Tepiditoga spiralis: OSSY52_12420
Help
Entry
OSSY52_12420 CDS
T06810
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome partition protein Smc
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
ocy
Tepiditoga spiralis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ocy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ocy03036
]
OSSY52_12420 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
ocy03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
OSSY52_12420 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_21
AAA_29
ABC_tran
TPR_MLP1_2
Crescentin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBE31101
UniProt:
A0A7G1G434
LinkDB
All DBs
Position
complement(1353000..1356530)
Genome browser
AA seq
1176 aa
AA seq
DB search
MELLNLTIDGFKSFAKPTSFELNKKIIAIVGPNGSGKSNIVDAIRWLLGEQSSKQMRIDD
RTDVIFSGTEKLKPAKIAKVFLTLKNEKNEIFEIGKILDKNSGKYLLNNKTSTLKELHSI
FSNGGVGKQFYSIISQGQVSDIVKSSPEDLRDLVLGIIDIGKYLKEKETSLKLLEKTSEN
LERLKDVLFETEKRLKNLSNRASRAKKHLSYTNELKNIGKKFYGAKKISIKLKIDSLKYL
NEELSKEMKELLSKSFDAERAYMSLKQEIENVDKSLSQNGEIIENYRNRISLLEKEKNRI
SELLNNTNSKIVEHDWKIKTYTENLKKLELRYTEIKDLSEKYYNDMIKVKNKLEIITSEK
NELDEKVSEQNKKISEFKAKLSQEKNLFTETNKKLSTSNKEITGKQERISYLNEEFKKLE
KDIKNLSKEIQKIEDKLKISTDEEKTLKEIIIKEKNKQSIEFQELEKIKNELNYFFKEKQ
ESEYKLEIIKNQVNSYDGYSKSIKEFFKRFKDEKNVIDVVANLIEVEEQFEEAISAAAGA
KLQNIVINSSSEADKYINYMKRVGGRITFLPLDLMKGTYALNKNILKEAGVIDYLINIVE
FDKKYIKVMQYTFSNILLVDELKTAITISKNGFKSTIVTLKGEVVYGSGAISGGKTRYDS
SIILKRKREIEELKLKIEESIENINYYKDLEEQKSQKIKKLKLHLNSLEEELKELILKRN
IESSNYKQLNNDLKNKKSSYDSILNRIETYKNELNELNKEINSLKVIQKEQEKNIKYYTE
ELSIFSENSTQYTEKMNKINFEILEKNSQLKNTEEKYYMYLNEKKSINHEINNLKNNIIN
NETEFKNLKSLLETYKKDFEKVQNSHKTLSEEISKIFDIMKNNRKGKVEKIDKLEELDKN
RTNIKNKIQEIKDKKNKNDFDIKTLEQNIKFIVEKAKNIDLNEEEFEKEQLEEFEIKALE
NRIKDIEKALKNIGSVDLTVLKEYKEVRNDFEQKNIEKKDILDSIKKIKDSIDLLDETAE
KEFFNFFNLLNEEFKKLVSKLFVNGYGELNLIGEGKDFEKGIQISVKKAGRRFQKLSLFS
GGEKALIAIAFLFAMMNLNPSPFYILDEIDAPLDDINAGKIASLIHENSNKSQFLVITHN
KLMMEIAEVFYGITMKQGITKVVPVNFKLLEKGVNS
NT seq
3531 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaactattaaatttaacaatagatggttttaaaagctttgcaaaaccaactagtttt
gaattaaataaaaaaataatagcaattgttggacctaatggttctgggaaatctaatata
gttgatgcaattcgatggctattaggagaacaatcatcaaaacaaatgagaatagatgat
agaactgatgtaatattttctggtactgaaaaattaaaacctgcaaaaattgcaaaagtt
tttttaaccttaaaaaatgaaaaaaatgaaatttttgaaattggaaaaattttagataaa
aattctggaaaatacttattaaataataaaacttctactttaaaagaattacactctatt
ttttcaaacggaggtgtaggtaagcaattttattctataataagtcaaggtcaagttagt
gatatagtaaaatcttctccagaagatttaagagatttagtacttggaataatagatatt
ggaaaatatttgaaagaaaaagaaacatcacttaaattacttgaaaaaacatctgaaaat
ttagaaagattaaaagatgttttatttgaaactgaaaaaaggttaaaaaatctttctaat
agagcttccagagctaaaaaacatttatcatatacaaatgaattaaaaaacattggaaaa
aaattttatggtgcaaaaaaaatatctattaaattaaaaatagattcattaaaatattta
aatgaagaactctctaaagaaatgaaagagttgctttcaaaatcttttgatgccgaaaga
gcttacatgtctttaaaacaagaaatagaaaatgttgataaatcattatctcaaaatggt
gaaataatagaaaattatagaaatagaatttctttacttgaaaaagaaaaaaatagaatt
tcagaactattaaataacacaaatagtaaaattgttgaacatgattggaaaataaaaaca
tatacagaaaatttaaaaaaattagaattacgttatacagaaataaaagacttatcagaa
aaatattataatgatatgattaaagtaaaaaataagcttgaaattattacttctgaaaaa
aatgaattagacgaaaaagtttcagaacaaaataaaaaaatttcagaatttaaagcaaaa
ctatctcaagaaaaaaatttatttactgaaactaacaaaaaattatctacttctaacaaa
gaaataacaggaaaacaagaaagaatttcatatttaaatgaagaattcaaaaaattagaa
aaagatattaaaaacttatctaaagaaatacaaaaaatagaagataaattaaaaataagt
accgatgaagaaaaaacattaaaagaaataattataaaagaaaaaaataaacaaagtata
gagtttcaagaattagagaaaataaaaaatgaacttaactatttttttaaagaaaaacaa
gaaagcgaatacaaacttgaaattattaaaaatcaagtaaattcttatgatggatattct
aagtccataaaagaattctttaaaagattcaaagatgaaaaaaatgtaatagatgtagtt
gcaaatctaatagaagttgaagaacaatttgaagaggctatttcggcagcagctggtgca
aagcttcaaaatatagtaattaacagttcttcagaagcagacaagtatattaattatatg
aaaagagttggaggaagaatcacttttttacctcttgatttaatgaaaggtacgtatgca
ctaaataaaaatattttaaaagaagctggtgtaattgattatttaattaatatagtagaa
tttgataaaaaatatataaaagtaatgcaatatactttttctaatatcttgcttgtagat
gaattaaaaaccgcaataacaatatctaaaaatggtttcaaatcaacaattgttacttta
aaaggtgaagtcgtttatggctcaggagctataagtggtggaaaaacaagatatgattca
tctattatattaaaaagaaaaagagaaatagaagaattaaagttaaaaattgaagaaagt
attgaaaatattaattattataaagatttagaagaacaaaaatctcaaaaaataaaaaaa
ttaaaattacatttaaactctttagaagaagaattaaaagagttaatattaaaaagaaat
attgaaagttctaattataaacaattaaacaatgatttaaaaaataaaaaaagttcttat
gattctattttaaatagaattgaaacctataaaaatgaattaaatgaactaaataaagaa
ataaactctttaaaagttattcaaaaagaacaagaaaaaaatataaaatactatactgaa
gaactttctattttttcagaaaattccacacagtatacagaaaaaatgaataaaataaac
tttgaaattttagaaaaaaactctcaattaaaaaatactgaagaaaaatattatatgtat
ttaaatgaaaaaaaatctataaatcatgagataaataatttaaaaaataatattataaat
aatgaaactgaatttaaaaatctcaaatctttattagaaacatacaaaaaagattttgaa
aaagttcaaaattctcataaaacattgagtgaagaaatatctaaaatttttgacattatg
aaaaataacagaaaaggaaaagtagaaaaaattgacaaacttgaagaattagataaaaat
agaactaacataaaaaacaaaattcaagaaataaaagataaaaaaaataaaaatgatttt
gatataaaaacacttgaacaaaatataaaatttatagttgaaaaagctaaaaatattgat
ctaaatgaagaggaatttgagaaagaacaattagaagaatttgaaataaaagctttagaa
aatagaattaaagacattgaaaaagctttaaaaaatattggttctgtcgatttaactgtt
ttaaaagaatataaagaagtaagaaatgattttgaacaaaaaaatattgaaaaaaaagat
attttagattctataaaaaaaataaaagattccatcgatttacttgatgaaacagccgaa
aaagaattttttaatttttttaatcttttaaatgaagaatttaaaaaattagttagtaaa
ttatttgtcaatggatatggagaattaaatctaattggagaaggaaaagattttgaaaaa
ggtatacaaatttccgtaaaaaaagctggaagaagatttcaaaaactttctttattttct
ggtggtgaaaaagcattaatagctattgcttttttatttgctatgatgaatttaaaccca
agtccattctatatactcgatgaaatagatgcacctcttgatgatataaatgctggaaag
attgcttctttaatacatgaaaactctaataaatctcagtttttagtaataactcataat
aaattaatgatggaaattgcagaagttttttatggaattacaatgaaacaaggtattact
aaagttgttccagtaaatttcaaactattagaaaaaggagtgaactcatga
DBGET
integrated database retrieval system
