KEGG   Opisthocomus hoazin (hoatzin): 104330886
Entry
104330886         CDS       T08436                                 
Symbol
COL1A2
Name
(RefSeq) collagen alpha-2(I) chain
  KO
K06236  collagen type I alpha
Organism
oha  Opisthocomus hoazin (hoatzin)
Pathway
oha04510  Focal adhesion
oha04512  ECM-receptor interaction
oha04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:oha00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    104330886 (COL1A2)
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    104330886 (COL1A2)
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    104330886 (COL1A2)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:oha00536]
    104330886 (COL1A2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:oha00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   104330886 (COL1A2)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI Frataxin_Cyay
Other DBs
NCBI-GeneID: 104330886
NCBI-ProteinID: XP_009934436
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1363 aa
MLSFVDTRIVLLLAVTSYLATGQHVSEASAGRKGPRGDKGPQGERGPPGPPGRDGEDGLP
GPPGPPGPPGLGGNFAAQYDPSKAADFGPGPMGLMGPRGPPGASGPPGPPGFQGVPGEPG
EPGQTGPQGPRGPPGPPGKAGEDGHPGKPGRPGERGVAGPQGARGFPGTPGLPGFKGIRG
HNGLDGQKGQPGTPGTKGEPGAPGENGTPGQPGARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGSTG
PAGPAGPIGAAGPPGFPGAPGAKGEIGPAGNVGPSGPAGPRGEIGLPGSSGPVGPPGNPG
ANGLPGAKGAAGLPGVAGAPGLPGPRGIPGPPGPSGPSGARGLVGEPGPAGAKGESGNKG
EPGAAGPAGPPGPSGEEGKRGGPGEPGSAGPPGPAGLRGVPGSRGLPGADGRAGVMGPAG
NRGASGPVGAKGPNGDGGRPGEPGLMGPRGLPGQPGSPGPAGKEGPVGFPGADGRVGPIG
PAGNRGEPGNIGFPGPKGPTGEPGKPGEKGNVGLAGPRGAPGPEGNNGAQGPPGVTGNQG
GKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEAGKPGERGLHGEFGVPGPAGPRGERGPPGESGAVG
PAGAIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGNVGPAGGPGPAGPGGIPGERGVAGVPGGKGEKGPPG
LRGDTGATGRDGARGLPGAIGAPGPAGGAGDRGEGGPAGPAGPAGARGIPGERGEPGPVG
PSGFAGPPGAAGQPGAKGERGPKGPKGETGPTGAIGPIGASGPPGPTGAAGPAGPRGDGG
PPGMTGFPGAAGRVGPPGPAGITGPPGPPGPAGKDGARGLRGDVGPVGRTGEQGIAGPPG
FAGEKGPSGEAGAAGPPGSPGPQGILGAPGILGLPGSRGERGLPGISGATGEPGPLGVSG
PPGARGPSGPVGSPGPNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGAPGFKGERGAPGSPGPSGALG
APGPHGQVGPSGKPGNRGDPGPVGVVGPAGAFGPRGLAGPQGPRGEKGEPGDKGPRGLPG
LKGHNGLQGLPGLAGQHGDQGPPGNTGPAGPRGPPGPSGPPGKDGRNGLPGPIGPAGVRG
SHGSQGPVGPPGPPGPPGPPGPNGGGYEVGYDAEYYRADQPSLRPKDYEVDATLKTLNNQ
IETLLTPEGSKKNPARTCRDLRLSHPEWSSGFYWIDPNQGCSADAIRAYCDFATGETCIH
ANPDTIPAKNWYVNKNSKDNKHVWLGETINGGSQFEYNDEGVTSKEMATQLAFMRLLANH
ASQNLTYHCKNSIAYMDEETGNLKKAVILQGSNDVELRAEGNSRFTFSVLEDGCSRKNNE
WGKTIIEYRTNKPSRLPILDIAPLDIGGADQEFRVEVGPVCFK
NT seq 4092 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctcagctttgtggatacacggattgtgttgctgctcgcagtaacttcatacctagcg
acaggccaacatgtgagtgaggcatctgcagggcggaagggccctagaggagacaaaggg
ccacagggagaaaggggtccaccaggtccaccaggcagagatggtgaagatggtctacca
ggtcctccaggcccccctggtcctccaggtcttggcggaaactttgctgctcaatacgat
ccatctaaagcggctgattttggcccaggacctatgggtttaatgggacctagaggccca
cctggagcatctggaccccctggtcctcctggttttcaaggtgttcctggtgagcctggt
gaacctggtcaaacaggtccccagggtcctcgtggtccccctggtcctccaggaaaggct
ggtgaagatggtcaccctggcaaacctggaagacctggtgagaggggtgttgctggccct
cagggtgctcgtggtttccctggaactcctggtctgcctggctttaagggaattaggggg
cacaatggtctggatggtcaaaagggacaacccggtactcctggcacaaagggagaacct
ggtgcccctggtgaaaatggtaccccaggacaacctggtgctcgtggtctccctggtgag
agaggaagagtaggtgcccctggaccagctggtgctcgtggaagtgatggcagcactggc
cccgctggacctgctggtcctattggtgctgctggtcctccaggcttcccaggtgctcct
ggtgctaagggtgaaatcggacctgctggcaatgttggtcctagtggtcctgctggtcca
agaggagagattggacttcctggttctagtggtcctgttggccctccaggcaaccctggt
gctaatggtcttccaggggctaaaggtgcagctggtcttcctggtgttgctggtgctcct
ggtctgcccggtccccgaggtattcctggtcctcctggcccctctggtcctagtggtgct
agaggacttgttggtgaaccaggccctgctggtgccaagggagaaagtggtaacaagggt
gagcctggtgctgctggccccgctggccctcctggtcctagtggtgaggaaggcaagaga
ggtggccctggtgaacctggctctgctggtcccccaggccctgctggtctaagaggtgtg
cctggatctcgtggtctccctggagctgatggcagagctggtgtcatgggacccgctggt
aaccgtggtgctagtggtccggttggtgctaagggtcctaatggtgatggtggccgtcct
ggtgagcctggtcttatgggtccaagaggtctcccaggtcagcctggaagcccaggccct
gctggcaaggaaggtcctgttggtttccctggagcagatggtagggttgggccaatcggt
ccagctggtaatagaggtgagcctggcaacattggattccctggaccaaaaggtcccact
ggtgaacctggcaaacctggtgaaaaaggcaatgttggtcttgctggcccacggggtgct
cctggtccagagggaaacaacggtgctcaaggtcctcctggagtcactggcaaccaaggt
ggaaagggtgaacaaggtcctgctggccctcctggcttccagggtctgccaggcccctca
ggtccagctggtgaagctggtaaaccaggcgaaaggggtcttcatggtgaatttggtgtc
cctggtcctgctggaccacgaggtgaacgtggtcctcctggtgaaagtggtgctgttggt
cctgctggtgccattggaagccgtggtccatctggcccaccaggccctgatggtaacaag
ggtgagcctggcaatgttggtcctgctggtggtcctggtcctgctggccctggtggaatc
ccaggagagagaggtgttgctggtgttccaggaggcaagggtgaaaagggtcccccaggt
ctgagaggtgatactggtgcgacaggaagagatggtgctcgtggtcttcctggtgctatt
ggtgctcctggccctgctggtggtgctggtgatcggggtgaaggagggcctgctggtccc
gctggtcctgctggtgcccgtggtatccctggtgaacgcggtgagcctggtcctgtaggt
cctagtggatttgctggacctcctggtgcagctggtcagcctggtgctaaaggcgagcgt
gggcctaagggacctaagggtgagactggaccaacaggtgctattggcccaattggtgct
tctggaccaccaggtcccactggtgctgctggtcctgctggccctcgtggtgatggtggt
cctcctggcatgactggtttccctggtgctgctggaagagttggtcctcctggccctgct
ggcatcactggtccccctggtcctcctggcccagctggcaaagatggtgctagaggtcta
cgtggtgatgttggtccagttggccgtactggtgaacaaggtatcgctggcccacctggt
tttgctggtgagaaaggtccatctggagaggctggtgctgctggtcctcctggtagccca
ggtcctcagggtattcttggtgctcctggtatcctcggtctgcctggctctcggggagaa
cgtggtcttccaggcatctctggagcaacaggtgaacctggtcccctgggtgtttctggt
cctcctggtgcccgtggtccctctggtcctgtgggttctcctggtccaaatggtgctcct
ggtgaagctggtcgtgatggcaatcctggtaacgatggtcctccaggccgtgatggtgct
cctggtttcaagggtgagcgtggtgctcctggtagccctggtcccagtggtgctctcggt
gctcctggtcctcatggccaagttggtccttctggaaagcctggaaaccgtggtgatcct
ggtcctgttggcgttgtcggtcctgctggtgcttttggtccaagaggtcttgctggccca
caaggtccacgtggtgagaaaggtgaacctggtgataaagggcctagaggtctgcctggc
ttgaaggggcacaatggattgcaaggtcttcctggtcttgctggccagcatggtgatcaa
ggtcctcctggtaacaccggccctgctggcccaaggggtccacctggtccttctggtccc
cctggtaaagatggtcgcaatggtctccctggacctattggccctgctggtgtgcgtggc
tctcatggtagccaaggccctgttggtcctcctggtcctcctggtccccctggtccccct
ggtcccaatggtggtggatatgaagttggctatgatgcagaatactaccgggctgatcag
ccttctctcagacccaaggattatgaagttgatgccactctgaaaacattgaacaaccaa
attgagaccctgctgaccccagaaggctccaaaaagaacccagctcgcacctgccgtgac
ctaagacttagccacccagaatggagcagcggcttctactggattgatcctaaccaaggc
tgctctgcagacgccattagagcatactgtgactttgccactggtgagacttgcatccat
gccaaccctgacactattcccgctaagaactggtatgtcaacaagaattccaaggacaat
aagcatgtatggcttggtgaaactatcaatggtggcagccagtttgagtacaatgatgaa
ggagtgacctcaaaggaaatggccacccagcttgccttcatgcgtctgctggccaaccac
gcctcccagaacctcacctaccactgcaagaacagcattgcctacatggatgaggaaact
ggcaaccttaaaaaggctgttatactgcagggatccaacgatgttgaactacgagctgaa
ggcaacagcagattcactttcagtgttcttgaggatggctgctctagaaagaacaatgag
tggggcaaaacgatcattgaatacagaacaaataagccatctcgcttgcccatccttgac
attgcacctttggatattggcggcgctgaccaagaattcagagtggaggttggcccagtc
tgtttcaaatga

DBGET integrated database retrieval system