Ooceraea biroi (clonal raider ant): 105280308
Help
Entry
105280308 CDS
T05778
Symbol
Fancd2
Name
(RefSeq) Fanconi anemia complementation group D2
Organism
obo
Ooceraea biroi (clonal raider ant)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FancD2
EF-G-binding_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105280308
NCBI-ProteinID:
XP_011339050
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(2189918..2196768)
Genome browser
AA seq
1504 aa
AA seq
DB search
MDRRKLKLKGSLHRNLQSDSQSSERADSIISSKQASLCTTKERSDSFIDRRLSGVGSSAL
KPLNSQSSVGSNSSMKSRKRNFYEIQNDASEEEDLIVSHKLSKTAVSRSKLNSQVSMNTS
VMSPEDTRPSENSTPIKRRYPFTNKSRVASPKITEEVPKRTEEDSDLDVSFDEPTVIRKK
HKTTQNTNTDEDSPLKKGSTSYRSPIKPITKSNISQKKQHDTSKELYSATRLEKRKSTDK
LVEKCKVNSEDRSFRKQDELCVFSNFLQKCGITLSVDDVHVLNVPASVAKRKMNKLLNSK
QFQKKDIINTIDKYVQNEGRFERMLNDMELSVDTRGLSALNNVSLARILLEFTEIQTDVY
NIFISKLNEFVLLADTPEKIPWAILLLHQFRFLDTIVNVDTLTTNIEQLLETCPLWFQHE
LILFLPDILSDVQHQSIAQILIKMLEENNELINVILNCITTFNLSEECLEEYKIKVLQLL
KTNMKIKFVPSVIRFLLNDSVTPDIIKQTLLVLRNIEMQPLAGDKVEECYKNQVQIVKTL
KMCMLLVKDVVPVVLALIKDINKNAKPMDLIILLLVFSGTTRQKSAETLLKQNIRCGFYR
ISLLHTFYNEYKEVVQELQTAILQLASKLLKSEECVFVNFAIEWFRLQFVSQKDMLFKQR
EIVEKIILLMGNNDQTVKHALTILCKMTENTVERDCLISHCNHLRILLEKIDCFGLEEVG
TLGDLLHGLCLADDVTSESLRDDLFILLQKQLSVAKPITKCKGVMAAVMAIKHLAGKVET
CDQALELFNKVMKSVKSCSKSQPLFYDQLSQVIVQTEHINANFLQKITSCIEDEFINTYM
TDTLPSSEDLVPKFGLNKGTGNESENCVLNLGNKRSGSIAPVLFRLLRVCNMRLSVHGEL
QAIDALLGCEILMPGNFDIPEPPILDLMICSINWFREIITGFVTQTDLLLQEQILKRLDT
LIDLQGELNVLLTLCDTKYQPPPCYFHYFPLPPFVKMEHKTTKKGKKSSKGNKANITITE
NEPWETGSILCSKNPAYFRKFDAKIAHLLDIKTGSQSSSCCEMQGISIKQVCFLTRELLA
IFENEPSESFVKDLIHLLPKICSKLDDIVNRLRQENNHDFREGAKLLLRLLTKIFDWKGF
LSVTYNILLREGLRTLARQVNEENAQLRSCKELVAESYKYFESLSDVATEISLATALVNM
CQSLMKHSETYTQQYKDKHAKLAYGFLCLEWPEDKHTGSQYKLSINQLLNNWMDNEPLPL
QVVTSILKWLPNEVSDLENVQSTLTQIPSVNRNIFHLLYKKLFDGLIKGINISLLTVNSD
PKRIKVWHSIVSNVQKLVQICKTLKTKSLIQLFLRYMPLLIKQFLNVGMPILEHNLKYQT
DDVTSILKMMQSGTRYLHAICCDCTEKKNLPLTKYVPAAKSILERLIYSVKGMLVLNDSA
TAFWMGNLVNKNLDGREILSQTSSEETAVDMNAVSEELVSASSEILDSDLSEDLMEETDD
EDNN
NT seq
4515 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataggagaaaattgaagctcaagggcagcttgcacagaaatctgcagtcagatagt
caatcttcagaaagggcagattccatcatcagcagtaagcaagcaagtctttgcacaaca
aaagaaaggagtgattcatttattgatagaagattgtcaggcgtcggatcatcagctttg
aagccactaaacagtcaatcatcagtagggagtaattcttccatgaaaagcagaaaacga
aatttttatgagattcaaaatgatgcctcggaagaagaagatttgattgttagccataaa
ttatccaagactgcagtgtcgagatcgaagctgaatagtcaagtgtcaatgaacacatct
gtcatgagcccagaggatactcgcccttcagaaaatagtacgccgataaagcgtcgttat
ccattcacgaacaaatctagagttgcgagtcccaaaataacagaggaggttcccaaaaga
acagaagaagacagtgatcttgatgtttcattcgacgaacctacagtcatcaggaagaaa
cataaaactacacaaaatactaacactgacgaggattctcccttgaagaaaggttccacg
agttatagatcacctatcaaaccaatcaccaaatctaacatctcgcagaagaagcaacac
gacacatctaaagaactgtattcagctacaagattagaaaaacgtaaaagtactgataaa
cttgtggagaaatgcaaagtcaacagcgaggatcgttcattcaggaagcaagatgagcta
tgtgttttttctaattttttacagaagtgtggaattacattatcagttgatgatgtacat
gtacttaatgttcctgcatctgttgccaaaaggaagatgaacaagctattaaactcgaag
caattccaaaaaaaagatataattaatacaatagataaatatgttcaaaatgaagggaga
tttgagaggatgttaaatgacatggaattgtctgtcgataccagaggtctcagtgctcta
aacaatgtatctctggcaaggatattattagaatttacagaaattcaaacagatgtatac
aatatctttatatctaagctcaatgaatttgttctcttggcagatactcccgaaaaaata
ccctgggccatattattgctacatcagtttcgttttttggatactatagtcaatgtcgat
acgttaactacaaatatagaacagttgttagaaacgtgtccactatggttccaacatgag
ctcatcttattcctgccagatattttgtcagacgttcagcaccagagtatcgcgcaaatt
ctgataaaaatgttggaagaaaataatgaattgataaatgtgatcttaaactgcatcacc
acctttaatctcagtgaggaatgtctggaagaatacaaaattaaagttttgcaattgcta
aagacgaatatgaaaataaaatttgtaccgtccgttatcagatttcttctcaacgattct
gtaacacctgacattatcaagcaaacgttacttgtactgcgcaacatagagatgcaacct
cttgctggagacaaagttgaagagtgctataaaaatcaagtgcagatagttaaaacgcta
aagatgtgtatgttgttggttaaagacgtagtgcctgttgtgttagcgctaataaaagat
atcaacaaaaatgcaaagcccatggatttaatcattctactcctggtgttttctgggaca
acgagacaaaagagcgcagaaactttattaaaacaaaacatccgatgcggcttttacagg
ataagtttgctgcacacattttacaatgagtacaaagaggttgttcaggagttgcaaaca
gcgatattgcaattggcgtctaaattattaaaatctgaagagtgcgtgtttgttaatttt
gcaatagaatggtttcgattgcagttcgtcagccaaaaagacatgttgtttaaacagcgt
gagattgtagaaaagattattcttctcatgggcaataacgatcaaactgtaaaacacgca
ctgactatactttgcaaaatgacggagaacacggttgagagagattgcttgatatctcat
tgcaatcacctgagaattctgctagaaaagatagattgctttggactggaagaagttggc
actctgggcgatttattacatggattatgtttagctgacgatgtgacttcggaatcgcta
cgtgatgatctgttcatactgttgcagaaacagttgtctgttgctaagccgatcacaaag
tgcaaaggtgttatggcagcagtaatggcgataaaacatctagcaggaaaggttgagact
tgtgatcaagctctggaattatttaataaagtaatgaaaagcgtgaagagttgttctaaa
tcgcaacctttgttttatgatcaattgtcacaagtaatcgtgcaaacggaacatattaat
gcaaactttttacaaaaaattaccagctgtattgaggatgaatttattaatacatatatg
acagatacattaccatccagtgaagatttagtacctaaatttgggctaaataagggaaca
ggaaacgagtcagaaaactgtgtgctaaatttgggaaataaaagaagtggttcaattgcg
ccagtattgtttagacttctcagagtgtgtaatatgaggctcagcgtgcatggggaatta
caagctatagatgctcttctgggatgtgagatactaatgccaggaaactttgatataccg
gaaccgccaatactggatctcatgatatgcagtattaattggtttagggaaataatcaca
ggctttgttacacagacggatctcttactgcaagaacagatactaaaacgtctagatact
ttgatcgatttgcaaggtgaactaaatgttttactaacattatgtgatactaaatatcag
ccaccaccatgttacttccattacttcccattaccaccatttgtaaaaatggagcacaaa
actactaaaaaagggaagaaatcttcgaaaggaaacaaagcgaacattacaattacggag
aatgaaccatgggaaacgggttccatactgtgctctaaaaatccagcatactttaggaag
tttgatgcaaagatagctcatcttttggatatcaaaactggttcacagtcgtcatcgtgt
tgcgaaatgcaaggcatatcgataaagcaagtctgttttctcacaagagagcttttggcg
atatttgaaaatgaaccttctgagtctttcgtgaaagatttaatacacctgttgccaaag
atctgctcaaaattggacgacatcgtcaaccgattgagacaagaaaataatcacgatttc
agagaaggagcaaaactgttgttacgccttctgactaaaattttcgattggaaaggattc
ttgagtgtaacatataacatcttgctgcgtgagggattgcgtaccttagctagacaagtt
aatgaggaaaatgcacagctgcgttcttgcaaggaactcgttgccgagtcgtacaaatat
tttgaatcgttgtcggatgttgctaccgagatatcattagctaccgctctcgttaacatg
tgccaatcgttaatgaaacattccgaaacctatacccaacagtacaaagacaaacatgcc
aaattagcatacggatttctctgtctggaatggcccgaggataagcataccggttctcaa
tataagttatctatcaatcagttattaaataattggatggataatgaaccgttaccgtta
caagtagtgacatcaatcttgaaatggttgccaaacgaagtctcggatttagaaaatgtg
cagagcactttaacacaaataccttccgtgaacaggaatattttccatctgttgtataag
aaattgttcgatggtttgatcaaaggcatcaatatatcattgttaacggtcaactcagat
ccgaagaggataaaggtatggcacagcattgtttcaaatgtacaaaagctcgtgcagatt
tgcaaaactttaaaaacgaaatctctcatacagctgtttctgcggtacatgccgctgttg
ataaagcaatttctaaatgttggcatgcctatacttgaacataatttgaagtatcaaacg
gacgacgtaactagcatcctgaaaatgatgcaaagtggtacgcgatacttacatgctata
tgctgtgattgcacggaaaagaagaatttgccgttaactaaatatgtgcctgccgcaaaa
tctatactagagagattaatttacagtgtcaaaggaatgttggtccttaacgacagcgca
acagccttttggatggggaatcttgtcaataagaatttagacggacgtgaaattctttca
cagacatcgtcagaagagactgcagtagacatgaatgccgtttctgaggaactcgtaagt
gcgtcatctgaaatcttggattctgatttaagtgaagatttaatggaggaaaccgatgat
gaagacaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
