Nonlabens ulvanivorans: R1T42_13530
Help
Entry
R1T42_13530 CDS
T09493
Name
(GenBank) alpha-amylase family glycosyl hydrolase
Organism
nul
Nonlabens ulvanivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Por_Secre_tail
Big_7
CBM_48
PKD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOI22678
LinkDB
All DBs
Position
complement(2995843..2998572)
Genome browser
AA seq
909 aa
AA seq
DB search
MKNNLLILLAFIGFAFAKAQVTTNPSTPTQTDQVTLIFDSTGTALENTTGTLYAYTGVTI
NGNRWQNIIVPTFNDNNGAPQFVNTGGNIYQLTLGSDIESFYNVAAGDVVSEICLVVRNA
AASAQTSPDIFLPIFQPGLNALITSPADGDIFTLNQTINISGDASQNATLELKVNNTSIG
TATSSMNITSPYTFNTTGGHTIELTADNGAQQITDAVNVFVPAATQTQTRPAGLKNGVNE
NADGSVTFLLAAPGKTDAALIGDFTNWNLDTNFQMFKDGDYFWVTVPSSNFTAGQTFQYQ
YIVDYTFKVADPFSGLILDPDSDQYIKPGNYPNLPTYPTGLTTGDVSLYTYQATPYNWTV
NNFQKPNKENLVIYELLVRDFSENDSFQEVINRIDYLETLGINTLQLMPVNEFEGTDSWG
YNPKFHGALDKAYGTPEKFKELVDLCHSRGIAVVIDVVYNHAFSQSPLCQLWWDENNFRP
AANNPYLNSSPTHDFNVGYDFNHESQWTRDYVKQTLQYWIDEYRIDGFRFDLSKGFTQNF
TLGNISAWSAYDQSRVDILNDYKNTIWNANSNDIYMILEHLGDNSEETALANAGFMLWGK
MTDEFNQNSMGYSSNNDVFRSYYLARGWNDQHLVAYAESHDEQRLMYKNLNFGNSANSSH
NVRSLPVALDRQEAIAAILYSIPGPKMLWQFGELGYEIDIDQNGRTGRKPIPWTLNYDTD
QDRMDLYNVTATMIGFKTKYPDTWNTTNNNLDVSGVTKRINLNGPVFDVVVLSNYGITAQ
NVNPNFSQNGTWYEYFSNTTVNITNTTAMINLQPGEYRVYSTQQLQDPLSNEDSSNLTTG
IKLYPNPAQNSFRLSEDIQSMKIYNMKGQQVLDYEKSLPNYSIESLTSGVYIITVQTVKG
NHQIKLIKE
NT seq
2730 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacaatttacttatacttttagcatttataggattcgctttcgcgaaagcgcaa
gtaaccacaaacccatccactcctactcaaacagatcaggttacattaatatttgactct
actggtacggcgttagaaaataccacaggtactctttatgcctacaccggtgtaacgatt
aacggaaatagatggcaaaacattattgtgcccacatttaatgataataatggcgcacct
caatttgtaaatacaggaggaaatatctaccagttaacacttgggtctgatatagagtcc
ttttataatgtcgcagctggtgatgtcgtgagtgaaatatgcctagttgtaagaaacgca
gcagcaagtgcccagacaagtccagatatttttctacctatttttcaaccaggcctaaat
gcattaattacctcacctgcagatggagatatttttaccttaaatcaaaccatcaatata
tcaggtgacgcttctcaaaatgcaacacttgaattaaaggtcaataatacatcaataggc
actgcgactagttctatgaacatcacatcaccgtatacttttaatacgacaggtggacac
acaatagaattaactgcagataatggagcacaacaaatcacagatgctgtgaacgttttt
gttcctgcggcaacgcaaacgcaaacaagacctgctgggcttaaaaatggagtcaatgag
aatgcagatggtagtgtcacttttttactcgctgctccaggaaaaacggatgctgcctta
ataggtgattttacaaactggaacctagacactaactttcaaatgtttaaagatggtgac
tacttctgggtaactgttcctagttcaaattttactgctggacagacttttcaatatcaa
tatatagttgattatactttcaaagttgcagatccattttctggattaatattagatcca
gatagtgatcaatatatcaagcctggtaattaccctaatttaccaacatatcctacagga
cttacaactggtgatgtatcattatatacttatcaagcgacaccttataattggacggtt
aataattttcagaaacctaataaggaaaacctagttatttatgaactattagtacgtgac
ttttcagagaacgatagttttcaagaagtaataaatcgtattgactatttagaaacatta
ggaatcaatacgctacaattaatgccagtaaatgagtttgaaggaacggacagctggggt
tataatcctaagtttcatggagcattagataaagcatacggtaccccagaaaaatttaaa
gagttagtagatttatgtcattctagaggaattgctgttgtaatagatgtagtatataat
catgccttttcgcaaagtccattgtgtcaactttggtgggatgaaaataactttagacca
gctgcaaacaacccttatttaaattcttctcctacgcatgactttaatgttggttatgat
ttcaatcatgagagccagtggaccagagactatgttaaacagacattacaatactggatc
gatgagtatcgtatcgacggttttaggtttgatctttcgaaaggatttactcaaaacttc
acactaggtaacattagcgcatggagtgcatatgatcaatctagagtagatattcttaac
gattataagaacaccatttggaatgcaaatagcaatgatatatacatgattcttgaacat
ttaggcgacaactctgaagagacagccttagcaaatgcaggctttatgctatggggcaag
atgactgatgagtttaatcaaaattctatgggttattctagtaacaatgatgtttttaga
tcttactatctagctagaggatggaatgaccagcacctagttgcttatgcagaaagtcat
gatgagcaacgtttaatgtataagaacttaaattttggaaactctgcaaattcttcgcat
aacgtacgtagtttacctgtagcattagatagacaagaggctattgctgcgatattatac
agcatacctggccctaaaatgctttggcagtttggcgagttaggctatgagatagatatt
gatcagaacggtcgtacaggtcgcaaaccgataccatggacactgaattatgatactgac
caagaccgcatggacttatataatgttactgctaccatgataggttttaaaactaaatat
ccagatacgtggaacactacaaacaacaacctagatgtgtctggagttacaaaacgtatt
aatttaaatggacctgtctttgacgtcgttgtactgtctaattatggcattacagcccaa
aatgttaatccaaattttagtcaaaacggaacttggtatgaatacttcagtaatacaact
gtaaatattactaataccactgcaatgattaatctacaacctggtgaatatcgagtttac
tctactcagcaattacaagatccattaagtaatgaagacagctctaacttaacgacaggt
ataaagttgtatcctaatcctgctcaaaactctttcagattatctgaagacattcaaagc
atgaaaatttacaacatgaaaggacagcaagtacttgattatgaaaagagcttacccaat
tactctatcgagagccttacaagtggcgtttacatcatcacagttcaaactgtaaaagga
aatcaccaaataaaattgataaaagagtag
DBGET
integrated database retrieval system
