Olleya aquimaris: DZC78_08045
Help
Entry
DZC78_08045 CDS
T05582
Name
(GenBank) PKD domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
oaq
Olleya aquimaris
Pathway
oaq02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
oaq00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
DZC78_08045
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
CHU_C
PKD
CUB
K319L-like_PKD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXO80336
LinkDB
All DBs
Position
complement(1719130..1725603)
Genome browser
AA seq
2157 aa
AA seq
DB search
MKKLLLVITFLSIVLTAKSQDIIMQNGTVNQCSGVFYDSGGTTSNYNDDENYVMTICPDG
PDQFVQLQFTLFSTQLSTDVMTIYDGDDVTANIIGVFSGGGAANNPGTIAASSTSPSGCL
TIEFVSDASTNTLGWAANVSCLQSCQDITPTIDSTNPVADGTGVIQIALGGTVSFDGSAV
FGDDDTGAIYSWNFGDGTTATGQSVSHDYNNTGTYTVTFTASDINPTGCSESVTVEVEVL
SPYIDVDQTTYTVDELVEDVLINSPCATVSSIGSSTGINFGQENGIGYFTAIPGAFAFES
GIVLNSGDAMEAEGPETGIQSSGGWAGDADLETAIPGLNLGDTNDATYIEFNFAPIANSI
SFDFLFASEEYGGFQCSYTDAFAFLLTDLTTGNVTNLAIVPGTTDVVSVFTVRDNAYNAS
CASANPGYFDSYYGAGGEPTINSPIDFRGYTRPMTAFANVIPNNNYKIKLVIADDGDSAY
NAAVFLDAGSFDLGGDLGEDVTIAQGTAICSGGVIPLDTNVPSATHVWYLDGNIIAGETG
STLDATEDGVYSVDVVFSGTCQTSDSVVVEFIPGAIIQNTIDINVCDNPTGDEVFDLTLN
DVEVIGTQDPTEVNVSYYTLLTDAENGVNEIVDPSNYIGSGTYPETIYVRIDDTASQTCF
DTDSFNLDVIITGINPVMDMEVCDDASNDGFELFDLESQTLSILGTQSATDFDVTYHTSF
TDADSNTNALTSPYNGSNGEFIFVRVENILDSTCYAVSQDPNGEFTLVVNAVAEATQPMD
MIVCDDLSEDGFEVFDLTSQELTILGVQDPNDYTVSFYENMADLSSEMNPITNPTAYQNT
VVSQQTIYVRVNENANPTCFGSTTFDLIVNPLPTAVTPTALSVCDDGTPDGLTSIDLSIK
NNEISGGNPAYSVTYYLTQSDADLEVNPLPIPYDNVSNPQIIFVRVEDVNTTCYTTTTLQ
LEVEQAPVTFPPSDLTFCDPDSDGFGVFTLTDADAEITAGAPGLTVTYHETSSDAQLNVN
PLTSPYNNIVENTQFIYVRVESTTISTACASYETLTLIVYPTPQITDPSPLEVCDNDTDG
IAVFDLELNNAEILNQLDSDTSNDLATADYTITFYETLANAEVPQNAIATPNAYVNTTPD
LQTIWVRVDDNANGCSTVTTMDLVVNPLPVLVQPDALELCNATDLPGETSALAQEEFTLE
DANAQILNGQSGITLTYYFTQSGADNATAADQIFSPYTNVANAQTVYIRAQDNVTNCVST
ITLDLRVNPTPSPQAIPATLVVCDDDNDGFSSFDLDSQTTAILNGEPDVTISYHETESDA
INDINVLISPYTNIVANTQMVYVRAENDNTGCFTIVILPLDVQPSPVVPVAIDDYVVCDD
NDDGFNQFDFDTVMTPQILGTQNPSDFTLTYHTTQANAETGSSPIVNTGNYTNATNPQTI
YIRLVSNTNGCVSTGEFIISVEFPPVIVQPTPLTICDELDANYYENNDEIATFDLTVKND
EITAGDASWIVTYYETQADATADSNAITDPTQYTNMMVGTNPANPQTVYVRVTDGDTGCF
SFTTLTIRVLPNPTPAPNPDNIVLCDDVDVVGPNDLIEIFDLTTNEVATINGEANVSASY
YTDLDDALMGSNQIVDPTMHSNEDPNNPGVAITPQTIYVRVTNGSDALGTGGTGCFTIVS
FDIMVNPLPAVVPISDYIYCELFNDGQYGFDLESKTDEILNGQDPTLFTVTYHETQAEAD
QSMNDLVSPYTNTSNPQTIYVNITNTITGCDTTTTFVIEVQEAAQVNPDMESLDYSECDD
NMETDGDTTNDSVQFDLESLNEEVLDGQDPLSYIVSYYESQSDADAGINPLPLLYENIVN
PQVIYVRVDNDTMVDDGTGTMVDSSICYDTAEITLRVNPLPEFDLEDSYLLCINTNGSEV
VSAPIIDTGLDETQYTFEWLLDGLSLSGETGSSLEPTQAGTYEVIVTNVTTTCNNSDTTI
VEESEPPTVTYELLTEAFADVHNIEVTATGNGTVALYEFSLDDGPWESNIPNNGSFTFTD
VGAGDHIITVRDINGCGERSVPVSIMDYPHFFTPNDDGFNDTWNIYGIGNQPDAVIYIFD
RYGKLIKQLSPTGSGWDGTYNGNPMPTSDYWFTVDYKEQNDTSNTRKQFKAHFTLKR
NT seq
6474 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacttctactagttataaccttcctcagtattgttctaactgcaaaatcacaa
gatattattatgcaaaacggaacagttaaccaatgttctggggtgttttatgattctgga
ggaacaacatcaaattataatgatgatgaaaactatgtaatgactatttgccctgatgga
cctgatcagtttgtccaattacagtttactttatttagtactcaattaagtactgatgta
atgactatttatgatggtgatgatgttacagcaaatattattggtgttttttcaggagga
ggagcagctaataatccagggacaattgctgcgtcttctaccagtccttcaggttgccta
acaatcgagtttgtatcagatgctagtaccaatactttaggatgggctgcaaacgtgtct
tgtttacagtcttgtcaagatattacgccgacaattgactctacaaatccagtagccgat
ggtacaggagtaattcagattgctttgggtggaactgttagttttgatggtagtgctgtt
tttggagatgatgatacaggtgctatttatagttggaattttggtgatggtaccacagca
acaggacagtctgttagtcacgactataataatactgggacttacactgtgacatttact
gcaagtgacattaatccaacaggatgctcagagtcagtcactgttgaagttgaagtttta
agcccatatattgatgttgatcaaacaacatatactgtagatgagttagtagaggatgtt
ttaattaatagtccttgtgctactgtttcttctattggatctagtactggtattaatttt
ggacaagaaaacggtataggatattttacagcaattcctggtgcttttgcttttgaatct
ggaattgttttaaattctggtgatgctatggaagctgaaggacctgaaactggaatccaa
agtagtggaggatgggcaggtgatgctgatttagaaaccgcaattcctggtttaaactta
ggggatactaacgatgcaacttacattgaatttaattttgctccaattgctaattccata
agttttgatttcttatttgcttcagaagaatatggaggttttcagtgtagttatactgat
gcatttgcctttttattaacagatcttaccactggaaatgtaactaatttagcaattgtg
ccaggaacaacagatgttgtgtctgtttttacagtaagagataatgcttataatgcctct
tgtgcctcagctaatccaggatactttgattcatattatggtgcaggaggagaacctaca
ataaattctccaattgattttagaggttatactcgtccaatgacagcttttgcaaatgtc
atacctaataataattataagataaaattagttatagctgatgatggagattcagcatat
aacgcagctgtgtttttagacgctggctctttcgatttaggtggtgatttaggtgaagat
gtaacgatagctcaaggtacagcaatttgtagtggaggtgtaattcctcttgatacaaat
gttccttcagctactcatgtttggtatttggatggtaatattatagcaggagaaacaggg
tccacattagatgctactgaggatggagtttacagtgtagatgttgtcttttctggaact
tgtcaaacttctgattctgttgttgtagaatttattccaggcgccataatacaaaatact
atagatataaatgtttgtgataatcctaccggagacgaggtatttgatctcaccctaaac
gatgttgaagtgataggtactcaagatccaactgaagtaaatgttagttattatactctt
ttaactgacgctgaaaatggtgtgaatgaaattgtagatccttcaaattacataggtagt
ggtacttatcctgaaacaatatacgttagaattgatgatactgcgtctcaaacttgtttt
gatacagactcatttaatctggacgttatcataacaggtattaatcctgttatggatatg
gaagtatgtgatgatgcttcaaatgatggatttgagctttttgatctagaatctcaaaca
ctttctatactagggacacaatctgctacggattttgatgtaacttatcatacttctttt
acagatgcagattcaaatactaacgctttaacaagtccgtataacggaagcaacggtgaa
tttatttttgttagagtagaaaatattttagactcaacttgttatgctgttagtcaagac
ccaaatggagaatttactttagttgttaatgctgtagctgaagcaacacaaccaatggat
atgatagtatgtgatgatctatcagaggatggatttgaggtttttgacctaacctcacaa
gagttgacaattttaggagttcaagatcctaatgattacactgtttctttttatgaaaat
atggctgatttgtcatcagaaatgaatccaattacaaatccaacagcatatcaaaataca
gtcgtatctcaacaaactatttatgttcgtgtaaacgaaaatgctaatccaacatgtttt
ggtagcactacttttgatttaattgtaaatccattacccacagcagtcacaccaacagca
ttatcagtatgtgatgatggtacaccagatggattaaccagtatagatttaagtattaaa
aacaacgagattagtggaggtaacccagcgtattcagtgacatattatttgacgcagtca
gacgcagatttagaggttaatccattaccaataccttatgataacgtcagtaatccacaa
attatatttgtacgagtagaagatgtaaacacgacatgttatacgacaacaacattacaa
ttagaagtagagcaagcaccagtaacctttcctccatcagatctaacattttgtgatcca
gatagtgatggttttggagtatttacactaacagatgcagatgccgaaatcacagcaggc
gcaccaggattaacagtaacctatcatgaaacgtcaagtgacgctcagttaaatgttaac
ccactaactagtccttataataacattgtagaaaacactcaatttatttatgtacgagta
gaaagtacaaccatatcaacagcatgtgctagttatgaaacgttaaccctaatcgtctac
ccaaccccacaaatcacagacccaagtccattagaagtttgtgataacgatacagatggt
attgcggtttttgatttagaattaaataatgcagagattttaaaccagttagattcagat
accagtaacgatctagcaacagcagattacacaattacattttacgagactctagccaat
gcagaagtgccacaaaatgcaatagcaacaccaaatgcttacgtaaacaccacgccagat
ttacaaaccatttgggtaagagtagacgataacgctaatggatgttcaacagtaacaaca
atggatttagtggttaatccattaccagtattagtacagccagatgcattagagttatgt
aacgctaccgatttaccaggagaaactagcgctttagcccaagaagaatttactttagaa
gatgccaatgcacagattttaaacggacaaagtggtattacgttaacgtactatttcaca
caatctggagccgataatgcaacagcagcagaccaaatttttagtccttataccaatgtt
gccaatgcacaaaccgtgtatatcagagcccaagacaatgtgactaattgcgttagtact
attactttagatttacgagtaaacccaacaccatcaccacaagccataccagcaacatta
gtagtatgtgacgatgacaatgacggattctcaagttttgacttagacagtcaaaccaca
gcaattttaaacggagaaccagatgtcactattagctaccacgaaacagaatcagatgcc
atcaacgacattaatgttttaataagtccatacactaacattgtagccaatacccaaatg
gtttatgtacgtgcagaaaacgacaatacagggtgttttactatcgttatactaccatta
gacgtacaaccctcaccagtagtaccagtagcaatagacgattacgtagtctgtgatgat
aatgacgatggtttcaatcaatttgattttgatacggttatgacaccacaaatcctagga
actcaaaacccatcagatttcacactaacataccacaccacacaagccaatgcagaaact
ggaagtagtccaatagtcaacacaggtaactataccaacgcgaccaacccacaaactatt
tatatacgtttagtaagcaataccaatggatgtgttagtacaggcgaatttataatcagt
gtagaatttccaccagtaatcgtacaaccaacaccattaacaatttgtgatgagttagat
gctaattattacgaaaacaatgatgagatagccacttttgatttaaccgttaaaaatgat
gaaatcacagcaggagatgccagttggattgtgacgtattacgaaacacaagccgatgct
accgcagacagtaatgctataacagacccaacgcaatacactaacatgatggtcggtacc
aatccagccaatccacaaacagtgtatgtacgtgttaccgatggtgacacaggttgtttc
tcattcacaaccttaaccatacgtgtattacccaacccaacaccagcaccaaacccagat
aatatcgtgttgtgtgatgatgtagatgtagtcggaccaaacgatttaattgaaatcttt
gatctaaccacaaacgaggtagcaaccatcaatggcgaagctaacgttagtgcaagttac
tacacagacttagacgatgccttaatgggaagcaatcagattgtagatccaaccatgcat
agtaatgaagatccaaacaatccaggcgtagccattacaccacaaactatatatgtacgt
gtaacaaatggatcagatgctttaggaacaggcgggacaggatgtttcactattgtaagt
tttgatatcatggtcaacccattaccagcagtagtgccaatatcagattatatttattgc
gagttatttaatgacggacaatacggatttgatttagagagtaaaacggacgaaatccta
aacggacaagatccaaccctctttacagtcacttatcatgagacacaagcagaagcagac
caatcaatgaatgacttagttagtccatacactaacactagtaacccacaaaccatttat
gtaaacatcactaataccatcactggttgtgataccacaacaacgtttgtgatagaagtt
caagaagcagcacaagtcaatccagacatggaaagcttagattattcagaatgtgatgat
aatatggaaaccgatggagacaccaccaatgatagtgtacaatttgatttagaaagttta
aacgaagaagtattagacggacaagacccattaagctacattgtaagttattatgagtca
caatcagatgcagatgcaggaatcaatccattaccattattgtatgaaaacatcgttaac
ccacaagttatttatgtaagagtagataatgacaccatggtagacgatggaaccggaacc
atggtagacagttcaatctgttatgatacagccgaaatcaccttacgagtaaatccatta
ccagaatttgatttagaagatagttatttactatgtatcaataccaatgggtcagaggta
gtcagcgcaccaatcatagacacaggattagatgaaacccaatatactttcgagtggtta
ttagacggattaagcctttcgggagaaacaggaagcagtttagagccaacccaagcaggt
acttatgaagttatagtaacaaatgtaaccacaacatgtaataactcagatacgactata
gtcgaagaaagtgagccaccaacagtaacctatgaattattaacagaagcctttgcagat
gttcacaacatagaagttacagccacaggaaacggaacggtagcactatatgaatttagt
ttagacgatggaccatgggaaagtaatatcccaaacaacggaagctttacctttacagat
gtaggagcaggcgatcatataataacagtaagagatataaacggatgtggagagcgaagt
gtaccagtatcaatcatggactatccacacttcttcacaccaaacgacgatgggtttaat
gacacatggaacatctacgggatcggcaatcaaccagatgcagttatttacatatttgat
cgttacggaaagctaataaaacagttaagtccaaccggatcaggatgggatggaacctac
aatggtaacccaatgccaaccagtgattattggtttactgtagattacaaagagcaaaat
gataccagcaacaccagaaaacaatttaaagcgcactttaccttaaaacgttaa
DBGET
integrated database retrieval system