Oceanotoga sp. DSM 15011: OF820_05725
Help
Entry
OF820_05725 CDS
T08543
Name
(GenBank) helix-turn-helix domain-containing protein
Organism
ocs
Oceanotoga sp. DSM 15011
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_30
GGDEF_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UYP01184
LinkDB
All DBs
Position
complement(1158357..1159676)
Genome browser
AA seq
439 aa
AA seq
DB search
MTEIDYGIKDIIENFNIMNKNINEEDLKVLVHYIKETIKKDYRLVESSALLLNTLIQGKG
IKYIVELGSEILNNPVILVDSAYKVIAHSKKAEIEEKFWKENIEKGYCSYEFIKEVKKIK
EVKQAPNSNYPFVVTCYASPIKKMVSKVIIDHRCMGNIIVLESKKNFDEESFKLLKTLSD
VISEKLDKNGNYKNLKGLMYENLFLDLLEGNIKNENILKERAMSCDFNLNKDYFIFCVQL
SKIEEKNKLKNLYSFIQEKFLNFKTVYYKENFIVLIDKRDMSIIEDEDIKTILNKNNVYV
GISDFFSDIINMKKYYNQSLFALKNHKNYDNNLIKYSDFKVLDLIYNIKDKINLKDFCQN
SVYKLIEYDKNKNTEYFETLKSYLKNNMNMIETAKSMYLHRNTLAYRINKIKDIIDYDLN
DGDKNFEIYFTIKIIEEIK
NT seq
1320 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgactgaaatagattatggtataaaagatataattgaaaattttaatataatgaataaa
aatataaatgaagaagatttaaaagttcttgttcattatataaaagaaactataaaaaaa
gattatagactggtagaaagttcagctttacttttaaatactttaatacaaggaaaaggt
ataaaatatatagttgaacttggatcagaaatattaaacaaccctgttattctcgttgat
tcagcttataaagttatagctcattcgaaaaaagcagaaattgaagaaaaattttggaaa
gaaaatatagaaaaaggttattgttcatatgagtttataaaagaagtgaagaaaataaag
gaagttaaacaagctcccaattctaattatccatttgtagttacatgttatgcaagtccc
ataaaaaagatggtaagcaaagttataatagatcatagatgtatggggaatataatagtt
ctcgagtcaaagaaaaattttgatgaagaaagttttaagcttttaaaaacattaagtgat
gtaatatctgaaaaattagataaaaatggaaattacaaaaatttaaaaggtttgatgtat
gaaaatctttttttagatttacttgaaggaaatataaaaaatgaaaatattttaaaagaa
agagctatgagttgtgattttaacttaaataaggattattttatattttgtgttcaatta
tcaaaaattgaggaaaaaaataaattaaaaaatttatattcttttattcaagaaaaattt
ttgaattttaaaacagtttattataaagaaaattttatagttttgatagataaaagagat
atgagtataatagaagatgaagatataaaaactattttaaataaaaataatgtatatgtt
ggaataagtgattttttctctgatatcataaatatgaaaaaatattataatcaaagtctt
tttgctttaaaaaatcataaaaattatgataataatttgataaaatattctgattttaaa
gttttagatttaatatataatataaaagataagataaatttaaaagatttttgtcaaaat
tctgtttataagttaatagaatatgataagaataaaaatactgagtattttgaaactttg
aagtcttatttaaaaaataatatgaatatgatagaaacggcaaagagtatgtatttacat
agaaatactttagcttataggataaataaaatcaaagatataattgattatgatttaaat
gatggggataaaaattttgaaatatattttactataaaaataattgaagaaataaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
