Oscillatoria acuminata: Oscil6304_5055
Help
Entry
Oscil6304_5055 CDS
T02368
Name
(GenBank) WD40 repeat-containing protein
Organism
oac
Oscillatoria acuminata
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
WD40
ANAPC4_WD40
Ge1_WD40
AAA_35
NBCH_WD40
RMC1_N
eIF2A
Nbas_N
PROPPIN
PD40
IKI3
WDR54
DUF2379
RRP36
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY84557
UniProt:
K9TNX0
LinkDB
All DBs
Position
6447886..6451446
Genome browser
AA seq
1186 aa
AA seq
DB search
MQVETGDWMNKKLTSMYYQVGGSLPPDSPTYVVRKADRELYENLKAGEFCYVLTSRQMGK
SSLQLRTMQTLQAEGCACAAIDLSAIGNKDVTPVQWYSGIIHTLVSYFNLFSRPEFRTWL
RDRDELSPVQRLHEFIDSVLLVRMSENIVIFIDEIDSVLGLNFPIDDFFAAIRACYNKRA
QNSEYKRLTFVLLGVATPTELIQDKSRTPFNIGRAIQIEGFKLPEVQPLAEGLKPGCSRP
EVVLKEILKWTNGQPFLTQKLCQLVLAAQSPIGVGMEAERVEALARSQIVDNWESQDEPP
HLKTLRDRLLRNEQKASRLLGLYQQVLLSGELPADNSPEQLELQLSGLTLKRHSKLTVYN
PIYALVFNEHWVEQALADLRPYAEALSAWVASDYQDESRLLRGRALRDAQQWATTHSLSD
RDYQFLAASQEVEKREVQKALEAEKKAIHLLAEANQKQIEANHILTEAQQKANRMLKRAY
WGITGLVVLAVIIVCRGTIALKEAQKGTLIERQGANALKWFESEGVELEALLLAMQAGQD
LKALVKSDQRLTNYPTISPLYALQTILHQIHEKNQLRGHQGAVRSVSFSPNGDFLATGGE
DGRVELWTRAGENLRTIGIHKSAVDSVRFSSDGMRLATASEDGTVQIWQRDGTPIGAIAT
ETEAIDSVSFSPDGTRLATASESGTVRVWNQQGKLLNEIGSVNRRINTVSFSPDGEHFAT
AQVEGTVQIWNLNGQRQATLTIPTTPRQEFSSTPDAQPSVNSMTFSPNGELLATAGFDGT
VRIWNLSGQELSEFNTAQSAVNSMSFHPNGAEIAIVGFDGKVRLWTLDGVLLQQFKGDRH
DRITSMTFSPDGERLVTGGVDGTVRLWDISRQRNQPFPLTQTSSNSPGSENENPASSNSP
KMMVRSTKIPSENQFLRIGFSPDGEGFATAQPDGTVQIWTRSGQAVIPPFQAHQSRISTL
SFSWDGETLATAGEDGTIRLWNRLGQPLQPELNHSRGEVKSLSFSFDGKRIAFNNGPGRL
QIWNLSTNQVDELRFPYGQISSISFSPQGDRLAIASADGKIRLWSLSGEELDKFNSDTRW
VTSLSFNPTGQLLATAGTDGTVTVFLLTGQLSKQTLAKFKADETDVLSMTFLFNGEGLVT
VGTDNTLRWWRIKELDELLETGCNWLTDYLKAHPQAQADLPICQQP
NT seq
3561 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaggtagagacgggtgactggatgaataaaaaactgacatcaatgtactatcaagtc
gggggaagtttaccgcccgattctcccacctatgtggtccgtaaagccgatcgcgaattg
tatgagaatctcaaggcgggagagttttgctatgtcctaacgtcgcggcaaatgggtaaa
tccagcttgcaactgcggacgatgcaaactctacaagcggagggatgcgcttgtgcggcg
atcgatttatcggcgatcgggaataaagacgtgaccccggtgcagtggtatagcgggatt
attcataccctggtcagttattttaatttgttcagtcgcccggagtttagaacctggttg
cgcgatcgcgacgaactctcccccgtccaacgcttgcatgaatttatcgactcggttctg
ctggtgcggatgtcggaaaatatcgtcatttttatcgacgaaattgatagtgttctgggt
ttaaattttccgattgatgacttttttgccgcaattcgggcttgttataataaacgagcg
caaaactcagaatacaaacggctcacctttgttttactgggtgtggcaacccccacggag
ttgattcaggataaaagtcgcaccccgtttaatatcgggcgagcgattcaaattgaggga
tttaaactcccggaagtgcaaccgttggcggagggattaaaacccggatgttctcgcccg
gaggtggtcctgaaggagattttaaagtggaccaatggacaaccgtttttgactcagaaa
ctctgtcagttggtgttagcggcgcagagtccaattggggtggggatggaggcggaacgg
gtggaagcgttggcccgatcgcaaattgtggacaactgggaatctcaggatgaacccccc
catttaaaaaccctgcgcgatcgtctcctgcgaaatgaacaaaaggccagtcggctatta
gggctctatcagcaagtattactttccggagaactccctgcggataacagtccggaacaa
ctggaattgcagctatcgggtttaaccttgaagcgccattctaaattaaccgtttataac
ccaatttatgccttagtttttaatgagcattgggtggaacaggcgttagccgatttacgg
ccctatgccgaagcattatccgcttgggtggcgtccgattaccaggatgaatcgcgactg
ttgcggggacgggcgttacgagatgctcaacaatgggcgacgacccatagtttaagcgat
cgcgactatcagtttctcgccgccagtcaagaggtggaaaaacgcgaggttcaaaaagcc
ctagaagcggagaaaaaagcgattcatctgttagcggaagccaaccaaaaacagatagaa
gccaatcacattttaaccgaagcccaacaaaaagccaatcggatgctcaaacgcgcctat
tgggggattacgggactcgtggttctggccgtcattatcgtctgtcgcggcacgattgcc
ttaaaagaagcccaaaaaggaacgttaattgagcgccaaggtgcgaatgctttaaagtgg
tttgaatccgaaggggtggaactcgaagccttgttactggcgatgcaagcgggacaagat
ttaaaagcgctggttaaaagcgatcaacgcttgaccaattatcccacgattagccctttg
tatgcattacaaaccatcctccaccaaatccatgaaaaaaatcaactcagaggacatcaa
ggtgcagttcgcagcgttagtttcagtcccaatggagactttttagccaccggaggagaa
gatgggcgagtggaactttggacgcgggcaggggagaatttgcggaccattggaattcat
aaaagtgctgtggatagcgttaggtttagttccgatggtatgcgcctcgctaccgcttct
gaggatggaaccgtccaaatttggcaacgagatggcaccccgattggggcgatcgccacc
gaaaccgaagctattgatagcgtcagttttagtcccgatggtacgcgcctcgctaccgct
tcagaaagtggcacagtccgagtctggaatcagcaaggaaagttgcttaatgaaatagga
agcgtgaaccgtcgaattaataccgtgagctttagtcccgacggagaacactttgccact
gcccaagtcgagggaaccgtgcaaatttggaatctaaatggccaacgtcaagcaactttg
accattcccactactccccgccaagagttcagttcgacccccgatgctcaaccatcagtc
aacagcatgacctttagccccaacggggaattactagcaaccgctggatttgatggaacg
gtgagaatttggaacctatcgggtcaagaactctcggagtttaacaccgctcaaagtgct
gttaatagcatgagttttcatccgaatggggcggaaattgccattgtcggatttgatggc
aaggtgcgcctgtggacattggatggggtattactccagcaatttaaaggcgatcgccat
gatcgaattaccagcatgacctttagtcccgatggagagcgtttagtcaccggcggagtg
gatggaactgtccgactctgggatatttcccgccagcgcaatcagccctttcccttaact
caaacttccagcaattcccccggatctgagaacgagaacccagcctccagcaactcaccg
aaaatgatggtgcgatcgactaaaatcccgtcagaaaatcaatttctccgaatcggattt
agcccggatggggaagggtttgccaccgcgcaaccagatggaacggttcaaatttggacc
cgttccggtcaagcggttattcccccgtttcaagcgcatcaaagtcggatttctacccta
agttttagctgggatggagagactctcgccaccgccggggaagatggaacgattcgcctt
tggaatcggttaggtcaacccctacagccggagttaaatcatagccgtggggaagtcaaa
agcctgagttttagttttgatggaaagcgaattgccttcaataatggaccgggacgatta
caaatttggaatctctcgaccaaccaagtggatgaactgcggtttccctacggtcaaatt
agtagcattagctttagtccccagggtgaccggctggcgatcgcctctgctgatggcaaa
attcgcctctggagtctatccggtgaagaactggataaatttaacagtgatactcggtgg
gtcaccagcctgagttttaatcccacgggacaacttttagccacggctggaaccgatgga
acggttacggttttcttactcacgggtcaactttctaaacaaactttggctaaattcaaa
gccgatgaaaccgatgttttaagcatgacttttctcttcaatggcgaaggactggtcacc
gtgggaaccgacaatacactgaggtggtggcgcatcaaagaattagatgaattgctggaa
actggctgtaactggctgaccgattatttaaaagcccatccccaagcccaagcggacctc
cctatttgccagcagccctaa
DBGET
integrated database retrieval system