Ochrobactrum quorumnocens: CES85_0853
Help
Entry
CES85_0853 CDS
T05040
Name
(GenBank) outer membrane autotransporter barrel domain protein
Organism
och
Ochrobactrum quorumnocens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
AC_1
PATR
Pertactin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASV86090
UniProt:
A0A248UHS9
LinkDB
All DBs
Position
1:813211..815493
Genome browser
AA seq
760 aa
AA seq
DB search
MGGTSGDLAVDVSTGTDATHKGVLAFNRSDDVTFSNVISGTGSVTQMGAGTTTLTEDNSY
SGGTTITGGTLSVSSDAKLGNADGGLTLDGGTLQVTGTQYTSTDRAMTLGSHGGGFDIAD
ASNSFAVTQALSGDGRVWKRGDGTLLLSGGNSFSGGLTVEKGTAQAGAADHAFGSGLLTV
NDGAKADLAGFNTTVGGLAGAGNVAMRSGDLTLDQAIDTTFAGVIDGSGSLTKNGLGDLT
LSGTSSYSGATNVNEGKLIQAAQGALSGASVYTVANGSGIDLGGFSTSMAALINDGHVNF
GGNGGTTLNVTGNYAGNGGMMTINTVLGGDDSKTDMLKVGGNTSGSTKLYVNNVGGTGAQ
TVNGIKVVDIGGNSGGTFSLANSYQTKDGQQAVVGGAYAYTLEQGGTNTPDDGDWYLSSH
VDGPNPGPDPEPRYSAGVPVYEGYAQNMLALNKLPTLQQRVGNRYWTGENGNGADNGAVV
DNYGIWARVEGAHNRLEPDTSTSRMKQDINTLTMQAGVDGQFYEGENGKLIAGITGQYGH
AKGDVSSFHGDGDISTDAWSLGATATWYGNDGLYVDGQAQVTWFDNDLNSTTANKGLADG
SKATGYAMSLEAGQRFAINQSWSLTPQAQLMWSSIDADAFHDTWGSRVSLHDGDSLTGRI
GLAANYRNDWKNDDGMTVNTNVYGIANLYQQFLGGTTVNVAGVDFDTDNDKTWGGIGAGG
TYAWADNKYAIYGEGSINTALNHFADSYALKGTVGFKAKW
NT seq
2283 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggggcacgagcggtgatctcgcggttgatgttagcacggggacggatgcgacgcat
aagggcgtgttggcctttaatcgttccgatgatgtgacattctcgaatgtaatcagcggt
acgggttcagtcacccaaatgggagccgggacgaccacgctgaccgaggataatagttat
tccggcggtacgacgattacaggcggcacactttcggtctcgtctgatgccaagcttggc
aatgcagatggtgggctgacgctcgatggcggtacgctgcaggttactggtacacagtat
acgtcgacagatcgcgccatgacgcttggcagtcatggcggcgggtttgacatcgccgat
gccagcaatagctttgccgttacacaagcactttccggtgatggtcgcgtctggaagcgt
ggtgacggcaccttgctcctttccggcggcaacagtttctctggtggtctgacggtcgag
aagggcacagcacaggcgggtgccgccgatcatgccttcggttctggtcttctaacggtc
aatgatggcgcaaaagctgaccttgccggtttcaacaccaccgttggtggtctggctggc
gcgggcaatgtggcgatgaggtccggcgatctcactcttgatcaagcgatcgatacgaca
tttgccggtgtaatcgatggttcgggttctctgaccaagaatggtcttggtgacctgact
ctttcgggaaccagcagctacagtggcgcaacgaatgttaacgaaggcaaactcatacag
gctgcacaaggcgctttgtctggtgcatctgtttacacggttgcaaatggctcaggcatt
gaccttggtggcttctcgacgtcgatggctgcgctcatcaatgacggtcatgtcaatttt
ggcggcaatggtggcaccacactgaatgtgacaggcaattatgctggcaacggcggcatg
atgacgatcaatacggttctgggcggtgacgattccaagaccgatatgctgaaagtcggc
ggcaacacgtccggttccacgaagctctatgtcaacaatgtcggcggcacaggtgcgcag
acggtcaatggcattaaggttgtcgatattggcggcaactctggtgggactttttcgctc
gccaacagctatcagactaaagatggccaacaggcggtggtgggcggcgcttatgcctat
acgctggagcaaggcggcaccaatacaccggatgacggtgactggtatctctcaagccac
gtcgatggtccaaatcccggccctgatccagaacctcgttacagtgcgggtgtgccagtt
tatgaaggctatgcgcagaatatgctggcgctcaacaagttgccaaccctccagcaacgc
gtgggcaaccgctactggaccggagagaacggcaatggtgcagataatggtgccgttgtg
gacaattacggcatttgggcgcgcgtcgaaggagcacataaccgtctggaaccggacacc
tctacatcgcgcatgaagcaggacatcaacacgcttacaatgcaggcgggcgttgatggc
caattctatgagggtgagaacggcaaactgatcgctggcatcactggccaatatggacat
gccaagggcgacgtctcttctttccatggtgatggcgatatcagcaccgatgcttggagc
cttggtgctacggccacctggtatggcaatgacggtctttatgtcgacggtcaggcacag
gtgacgtggttcgacaatgatctcaactccaccacggccaataaaggtcttgctgatggc
agcaaagcaaccggctatgcgatgagccttgaagccggtcagcggtttgccatcaatcag
agctggtctctgacaccgcaggcacaactgatgtggtcttcaatcgatgcggatgcgttt
catgatacttggggcagccgggtcagcttgcatgatggcgacagtctgactggtcgcatc
ggccttgccgccaattatcgcaatgactggaagaacgatgacggcatgactgtcaacacc
aatgtctatggcattgccaatctctatcagcagttcctgggcggtacgacagtcaacgtg
gcaggggttgattttgacaccgacaatgacaagacctggggcgggattggtgctggcggc
acttatgcctgggctgacaataaatatgccatttatggcgagggctccatcaacacggcc
ctcaatcacttcgcggacagttatgcgctcaaagggaccgttgggttcaaagccaagtgg
tga
DBGET
integrated database retrieval system
