Oscillatoria acuminata: Oscil6304_1214
Help
Entry
Oscil6304_1214 CDS
T02368
Name
(GenBank) putative calcium-binding protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
oac
Oscillatoria acuminata
Pathway
oac02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
oac00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
Oscil6304_1214
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4347
Big_13
HemolysinCabind
Big_6
Cadherin_5
DUF4625
Big_3_5
Big_9
BNR
Peptidase_C80
Big_3_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY80930
UniProt:
K9TEG9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1476116..1480600)
Genome browser
AA seq
1494 aa
AA seq
DB search
MNNSIIFVDSSVHDYQNLIDNADAAHIVILDNRSSGIDQIASALANQKDIAAVHIVSHGS
EGTLKLGTDVLNGNNIEDFNTQLKQWGNALTENGDILLYGCNVAAGETGNNFVKRLSEIT
GADVAASNDLTGNQTLGGDWDLETATGKIEAAVPFNGEAMKDYDGVLLNYNVTVATDNGT
GGTANTLSWAILQANNSVGVDDTITLATNVRLTGTPNQLINSNIGFIGGGFTVSGDINNN
GINDTGDVRPFLIRSGTVSFSNMTIAGGRAQGGNGSATNSGGGGGAAGMGGALFIYNGNV
TIDNVTFTSNQAIGGSSANNNRFLAGGGGLGGNSGVGVNGASGGNGGGGFGGNGGNNSNI
TYNGGAGGAGGAFGGAGGAGGIGTVGGNGTGGGGGGGGFNTTNGGNGAFGGGGGSAGDQA
FLNGGWGGFGGGGGAAANFGGRGGFGGGGGVSINTNNPGAGGFGGGAGGGTTGYSAYLPG
GGGAGLGGAIFVREGSLTLQNTTFTNNTTTGGTGANNGQALAGAIFVLDAAAQTAQTAQG
NTQGMPTTPPTVSVIGYLRTTSNTAANNANTTPNNNDIYGSINTAPVLNNTPVTLNAVLE
DAPAPVGAVGTLISSLVEIGTNVTDPDTGALTGIALTATDTTNGSWFYTTDGGITWNALG
AVTNTNARLLAADASTRIYFQPTTANYNGTITNALTFHAWDQVVGTNGATANTSINVGIS
TAANTAAITVTPVNDIPSFTATSPTAVNQNAGAQTLTTWAAFSPGGGTDEATQTATYTVS
NISNAALFAVSPAIDTSGTLTYTPSTIASGTSTFDVVVQDSGGTANGGVDTSTIQTFTIT
VVDTTPPAAPAIITAPGTTNDTTPTLTGTAEANSTVNILQGITSLGTATADASGNWTFTP
TTALTDGTYALTATATDAAGNISPASSAVNLTVDATPPAAPIITTTGTTNDATPDITGTA
EAGSTVKILQDGTAIGTATADATGNWTFTPATAIADGTYNFTATATDAEGNTSVASTASS
LTIDATAPNAPTITSDGTTDDTTPDITGTAEAGSTVKIFSGTTELGTVTVGANGTWTFTP
ATALADGDYTLTATATDAAGNVSVASTPVTLTIDTSSLEEPPVEEPPVEEPPVEEPPVEE
PPVEEPPVEEPPVSDGEPSRLIIQIFGPTGPGYFSQFQANNPVSTPQVDVASILADVPDI
CNLLVTMPTLPPLGNTISGTPGTDILLGTQEAESLIGTNEAIFIQGLAGNDQIFGGIGND
IIHGNQGEDFIDAGLGDDLVHGGQGNDFIRANQGNNEIYGDLGNDTLVGGPGNDFMNGNQ
GNDVLFAVAGNNTLHGGQGDDSLVGGSGDDVLFGDKGNDIICAGAGNNFINGNQGNDTLV
GKDGDDVLHGGQDDDLLIGGAGNDWLFGDLGNDILIGGAGNDRFVIRKGAGVDLIVDFTD
REDLIGLAEGLTYNDLTLTQSASGAVISVGNELLAIVNGVDVAVLDMQDFFEVV
NT seq
4485 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaactcaatcatttttgtagactcctcagtacatgactatcaaaacctaattgat
aacgctgatgccgctcacatagtcattttagataacagatctagcggtatcgaccaaatt
gccagcgccttagctaatcaaaaagatattgcagccgtccacatcgtttctcatggtagc
gaaggcactttaaaactcggtacagatgtactgaatgggaataatatagaagattttaat
actcagctaaaacagtggggaaatgccctgacagaaaatggagatatcctcttatatgga
tgcaacgtagccgccggggaaactggcaataattttgtcaagcgattgagtgaaattacc
ggggcagatgtcgctgcatctaacgacttaacgggaaatcaaacattaggtggcgactgg
gatttagaaacagcaacaggcaagatagaagccgcagtaccgtttaatggggaggcgatg
aaagattatgacggtgtgttgctcaattataatgtcacggtggcaaccgataatgggaca
ggcgggacagcaaataccctgagttgggctattttgcaggcgaataattcggtgggggta
gatgacactattaccctcgccacaaatgtcaggctgacggggactccgaatcagctaatt
aacagtaatatcggctttattggtggcggtttcaccgtcagcggggatatcaataacaac
ggcattaatgacactggcgatgttcgacctttccttatccggtctggaactgtcagtttc
tccaacatgaccattgccggaggaagggcacaaggaggaaatggcagcgcgactaacagc
ggcggcggtggtggcgcggctggcatgggtggcgcgttatttatctataacggtaatgtg
acaattgataatgtcacttttaccagtaaccaggcgatcggcgggagcagcgctaacaat
aatagattcttagccggcggtggcggtcttggcggtaacagcggagttggggtaaacggt
gcttctggcggcaacggcggcggcgggtttggcggcaacggcggcaataactctaacatc
acctacaacggtggagctggtggtgctggcggtgctttcggcggtgctggcggtgctggc
gggatcggaacggttggcggtaatggtactggtggcggcggtggtggcggcggttttaat
actaccaacggaggcaacggtgccttcggtggtggtggcggttctgctggcgaccaagcc
tttttgaatggtggttggggtggctttggtggtggcggcggtgctgctgctaacttcggt
ggcagaggtggctttggcggtggcggcggtgtgagtattaacactaacaacccaggcgca
ggtggctttggcggtggcgcaggtggcgggactacgggctattccgcctatctgcctggt
ggtgggggtgccggattgggtggcgcgatttttgtcagagaaggcagtttaacgctacaa
aacacaaccttcaccaacaacaccacgacaggcggcacgggagcgaataatggccaagcc
ctggcaggcgcgatttttgtgctggatgcagcagcccaaaccgcacaaaccgcccaaggc
aacactcagggaatgccaacaactcctcccactgtcagtgttattggttatctccgcacc
acgagcaatactgctgctaataacgcaaacaccacccccaataacaacgatatctacggc
agcatcaacactgcacccgtccttaacaatacccctgttaccctcaatgctgtcctagaa
gacgcacccgcgccggtgggtgctgtcggtaccctcatttccagccttgtggagataggt
acaaacgtcaccgatcccgacactggggcattgaccggcatcgccctcactgccactgac
acgactaacggcagttggttttacaccacagatggcggaataacctggaacgccttgggg
gcagtaaccaataccaacgcccgcttactggcagcagatgccagtacccgcatctacttc
caaccaacaaccgccaactacaacggcactatcaccaacgccctcaccttccacgcttgg
gatcaagtcgtcggtactaatggtgctaccgccaataccagcatcaacgttggtatcagc
acagccgccaacaccgcagccatcaccgttacccccgttaacgacattcccagtttcacc
gccaccagcccaaccgcagttaatcaaaatgcaggagcccaaacactgacaacgtgggca
gccttcagcccaggaggaggtacggatgaagccacacagacggcaacatacaccgtcagc
aatatcagcaacgctgcattatttgcagtatcgccagccatagatacctccggtactctc
acctatactccctccaccattgccagcggtacttctacctttgatgtagtagtccaagat
agcggtgggactgccaacggcggtgttgatacctcgaccattcaaaccttcaccatcaca
gtagttgataccactcccccggctgcacccgcaattatcactgcccctggcacaaccaac
gacactaccccaaccttaacggggacggcagaagccaatagtacggttaacatcttacaa
ggcataacttctctgggaacagccacagccgatgcttctgggaattggacatttaccccc
actactgctttaaccgatggtacttacgctttaacagccacggctactgatgcggcgggg
aatatttccccagcttcgagtgcagttaatctgactgttgatgccactcccccggctgca
cccatcatcaccacgacaggcaccaccaacgatgccactcccgatattaccgggacggca
gaagcgggcagtaccgttaagattttgcaagatggtacggcgatcggtactgccacagcc
gacgctactggtaactggacatttactccagctacagctatcgctgatggcacttataac
tttactgccacggcaaccgacgcagagggaaatacttctgtagcttctactgccagcagc
ttaaccattgatgctaccgcaccgaatgcaccaaccattaccagcgatgggacaaccgat
gataccactcccgatattactggaacggcagaagctggaagtacagtaaaaatcttctcg
gggacaacggaattgggaacagtcactgttggtgcaaacggcacttggacatttaccccc
gctaccgcactagcagacggtgattataccttaactgccaccgctaccgatgcagcaggg
aatgtgtctgtggcttctaccccagttaccttaaccatagataccagcagtctggaggaa
cccccggtagaggaacccccggtagaggaacccccggtagaggaacccccggtagaggaa
cccccggtagaggaacccccggtagaggaaccgccagtttctgatggtgaacccagtcga
ttaattatccaaatcttcggacccaccggacccggttattttagtcagttccaagccaat
aatcccgtcagcactccccaagtcgatgtggcatcgattttggctgatgttccagacatt
tgtaacctgttggtgaccatgccaacactcccccccttgggaaacacgatttctggcact
ccgggaacggatattctcctcggcactcaggaagcggagtctctcattggaacaaatgag
gcgatttttatccaaggattagccggaaatgaccaaatctttggggggattggcaatgat
attattcacggcaatcaaggtgaggatttcatcgatgctggtctcggagatgacctcgta
cacgggggacaaggaaatgatttcattcgggccaatcagggcaataatgaaatctatggg
gatttagggaatgataccctagttggcggtcccggcaatgattttatgaatgggaatcaa
ggaaatgatgtcctgtttgctgtcgccggaaacaataccctacatgggggacaaggagat
gatagcctcgtcggtggcagtggagatgatgtcctgtttggagacaaaggaaatgatatc
atctgtgcgggagccgggaacaattttatcaatggcaatcaagggaatgataccctcgtt
ggcaaggatggagatgatgttctgcatggtggccaagatgatgatttgctcatcggtggt
gctggcaatgactggctctttggggatttagggaatgatatcctcatcggtggggccgga
aatgaccgctttgtgattcgcaaaggtgccggagttgatttgattgttgacttcaccgat
cgcgaggatttaatcgggttagccgaagggttaacctataatgacctcacgcttactcaa
agtgccagcggcgcggtgatttctgttggaaatgaactcctcgccattgtgaatggagtg
gatgtcgctgttttggatatgcaggatttctttgaagtggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system