Candidatus Ornithobacterium hominis: MSHRCOH1_00960
Help
Entry
MSHRCOH1_00960 CDS
T09176
Name
(GenBank) Outer membrane porin F
Organism
ohm
Candidatus Ornithobacterium hominis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
OMP_b-brl
Opacity
CotJB
TSP3_bac
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI9428765
LinkDB
All DBs
Position
1:201821..203266
Genome browser
AA seq
481 aa
AA seq
DB search
MKKLNLVLGLVALLFAGSLKAQDAQNPWGISIGAHAVDHTSVSGLFDGFFDYDDYSVVPP
LSKLSVVRHLSGPFSADLTASIGQIDNKRLMLNDLFFLNAGLGLRFQFLNAFTKKSSWFD
PYLRVGASYNKTDYSKINISKSSPYKTFDGSLIDKEFKGAEDHFMTQLGAGINFWFTDNI
GLNIASDYNWAPTVEGNTINFFQHTAGLAFKFGLQDRDKDGIPDDKDECPDTFGLKEFNG
CPDTDGDGIRDIDDACPEVAGLPEYNGCPDTDGDGIADNVDKCPNQAGPKENNGCPWPDT
DGDGLNDNVDKCPNQAGPKENNGCPWPDTDGDGFTDNVDKCPNEPGIAPSGCPEAAVMVQ
NINVGFAVEFDFDKASIRPVSKAKIEEKAAQIRKVLEVYPDMTLYIDGHTDSKGAASYNK
NLSQKRAASVVQALEGEGISAGVLTPRGFGESQPKCSNDTEEGRQCNRRVEVTINKLGEQ
K
NT seq
1446 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagttaaatttagtattaggcttggtagctctgctctttgcaggctcacttaag
gctcaagatgcccaaaatccttggggaatttctatcggtgcacatgctgtggatcacacc
tcagttagtgggctttttgatggtttttttgattatgatgattacagtgtagtaccaccg
ttatcaaaactttcagttgtacgtcacctgtctggacctttcagtgcagatttaactgct
tccattgggcagattgacaacaaaagattaatgttaaatgatttatttttcttaaacgca
ggtttaggtttgcgttttcagtttttgaatgctttcactaaaaaaagtagttggtttgac
ccttacttacgcgtaggtgcttcatacaacaagacagattatagcaagattaatatatct
aagagttctccttacaaaactttcgatggatctcttatcgacaaagaatttaaaggagca
gaagatcactttatgactcagttaggagcaggaatcaacttttggtttacagacaacatc
gggctaaacattgcatctgattacaactgggcgccaaccgtggaaggaaatacaattaac
ttctttcagcatactgctggtttagcctttaaattcggattacaagacagagataaggat
ggaatcccagatgataaagacgaatgcccagatacatttggtttgaaagagtttaatggt
tgcccagatactgatggagatggaatccgtgatatagatgacgcttgcccagaggttgca
ggtttgccagaatacaacggctgcccagataccgatggcgatggtatagctgacaatgta
gataaatgcccaaaccaagcagggcctaaagaaaacaatggttgcccttggccagatact
gatggagatgggctaaatgacaatgtagataaatgcccaaatcaagcaggacctaaggaa
aataatggttgcccttggccagatactgatggcgacggattcacagacaatgtagataaa
tgccctaacgagccaggtatagcaccaagcggatgcccagaggcagcagtaatggtacaa
aacatcaatgttgggtttgcagttgagtttgattttgataaagcttcaatccgaccagtt
tctaaagctaaaatcgaagaaaaagcagctcaaattagaaaagttctagaggtttatcca
gatatgactttatatatcgacgggcataccgatagcaaaggtgctgcttcttataacaaa
aatctttctcagaaaagagcagcctctgtagtacaagcgctggaaggagaaggaatctct
gcaggagtattgactccaagaggatttggtgaatctcagccaaaatgttcaaacgatacc
gaagaaggtagacaatgtaacagaagagttgaggtaactatcaataaactaggtgagcag
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system
