Okeanomitos corallinicola: WJM97_14015
Help
Entry
WJM97_14015 CDS
T10416
Name
(GenBank) AAA family ATPase
Organism
ocf Okeanomitos corallinicola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WZB86512
LinkDB
All DBs
Position
3228405..3234188
Genome browser
AA seq
1927 aa
AA seq
DB search
MFSLPGIVVRTQICESAASLVYRAIREDSHQPIIIKLLKQEYPTPEELSRYRTEYQITKS
LNLSGVVKVYELQKYKNSLVMLLEDFGGDSLQFLNQQQRFNLQDFLQIAIAITESLAQIH
AVNIIHKDINPSNIVFNPVTKELKIIDFGISTQLTRENPTITDPNILEGTIAYISPEQTG
RMNRSLDYRTDFYSLGVTFYELLTNQLPFLTTDALELVHYHIAKQPLTPSEINPDIPPML
SAIVMKLIAKTAEERYQSALGIKADLENCLNQLSTHNYIANFQIGSQDIYDKFQIPQKLY
GREKEIKILLDAFTRISVKSSEVMLVIGYSGIGKSALVQELYKPITQKRGYFISGKFDQY
QRNIPYSAIVNAFKQLIKQLLTKSAAELQQCKQKILTALGVNSAVIIDVIPELELIIGEQ
PPVLELGAVENANRFNLVFQNFIKVFTTPSHPLVIFLDDLQWADGASLKLMQILLNTDIS
GLLLICAYRENEVDASHPLMLALDSMTKNGVIVNSILLSPLDLNTVVKIIEDTLKYWGEE
VLPLANLLHLKTGGNPFFLNEFFKSLYTEELLRFNLLTQKWEWDLEQIQVRDFTDNVVEL
MINKIKTLPENSQDVLKLASCIGNQFDTEQLALIANQDWQKIAHDLYLCVSSGFLVNIGN
NKNLELAHVNREFAYEFVTNTEFTVAEYKFTHDRIQQAAYLLIPESERADIHYRIGKIFL
KNTQNYQHEELIFTIINQINFGVHLITEQSEKDELAQLNLIAGKKAKTSVAYQPALNYLE
IGIDLLGTISWQRKYNLSLYLHEEAAEVAYLNGDFEKMTVHVNNVHQYAKTVLEKIKVTN
VKILALISQSKLNESINIGLDILDELGFKLPRNPNYFHIFAGFLATKISLFSKDFDYLAN
LPLITDKYKIAALSILLNISFSAYIVAPNLLAIIVFKQITISSRYGYSIDSTRVFATYGL
ILCGIFHQIELGYQFGQLSLNLIDKFNAHEFAAKSFYTVNVFINHWKKPLREIIPSLIET
YKVGLETGDLVFAAYGVLVYCCYSFLAGYELSDLKLKIELYSETITRLKQTEALYQLKSF
HQAIINLLGENENPCKLMGSVYDADVILPEIIKAQDHSSVFDLYFYQQILCYIFGEYGES
LENAELARKYINSMTSTGLIPHFYFYDSLARCQLYSVVDVKLQKKYLAQIKANQKKMQIW
AHHAPANYLHKFYLVEAEKYRIFNQSDLAIENYSQAINLAKEHEYIHECAIAYELAGRFF
LANKQDLIAKTYLQEAHYYYKLWGANAKVKDLENKFSQFFIDKIRGEQNINKVHISNTIS
VTSNSHSSNLDLATFIKASQAISREIMLDKLLATLMKIVIENAGAQKGYLILENQGKLLI
EAKGAVDSDQVKILQSLDVDTCGKVSTAIINYVVRTQETVVLNNASLEGGFTQDIYIQNH
QPKSILCLPLINQGKLIAIVYLENNLIIGAFNAQRVEVIKLVTSSAAISLENAKLYQEMR
ENESRLAQLNQDLEKSLQSELEITSAASRFVPNQFLSFLGYNSLSEVKLGDSVQLEMSVL
FSDIRNFTTLSEKMNPQDAFLFINSYLSRMEPIITENQGFIDKYIGDAIMALFSGEADNA
VKAGIAMLKTLDLYNQDGLRYGFEAINIGIGIHTGSLMLGTVGGQNRMDGTVISDAVNLA
SRIEGLTKIYHVYLLITEKTYQKLVNIHDYNIRILDKVQVKGKTELITVYEVFDADVPAV
KQGKLNSQSLFEEAVFLYHQGDFTQALNLFVRCLEICPVDEVANIYSQRCQEKQARVKID
VLSRSLELTKIKGDFGKTFYDVLFTDYPQIQVLFANSDMLQQQDKLCHSLEIIVENLNNP
RNFTSFLKGLGAIHVKYGVLPEHYPIVGNTIIKAFKVHLGTDWNADFEAAWLDAYAAIQS
LMLIGAE
NT seq
5784 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttccctaccaggtattgtagttaggacgcaaatttgcgaaagtgcagcatctctc
gtatatcgagctatacgagaagattctcatcaacccataattattaaattacttaaacaa
gaatatcctacaccagaagaactatctagatatcggacagaatatcaaattacaaaatct
ctgaatttatctggagttgtcaaggtttatgaattgcaaaaatataaaaatagtctagtc
atgttactagaagattttggtggtgattcattacaatttttaaaccaacaacagagattt
aacttacaagattttttacaaattgcgatcgccataactgaaagtttagcacaaattcat
gcagttaatattattcataaagatattaacccctcaaatatagtttttaatccagttaca
aaagaattaaaaattattgattttgggatttctactcagttaaccagagaaaaccctaca
attaccgatcccaatattttagaaggaactattgcttatatttccccagaacaaacagga
agaatgaaccgcagtttagattacagaactgatttttattctctaggtgttaccttttat
gaattattaacaaatcaactgccttttttaactacagatgctctagaattagttcattat
cacattgctaaacaacctttaaccccttcagaaattaatcctgatattcccccaatgctg
tcagcaattgtgatgaaattaatagcaaaaacagcagaagaacgttatcaaagtgcttta
ggaattaaggctgatttagaaaactgtttaaatcaattatctacacataattatattgct
aattttcaaattggtagtcaagatatttatgataaatttcaaattccgcaaaaactttat
ggtagagaaaaggaaattaagattttactcgatgcttttaccagaattagtgtgaaatct
agtgaagtgatgctggttatcggctattcaggtattggtaaatcagcgttagtacaagaa
ctatataaacccattacccaaaaacgtggttattttatttcaggtaaatttgatcaatat
caacgcaatattccttatagtgctattgtaaatgcttttaaacagttaatcaaacaatta
ttaactaaatccgcagcagaattacaacagtgtaaacaaaaaatattaacagcattgggg
gtaaatagtgcggtaattattgatgttattcccgaattagaattaattattggtgaacaa
ccaccagttttagaattaggtgcagtagaaaatgctaaccgctttaatttagtatttcaa
aacttcattaaggtttttactactccatcccatcccctcgtcatatttttggatgattta
cagtgggctgatggtgcatctttaaagttaatgcaaattttattaaatactgatatatct
ggattattgttaatttgtgcttatcgggaaaatgaggttgatgcttcccatccattgatg
ctggctttagatagtatgacaaaaaatggagttattgttaatagtatcttgctctcacct
ttagacttaaacacggttgttaaaatcattgaagatactttgaaatattggggggaagaa
gttttacccttagctaatttattacatttaaaaactggtggcaatccctttttcttgaat
gaattttttaaatcattatatacagaagagctattaagatttaatctattaactcagaaa
tgggagtgggatttagagcagattcaagtgagagattttacagataatgttgtggaattg
atgattaataaaatcaaaactttacccgaaaatagtcaagatgtcttaaaactagcttca
tgtataggaaatcaatttgatacagaacaattagcattaattgctaatcaagattggcaa
aaaatagcccatgatttatatttatgtgtaagttctggtttcttagtaaatattggtaat
aataaaaatttagaattggctcatgttaaccgagaatttgcctatgaatttgtaactaat
actgaatttactgtggctgaatataagtttactcacgatagaattcaacaagctgcttat
ttactaatcccagagtcagaaagggcagatattcactatagaattggtaaaatttttctc
aaaaatactcaaaattatcaacacgaagaattaatttttacaattatcaatcaaataaat
tttggtgtacatttaattactgaacagtcagaaaaagatgagttagctcaattaaattta
atagctggtaagaaagcaaaaacctctgtcgcatatcagccagcattaaattatctagaa
ataggtatagatttattaggtacaatatcttggcaaagaaaatataatttatctttatat
ttacatgaagaagcagcggaggttgcttatcttaatggtgattttgaaaaaatgacagtt
catgttaataatgttcatcaatatgcaaaaactgtcttagagaaaattaaagttactaat
gtaaaaatcttggctttaatttctcaaagtaaattaaatgaatctattaatatcggttta
gacatacttgatgaattgggatttaaactgcctagaaatcctaattattttcatatattt
gcaggttttttagcaactaaaatatctttatttagtaaagattttgactacttagctaat
ttacctttaattacagataaatataaaatagcggctttaagtattttgttaaatatcagc
ttttctgcctatattgttgcacctaatttactagcaatcattgtctttaaacagataact
atatcatcacgatatggttatagcattgactcaactagagtctttgctacctacggttta
attttatgtggtatttttcatcaaatcgaattgggttatcaatttgggcaattatcactt
aatctaattgataaatttaatgcccatgagtttgcagctaaaagtttttatacagttaat
gtttttattaatcattggaaaaaacctttacgggaaattatcccttctttgatagaaaca
tataaagttggtttagaaacaggtgatttagtatttgctgcttatggagttttagtttat
tgctgttattcttttttagctggctatgaactatcagatttaaagttaaaaattgaactt
tatagcgaaacaattactagattaaagcaaacagaagctctttatcaacttaaatctttt
catcaagctatcattaatttgctgggtgaaaatgaaaatccatgtaaattaatgggtagt
gtttatgatgcagatgttattttaccagaaattatcaaggctcaagatcatagttcagtt
tttgatctgtatttttatcaacaaattctttgttatatttttggagaatatggagaatct
ttagaaaatgctgagttagctagaaaatatattaatagcatgacttctactggtttaatt
ccccatttttatttttacgattctttggcacgatgtcaattatatagtgtagttgatgtt
aaattacaaaaaaaatatttagcacaaattaaagctaatcaaaagaaaatgcagatttgg
gcgcatcatgcacctgccaattatttacataaattttatttagtcgaagcagaaaaatac
agaattttcaatcaatctgatttagctatagaaaattactcccaagctattaatttagct
aaagaacatgagtatattcatgaatgtgctattgcctatgaattagcaggtagatttttt
ttagcaaacaaacaggatttaatcgctaaaacttatctccaggaagcgcactactactat
aaactctggggtgctaatgctaaagtcaaagatttagagaataaattttctcaatttttt
attgataaaatcagaggtgaacaaaatattaataaagttcatatttctaatactatctct
gttacatccaatagtcatagttcaaacttagatttagctacttttattaaggcttctcaa
gctatttctagggagattatgcttgataaattgttggctactttaatgaaaattgtgatt
gaaaatgcaggagcgcagaaagggtatttaattttagaaaatcaaggcaagttattaata
gaagctaaaggtgctgttgattcagatcaagttaagattttacaatctctagatgttgat
acttgtggtaaagtttctacagcaattattaattatgtggtacgcactcaagaaactgtg
gttttaaataatgctagtttggaagggggttttactcaggatatttatattcaaaaccat
caacctaagtctattttatgtctacctttaatcaatcagggaaaattaattgctattgtt
tatctggaaaataatctgattattggtgcttttaatgctcaacgtgtagaagttattaaa
cttgtgacttcttctgctgctatttctttggaaaatgctaagttgtatcaagaaatgagg
gaaaatgaaagtcgtttagctcaactgaatcaagatttagaaaaatctctacaatctgaa
ttagaaatcaccagtgctgctagtcgttttgtacctaatcagtttttatcttttttgggt
tataacagtttatctgaggtgaaattaggtgattctgtacagttggaaatgtcggtttta
ttttctgatattcgcaatttcacaactttaagcgaaaaaatgaatccccaggatgctttt
ctgtttattaattcctatttgagtcgcatggaaccaataattacggaaaatcaagggttt
attgataagtatattggtgatgcaattatggcgttatttagtggggaagctgataatgct
gtgaaagcaggaattgctatgttaaaaactttggatttatataatcaagatggtttacga
tatggttttgaggcgataaatattgggattggtattcacacaggttctttgatgttggga
actgtcggtggacaaaatcgcatggatggtactgtaattagtgatgcggtaaatttagct
tcccgcattgaaggtttaactaaaatttatcatgtttatttgttaattactgaaaaaact
tatcaaaagttggtgaatattcatgattataatattcggattttggataaagttcaagtt
aagggtaaaactgagttaattactgtttatgaggtgtttgatgctgatgtaccagcagtt
aaacagggtaagttaaatagtcaatccttatttgaagaagctgtgtttttatatcatcaa
ggtgattttactcaagcattgaatttgtttgttcgatgtttggaaatttgtcctgttgat
gaagttgctaacatttattctcaacgttgtcaagaaaaacaagctagagtgaagattgat
gttctatctcgttccttggagttgactaaaatcaaaggtgattttggtaaaactttttat
gatgtgctatttacagattatcctcaaattcaagtactttttgctaatagtgatatgcta
caacagcaagataaattatgtcacagtttagaaattattgtggaaaatctgaataaccct
agaaattttacttcttttttaaagggtttaggtgcaattcatgttaagtatggtgtttta
ccagaacattatccgattgttggtaatacaattattaaggcttttaaagttcatttaggt
acagattggaatgctgattttgaagctgcttggttagatgcttacgctgcaattcagtct
ttaatgcttataggtgcggagtaa
DBGET
integrated database retrieval system