Oenococcus sp. UCMA 16435: DSM07_05320
Help
Entry
DSM07_05320 CDS
T05781
Name
(GenBank) AraC family transcriptional regulator
Organism
oen
Oenococcus sp. UCMA 16435
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_18
HTH_AraC
AraC_binding
Cupin_2
Cupin_3
MPI_cupin_dom
JmjC_2
Cupin_1
JmjC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZZ60773
LinkDB
All DBs
Position
complement(1074687..1075568)
Genome browser
AA seq
293 aa
AA seq
DB search
MNILKNAHRLPVLDWNLNFFGGHSQKVDDNWVVPLNKYQAFELIFVLSGREIVNFEHDSY
VLNSGDFVLIPPGFIHTVAAVKNLTYFCFHFDIDDPNFVVRLIQNSPVYFPKNSFINQEI
TPIIKDMNRMISSRVYSFEDKMNLQIYLSKMLLTFNCLINKRSDIASSNQSKYAKTISEM
IKNEFNDHVLYFAARSLGGSDNQKIQIPEMPTIKHIMEATGISVGYGNRVFRSVYGFSPS
EYLSKLKLKWAQQMLAKPQYNVDEIALVLGYSDSTHFSRQFKRWTGLSPKKYR
NT seq
882 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatattctaaaaaatgctcatcgtttaccggtattggattggaatttaaattttttt
ggcggtcattctcaaaaagtcgatgataattgggtagttcctttaaacaaatatcaagca
tttgaattaatattcgttcttagcggtcgagaaattgttaattttgagcatgacagttat
gttttaaacagtggagattttgtgttaattccgccaggattcattcatacggttgcagca
gtaaaaaatttgacctatttttgtttccattttgatattgatgatcctaattttgttgtc
cgtttaatccaaaattcaccagtatactttcctaagaattctttcataaaccaagaaatt
acaccaattatcaaagatatgaatagaatgatttcttcgagggtttattcttttgaagac
aaaatgaatttgcaaatttatttgtccaaaatgttattaacattcaattgtttgattaat
aagcgttccgacattgccagttccaatcaatccaaatatgcgaaaaccatatctgagatg
attaaaaatgaatttaatgatcatgtactatattttgctgcacgttctttaggcggttca
gataaccaaaaaatacaaataccggaaatgccgacaattaaacatataatggaagcaact
ggaattagtgtcggttatggtaatagggtttttcgttcagtatatggtttttctcctagt
gaatatctgtcaaaattgaagttaaaatgggctcaacaaatgctagcaaaaccacaatat
aatgtagacgaaattgcactagtacttggatactctgattcaactcattttagtcgtcaa
ttcaagagatggacaggtctttctccaaaaaaatatcggtaa
DBGET
integrated database retrieval system