Ostrea edulis (European flat oyster): 125652346
Help
Entry
125652346 CDS
T09123
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
oed
Ostrea edulis (European flat oyster)
Pathway
oed04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
oed00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
125652346
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
oed00536
]
125652346
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
oed00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
125652346
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125652346
NCBI-ProteinID:
XP_048737449
LinkDB
All DBs
Position
5:42542087..42685374
Genome browser
AA seq
2809 aa
AA seq
DB search
MKSVEYKLTLIILIVVFINIFEKHFVSGQDKKRQRHYWSYYQRDGAGSRNGSRPNVNLLR
GPNTCGSTSRRYCCQGWTRQPGHYRCIIPICQMGCHGGTCIRPNLCLCSNGQPSTSCQSK
AVCKPQCANGGRCIRNNRCSCTYGFSGPHCENDYRIGPCFTQLSNNMCRGQLTGLVCTKN
LCCATVGKAWGNPCEQCPVRPFPCRRGYIPNLKTNTCQDVNECIAIPGVCGGGTCVNSVG
SYRCECKTGQRQNPITRHCEDIDECAERRDICGNGRCTNTQGSYFCTCNEGYELAQDKST
CVETQKKRCFKQVVNNRCFQPMVPRLSLADCCCDSGKGWGDIFNCQICPEPGKEAHSELC
RSGGGITRNKCRLFPNLCVNARCEPTEYSYRCVCYPGYKPTTNKDRCTDIDECSEQQGLC
GNGRCFNTPGSYRCRCNRGYVLSSGGQCTDINECATNRMCSNGRCVNMDGGYKCECKPGY
RPSSNLQTCYDINECTENGKLCRNGRCQNTEGSYRCICNQGYQLSPDRAYCLDYNECERT
GMCTHGVCVNLNGGYKCVCNTGFTSSSDGRTCLDVNECLRNPCVNGICINNQGSFRCECP
NGFRLQADGKTCLDTRQGNCFLEYRKGRCSNALTVPMSKSLCCCMDDDASKAWGPRCEKC
PKKGEVQYSRLCKDIPDINECMLNPNICQNGACENLRGTYRCVCDKGFTPNPTRKKCLDL
DECEVYPNYCDGGSCKNTIGSFRCTCPSGFRLNPASIICEDIDECIDNNPCVGGTCNNVP
GSFRCDCLDPGKKLDSTGRICLDNRKGSCWLEINNGRCENNAQALVTKSECCGSIGVAWG
SPCEECPSSPQRRCPPGYATNDGKNCIDINECEMFQNVCEGGGLCVNTRGSFRCNCPPGL
ILDSTGRRCIDKREGSCYLKYYKGSCEHPVVGRYSRGTCCCSLGKAWGPSCSACPRRDSD
EFKQLCDTTKQPDINECVEFPDICKDGICGNTVGSFTCKCNQGYTLDETGTVCLDINECK
ISFGICSNGTCINTPGMFRCECDKGFRPVMMDQMCMDINECEELPAACKGGLCLNLPGTF
LCECPEGLILSPDGQSCQDIDECGDSSSLCSNGVCENYLGGYQCRCLEGYAPNLQHTSCI
DIDECASGNGGCQSLCFNKPGTFSCGCETGYVLMSNQRSCQDINECKETKDICSGGSCSN
LPGSHRCTCVGGLIPSVDGKQCLDVNECLVNTNICLQGACHNTHGSYECICEPGFSVKPD
SRNPACTDDDECATKEANCDQNAKCINTMGSYKCDCVPGYSGDGYTCRDSNECTRDNGGC
SLDANCVNLPGSFKCVCEDGFKGDGYSCSDADECFLNPYLCQNGNCINLPGSYRCECDMG
FSPTPDGKTCQDIDECSYFSNLCINGECENTLGMFRCRCNPGFKQDATGGNCTDINECEN
HDNCLYGTCVNLPGSYVCQCPPDKVLNPTGTACVDKRRGFCYLEVGSRGTCQNVIGTNVY
KASCCCSFGQGWGEVTGLCEACPQNQTAEYQRLCPGDPGLRPDEVTGIPIDIDECQEIDG
LCEGGECQNTFGSFICVCPKGHRLINYRCVDIDECRENGSLCGAGSCLNTKGSYKCTCPD
GYVLMKGETECMDMRKGSCYSTYNTTTGSGLRQYICRNPLSRNLTRKQCCCTVIGKAWNS
PCEPCPESNTKEYESFCDVASVVQDLDECTLFGDAICKNGRCINTKESFRCECNPGYRYD
VESHSCYDEDECRRSLPPCVPIARCVNTPGSYRCQCPSGYRLHQNGHSCLDINECSEVPG
MCANGVCTNLEGRFQCTCNPGYRLNRNRDGCIDIDECSIQPGLCNNGTCENTLGRYMCHC
HPGFTRSPNEDCEDINECVTQVGLCQNGRCVNQVGNFSCQCQSGYMVSRDGRSCQDVDEC
TLFGDICGSGVCRNREGSYECICYEGYELTRARDTCMDVNECRTVPGICAGGQCRNLEGG
YRCVCPPGLLLTADGQKCIDIRMGNCFNIFRNGRCLRPSLINMTKADCCCTYGQAWGSQY
QCAVCPTEQESAFQTLCPDGFGRVVDPSGEIVDVNECARDADLCVNGKCINTDGSYRCEC
LPGYKLGTDQRTCEDKNECTDSPGVCGNGTCRNRIGGFECLCSPGFEPGADRTCEDIDEC
SSSLNNCAFRCVNLPGTFQCVCPKGFTLAPDNSHCQDVDECQTRANKCQYACKNLVGSFM
CVCPDGFTGTGDNCRDINECRDPRVCQPGRCINRQGSYQCRCPPGYTLSPDRKQCYDQRE
GYCFLELRGGRCIPTNFYRMTRQECCCSGSAAWGPACSRCPILRSRAFKELCPEDIGKTP
DGKDINECQKFPGICGNGYCINTQGSYRCRCNRGYKTDITNTKCIDVDECREGTSSCESS
CRNTVGSYRCSCATGYVLNRDGKTCRDLDECATMKHSCQQICTNTEGSYQCSCKIGYRME
ANQCRDINECNEDSSLCTPGGTCRNTLEGFKCICKRGYKMDSTGRKCIDINECETGRCDD
GCENKPGSYKCICPPGYKPVHGQCIDDNECQTQDICGLAACFNVPGSYQCQCSSGTNFDP
GLMSCLGVDICVNAPCLYGCSLTGPSFICDCPPGYQTLGVGHCVAVSPDGGVRGSFPTGD
NIPHVPAPDNGRLPTGEGCFECDIKSQDIPLSKRAKRDIQNQVASIDYSTKTLHQQLPRK
LQPVIVTEVLKLYIKRKDVYRKKKLIAVLPSLMALKNNVKYHILLGNEKKIFVIHKRQGV
SSLQFRRKIRKPKIFHLIIEAKPIHKDENVAGSKVILRRTLLHVEVKVL
NT seq
8430 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatccgtggagtacaaattgactttaatcattcttattgttgtgtttataaatata
tttgaaaaacattttgtgagtggacaggacaagaaaaggcagcgacattactggtcttac
taccaaagggacggcgctgggtcaaggaacggatcaagaccgaacgtcaacttactgagg
ggacccaacacctgcggttcgacttctcgacgctactgttgtcagggctggactcgccaa
ccgggacactaccgatgcatcattccgatctgtcaaatgggatgtcatggaggaacgtgt
atacgtcctaatctctgtctctgctcaaatggtcaaccctcaacatcttgtcaaagtaaa
gcagtgtgcaagccgcaatgtgcaaatggaggaagatgcataaggaataacagatgttca
tgcacatacggattctcagggccacattgtgaaaatgactataggataggaccatgtttt
actcagctctccaacaacatgtgcaggggccagctgaccggactggtttgtaccaagaac
ctatgttgtgccacagtaggaaaagcctggggcaatccctgtgagcagtgccctgttcga
ccattcccatgtcgtcgtggatacattccaaacttgaagacaaacacatgtcaagatgta
aatgagtgtatagctatacccggggtgtgtggtggaggaacatgtgtgaactctgtaggg
tcctacaggtgtgagtgtaaaacagggcagcggcaaaaccccatcactcggcattgtgaa
gatattgatgaatgtgctgaacgtagagacatatgtggaaatggaaggtgtacaaacacc
cagggcagctatttttgtacctgtaatgagggttatgaacttgcccaagataaatctaca
tgtgttgaaactcagaagaagaggtgctttaaacaggttgtaaacaacagatgtttccag
ccaatggtaccccgcttatctttggccgactgctgttgcgactctggcaagggctgggga
gacatcttcaactgccaaatctgtcctgaaccaggaaaagaggcgcactcggaactctgt
cggagtggtggaggtattactagaaacaagtgtcgactttttcccaatctgtgtgtgaat
gcccgctgtgagcctactgaatactcctacaggtgtgtgtgttaccctggatacaaacca
acaacaaacaaagacaggtgcacagatatagatgagtgttctgagcagcaaggattatgt
ggaaatggtcgttgttttaatacccctggcagctacagatgtcgttgtaatcgtggatat
gtattgtcatcaggtggtcaatgtacagatataaatgagtgtgccacaaacaggatgtgc
tctaatggtcggtgtgtgaatatggatggtgggtacaaatgtgaatgcaaacctggctac
cgtccctcatccaatctgcagacctgttatgatataaatgagtgcacagagaatggtaaa
ctatgtagaaatggtcgttgtcagaatacagaaggatcctaccgatgtatttgtaaccag
ggttaccaactgtcaccagacagggcttactgcctagattataatgagtgtgaacgaact
ggcatgtgtacacatggggtgtgtgtaaacctaaatggtggctacaagtgtgtttgtaac
acaggtttcacatcatcttctgatggcagaacctgtcttgatgttaatgaatgcctcagg
aacccatgtgtgaatggaatctgcataaacaaccagggaagttttcgttgtgagtgtcca
aatggtttccggttacaggctgatgggaagacttgtttggataccagacaagggaactgc
ttcctagagtacagaaaaggccgttgttccaatgccctgactgtaccgatgtctaagtcg
ctgtgctgttgtatggatgatgacgcttcaaaggcttggggacctagatgtgaaaaatgt
ccaaagaaaggagaagttcaatactcacggctctgtaaggatattccagacatcaatgaa
tgtatgctgaatccaaatatctgtcaaaatggagcatgtgaaaatttacgaggaacctac
agatgtgtttgtgataaagggtttactcctaatcccacaaggaaaaagtgtcttgactta
gatgaatgtgaagtgtaccctaactactgtgatgggggaagctgtaaaaacactatagga
agttttcgctgcacgtgtccctcaggcttccgtcttaatccggcttccataatctgtgaa
gatattgatgaatgcatagacaacaacccatgtgttggagggacttgtaacaatgttcct
gggagtttcagatgtgattgtctggatcctggaaaaaagctggactccactggcagaata
tgtcttgacaacagaaagggatcatgctggttagaaattaacaatggccgatgtgaaaat
aatgcccaggccttggtgactaaatctgagtgttgtggaagtattggggttgcttggggt
agtccgtgtgaggagtgtccatcctcaccacagagacggtgccccccagggtatgccacc
aatgatggaaagaactgtatagatataaacgagtgcgagatgtttcagaacgtgtgtgaa
ggagggggtctgtgtgtgaacactcgtggatcattcaggtgtaactgtcctccaggtctg
attttggactccactgggaggcgatgtatagataaaagagaaggcagctgttacttgaag
tactataaggggtcctgtgaacaccctgtagtggggaggtactcgagggggacgtgttgt
tgctctctagggaaagcttgggggccaagctgctctgcctgtcctcgtcgagattcagat
gaattcaaacagctctgtgatacaacaaaacagccagacatcaatgaatgcgtggagttt
ccagacatttgtaaagacggaatatgtggcaacacggtagggagcttcacctgtaagtgt
aaccagggttacactctggatgaaacaggaactgtgtgtttggatatcaatgaatgcaag
atctcctttggtatatgcagcaatggtacatgtatcaacactcctggtatgtttcgctgt
gagtgtgacaaaggcttcaggccagtcatgatggatcagatgtgtatggacatcaatgag
tgtgaagaattgcctgccgcttgcaaaggaggactgtgccttaatctcccagggactttc
ctatgtgaatgtccagagggactgatcctgtctcccgatggacagtcctgtcaagacatt
gacgagtgtggtgacagcagcagtttgtgtagtaatggtgtttgtgagaactaccttgga
ggataccagtgtcgttgtctggagggatatgccccaaacctccagcacacctcatgtata
gacattgatgaatgtgcctcaggaaatggaggctgccagtcactgtgcttcaacaaacct
gggactttttcatgtggatgtgagacgggctatgttttgatgtcaaaccaaagatcctgt
caagatataaatgagtgtaaggaaacaaaagacatttgcagtggagggtcctgcagcaat
ctgcctggttcacaccgctgtacttgtgttggaggcctgattccctctgttgatggcaag
cagtgtctcgatgtaaatgaatgcctggtgaataccaacatctgtcttcagggagcctgt
cacaatactcatgggtcttatgagtgtatctgtgagccagggttttctgtcaaacctgat
tctagaaatccagcctgtacagatgatgatgaatgtgccactaaagaagctaattgtgat
cagaatgctaagtgtatcaacaccatgggctcctacaaatgtgattgtgtaccgggctat
tcgggtgatggttacacctgcagagacagtaatgaatgcacacgtgataatggtggctgt
tcccttgatgccaactgtgtcaatttacccggaagcttcaagtgtgtttgtgaagacgga
ttcaaaggagatggttatagctgtagtgatgcggatgagtgtttcctaaatccttacctt
tgtcaaaatggcaattgtatcaatttacctgggagttatcgatgtgaatgtgacatgggt
ttctcgccaacaccagatgggaagacctgccaagatattgatgaatgcagctacttcagt
aacctttgtattaatggcgagtgtgaaaacacattgggaatgttccgatgtcgatgtaac
ccgggatttaaacaagatgctacagggggaaactgtacagacataaatgagtgtgagaac
catgacaactgcctgtatgggacatgtgtgaacctccccgggagctatgtttgtcagtgt
cccccagacaaagtactcaatcctacagggacagcctgtgtcgacaagaggcgtggtttt
tgttacctggaggtagggagcagaggaacctgtcagaatgttattggtaccaatgtttac
aaggccagctgctgttgttcctttggccagggctggggggaggtgacagggctgtgtgaa
gcatgtccccaaaatcaaacagctgaataccaaaggctttgccctggcgaccctggatta
aggcctgacgaagtgacaggaattcccattgacatagacgaatgtcaggagatagacggg
ctgtgtgaagggggagaatgtcagaatacatttggaagcttcatttgtgtctgcccaaag
ggtcatcggctgatcaactacagatgtgtagatattgatgaatgcagggagaatgggtct
ctgtgtggagcaggttcctgtctgaacaccaagggtagctacaaatgtacttgtccagat
ggctatgtcctcatgaaaggagagacagaatgcatggacatgaggaaaggaagctgttat
tctacctacaacacaacaacaggttctggtctccggcagtatatctgtaggaaccccctg
tcgaggaatctgactcgcaaacagtgctgctgtacagtgattggcaaagcctggaattct
ccctgtgaaccctgtccagagtctaatacaaaggaatatgaatcattctgtgatgtggca
tcagtagtacaagatctggatgaatgcactttgtttggagacgctatctgtaaaaatggt
cggtgtatcaataccaaggagagtttccgttgtgaatgtaatccaggataccgttatgac
gttgaaagccatagttgttatgatgaagatgagtgtagaaggagtttacccccttgtgtt
ccaatagctcggtgtgtgaatactcctggcagctacagatgtcagtgtccctcagggtac
cgactacatcagaatggacatagctgtttagacatcaatgaatgctcagaagtgccagga
atgtgtgctaatggagtttgtacaaatttggagggcaggtttcaatgtacatgtaatcct
ggctacagactaaatcgtaatagggatggctgtattgatattgatgagtgtagcatacag
cctggcctgtgtaataatggaacatgtgagaacacactaggacgttacatgtgtcattgt
catccaggatttactcgttctccaaatgaggactgtgaagacattaatgagtgtgtaact
caggtaggcctgtgtcagaatggtcgctgtgtgaaccaggttggaaacttcagctgtcaa
tgtcagagtggatatatggtctccagggatggacgctcctgtcaagatgttgacgaatgc
accctttttggggacatttgtggtagtggggtgtgcaggaacagagaggggtcttatgag
tgtatctgctacgagggatatgaactcaccagggcaagggacacttgcatggatgtgaat
gagtgcagaacagttcctggtatatgtgctggcggtcagtgtaggaatctggagggagga
tacagatgtgtatgtcccccgggactactgttgactgctgatggacagaagtgtattgat
ataagaatggggaactgtttcaacatctttaggaatggacgctgtttacgcccaagtctg
atcaacatgactaaggcagattgttgttgtacatacggccaagcttgggggagtcaatac
cagtgtgctgtttgtcctactgaacaagaatctgcttttcagacgctttgtcctgatggt
tttggaagagttgtggatccatctggagaaattgtggatgtgaatgagtgtgctagagat
gcggacctttgtgtaaatgggaaatgtataaacacagatggatcctacagatgtgagtgc
ctacctggctacaagctgggtactgatcaaaggacctgtgaagataaaaatgaatgcact
gatagtccaggggtctgtggtaatggaacatgtcggaatagaattggaggatttgaatgt
ctttgtagtccaggttttgaaccgggagcagaccgcacctgtgaagatattgatgaatgc
agcagctctctgaataattgtgctttccgttgtgtcaaccttcccggtacttttcagtgt
gtgtgtcccaagggcttcactctggcccccgataactctcactgccaggatgtggatgag
tgccaaacacgggcaaataaatgccagtatgcctgcaaaaacctggtggggtcattcatg
tgtgtttgtccagatggcttcactggcacaggagataactgtagagatattaatgagtgt
cgtgatcctcgagtttgtcaaccaggaagatgtatcaatcgccagggaagctaccagtgc
aggtgtcctccaggctatacccttagtccagacagaaaacagtgttatgatcagagggaa
ggttactgtttcctagagttacgaggagggagatgtattcccaccaatttctacagaatg
acaagacaggagtgttgttgttctgggtctgcagcctggggtccagcctgctccaggtgt
cccatcctgagatctagggcattcaaggaattatgtccagaagatattggcaaaacacct
gatggaaaagatataaatgagtgtcagaagtttccaggcatttgtgggaatggctactgc
atcaacacacagggatcctacaggtgtcgctgtaaccgtggctacaaaacagatatcaca
aacacaaaatgtatcgatgttgatgagtgcagggagggcacatcttcttgtgagtccagc
tgtaggaacacagtcggaagttatcgatgttcctgtgctacaggctatgttcttaacagg
gatggcaaaacttgcagagatttggatgaatgtgccacaatgaagcacagctgtcagcag
atttgtactaacaccgagggaagttaccaatgcagctgcaagattggctacagaatggag
gctaaccagtgtagagatattaatgaatgcaatgaagattcctcactttgcacaccagga
ggaacatgccgcaatactctggagggatttaaatgtatttgtaaaagaggatacaaaatg
gactcaacaggcagaaagtgtattgatatcaatgaatgcgagactggtcgatgtgatgat
gggtgcgagaataaacccggttcctacaaatgtatctgtcctccagggtacaagccagtc
catggacagtgcatagatgacaatgaatgtcagacacaagatatatgtggtttggcagct
tgcttcaatgtacctggctcctaccagtgccagtgttcatctggtacgaactttgaccct
ggtctcatgtcctgtctaggtgttgatatttgtgtgaatgctccctgtttatatggatgt
tccctaactggcccctcctttatctgcgactgtccacctggatatcagactctgggagtt
ggacattgtgtggcagtctccccagatggtggtgtgagagggtcattccctacaggagac
aacattccccatgtccctgccccagacaatggcagacttcctacaggagagggctgcttt
gagtgtgatatcaaatcgcaagacattcctttatccaagagagccaagcgagatattcag
aaccaggttgcttcaatagattatagtacaaaaacacttcatcagcaactgccaagaaaa
ctgcagccggtgatagtgacagaagttttgaaactctacataaagaggaaagatgtatat
agaaagaagaaattgatagcagttcttccatcattgatggctcttaaaaataatgtcaag
taccacattctccttgggaatgaaaagaagatttttgttattcataaaagacaaggtgtc
agtagccttcagtttagaaggaaaatcagaaaacccaaaattttccatctgattatagaa
gcaaaaccaattcacaaagatgaaaatgtggcagggtcaaaggtcatactaaggagaact
cttttacatgtggaggtaaaggtactgtag
DBGET
integrated database retrieval system