Oceanihabitans sp. IOP_32: FEZ18_00430
Help
Entry
FEZ18_00430 CDS
T06249
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
oci
Oceanihabitans sp. IOP_32
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Por_Secre_tail
CBM_48
Big_7
hDGE_amylase
Pur_ac_phosph_N
Aminotran_5
AMPK1_CBM
CBM53
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QFZ53377
UniProt:
A0A5Q0JRH2
LinkDB
All DBs
Position
104777..107542
Genome browser
AA seq
921 aa
AA seq
DB search
MKKILYSFFLFLTVLLQAQVVTTSPVIPTATNAITITFDATGTGLDGYTGDVYAHTGLLT
TASTGNNDWKHVIGSWGNNATQPQLTRTGTNTYELFITPDIPTFYQSGADVITDIAVVFR
NADGTAQTSPNIYLPIYAAGLNVAITNPSNESVFNLNDNITISAESSINAALELKVNTLS
EQTATNTTTISKSYTFTSAGNHTIEAIATKNAQTKTNQISVYVKTMTQNQTLPTGLKNGF
NDNGDGSVTFVLKAPLKTDVFLIGGFNNWALNPNYQMKKDGDTFWLTLNGLDPNTEYAYQ
YFIDYSIKVADPYSKKILDPDDDQYISSTTYPNLMAYPIGDATGNVSAFKINEAEYVWQN
TNFTRPNKENLIIYEMLLRDFTESSSYQDAITHLDYLQTLGINAIELMPINEFEGNISWG
YNPSFYMALDKAYGTANDLKQFVDACHQRGIAVIVDVVFNHSFSESPLLQMYWDSTNTLP
ATNNPYYNRNHNLVDNTASHWGYDFNHESPHTVNFFNDVLSFWMDEYKIDGFRFDFTKGF
SNTIYPGENNWASTYDTARITNLKAYADHVWSHEPGNEAYVIFEHLSDNSEETELANYGI
LLWGNLNHSFNQNTMGYASGADISWLSHQNRGWNNPHIVGYMESHDEERLMVKNLAYGNR
SGSYNIKDLNTALDRQEAATVIFYGIPGLKMIWQFGELGYDKSINCAANITDGSCRTDEK
PVAWTLGYHTDSNRKDLYDVTKKMIQLKKQFPSTFNTNYADLDVGGLVKRINLNDNKGSL
NVVIVANFDVTTQTVNPNFPATGNWDDIFSGTTLNVVNRTGLISLQPGEYRLYSQNKSLS
SEDIKEQDVIKLYPNPTSTGFKINKTVGDVYLYDITGKLISNFKGDFEKNHAFNTSNLSK
GLYLVKFQSYTGVIVKQLIID
NT seq
2766 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatactatactcattttttttatttttaacggttttgctccaagctcaagtt
gttacaacatcgcccgtaattccaacagcaaccaatgctattaccattacttttgatgcc
acaggtacagggttagacggttacactggagatgtttatgcccacacgggcttacttacc
acagcctctacaggtaataacgactggaaacatgttattgggtcttggggaaacaatgca
acacagccacaattaacacgaacaggaactaatacctatgagctatttataaccccagat
ataccaactttttatcaatcgggtgcagatgttatcacagacattgctgttgtttttaga
aatgctgatggaaccgctcaaacaagtcccaatatctatttacccatttatgctgcgggt
ttaaatgttgcaattacaaatccttcaaacgaatcggtttttaatttgaatgataatatt
accataagtgcagaatctagcataaatgcagccttagaattaaaagtaaataccctatca
gaacaaacggctacaaacacaactacaatatccaaatcttacacgtttacttcagcagga
aaccacactatcgaagctatcgccaccaaaaatgctcaaacaaaaacaaatcaaatatca
gtttatgtaaaaacaatgactcaaaatcaaaccttacctacaggattaaaaaacggtttt
aacgataatggtgacggctccgttacatttgtactaaaagcccctttaaaaacagatgtg
tttttaataggaggctttaataactgggcactcaacccaaactatcaaatgaaaaaagat
ggagatacattttggttaacccttaatggcttggatccaaatacagaatacgcctatcaa
tattttatagattatagcataaaggttgcagacccttactcaaaaaagatattggatcct
gatgacgatcaatacatctctagtacgacctatccaaatttaatggcttacccaattgga
gatgctacaggaaatgtatctgcttttaaaattaatgaagccgaatatgtttggcaaaac
acaaactttacaagacctaataaagaaaatcttataatatacgaaatgcttttaagagat
tttaccgaaagtagctcatatcaagatgccataacgcatctagattatttacagaccctt
ggtataaatgccatagaattaatgcctattaatgaatttgaaggtaatattagctggggt
tacaacccatctttttatatggcattagataaggcttacggcacagcaaacgatttaaaa
caatttgtagatgcttgccaccaacgtggtatagcagttattgtagatgttgtttttaat
cattctttttcagaatcgcccttattacaaatgtattgggatagcacaaatacacttcct
gctacaaataatccttattataatcgcaatcataatttagtagataatacagcttcacat
tggggctacgattttaatcacgaatctccccataccgtaaacttttttaatgatgtattg
agcttttggatggacgaatataaaattgatggatttcgttttgatttcactaaaggcttt
tcaaatactatatatccaggtgaaaataattgggcaagcacctacgataccgcaagaatc
accaatttaaaagcctatgcagatcatgtttggagtcatgaaccgggaaacgaagcgtat
gtgatttttgagcatttgtcagacaattcagaagaaacagaactagcaaattacggtatt
ttactttggggtaatctaaaccatagtttcaatcaaaatactatgggctatgcatcaggt
gctgatatttcatggctatctcatcaaaatagaggctggaacaatccgcatattgtaggt
tatatggagagtcatgatgaagaacgcttaatggtaaaaaatttggcctacggaaatcgt
agtggtagctataatattaaagatttaaatacagctttagatagacaagaagcggctaca
gttatattttacggtattcctggtctgaaaatgatttggcaatttggagaattaggatac
gataaaagtattaattgtgctgccaatattactgatggtagttgtagaacagacgaaaaa
ccagtcgcttggactttaggttaccataccgattcaaacagaaaggatttgtacgatgtt
actaaaaaaatgattcagttaaaaaaacaatttccatcaacttttaacactaattatgct
gatttagatgttggtggcttggtaaaacgtattaatttaaacgataataaaggaagttta
aacgttgttattgtggccaattttgatgtgactacacaaactgtaaatccaaattttcct
gcgacgggtaattgggacgacatatttagcggtacaacgcttaatgttgtaaatcgaaca
ggattaataagtttacaaccaggagaatacagattgtactcccaaaataaaagtttaagt
tcagaagacataaaagagcaagatgttattaaactttatccaaaccccacttcaacagga
tttaaaataaataaaacagttggagatgtttatttatatgatataacaggaaagttaatt
tcaaactttaaaggtgattttgaaaaaaaccatgcatttaatacgtctaatttatctaaa
ggactataccttgtgaaatttcaatcttatactggtgtaattgtaaaacaattaattatt
gattaa
DBGET
integrated database retrieval system