Oncorhynchus gorbuscha (pink salmon): 124035934
Help
Entry
124035934 CDS
T07892
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(X) chain-like
KO
K19479
collagen type X alpha
Organism
ogo
Oncorhynchus gorbuscha (pink salmon)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
C1q
BclA_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124035934
NCBI-ProteinID:
XP_046205855
LinkDB
All DBs
Position
LG05:complement(40201351..40207307)
Genome browser
AA seq
659 aa
AA seq
DB search
MEVRVLSILILLVALTAVHGSGSYVVKKVMKVAPQYQPYSVKSHVVSVAGEPGAPGEPGS
EGPPGPPGPPGESAVGQPGPEGPVGPPGPAGHSAPGKPGPSGGPGKPGVPGAAGKKGEVG
TAGLQGPRGMPGPTGRSGPAGISSTGKPGPHGLPGAMGPRGETGLKGHPGMPGFPGAKGD
RGVGIPGAQGETGAVGPMGPAGQPGAAGVGKPGKPGIPGEAGKSGSPGRDGGAGPMGLPG
AKGHTGAPGVGMPGKPGDNGAPGMPGAAGPKGHQGATGATGAPGIPGYGKPGANGQKGER
GVVGSTGTTGQKGEPGAQGYTGATGATGPMGLTGPQGARGFQGDTGEMGPKGDTGALGPQ
GPKGYKGDQGAQGFQGKQGNTGVTGPTGATGATGAPGNKGDTGHTGSTGASGVPGPAGPK
GFPGRNGEAGEAGAAGASGPRGPVGPTGAAGTPGLKGHPGLPGAPGPAGLAAKGILGPLG
PPGLPGADGQDGGQGPAGPPGPPGPPGEFFFEKSMGMGEVMVPTLVKAPMSAFSVSLAKP
YPPSGEPIKFDNEVYNAENHYDTTTGQFTCQVPGVYYFSYTIHVNGAHALVALYKNDKPV
MFSYDEYNKGFLDQMSGSTVLMLDVNDTVYLQIPDDEANGVFAAENVHCSFSGFLIAST
NT seq
1980 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagtacgagtattgagcatcctcatcctcctggtggccttgacggctgttcatggt
agtggttcatatgtggtgaagaaggtgatgaaggtcgcccctcaataccagccctactct
gtgaagagtcacgtggtgtcggtggcgggagagcccggtgcaccaggtgagcccggctca
gaaggcccccctggcccacctggccctccaggggaaagtgctgtgggacagccgggaccc
gagggccctgtcggaccgcccgggcctgctggccactccgcacctggcaaacctggtccc
tcaggtgggcctggtaagcctggtgttcctggcgcagctggcaagaaaggagaggtgggc
acagctggacttcaagggcctaggggcatgcctggacctactggtcgttccggaccagct
gggatctcttccactggcaagcctggacctcatggtctgcccggagcaatggggccaaga
ggggaaacaggccttaagggacatccaggtatgcctggttttccaggagctaagggtgat
agaggagtgggtatcccaggggcacaaggtgagacaggggctgtgggacctatgggacca
gctgggcagccaggagcagccggagttgggaagccaggcaagccaggaatccctggtgaa
gcaggaaagtcaggtagcccaggtagggatgggggcgctggtcccatgggtttgccaggt
gctaagggccacacaggggctcctggtgtaggtatgcctggaaaaccaggtgataatggg
gctccaggtatgcctggtgcagctggtcctaaaggtcatcagggagcaacaggagcaact
ggtgctcccggtatccctggatatggaaagccaggagcaaatggacagaagggtgagagg
ggagttgtaggaagcacaggcacaacaggtcagaagggtgagccaggagcacagggatat
accggtgctactggtgctactgggcccatgggtctcactggtcctcagggtgcaagaggc
ttccagggagatactggggaaatgggtcccaaaggtgacacaggtgcattgggaccccag
ggaccaaagggatataagggagatcagggagcacaaggtttccagggaaagcaaggtaat
actggagtaacaggcccaactggtgccacaggagctactggagctccaggtaacaaaggt
gacactggtcacacaggttcaactggtgcttcaggtgtcccaggacctgccgggcccaaa
ggtttcccagggcgcaatggtgaggcaggtgaggctggagctgctggagcctcaggtccc
agaggacctgttgggcctactggtgccgcaggtacacctggccttaaaggacacccgggt
ctccctggagcacctggcccagctggactggccgctaagggaatccttggccctctcggt
ccccctggtctccctggtgctgatggtcaggatggtggccaaggccctgctggccctccc
ggcccacctggtcctcccggcgagttctttttcgaaaagagcatgggcatgggtgaggtc
atggtgcctactcttgttaaggcccctatgtctgctttctctgtttctctggctaagcct
tatcctccatctggggaacctattaagtttgacaatgaggtgtacaatgcggagaatcac
tatgacactaccactgggcagttcacttgccaggttcctggagtctactacttctcatac
accattcacgtgaatggggctcatgctctggtggctctgtacaagaacgacaagccagtc
atgttcagctatgatgagtacaacaagggcttcctggaccagatgtccggtagcactgtc
cttatgctcgatgtgaacgacacagtctaccttcagattcccgatgatgaggccaatggc
gtttttgccgctgagaatgtccactgctctttctctgggttccttatcgcttcaacgtga
DBGET
integrated database retrieval system