KEGG   Oceanihabitans sp. IOP_32: FEZ18_03135
Entry
FEZ18_03135       CDS       T06249                                 
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
Organism
oci  Oceanihabitans sp. IOP_32
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel CarbopepD_reg_2 Plug CarboxypepD_reg OMP_b-brl_3 TTR_TEN1-4 CooC_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: QFZ53871
LinkDB
Position
750344..753583
AA seq 1079 aa
MKTKFNGILTLFLAFVVQFAFAQEKTISGTVSDESGMPLPGTTVLVKGTTTGTSTDFDGK
YSINANQGATLVFSFVGYTTQEVTVGVSNTVNVSLQEDAESLDEVIITALGIEKKKDDDL
SSSTTVSAEDIQKSGESGVIQGLAGKTSGLKITRNSGDPGAGAFIQIRGQNTILGNGSPL
IVVDGIPMSNSSIGGDVDGVTQQSRLNDINPDDIENVTVLKGAAAAAVWGTGAANGVILI
NTKKGKGRNKVSVSVRSTIAIDVINIEFDKQNKFGQGVNGEYSLSGLSWGDKIADRSGGA
DGFIVGNQRLESITGNIIYPLDTNPDGSLAKNSREVFNQKNRDAIFGTGFTWDKSIGINF
SGDVFKTYLSFSDWDQEGIIKGKSNYRRQTLRLNHVVDLTDKFSIQFNTSYAKVVSDRIQ
QGSNLNGLYLGYLRNAPDFDITDYKGTFYNSANVPTANYHRTYRNHVGGGGAIYNNPLWT
INEQANPNQVERFTIAPQLTWKIKDNMSVIARYGIDYYTDHRETFFPVNSAGSGVGLYEQ
QDINEKVQNFNIFIQSSHDISDDFNLNWVLGTSLDRKELAWVTGTSENFTNPIVDDLRIF
SNASAADNSIENYKEETRKHGAYATIGTELFNQLYFEFAGRYERPSTLETNLFYPSASFG
WKFSEIIGENDILSFGKIRASYGEIGIEPQPYLLSSTFSAGGATSSVESSWGDGLNNAAY
GNPFQRDVIAGNPDLKEERVKEFEVGADIRFFNNKITLGATYYDRTTEDAILDLPVPNST
GFTSQFRNAAEISNKGFEIDLSANIINSGDLKWSLNTMFSKNKSLVKSLSGVKEYGLNGF
TSASSSLVEGEPFGVIFGNEFARDANGEMILENGFPTTTAGYEAVVLGDPNPDWIGGLGT
VVSYKNFTLSAQFETSQGNDVWTGTEGVLNYFGISEVTANESVSNQDLRVYNSTDVIPAG
TVFRGNIKDFGDGDVALTQSWYTAEGGGFGNVTEGFVKDASWTRLRELSLTYDFNTALIE
NTGITELQLSVTGRNLFLWTDIEGFDPDLNLTGASKGRGLDYFTNPATKSFLMTVTIGF
NT seq 3240 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaacaaagtttaatggaattttaacgctatttctagcgtttgttgtgcaatttgca
tttgcacaagaaaagacaatttctgggacagtttcagacgaatctggaatgccgctgcct
ggaacaacagtcttagtaaaaggtacaaccactggcacatcgacagatttcgatggcaaa
tattcaatcaatgcgaatcaaggggccaccttggtttttagctttgttgggtatactact
caggaggttacagtcggagtttcgaacactgtaaatgtgtctttgcaggaggatgccgag
tctcttgatgaggttattattactgccttaggtatagaaaagaaaaaagatgatgacctt
tcttcttctaccacagttagcgcggaagacatccaaaaatcaggagaatctggtgttatt
caaggtttggctggtaaaacttctggtcttaaaattaccagaaactctggagaccctgga
gcaggtgcttttatacaaattagaggacaaaataccattttaggaaacggctcgccttta
attgttgtagatggtataccaatgtctaacagtagtattggtggagatgtagatggtgtt
acccaacaatccagacttaatgatataaaccctgatgatatagaaaacgttactgtatta
aaaggtgcagcagctgctgcagtttggggtacaggtgctgcgaacggtgttattttaatc
aataccaaaaaaggtaaagggagaaataaagtatcggtatctgtaagaagcacaatagct
attgatgttattaatattgaatttgacaaacaaaacaaatttggtcagggagttaatgga
gaatattcacttagtggattatcatggggtgataaaatagcagatcgttctggtggtgcc
gatggttttatagtaggcaaccaaagattagaatctatcacaggaaatattatatatcct
ttagatacaaaccctgatggctcactagccaaaaactcacgagaagtttttaatcaaaaa
aatagagatgccatttttggtacagggtttacttgggataaatctattgggattaatttt
tctggtgacgtatttaagacttatttaagtttttcagattgggatcaagaagggattatt
aaaggaaaatctaattatagaagacaaacgctacgtttaaatcatgttgttgatttaact
gataaattttcaatccaatttaacacatcgtatgcaaaggtggtttcagaccgtatacag
caaggttcaaatcttaatggtttataccttggttacttaagaaatgctcctgactttgat
atcactgattacaaaggtactttttacaatagtgccaatgtaccaacggcgaactaccac
agaacttacagaaaccatgttggcggtggcggagctatttataacaacccgctttggaca
attaatgagcaggctaacccaaaccaagttgaacgttttactattgctcctcaacttaca
tggaaaataaaagataacatgagcgtaattgcacgctacggaatcgattactatactgac
catagagaaacattctttccagttaattctgctggaagtggtgtaggtctttacgagcaa
caagacatcaatgaaaaagtacaaaactttaatatttttattcaatctagccacgacatt
agcgatgattttaatttaaattgggttcttggaacttcattggatagaaaagaattggca
tgggttacaggtacttcagaaaatttcacaaaccctatagttgatgaccttagaatattt
agtaatgcttcagctgcagataattccatagagaattataaggaagaaactcgaaaacat
ggagcttatgcaactataggaacagaattgtttaatcaactatattttgagtttgcagga
cgttatgaaagaccatctacattagagactaatttattctatccgagtgcctcttttgga
tggaaattctctgagattattggtgagaacgatatcttaagctttggtaagataagagca
tcttacggtgaaattggaatcgagccacaaccttatcttttaagttctactttttctgct
ggtggtgcaacgagtagcgtagaatcaagctggggagatggattaaataatgctgcctac
ggtaacccttttcaaagagatgttattgcaggtaatccagacctaaaagaagaacgtgta
aaagaattcgaagttggagcagacatacgcttctttaataacaaaattacactaggagca
acctattacgatagaacaactgaagatgcaatattagatttacccgtacctaatagtact
gggtttacatcacagtttagaaacgctgccgaaatctctaataaaggattcgaaatagat
ttaagcgcaaatattattaacagtggagatttaaaatggtctttaaacaccatgttctca
aaaaataagagtcttgttaaaagtttaagtggggtgaaggaatatggattaaatggtttt
acttcggcttcttcaagtttagttgaaggtgaaccttttggagtgatttttggtaatgaa
tttgccagagacgctaatggtgagatgattttagagaatggcttccctacaactactgca
ggctatgaggccgtagtacttggagatccaaatccagattggattggtggcttagggaca
gttgtttcctataaaaactttacactttccgctcaatttgaaacatctcaaggaaatgat
gtttggactggaacggaaggcgttctaaattattttggaattagtgaagtaaccgctaat
gaatctgtgtctaatcaagatttacgagtttataattctactgatgtgattcccgctgga
accgtttttagaggtaacattaaagactttggtgatggcgatgttgctttaactcaatcg
tggtacaccgcagaaggtggaggatttggtaatgtaacagagggttttgttaaagacgct
tcttggacacgtttaagagaactttctcttacctatgatttcaacacagctttaattgaa
aacacgggaattactgaactacaattaagtgtgacaggacgtaatttatttttatggact
gatattgaaggatttgatccagatttaaatttaacaggagcgagtaaaggtagaggatta
gattattttactaatccagcaactaaatcctttcttatgaccgttacaataggattctaa

DBGET integrated database retrieval system