVPAKMTMYSLENLT
GITEDSLIALNPHIKDGLKLGMNIRIPNSDKGQLNVMDSKITGFSNLLDSISNYNPQRFA
VMLPLSLNKLGEETSDDALLRKESATRIALDFYSGMTIARDSAQSLGLMVTYDVFDTQKS
TSKVNSIINSHDFNSYTAVVGPLLAKNVVEAAKELKSDGIPVISPLTNTDVRLYKNLFQA
RPDQALLKQKLMDYLVANSEGKNIILVTDSKKPELKNEYLALFPNAIELKPNKDNYIYKQ
TYINALDSDKDNWVILAVDNEGFITDAISHYSAKAKSHNVTMFGYENYDELELPHMRLGS
LKYTYPSINRDFGSENGFSKKYYRKYQITPNAYATRGFDVVMDIILRNASAGNLYDSAMN
NGSTSQVENKFNYSKKFMAGYYNESVYLLQYQEDLTIKELD
NT seq
1926 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatataatcttagtagtctttgtttttttcgctttcgcgaaagcgaatgcaaca
gtccttcagaactacaaacagcatgtcgttcaaaaaggagagaccgtttttagtatcgta
ggtaaataccgaattaatgctacagaattaacccaacttaatcctgatattaaatctggt
ttaaaagaaggttctatactattaattcctgcaagctcaaatgtactgactcaacgtaaa
attgttgaatataagaagcataaagttcgtcgcagagaaacgttatatggtattgcaaaa
aaatatgatgtcacagaactagatattaaagaggccaataaagaattgtattctaaagga
cttagaaaaggtgaccgtatacaaataccagtttttgaagaagttgaaataccggtaact
gtcacaacacctgttgatgttgttagtgcagatactcctttaggagatggaaaatatcgt
ataatgtccaaagataccaaatttggtatagcaactaaatatggtattaaagttccagcc
ttagaatctcttaatccagacatgaaagatcttcatcctggaatgattatcaatgtaccg
gttatgacacctgtaattgttgatagttcaatttcaaattcagataatgcagtggtaaat
aagtttgtgaactatgaagtacctgcaaaaatgacgatgtactctttagaaaacttaacg
ggtattactgaagattcattaattgcattaaatcctcatattaaagacggtttaaaacta
ggtatgaacattagaatacctaattctgataaaggacagttaaatgtcatggattctaaa
atcactggattttcaaaccttttagatagtatatctaattataatccgcagcgatttgct
gtgatgttgccattatcacttaataaattaggagaggaaacatctgatgatgcgttattg
cgcaaggaatctgcaactcgtattgctttagatttttatagtggtatgaccattgccaga
gactctgcacagtcactaggccttatggtgacgtatgatgtttttgatacccaaaaaagt
actagtaaggtgaattctattataaattctcatgactttaatagttatacagctgttgta
ggacctctattagctaaaaatgtggtagaggccgctaaagaattgaaaagtgatggtata
cctgtcatatcaccactgactaacactgatgtacgtctatataaaaatcttttccaagct
agaccagatcaggctcttttaaaacaaaagctcatggattatctagtagcaaactcggaa
gggaagaacattatcttagtaacggattctaaaaaaccagaattgaagaacgagtatcta
gcgctttttccaaatgcgatagaattgaagcctaataaagataattacatctataaacag
acttatatcaatgctttagattctgacaaagataactgggtaatacttgcggtagataat
gaaggttttataacagatgcgatatcacattattctgcaaaggcaaaatcgcataatgta
accatgtttggttatgaaaattatgatgaactagaactacctcatatgagattaggttca
ttaaagtatacataccctagtattaatagagactttggaagtgagaatggattttcaaaa
aagtattatcgcaaatatcaaataacacctaatgcttacgctacgagaggctttgacgta
gtaatggatattatcttaagaaatgcgagtgccggtaatctatatgatagcgcaatgaat
aatggaagtacttctcaagtagagaataaattcaactattcaaaaaaattcatggcaggt
tattataacgaatcggtttatctattgcaatatcaagaagatttaaccattaaagaattg
gattaa
DBGET
integrated database retrieval system
