KEGG   Oenococcus sp. UCMA 16435: DSM07_07055
Entry
DSM07_07055       CDS       T05781                                 
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase
  KO
K16899  ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
oen  Oenococcus sp. UCMA 16435
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:oen00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:oen03400]
    DSM07_07055
Enzymes [BR:oen01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     DSM07_07055
DNA repair and recombination proteins [BR:oen03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     DSM07_07055
SSDB
Motif
Pfam: ADDB_N PDDEXK_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: AZZ61075
LinkDB
Position
1422540..1426025
AA seq 1161 aa
MTLEIVRGFADKDFRSELLERIYEKYRADPEARFFYIVPNHIKFSAEVDVLKKFGLLLGQ
NDQEAEAFSRLQVYSLSRLAWALTKERDQKTTISNQAISILVGQVLRELPIEKLSIFARS
ARMPGFVANVAEQLLEIWRSGLTATEILSLHQSSDRLSEKIKVLALIEVKILPSLKNYSL
ADDALRNFAAQISQIDLKNCNFYFEGFSGFTASELSLVKALLAADRKQQLGKNSEIVLSL
LGDQQSERYGQGNLFYKANQLFKDEFSLAKIRIASNNRPLSGSQLNLERSWRELETQGFT
NQKRSFPQTKIVVTSDREHEIDFVARSIRQRLVNDPKLRAKNILVLAQRLGEYKNIIPKI
FDRYDLPYFLDKDIRMSDHPLASLIENLLGPFNEFAYDRIMKIFRTGLFSWQLKDDFQTA
LDYLENYLLANNPKEKAWRQEEFQLIQISDEQDLSNDQKIDRQINRLINQMHHFILEILD
DFQDKFARVENYHQAVKTLYSWLTDRQVDRILLSQANDGDDRGLQTWKLLISTLNEVDQL
IGDKEYSQKDFLQILKDGFAAASFSGIPASLDQITVSESGIVQRNDFKILYFIDASDASL
PAQTNSNSLIDDFDRLQLIDDFSKAKKSYYLQDTSRQQMTAENFRFYSSVLSATDAVVFS
YSKLKLDGKQNELSPYLRRLALKNVSDLEIKKIPDLPRSQADLINYLGTPNSSAAILSQS
AQNFGENFIDGLIDLLIDRNPHFQKILQALHYTNQSVTLRSELINKLFGEDLRLSISQIE
KYYSNPYEYFLQYGLRLKKRNQFMVDAALSGTYYHSIFEQVINRLIGKATNFHDLNDQEL
EKLSQRSAHDLIELPDFQILQSDDHFRAVATSLADDVLLTLKLMHRANALNHSRPIKTEA
IFGKLSDDQKQEQSLAGLDFTLANGHKIYLRGKVDRIDQQDLEHLFGTIIDYKSNGKVFD
FRDAYVGTELQLLTYWLALSKNSSRIGINQTGGAVFVQIRNKPTDISQALARQIQLDQLI
GDRAQQQAPDFQFHGLLLDDQNYLTNLQAISAGQRAKYYNFGLTKKGQNTARSDLISKED
LTVLLKHDEKKLVEAGNKIIHGEFPLFPIKKNEQRSALTYSDYTEIMNFDRNFGNQYNNL
NRYPKNKNELISKMREEEGEN
NT seq 3486 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgactttagaaatcgtcagaggattcgctgacaaggattttcgcagcgaactattggaa
cggatttatgaaaaataccgagcagatcccgaggcgcgtttcttttacattgttccaaat
catattaaattctccgccgaagtagatgttttaaaaaaatttggtctgttgttgggccaa
aacgatcaggaagctgaagccttttcacgtctgcaggtttattcgttatctcgccttgcg
tgggctttgacaaaagagcgcgaccaaaaaacaactatttcaaatcaggctatttcgatt
ttggttggccaggttttaagagaactcccaatcgaaaaactaagtatttttgctcgttcg
gcacgaatgcccggctttgtcgctaatgttgccgagcaattgttggaaatttggcgttcc
ggtctgacggcaacagaaattttatctcttcatcaatccagtgaccgtctgtcggagaaa
attaaagtacttgccttaattgaagtaaaaatattaccaagtttgaaaaactattcgttg
gctgatgatgctcttagaaattttgctgctcaaattagtcaaattgatttaaaaaattgt
aatttttacttcgagggtttttccggtttcacggcaagcgaactatcacttgttaaagct
ttgcttgctgcagacagaaaacaacaattgggtaaaaattctgaaattgttttatccctg
ctaggagaccagcaaagtgagcgttatgggcagggaaatttattttataaagcaaatcag
ctctttaaagatgagttctctttggcaaaaattcggattgcttctaataatcgcccatta
tcaggttcacaactaaatttagaacgaagctggcgcgaattggaaacacagggatttaca
aatcaaaaacgttcttttccacaaactaaaatcgttgttaccagcgatcgagaacacgaa
attgattttgttgctcgatcaattagacagcgattggttaatgacccgaaattgcgagcg
aaaaatattcttgttcttgctcagagacttggtgagtataagaatattattccaaaaatt
tttgatcgctatgatttaccttattttctcgacaaagatatacgtatgtcggatcacccg
cttgcttctttgattgaaaatttattaggtcctttcaatgagtttgcctatgaccgaatt
atgaaaatttttcggactggccttttttcttggcaactaaaagatgatttccaaacggcc
ttggattatttagaaaattatctgttggctaataatcctaaagaaaaagcttggcgtcaa
gaggaattccagttaattcagatttcggatgaacaagatttaagcaacgaccaaaaaatc
gatcggcaaattaatagattgattaatcaaatgcatcattttattcttgaaattcttgat
gattttcaagacaaattcgcaagggttgaaaattatcatcaggctgttaaaacgctttat
agttggttaaccgatcgacaagtcgatcgaattttgcttagtcaagctaatgatggagat
gatcgtggtttacaaacttggaagctgcttatttcaactttgaatgaagtcgatcaattg
attggagacaaagaatatagccaaaaagattttttacaaattctaaaagatggttttgca
gctgccagtttttctggaattcctgccagtcttgaccaaattaccgtttctgaaagcgga
attgttcaaagaaatgattttaaaatactttattttatcgatgccagtgatgccagtctt
ccggctcaaactaattccaacagtttaatcgatgattttgatcgtctgcagttaatcgat
gatttttcaaaggcaaagaaatcttactatcttcaagacaccagccgccaacaaatgact
gctgaaaatttccgtttctattcttctgtcttgtcggctactgatgcagttgttttttcc
tattcaaaacttaagcttgatggaaaacagaacgaattgtcaccttatttaaggcgtctt
gctctgaaaaatgtttctgatcttgagattaagaaaattcccgatctacctcggtcacag
gcggatttgatcaattatttgggaacgcctaatagttctgctgccattttgagccaaagt
gcccaaaattttggcgaaaattttattgacggtttgattgatttgctaattgatcgcaat
cctcacttccaaaaaatacttcaggctcttcattacactaaccagtcggttaccttacgc
tcggaattgattaataaattatttggcgaggatttgagactttcaatttcccaaattgaa
aaatattacagtaatccttatgaatactttcttcaatatggcttacggctaaaaaaacgt
aatcaatttatggtcgatgctgctttgtccggtacttattatcattcgatcttcgaacag
gttattaatcgtttaattggcaaagcaactaattttcatgatttgaatgatcaggaattg
gaaaaactcagccaaagaagtgcccatgatttaattgaactgcctgattttcaaatttta
caatccgatgatcattttcgagcagttgccacgagtctggctgatgatgttttgttgacg
ttgaagttaatgcacagagccaacgcgttaaaccattcccgtcccattaaaacagaagcg
attttcggtaaattatctgatgatcaaaaacaggaacaatctctagctggacttgatttc
acattggcaaatggtcacaaaatttatttgcgtggaaaagtcgatcgaatcgaccaacag
gatttagaacatttatttggaacgattattgattataagtcgaatggaaaagtatttgat
tttcgcgatgcctatgtaggtacggaattacagttattgacttattggcttgctttgtca
aagaacagttctcgaattggaatcaatcagaccggtggagctgtttttgtacaaataaga
aacaagccgactgatatttcccaagctttggcccgccagattcaacttgaccaattgatt
ggtgaccgggcccaacaacaggctccggactttcaatttcatggtcttttactcgatgat
cagaattatttaactaacctacaagcgatctcggctggccaaagagctaaatattataat
tttggtttaactaaaaaaggtcaaaacacagcccgaagcgacttaatttccaaagaagat
ttaactgttttgttaaaacatgatgaaaaaaaattagtggaagccggcaataaaattatt
catggagaatttccattatttccgattaaaaaaaatgagcaaagaagtgctttaacatat
tctgattacacggaaattatgaattttgatagaaattttggcaatcaatataataacttg
aatcgttacccgaaaaataaaaatgaattgatttcaaaaatgcgtgaagaagaaggcgaa
aattaa

DBGET integrated database retrieval system