KEGG   Oncorhynchus gorbuscha (pink salmon): 124035934
Entry
124035934         CDS       T07892                                 
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(X) chain-like
  KO
K19479  collagen type X alpha
Organism
ogo  Oncorhynchus gorbuscha (pink salmon)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen C1q BclA_C
Other DBs
NCBI-GeneID: 124035934
NCBI-ProteinID: XP_046205855
LinkDB
Position
LG05:complement(40201351..40207307)
AA seq 659 aa
MEVRVLSILILLVALTAVHGSGSYVVKKVMKVAPQYQPYSVKSHVVSVAGEPGAPGEPGS
EGPPGPPGPPGESAVGQPGPEGPVGPPGPAGHSAPGKPGPSGGPGKPGVPGAAGKKGEVG
TAGLQGPRGMPGPTGRSGPAGISSTGKPGPHGLPGAMGPRGETGLKGHPGMPGFPGAKGD
RGVGIPGAQGETGAVGPMGPAGQPGAAGVGKPGKPGIPGEAGKSGSPGRDGGAGPMGLPG
AKGHTGAPGVGMPGKPGDNGAPGMPGAAGPKGHQGATGATGAPGIPGYGKPGANGQKGER
GVVGSTGTTGQKGEPGAQGYTGATGATGPMGLTGPQGARGFQGDTGEMGPKGDTGALGPQ
GPKGYKGDQGAQGFQGKQGNTGVTGPTGATGATGAPGNKGDTGHTGSTGASGVPGPAGPK
GFPGRNGEAGEAGAAGASGPRGPVGPTGAAGTPGLKGHPGLPGAPGPAGLAAKGILGPLG
PPGLPGADGQDGGQGPAGPPGPPGPPGEFFFEKSMGMGEVMVPTLVKAPMSAFSVSLAKP
YPPSGEPIKFDNEVYNAENHYDTTTGQFTCQVPGVYYFSYTIHVNGAHALVALYKNDKPV
MFSYDEYNKGFLDQMSGSTVLMLDVNDTVYLQIPDDEANGVFAAENVHCSFSGFLIAST
NT seq 1980 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaagtacgagtattgagcatcctcatcctcctggtggccttgacggctgttcatggt
agtggttcatatgtggtgaagaaggtgatgaaggtcgcccctcaataccagccctactct
gtgaagagtcacgtggtgtcggtggcgggagagcccggtgcaccaggtgagcccggctca
gaaggcccccctggcccacctggccctccaggggaaagtgctgtgggacagccgggaccc
gagggccctgtcggaccgcccgggcctgctggccactccgcacctggcaaacctggtccc
tcaggtgggcctggtaagcctggtgttcctggcgcagctggcaagaaaggagaggtgggc
acagctggacttcaagggcctaggggcatgcctggacctactggtcgttccggaccagct
gggatctcttccactggcaagcctggacctcatggtctgcccggagcaatggggccaaga
ggggaaacaggccttaagggacatccaggtatgcctggttttccaggagctaagggtgat
agaggagtgggtatcccaggggcacaaggtgagacaggggctgtgggacctatgggacca
gctgggcagccaggagcagccggagttgggaagccaggcaagccaggaatccctggtgaa
gcaggaaagtcaggtagcccaggtagggatgggggcgctggtcccatgggtttgccaggt
gctaagggccacacaggggctcctggtgtaggtatgcctggaaaaccaggtgataatggg
gctccaggtatgcctggtgcagctggtcctaaaggtcatcagggagcaacaggagcaact
ggtgctcccggtatccctggatatggaaagccaggagcaaatggacagaagggtgagagg
ggagttgtaggaagcacaggcacaacaggtcagaagggtgagccaggagcacagggatat
accggtgctactggtgctactgggcccatgggtctcactggtcctcagggtgcaagaggc
ttccagggagatactggggaaatgggtcccaaaggtgacacaggtgcattgggaccccag
ggaccaaagggatataagggagatcagggagcacaaggtttccagggaaagcaaggtaat
actggagtaacaggcccaactggtgccacaggagctactggagctccaggtaacaaaggt
gacactggtcacacaggttcaactggtgcttcaggtgtcccaggacctgccgggcccaaa
ggtttcccagggcgcaatggtgaggcaggtgaggctggagctgctggagcctcaggtccc
agaggacctgttgggcctactggtgccgcaggtacacctggccttaaaggacacccgggt
ctccctggagcacctggcccagctggactggccgctaagggaatccttggccctctcggt
ccccctggtctccctggtgctgatggtcaggatggtggccaaggccctgctggccctccc
ggcccacctggtcctcccggcgagttctttttcgaaaagagcatgggcatgggtgaggtc
atggtgcctactcttgttaaggcccctatgtctgctttctctgtttctctggctaagcct
tatcctccatctggggaacctattaagtttgacaatgaggtgtacaatgcggagaatcac
tatgacactaccactgggcagttcacttgccaggttcctggagtctactacttctcatac
accattcacgtgaatggggctcatgctctggtggctctgtacaagaacgacaagccagtc
atgttcagctatgatgagtacaacaagggcttcctggaccagatgtccggtagcactgtc
cttatgctcgatgtgaacgacacagtctaccttcagattcccgatgatgaggccaatggc
gtttttgccgctgagaatgtccactgctctttctctgggttccttatcgcttcaacgtga

DBGET integrated database retrieval system