Olea europaea var. sylvestris (wild olive): 111390591
Help
Entry
111390591 CDS
T05244
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
oeu
Olea europaea var. sylvestris (wild olive)
Pathway
oeu03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
oeu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
111390591
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
oeu03019
]
111390591
Messenger RNA biogenesis [BR:
oeu03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
111390591
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111390591
NCBI-ProteinID:
XP_022871418
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
440 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETDEEKLKEHFQGYGEVLQAVVMRDKITGKPRGFGFVVFADPNIL
DTVLQERHVIDGRTVEAKRALSREEQQVSKGGNPNTSRNFGGVGNTRTKKIFVGGLPPIL
SEDGFRDYFEAYGTVTDVVIMYDQQTNRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKTFHDLNGKHVE
VKRALPKDANPGGSGRSMGGGTGGGSVGGYQGYGSSFGDSRMDSSRYMQSQNAGAGYPPY
GPSGFNTSAFGYGPGNNGMGYGGYGNYGSAGSGYGNPNAPNAQRSSWGSQAPSGYGNMSY
GNSQWGSPNPSAGNGLGSGGLTAGQPSSGTTGYGNQGYGYGVYGGNDGTYGNQAAAYGAV
GGRTGSGPNGSAPAGELQAGPGGYMGGGYSDAGGNFGYGNSGWRSDPSQASGQQSNGSHG
GQAGYGGGYGSGPTRQAQQQ
NT seq
1323 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaaggaaagctttttatcggagggatatcatgggagacagatgaggaa
aagctcaaggagcatttccaaggctatggtgaggttttgcaggctgtggtgatgagagat
aagatcactggaaaacccagaggatttgggtttgtcgtatttgcagatccaaacattctt
gacacggttcttcaagagagacatgttattgatggccgcacggtcgaagcaaagagagcc
ttatcaagagaggaacaacaagtttcaaaaggtggaaaccctaatacgtctaggaatttt
ggaggtgttggcaataccaggaccaagaagatatttgttgggggactgccaccaattctt
tctgaagatggattccgtgattattttgaagcttatggcactgtaactgatgtagtaata
atgtatgaccagcagacaaacagacctcgtggatttgggtttatttcatttgattctgag
gatgcagtagatagggttttacacaagacttttcatgatctaaatggtaagcatgttgaa
gtgaagcgtgctcttcctaaagatgccaatcctggtgggagtggtcgttccatgggtggt
gggacaggtggcggcagtgttgggggctatcaggggtatggttcttcttttggagatagt
cgaatggattcctccaggtacatgcaatctcaaaatgctggagctgggtatccgccttat
ggtccatctgggtttaatacttctgcttttgggtatggtcctggcaataatggcatgggt
tatggtggctatggaaattatgggagtgctggttcaggctatggaaatcctaatgctcct
aatgcccaaagaagttcatggggttcacaggctccttctggatatggaaatatgagctat
ggaaattctcagtggggtagccctaatcctagtgctggcaatggccttggaagtggtggg
ttaactgctggtcaaccgtcaagcggaactactggatatggtaatcaaggttatggttat
ggtgtatatggtggcaatgatggaacttatgggaaccaagctgctgcttatggggctgtc
ggtgggcgtacgggaagtggcccaaatggcagtgcaccggcaggagagctgcaagcaggt
cctgggggttatatgggaggtggctacagtgatgctggtggtaatttcggttatggtaac
tcaggctggcgatctgacccttcacaagcttctgggcaacaatcaaatggatctcatggt
ggtcaagctgggtatggtggtggatatggcagtggtccaactagacaggctcagcagcag
tga
DBGET
integrated database retrieval system