Oceanotoga sp. DSM 15011: OF820_12160
Help
Entry
OF820_12160 CDS
T08543
Name
(GenBank) polysaccharide biosynthesis protein
Organism
ocs
Oceanotoga sp. DSM 15011
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_2
Epimerase
RmlD_sub_bind
CoA_binding_3
GDP_Man_Dehyd
3Beta_HSD
NAD_binding_4
adh_short
CoA_binding
Shikimate_DH
KR
C2185-like_N
PglD_N
Oxidored_nitro
GFO_IDH_MocA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UYO99793
LinkDB
All DBs
Position
2564542..2566395
Genome browser
AA seq
617 aa
AA seq
DB search
MNFVLKRKYKIVFIDYILFFISYLIAMFMRFQFDFDEFSKYISPIILYPFIMIVIFKITG
VYKSIWRFATLKELLPIFYSGFFGFLINFFIFELFSRYVTDFFILPFSVVSFASLLGVLL
VSWSRIFWFSYSKKDKKAVNLSKKILIIGAGDAGVELLSEFERHPEAGIVLGFLDDDDSK
IGRKIRNYEVLDKPENIMKYVENMEINEVIIAIPSANSDEVKNILDFIDKSKVRVKTLPG
IFEILNNKVSLGFLRDVEISDLLGRKEIEVNLNEIESYIKGKNVLITGAGGSIGSEICRQ
VSALKPKILYVLGRGENSIFKINKELKNKFPNLMIEEIICDVTNEKRLYNIFKKYKFDIV
FHAAAHKHVPLMEKNPSEAFMVNTLGTYNIARFSGEFNIERFIFISTDKAINPTSIMGTS
KRLGEMLIRSISKDFDTKFGIVRFGNVLGSRGSVVPIFKEQIKNGGPVTVTHKDMKRYFM
TIPEAVALVLQSGKYAEDGEVFILNMGEPVLIDSLARELIRLSGYVPDQDIKVVYTGIRP
GEKLYEELFLETEEFLKTNNSRIFKLKANNMIDYDKINNFVEFLNMAIESNNFDLINAII
GKYVPDSKARVDNEISR
NT seq
1854 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttgtcttaaaaagaaaatataaaatagtttttatagattatattttatttttt
atctcttatttaatagcaatgttcatgaggtttcaatttgattttgatgaattttctaaa
tatatttctcctataattttatatccatttataatgattgtaatttttaaaataaccgga
gtttataaatctatttggagatttgcaactcttaaagaacttttacctattttttatagt
ggattttttggatttttaataaacttttttatctttgaactctttagtagatatgttact
gatttttttatattacctttttcggttgtatcttttgcaagtttattgggagttttgctt
gtttcatggagtagaattttttggttttcatatagcaagaaagataaaaaagctgttaat
ttaagcaaaaaaattttgataattggtgctggagatgctggtgttgaattactatctgaa
tttgagagacatcctgaagcgggaatagttttaggttttttggatgatgatgattctaaa
ataggtagaaaaataagaaattatgaagtgcttgataaaccagaaaatattatgaaatat
gtagagaatatggaaattaatgaggtcataatagctattccttcagccaattcagatgaa
gttaaaaatattcttgattttatagataagtcaaaagtaagagttaagactctccccgga
atttttgaaattcttaataataaagtatctcttggttttcttagagatgttgaaatttct
gatttattggggagaaaggaaatagaagttaatttaaatgaaatagaaagttatataaaa
ggaaaaaatgttttgattaccggtgcgggtggtagtataggaagtgaaatatgtagacaa
gtttcagctttgaaacctaaaatattgtatgttttaggtagaggtgaaaatagtattttt
aagataaataaagagttaaaaaataaatttccaaatttaatgattgaagagattatatgt
gatgttactaatgaaaaaagactttataatatttttaaaaaatataaatttgatatagta
tttcatgctgcggcacataaacatgttcctttaatggagaaaaatccatctgaggcattt
atggttaatactttaggtacttataatattgccagattttctggagagtttaatatagaa
agatttatatttatatctactgataaagctataaatccaacttccataatgggaacatct
aaaaggcttggtgaaatgcttattagatctatatctaaagattttgatactaaatttggt
attgttagatttggaaatgttttgggtagtagaggaagtgtagttccaatatttaaagaa
cagataaaaaatggtggcccagttactgtaactcataaagatatgaaaagatatttcatg
actattcctgaagcagtagctttagttttacaaagtggaaaatatgctgaagatggagag
gtttttattttgaatatgggagaacctgttttaatagattctcttgcaagggaattgatt
agattatctggttatgttccagatcaagatataaaagtagtttatacaggtataagacca
ggtgaaaaattatatgaagaattgtttttagaaacagaagaatttttgaaaacaaataat
agtagaatatttaaacttaaagctaataatatgatagattatgataaaataaataatttt
gttgaatttttaaatatggcaattgaatcaaataattttgatcttataaatgcgattatt
ggaaaatatgttcctgattctaaagcgagggttgataatgaaatttcaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
