Okeanomitos corallinicola: WJM97_20700
Help
Entry
WJM97_20700 CDS
T10416
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB domain-containing protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
ocf Okeanomitos corallinicola
Brite
Transporters [BR:
ocf02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
WJM97_20700
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WZB87746
LinkDB
All DBs
Position
4727048..4732513
Genome browser
AA seq
1821 aa
AA seq
DB search
MSNSSKQDSQTPTTSSQRLRLMLLSRGSMALVSLLLLLLVGSIWWLRNFIKTELAPLAQE
NLTKALNRPLKLGEVTGFSLTGVKFAASSIPATPTDTDRATIESIDVSFNPWQLVTNRQI
KLDVTLINPEVYIEQDSQERWITTILEPPGKPGIIKTDLDTLRFRNAKLVLVGNEKTNIN
LPSDQSPVPVVYSNLYGKAQLVDNNQAVKFDVTGKGDSGGSVFIEGNLQAQATLDGDLQV
KAQDLSAADVSRLIPLPAYLQTGQINSDLQVKLIPDQPTLLDGNAVLKGVNLQIPEVPQK
LLNTQGSVKFAGLSLELENIVSNYGKIPLTAKGIIDREKGFDLTANVNAVSVTNALETLK
VKSPLPVSGVVKADLKISGNIDEPMLSGQVTNIKPAKIDKVDFEQVSSRFTLTSRDSLIT
LKDIQGKTTLGGEVKGTGKIQLGKVPQMDVNLIAQNVPGDAIAKLYNDTINSTLKVGTVT
ATAKLSGAAENVQTVVRWQAPEATYPASGETIINPDQTVDFRNVAINVAGNIIRGYGSYN
RQNWQAVAEASGVKIEPFLKPEQLENISLGNAAFNGKLVVSGTSEKFQVTNIRSEGAGIN
IGGGRVNIARLQLEDKNFVADLIANNVRLGRILKQSLPILNNPIAGKFTIAGNTENFDLK
TLGAVGEGSLTVGNGKITAKNIQVGNGSYKAQVAVNNVPVQKLADIPPQLTGILAGDFNV
AGAVDSFQPENIQATGNARLNLAGGIVTASNIQVADGKYQAVVNSSGVQLNRLNQQLQGK
FTSQLQVAGILGSTKLADLRATGQVQFSRGIPGINTPLNAALAWNGQQLTIPQARTPNIN
ASGYIVANAQQPGIPEITQLNLNVQAQNYDLKQLPFNLPNAVNVAGTADFKGQITGKPTS
PNVVGALALKDLQVQKFAFEPLLTGEVNIVSGKGSNIDIAGKKDRLAATLNANNQPTAFL
VQWQQALATGEAQGDNWNVKVNQFPLQVLNFNLPSNPVLGKGVLAGFLSGDLQFNQKTLD
AKGNIAIAKPQLGRIKGDNFATQFSYNNNTATITDGKFTKDESSYILNAAVKQTSQGPQI
QAKVNLDKANIQDLLTVAQIFEIQDLQRGLTPPTYGTAADLTTNPRGLPEQTLLNQIQRL
AEIDALLLAEEEKRVEFQPIPDLRDLKGILNGEIALNTATKNGLAINFKLRGQDFTWGRE
EEPSRFYRADKLIAEGGFEKGILRLQPLRIEAKNRLIALTGNIGGEQQSGKLIVENFPIQ
LLDRFVKIPLGISGNLNINAGLAGSMANPKSRGNLEITEGTLNQKPIQLALAGFSYSDGR
LQFGSEFKAAGIEPLAIKGDIPYKLPFASVEPSNNQIQLDAKIENENLRILNLLTDQIAF
ENGEGNIDIKVRGTIKKPLVEGVATLNNATFVAQALPGKLTNVSGKATFDLDKVILESLQ
AQFSDGKIEAAGEIPIFNNQPIPEEKQLAVSLEKLILNLKGLYQGGASGNLAITGSVLKP
GIGGKIELSNGQVLLTESSASALSQNNPQSSILAANKQNKIPDVDSGTVRLNNLIIKLGK
NVQIASPPVFNFLASGELDVTGSLNDPIPAGTIRLDKGGVNLFTTQFKLARSYKHTAIFR
RSQPRDPELDVKLIAKVLDGTQTTDLNRQLSTGLSALETVRVEAIVKGSARQLDKNLELR
TSPSRSQTEIVTLLGGGFIDTQGRGDSTLGLINIAGSAVFNNFQGAFNQIGDAFGLSELR
IFPTILSDNPEAGKSNSTLELALEAGIDISNIFSLSTIKILTASDPFQWGINYRINDEFR
IRASTNLTDDSRTVIEYERRF
NT seq
5466 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaactcttctaaacaagattctcaaaccccaaccacaagctcccagcgcttacgg
ttgatgctcttgagtcgtggtagcatggctttggtttcgctgttgctgctattacttgtt
ggtagtatttggtggttaagaaatttcattaaaacagagttagcacccctagcacaagaa
aatctgaccaaagctctcaaccgtcccttaaaattgggggaagtaacaggattttccctc
acaggtgtaaaatttgctgcttcatctattcccgcaacacctacggatacagaccgggca
actatagaatcaatagatgttagttttaatccttggcaattagttactaatcggcaaata
aaattagatgttactttgattaatccagaggtttatattgaacaggatagtcaagaacgc
tggattactactattttagagccaccggggaaaccagggattattaaaactgatttagat
acactccgttttcgtaatgccaaattggtattagtaggaaatgagaaaacaaatatcaat
ttacccagtgaccaatctccagttcccgtagtatattcaaacttatatggtaaagcccaa
ctggtagacaataaccaagcagttaagtttgatgtaactggtaaaggagacagtggtggt
agtgttttcatcgaaggaaatttgcaagctcaggctactttggatggggatttacaagta
aaagcccaagatttatcagccgccgatgtcagtcgtttaattcccttacctgcgtattta
caaactggacaaattaatagtgatttacaagttaaattaattccagaccaaccaacttta
ttagatggtaatgcggttttaaaaggggtaaatttacaaatacctgaagtacctcaaaaa
ttgcttaatactcagggaagcgttaagtttgccgggttatctttagagttagaaaatata
gttagtaattatggtaaaattcctctcacagctaaaggcataattgatcgagaaaaaggc
tttgatttaactgctaatgttaatgcagtgagtgtaactaatgctctagaaactctcaaa
gttaaatcacctttacctgtgagtggagtagtaaaagcagatttaaagatatcaggaaat
attgacgaaccgatgctttcaggtcaagttactaatattaaacctgccaaaattgataaa
gttgattttgagcaagttagcagtagatttactctgactagccgtgattctttgattacc
cttaaagatattcaaggtaaaactacattaggtggggaagttaaaggtacaggaaaaatc
caattggggaaagtaccacaaatggatgttaatttaattgcccaaaatgtcccaggagat
gcgatcgctaaactctataatgatacgattaattctacattaaaagttggtactgtcacc
gctacagctaaacttagtggtgcggctgagaatgtacaaactgtagtcagatggcaagcc
ccagaagccacatacccagcgagtggggaaacaattatcaacccagaccagacagttgat
tttaggaatgtagctattaatgtcgctggtaatatcatccgtggttatggtagttataat
cggcaaaattggcaagctgtagctgaagcatcgggagttaaaatagaaccttttttaaaa
ccagaacaattagaaaatatctctttaggtaatgctgcatttaacggtaaattagttgtc
tcaggaacttctgaaaaattccaagtcactaatattcgttctgaaggggcaggtattaat
attggtggtggtagagttaatattgcacgtttgcaattagaagataaaaactttgtcgct
gatttaattgctaataatgtccggttaggaagaatattaaaacaatctttaccaatttta
aataatcccattgcagggaaatttaccattgctggtaacaccgaaaatttcgacctcaaa
acattaggtgctgtgggtgaaggtagcttaacagttgggaatggaaaaatcactgctaaa
aatattcaagtaggtaatggtagttataaagctcaagttgcagttaacaatgtacctgta
cagaaattagcagatattcccccacaattaacaggaatattagcaggtgattttaatgtt
gctggtgctgtagactcttttcaaccagaaaatatccaagcaactggtaatgctagattg
aatttagctggtggaatagttacagcctctaatattcaagttgctgatggtaaataccaa
gcagtagttaatagttccggtgtgcaattaaatcgtttaaaccaacaattacaaggtaag
tttaccagtcaattacaagtagcgggaattttaggttcgacaaaattagctgatttgcgt
gctaccggtcaagtgcaatttagtcgaggtattcccggaattaatactcctttaaatgca
gcattagcttggaatggtcaacaattaactattccccaagccagaacaccaaatattaac
gccagtggttatattgtcgctaatgcacaacaaccaggtattcccgaaatcactcaatta
aacctgaatgtgcaagcgcaaaattatgacctaaaacaattaccatttaatttacccaat
gctgtaaatgtagcgggaacagcagattttaaaggacaaataaccggaaaaccgacatct
ccaaatgtggtaggtgcgttggctttaaaagatttacaagttcagaaattcgcctttgaa
ccattattaactggtgaagttaatatagtttcaggaaagggttcaaatatagatattgcc
gggaaaaaagatagattagctgccacactaaatgctaataatcaacctactgcctttttg
gtacagtggcaacaagcattagctacaggtgaagcacagggagataattggaacgttaaa
gttaatcaatttccattacaggttttaaactttaacttgcctagtaatccagttttgggt
aaaggtgtattagctgggtttttaagtggagacttgcaatttaatcaaaagacattagat
gctaaaggtaatattgcgatcgctaaaccccaattaggtagaattaaaggtgataacttt
gccactcagtttagctacaacaataatacagccaccatcacagatggcaaatttaccaaa
gatgaaagtagttatattttaaatgccgctgttaaacaaacttctcaagggccccaaatt
caagctaaagttaatctcgacaaagccaacatccaagatttattaacagttgctcaaatc
tttgaaattcaagatttacaaagaggtttaacaccaccaacctacggaacagcagcagat
ttaacaaccaacccgcgaggtttaccagaacaaactttactgaatcaaatccagcggtta
gcagagatagatgcactactattagcggaagaagaaaaacgagtagaatttcaacccata
ccagatttaagagatttgaaaggaattttaaatggggaaattgccttaaatacggctact
aaaaatggattagcaatcaactttaaattacgtggacaagattttacttggggtagagaa
gaagaaccaagtcgtttttatcgtgctgataaattaattgctgaaggtggttttgaaaaa
ggtattttacgtttacaacctttacgtatcgaagctaaaaatagactcatagctttaact
ggtaatattggtggtgaacaacaatcaggaaaattaatagttgaaaatttccccattcaa
ctattagatagattcgtgaaaattcctctgggaattagtggaaatcttaatattaatgct
ggtttagctggtagtatggctaatccaaaatcgagaggaaacctagaaattacagaagga
acactcaatcaaaaacccattcagttagctctagcaggttttagttactccgatggaaga
ttacagttcggtagcgaatttaaagccgcaggaattgaacctctagcaattaaaggtgat
ataccttacaaattaccttttgcatctgtagaaccaagtaataatcaaattcaattagat
gctaaaattgaaaatgaaaatctcagaatattaaatttactaactgatcaaatagccttt
gaaaacggtgagggaaatatagatattaaagttaggggaacaatcaaaaaaccactggtt
gaaggtgtcgctaccctgaacaatgccacatttgtagcacaagcattacctgggaaactt
acaaacgtttctggtaaagcaacatttgatttggataaagtcatattagaaagtctacaa
gcacagtttagtgatggtaagatcgaagctgctggagaaattcccatctttaataatcaa
ccaataccagaagaaaagcaattagctgttagcttggaaaaactaatcttgaatttaaaa
ggattatatcaaggtggtgctagtggtaatttagcaattactggttctgtacttaaaccg
ggaattggtggcaaaattgagttatcaaatggtcaagtcttactaacagaatctagcgcg
tcagcattgtctcagaataatcctcaatcatcaatcttagcagcgaataaacaaaacaaa
atccctgatgttgatagtggtactgtaagattaaataatttaataattaagctaggaaag
aacgtacaaatagctagtccacctgtgtttaatttcctcgcatccggtgagttagatgtg
actgggtctttaaatgatcccataccagcaggaacaattagactagataaaggtggagtg
aatttatttaccactcaatttaaactagcgcgtagctataaacatacggcaatttttaga
cgttctcaaccccgtgatcctgaattagatgttaaacttattgctaaggtgttagatggt
actcaaactactgatttaaacagacaactttctacaggtttatctgcactagaaacagtg
cgagtggaagcaatagtgaaaggttctgcacgtcaactagataagaatttagaattaaga
actagtccttcccgttcacaaacagaaattgtcactctattgggtggaggttttatagat
actcaaggaagaggtgacagtacattgggtttaattaatattgcaggttcagcggtattt
aataatttccaaggtgcatttaaccaaattggtgatgcttttggtttaagtgaattacgg
atatttccaactattctgtctgataacccggaagctggtaaaagcaattctactttagaa
ttagcattagaagcaggaatagatatttctaacatattttctctttctacgattaagatt
ttaactgctagtgatccctttcaatggggtattaattacagaattaatgatgagtttcgg
attcgtgcttcgactaatttaacggatgatagtcggactgtgattgagtatgagcgacgg
ttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
