Oceanirhabdus sp. W0125-5: OW730_10090
Help
Entry
OW730_10090 CDS
T08747
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26939
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
ocw
Oceanirhabdus sp. W0125-5
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ocw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ocw02000
]
OW730_10090
Transporters [BR:
ocw02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
OW730_10090
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Polysacc_synt_C
MurJ
PufQ
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBW99072
LinkDB
All DBs
Position
2154128..2155462
Genome browser
AA seq
444 aa
AA seq
DB search
MKSKKILILSIITMSMPAILEMALNTMLGVADTIMISKFIGKEALSAVGFANQIVFALIF
IFSSFNTGAVAMISRAFGEKNFDKLKQVAEQNVVLNLIIGITISIAVYIFRNSIFGIYSI
SEEVFRNTITYFNIIIIGMVPMFLSFSYAAILRGSGDTKTPMKITAIANGVNIIGNYLLI
KGIGPLPEMGIAGAALSTSISRIIAVLLYIYILYIKDSSIKLKFELFINKKIVKPLWRIS
MPGAFEQALMQGSFVVLGVIISQLDTSSEAAFRILIQVESLSFMPAVGISIATATLVGKA
LGEKDVHKASETGYISSALGVIWGILMAIVFIAIPGGILKAFSSDTSVLAIGATAMLFLA
LNQPGLNFMIVMSGALRGAGDTTAVMLYTSLRLWVIFVPISSLLILVLNMGIAAVWYAEI
LSFVIFSVVIFLRFRSKKWADVKV
NT seq
1335 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagtaaaaagatactgattttatcaattataactatgtcaatgccagctattctt
gaaatggcattaaatacgatgcttggtgtggctgatacaattatgataagtaaatttata
ggtaaagaagcgctatctgctgtaggatttgctaatcaaattgtatttgcactgatattt
attttttcatcattcaatactggagctgtagcaatgatttcaagagcttttggagaaaag
aactttgataaactaaagcaggttgcagagcagaatgttgtattaaatcttattattggt
attacaatatctattgcagtatatattttcagaaatagtatctttggtatttattctatt
tctgaagaggtattcagaaatactatcacatattttaatataataattattggaatggtt
cctatgttcttaagtttttcttatgcagctattttaagaggatctggagacacaaaaaca
ccaatgaaaatcactgcaattgctaatggggtgaatataattggtaactacttattgatt
aaagggataggccctttacctgagatgggaatagcaggtgcggcgctttcaacatccata
tcaagaataattgcagtacttttatatatttatattttatatattaaagacagctcaatt
aaattgaaatttgagttattcattaataaaaaaatagtaaagcctttgtggcgtataagt
atgccaggagcatttgaacaggcattaatgcaggggtcatttgttgtattgggtgtcatt
atatctcaattagatacatcatctgaagctgcattcaggattctaatccaagttgaatca
ctatcctttatgccggcagttggtatatccattgcaacagcaactcttgttggtaaggct
ttaggtgaaaaagatgttcacaaagcttctgaaactggatatatttcttcagcacttgga
gttatttggggtattttaatggcaattgtatttatagcaattccagggggaattctaaag
gccttttcctcagatacatctgtgctagcaataggcgcaactgctatgctatttctagca
ttaaatcagccaggactcaattttatgattgtaatgtcaggtgcattaagaggagcaggg
gatacaacagcagttatgttatatacatctctaaggctttgggtaattttcgtaccgatt
tcatctttgttaatattagtattaaatatgggaattgcagcagtttggtatgcagaaata
ttatcatttgttattttctctgtagtcatattcttgcgttttaggagtaagaaatgggca
gatgtaaaagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
