Oncorhynchus clarkii lewisi (westslope cutthroat trout): 139392710
Help
Entry
139392710 CDS
T10872
Name
(RefSeq) elastin b isoform X1
Organism
ocla Oncorhynchus clarkii lewisi (westslope cutthroat trout)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
139392710
NCBI-ProteinID:
XP_070997007
LinkDB
All DBs
Position
33:complement(3908827..3974473)
Genome browser
AA seq
2310 aa
AA seq
DB search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NT seq
6933 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgagtgggacggtggcgttgttcctgtatggattcctgctcctgtctctgtggaaa
ccttcactgcaaggaggtgtgtacatacctgctggtgtaggtgaaggagctggggctgga
ttaggagctggagcaggagtcagagctggatttggtccaggtggagctggcaccggtttt
gggcctggtggtgtaggcactggatatgggccaggtggcggagccggagttggaccagga
gttggaccaggaggtgtaggtggagctggcgctggtccaggtggtgcaggctttggccct
ggagccggtggaggttacaccaagccagggaagacgggagctggctatggtggtcaggtt
gtaggccaaggccaaggaggactggggactggaggtctgggggaaggaagagttagacca
gaaggagctggggccggaccaggaggttatggacatggcggtggtttaggagctggaggc
cttggagcaggagctggcaatggaggttggggtcctggaggacagggggctggactagga
gctggaggtctgggaggaggaggtcttagaccaggagccagaccaggaggttatggacca
ggtggttatgggcctggagctggtcttagtctgggcggagctgtagctggaggtcttggt
ggtggttacggacttggcgggggtctaggtgccggaggccttggagcaggagctggagga
aagccagagaaggcaggagctggctacggtggtagagatccaggaggacagggggctgga
ctgggtgttggaggttttgaaccaggtggctatggaccaggtggagctggtgccggacca
ggtggctatgggcttggtgttggtcttggtcctgggggagctggccctggagtttttggt
ggtggttatggacccgatggaacaggagctggctatgtaggtcgcagtcctgggggacag
ggggctggattaggagctggaggctatggaccaggtggagctggaccaggaggatatggg
cctggttctggtgttggccagggtggagctggtccaggtggttttggtggtggtcttgga
gctggcggacaaggagacacccttggagctgggtatggaggcctcggagctgggggactg
ggatccagaggtacaggtcagggggctggaggacttggagcaggccaaggtcttggagcc
ggccaaggagatggatacagacctggaggaggctacggtggtgctgctggtggtctgtac
cctggagctggaggggcgggggcaggccagaaacctcccaaaacaggagcaggaagcaca
ctaggaggagatggatatgggcctggtggtgctggtggatatgggcctggtggcgcaggt
ggacatgggcctggtggcgcaggtggacatgggcctggtggcgtaggtggacatgggcct
ggtggcgtaggtggacatgggcctggtggcgtaggtggacatgggcctggtggcgcagga
actgggactggtggcgcaggaacgggacctagtggcacaggtggatatggtcctggtggc
gcaggaactgggcctagtggcgcaggtggagttggccttggtggttttgggcctggtggc
gcagcagtaccagctggagcaccagtacttccacagactggagtccctgggggtggagct
agagagaagagcggttggaaggccaacaaacaagtgccaggtgttggagtacctggactt
tatcaaggtggaatagtgcctagtcaaggtttcggagggcgtggggttctaccaggtgtt
gccactggatccggacttgctccccagacaggggcaggtgtgctgggccagggtggagtt
ggagctggcactggagctggaggtggccgaggcagtttaaatggagtgttccgtggatat
cccctcatatcacctaaatctggaggggctgggggcaaatcagctaattcccaggccaag
cttgctgctaaatatgctggaggtgtacttcgtcaagggggcatgtcgggagcaggagga
gtacctagcggtgtacctggagcaggtggggtccctggttatggagttggagctggaggt
gtacttcgtcaagggggcatggccggagcaggaggcgtacctagcggcgtacctggagca
gatggggtccctggttatggagttggagctggtggtgtacctggttacggaggtggagca
ggaggcatacctggattcggaggcgtagccagagcaggaggcgtacctggttacgggggc
ggagccggaccaggaggcgtacctggggcagggggcgtccctggctcaggtgggtatgga
tacccagggggttacccaggtggagggcggtacccaggggctggcctaggtgtaggaggt
gcctaccccggaggagctggatctaaggcagccaaatatggtcagggtggagcaggcact
ggagctggtggtgggctcagccagggagtgcctgcatctgggattggaacaggaagactg
cctggtggggctggaggggaaccaggaggcggttacaggcctggcggtagcttcggtcct
ggaggtggagttggaccaggtggggccagttatggaccaggtggggccggctatggacca
ggtggagctggacctggtggctatggaccaggtagtgctggaagttttggaacaggtgga
ggggttggaccaggtggtgccggggaaggacatggtggagctggctatggaccaggtgga
ggagttggtggagtgcctggtggtggacacagacctggaggtggtttacctggtagtggt
gctggttacggacctggtgctggtgttggaggatatgatgcaaatgccaaagctcgtaaa
tatggtatgctaagtggtgtccttgggaccccaggaggaggacaggcagccagcctggga
ggagtaccaggagggggagcagggactggagtaggccagggtggagtgcctggatctggg
cttggtggtggtggaggtgtccctggtggttatggtcctggagctggatttgggcctggc
cgtggaaccggtggtggttatggaccaggagtgggtgctgggactggacttggccaggga
gcagggcctggagctgggcttggtgctggtggagtgcctggtggtggatacagacccggt
ggtggtttacctggtagtggtgctggttacggacctggtgctggtgttggaggatatcct
gctggggctaagtctctgaaatacggtccaggaggaggtggaggagctccgggtggaggc
cttggtgggcgattcggtgccccgggaggaggtctgccaggaggaggctacggaccaggg
gcaggaggcgccttaggagcaggagaagcaggagcaggaggaagagtgcctgggggtgga
tacgggaccggagctgggcctggtgcaggaacagggcctggagctgggtacggtcaggga
gcaggaggagtccctggaggaggctatgaagctagggtgagagcaggaggactacctggg
gccggatatggacctggaagaggatatggaaccggatcaaaagctgctaaatatggacaa
gttgctggtggggccggtggggcccttggaggaggagctggacaaggattcggaggggta
ccaggtggctatggaccaggtggcttcggagccggaccaggtggcttcggagccggacca
ggtggctttggagccggaccaggtggctatggacccgggggcggagcaggatcaggaggg
gtgccaggtgggcttccaggagggtacagcggttctccctgggggaaaaggggctacggt
actggatctgaatttaaggcagacaaatacggaccaggtggggcaggaggggcccttggt
gctggggcagctggaggtgcaggggctgggacaggggctgggaccggagctgggacaggt
gctggaggaggtgcaggacctacacctggccctggcacaagagcaggaggagatggcact
gtgacaggagccggaggagacaggacaggcgcaggaggagcaggcacaggagcaggaggt
gagcctggtggtgccggtggggttctagaaggatctggaagttctggtggcccaggagat
ggcaccggcgtcacagctggtgctgttggaggaggggtgggagacacaggaatccctagc
attggaggaaaaccagatcaatcggggctcggggggacagcaatcccaggtccggaaaca
ggcatcggtattggtgccggcggaaaaccctctaaagaaagacaagcaggtgctgctaac
ggtgatatcactggaggggggactctacctggagctaaacctctgaaggctccaagagga
gatacacctggtgaaggagagggagatgcaggaggaggagcaagaggtgttggtggaggt
cctgatggtgcaggaggagcaggcagtggatctggcggagtaggaagagatggtgatggt
agaggaggaggaccaggaggagcaggcagtggatctggcggagtaggaagagatggtgat
ggtagaggaggaggaccaggaggagcaggcagtggatctggcggtgtaggaagagatggt
gatggtaaaggaggaggaggaccgggaggagcaggggggaaagacggtggtgcagttaga
gtgggaggaagtcctaacggtacagggggagctggaggttcaggaggtggaggagcagga
gtagaacctggaggaggtgcaggaccaggcagtagtgacaaaccacccaaaggttatgga
gcaggtggggctggcagtctgggtgcaggaggtgctggaggagcagctctggtccctggg
tctggtggtgccagtgatgtaggagctggaacccccaaaccaggaaaaagctacggagct
ggtgtagtcctgccaggtggaggatatggtgctggccaatttggagcaggaggacgacgt
cctggaggatatggtgccggaccaggcggatacggagccagtcctggaggatatggcact
ggacccggtggttatggggccaggcccggtggttatggtgctggtccaggtggttatggg
gctggagctggtcctggtggctatggtgctgggccaggtggatatggtgctgggcaaggt
ggctatggtgctgggccaggtggctacgggacaggggctgggcctggaggatatggatcc
aagccatacaagactggaggtgctggagccggtggtgttggtggaggtctgggtggagct
ggcagcctgggtgccataggagccggaccaggaggagtgggtggaggtcaaggaggcggt
ctaggtggaggtcaaggtggagctggaccaggtggatatataccaggtggagttggtagc
agataccccacaggtgctggaactggtacaggaactggcactggaaaaccacctaaaagc
tatgggagagctgttggagctggagatgggcttggtggttatggtggcggaacagttggt
tatggaccaggaggaaccggggccggactaggtggggctggggccgggcaaggtggatat
ggtgccggacataaaggttatggaccaggtggagcagggccgggaggagctggggtcaga
ccaggtggagcagaggccggacctggtggctatggtgctgggcctggaggttatgggcct
ggggctggtcttggtcctggaggttatggggctgaacctggtggctatggaccaggtaga
gcagggccgggaggagctggggtcagaccaggtggagccagaccaggtggagcagaggca
ggacctggtggctatggtgctgggcctggaggttatgggcctggggctggttttggtcct
ggcgtagctggtcctggaggttatggggctggacctggtggctatggaccacttggagct
ggggctggacggggaactggagctggagggtatgacgcaaatgcaaaagctcgtaaatat
ggtatgctaagtggttcccttggaggaggacaagcagctggccagggaagagtgccagga
gggggagcaaggactgggctaggtcagggaggagtgcctggagggggagcaggtactggg
ctaggccatggaggagtgcctggatctgggcttggtggcggtagtggtccgggtgctggg
tatggacctggcattggaacccatggaggttatggaccaggaggtggtgctgggaccgga
cttggtcagggaagagccggggccggaccaggtggctatggaccacttggagctggggct
ggacagggaactggagctggagggtatgacgcaaatgcaaaagctcgtaaatatggtatg
ctaagtggtaccattggaggaggacaagcagctggccagggaagtgtgccaggaggggga
gcagggactggagtaggccagggtggagtgcctggatctgggcttggtggtggtggaggt
gtccccggtggttatggtcctggagctggatttggacctggtggtggaactgttggtggt
tatggaccaggagggggtgctgggactggacttggccagggaggagttggggccgtacca
gatggctatgggactgggcctggtggttatggaccaggtggagccggacagggtgcagtg
aagccaaacaaatcaggttatggctcctcctcctcgggtggagctctctttggaccaggt
ggtggagcaggtggggtacctggtgctggagctaccgggcgaagaggaggagtaccagga
ggctacggagtaggagaagcgggacagtcagggcagaaatcaaaggcacagaaggcagcc
aaatacacagccatgcaaggcttcctgggagcacgcagctacagaggggtcgccgactgc
cagggtatatactgcggacggaggaggaagtga
DBGET
integrated database retrieval system