Oceanirhabdus sp. W0125-5: OW730_09415
Help
Entry
OW730_09415 CDS
T08747
Name
(GenBank) nucleoside-diphosphate sugar epimerase/dehydratase
Organism
ocw
Oceanirhabdus sp. W0125-5
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_2
Epimerase
GDP_Man_Dehyd
RmlD_sub_bind
3Beta_HSD
CoA_binding_3
NAD_binding_4
TrkA_N
NAD_binding_10
CoA_binding
Ldh_1_N
KR
CDC48_2
GFO_IDH_MocA
adh_short
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBW98943
LinkDB
All DBs
Position
2001367..2003226
Genome browser
AA seq
619 aa
AA seq
DB search
MRYLKKNRNIVLALADCLIVYVSYVLANYVRYDYKHSLNMIDTMKSYIPILIGIYIVVFT
IFRLYKSLWEHASIEEFMYAVGACASCVFIVEIINFLWKLKISFSVLMIANMFIFFMVFS
LRISFRLYRRIVILTNKTCEKKLRTMVIGAGEVGVALIKDMKTNKNSLFKPVCIIDDDYL
KQGRHIHGLKVYGGREKIKELVDKKQVELILIAIPSIPKKEKADLIDICTLTGCKVKIVP
GLIEIINGDVTLNNIRDIKFEDMLGRDEVALENEGIEDYITGKKVLVTGGGGSIGSELCR
QISKFKPKELIILDIYENNAYDIQNELTGVYKDLKLDVIIASVRDKKRIYEIFREKKPDV
VFHAAAHKHVPLMERNPVEAIKNNVFGTYNVVNAADEYGTKRFVLISTDKAVNPTNIMGA
TKRICELIIQGKNKVSKTQYVAVRFGNVLGSNGSVIPLFVKQIQNGGPVTVTHKEITRFF
MTISEAAQLVLQAGAYAKGGEIFVLDMGEPVKIYEFAEKLIKLFGYTPNEDVNIKITGLR
PGEKLYEELLLNEEGLGATPNNKIFIGKPSEIDITNIEKNLCKLYRAVDMNNISWIVGIV
EEIVPTYSRKTNTEVAATI
NT seq
1860 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgagatatttaaaaaagaacagaaacatagtacttgcccttgcggattgtttgatagta
tacgtttcatatgttctagcaaattatgtgagatatgattataaacattctttaaatatg
attgatactatgaagagttatattcctattttaattggtatttatattgtggtatttacc
atatttagactatataagagtttatgggaacatgctagtattgaggagtttatgtatgca
gtaggagcatgtgcaagttgtgtttttattgttgaaattattaacttcctgtggaagtta
aaaataagtttcagtgttttaatgatagctaatatgtttatattttttatggtattttca
ttaagaatatcatttagattatataggaggatagttatacttaccaacaaaacttgtgaa
aaaaagttaaggactatggtgattggagcaggtgaagtcggagtagcattgattaaagat
atgaagactaataagaatagtttatttaagcctgtatgtattattgatgatgattaccta
aaacaaggaaggcatattcatgggttaaaggtttatgggggtagagaaaagataaaggaa
ttggttgataagaaacaagttgaattaatactaattgccatcccatcaattcctaaaaaa
gaaaaagcagatcttattgatatatgtactctcactggttgcaaggtgaaaattgtccct
ggattaattgagattataaatggagatgtaacattaaataatattagagatatcaaattt
gaggacatgttaggacgagatgaagtagcacttgaaaatgaggggattgaagattatata
acaggaaaaaaagttcttgtaacaggcggtggaggttcaattggatctgaactgtgcagg
caaataagtaaatttaaacctaaagaacttataattttagatatttatgaaaataatgct
tatgatattcagaatgagttaacaggtgtatacaaggatttaaagttagatgtaataatt
gcttcagtaagagataagaagagaatatatgagatttttagggaaaagaaaccagatgtt
gtttttcatgcagccgctcataaacatgttcctcttatggagagaaatcctgtagaagca
attaagaacaatgtctttggaacatataatgtagtaaatgctgcagatgaatatggaaca
aagagatttgtcttaatatcaacagataaagctgtaaatccaactaatattatgggtgca
acaaagcgtatttgtgagttaatcattcagggtaaaaataaagttagtaaaactcagtat
gtagcagtgagatttggaaatgttttgggaagtaatgggtctgtgataccattatttgtt
aaacagatacaaaatggaggtccagtaacagtaactcataaagagataactagattcttt
atgacaataagtgaggcagctcagttagttcttcaagcaggtgcttatgctaaaggtgga
gaaatttttgttcttgatatgggtgaacctgttaaaatatatgagtttgcagaaaagttg
attaagctttttgggtatacccctaatgaagatgtaaatattaaaataaccggtttaaga
cctggagagaaactttatgaggaacttttgttgaatgaggaggggttaggcgcaacaccg
aacaataaaatttttataggaaagccaagtgaaattgatattacaaatattgaaaagaac
ttatgtaagttgtatagagctgtggatatgaataatattagttggattgttggaattgtt
gaggagatagttcctacttactctagaaagactaacacagaagttgcagcaacaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system