Opacimonas immobilis: ACM613_02005
Help
Entry
ACM613_02005 CDS
T11110
Name
(GenBank) family 16 glycosylhydrolase
Organism
oim Opacimonas immobilis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_16
SKN1_KRE6_Sbg1
3keto-disac_hyd
DUF4402
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XPD35962
LinkDB
All DBs
Position
complement(427443..432152)
Genome browser
AA seq
1569 aa
AA seq
DB search
MKKTLLNKSRIAAILAAATLVGCGGSASDSATVTDITTVNPIQPVTDWQLVWADEFDGNA
IDAEKWSHEVNCDGGGNQELQCYTDSAENSFVSDGTLKIVAKLNEGATGDSDDDYTSARL
NTQYKGDFKYGRIEMRAKLPKGQGTWPAFWMMPTDSVYGGWPKSGEVDIVEAVNLGADRA
DGSEETNIYGTIHYGAGPSSDFSGAAHTPSSNPADSFNRYAIEWQEGEIRWYFNDVLYAT
QRQSELRTNSSGEVTGLRHRGWYAELYDIATGQLETDYSSAPFDQDFFLILNLAVGGSWP
SSVNEGGVDPTMFTGAGQTYEIDYVRVYQCAADPQTGRGCETTAPGYNVPVEDGGKLVSG
KAPSPTLSAGEPDPITIFDDETNLSWVAWDCCGGTTPALVADDAARGNVYEFTVSESGGA
NGTVFGFITRSLFLPQDPSLGISAAPHNALAMAESGYVTFDVKVMSQPTDADARWMFKIE
ADEGNAGAWEQPLSNFGPAPSVGQWTTYQIPLADIQAAGVDLTSLDVIMVFPEWMRGAGA
VFRMDNVAILDGAATGGTPDVVYEPAAFTEAFGNASVTDNTFIFPTGAEAWAGFANLNDS
IYPMQFPNGGSISFTAFVPEGSPDVDVRFVFEFNPYPDVNPTFGSDVVTVSGSEARTYTI
ELPAQDAENTYSSFLLYLNTQDAPVNITNVVVTQKGISAGTPDVDYDPAAFTEAFGNASI
TDGNTYLFPTGAEAWAGFANLNDSIYPMEFPNGGKVTFRAAIPEGGVAVDVRYVFEFNPY
PDVNPTFGTDVVTVNTTELTTYTVEFPAQDAGNTYSSFLMYLNTQDAPVTITDVVVTQKG
QAGAVAADVETDPAAFTEAFGNASVTEGTFVFPTGAEDWAGFANMTDTMYPLQFPNGGKI
TFTGSAPEGSSGANVRFVFEFNPYPDVNPTFGVGPVFVSGAEATYTIEIPAQDAENTYSS
FLMYLNDRDAPVNVSNVVVTQYQIGDLELPAGGNTGGDAGGDTGGDTGGDTGGSSSPYAV
MQPFADSGAVKDGDTYTVPNDAVEWAGFANDNATLYPFNFANGGTITFTAALPEGGAQAD
VRFRFENAPYPDVNPAFDAGTISVSTTTPTTYTINVEARPAEENYSSLLMYVDTRDTPVI
ITNIEVTETPMPGEEVATAVMQPFADSGAVKDGDTYTVPAAAVDWAGFANDNADLYPFNF
ANGGTITFTASIPEGGATADVRFRFENAPYPDVNPAFNAGSVTVDASTPTSYTITVEARP
ADENYSSLLMYVDTRDAPVTITNIVVTEAEATVTAANAVMQPFADSGAIKDGDTYTVPTS
AVEWAGFANDNAELYPFNFANGGTITFTAALPEGGAQADVRFRFENAPYPDVNPAFDAGS
VSVSTTTATTYTINIEARPAEENYSSLLMYVDTRDTPVIITNIVVSENPAAGEAVATAVM
QPFADSGAVKDGDTYTVPATAVEWAGFANDNADLYPFNFATGGTITFTGAIPGDGTPADV
RFRFEKAPYPDVNPAFDAGTITVSGVDENTYTITVPAQDAANNYSSLLMYVDTRDAPVIV
KNIVVTDSE
NT seq
4710 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaacactcttgaataaatcaagaatcgcagcgattttagccgcagcaaccctt
gtcggttgtggtggcagtgccagtgattcagcgacagttactgatattacaactgtcaat
ccaatacaacctgtcactgattggcagctagtttgggcagacgaatttgatggcaatgcc
atcgatgcagaaaaatggtcccacgaagtcaactgtgacggcggcggcaaccaagaactt
cagtgctacactgattccgcagagaactcgtttgtctctgacggcacactaaaaattgta
gccaaactcaatgaaggtgccacaggtgatagtgatgatgattacacctcagcccgacta
aatactcaatacaaaggcgactttaagtacggtcgtattgagatgcgtgcaaaattgcca
aaaggtcaaggtacatggcctgccttttggatgatgccgacagattctgtatacggcggc
tggccgaagtctggtgaagtcgatattgtcgaagcagtcaaccttggcgcagaccgtgcc
gatggttctgaggaaactaatatctatggcacgattcattatggcgctggaccaagcagt
gatttttctggtgcggctcatacgccatcaagtaacccagctgattcgttcaatcgctat
gcaattgaatggcaagagggtgaaattcgttggtacttcaatgacgtattgtatgcgacc
caaagacagtctgagttgcgaactaattcaagcggcgaggtaacaggtttacgtcatcgc
ggttggtatgctgaactctatgatattgcgacgggtcaattagagacagattactcttct
gctccttttgaccaagatttcttcttgattttgaaccttgcagtaggtggttcgtggccg
tcatcagtcaatgaaggtggtgttgatccgacgatgtttactggtgcaggtcaaacatat
gaaattgattatgttcgcgtgtatcaatgtgcagcagacccacaaacaggtcgtggctgt
gaaacgacggcgccaggttataatgtgccagtagaagatggtggtaaacttgtttcaggt
aaagcaccttctccaacactttctgccggcgaaccggatcctattactatttttgatgat
gaaacaaacttaagctgggtggcttgggactgctgcggcggcaccactcctgcattggtc
gctgacgacgcggctcgtggcaatgtttacgagttcaccgtatctgaatcaggcggtgca
aacggcacggtatttggtttcattacgcgttctttgttcttaccacaagatccttcatta
ggtatttctgcggcgccacataatgctctggccatggctgaaagtggttatgtaacattt
gacgtcaaggtcatgtcacagccgaccgatgctgacgcacgttggatgtttaaaatagaa
gcagatgaaggaaatgcaggagcatgggaacagccgttgtctaactttggcccagcacca
agtgtgggtcaatggacaacatatcaaatcccacttgctgacattcaagcagctggtgtt
gatttgacttcacttgatgtcattatggtattcccagagtggatgcgtggtgctggtgcg
gtattccgtatggacaatgttgccattttagacggcgcagcaacgggtggaacgcctgat
gttgtgtatgaaccagcagcgtttactgaagcattcggtaatgcatcggtcactgataac
acgtttattttcccaacaggggcagaagcatgggctggttttgctaacttaaatgacagc
atttacccaatgcaattcccgaatggtggttcaattagcttcacggcatttgtgcctgaa
ggtagccctgacgtagatgtgcgtttcgtattcgaatttaacccatatccagacgtcaat
ccaacctttggttcggatgtagtcacggtatccggttcggaagctcgtacttatacaatt
gaattacctgcgcaagatgcagagaatacgtattcatcattcttgctgtaccttaatacc
caagatgcaccagtaaacattactaatgtcgtggttacgcaaaaaggcatctcggcgggt
acgccagacgtggattacgatcctgcagcgtttaccgaagcgtttggtaatgcgtctatc
acagatggtaacacttatctcttccccacaggggctgaggcatgggctggttttgctaac
ttaaatgatagcatctacccaatggaattcccgaacggcggtaaagttacattccgtgcg
gcgattccagaaggtggtgtggcagttgatgtacgctatgtctttgaattcaacccatat
ccagatgtgaatccaacctttggcacagacgtggtgacagtaaataccactgaattaacg
acttatacagttgaattccctgcacaagatgcgggtaatacatatagctcattcttgatg
tatctaaatactcaagatgcgccggtaaccattaccgatgtcgttgtgactcaaaaaggt
caagcaggtgcagttgctgctgatgtagaaactgacccagcggcgtttactgaggcattt
ggtaacgcgtcagttaccgagggcacttttgtgttcccaactggggcagaagattgggct
ggttttgcaaacatgactgatactatgtatccgttgcagttccctaacggcggcaaaatt
accttcactggttcagccccggaaggcagctcgggtgcgaatgtacgctttgtgtttgaa
tttaatccgtatccagacgtcaatccaacatttggtgtgggtccagtgtttgtatcaggt
gcagaagcaacctataccattgagattccagcacaagatgcggaaaatacatatagctct
ttcttgatgtatctcaacgaccgtgatgcgccagtcaatgtatctaatgttgttgtgact
caatatcaaattggcgacctagaattaccagccggtggtaacacaggtggtgacgctggt
ggcgacacaggcggtgatactggtggcgacactggtggttcaagctcaccatatgcggtc
atgcaaccatttgctgattcaggcgcagtgaaagacggcgatacttatactgttccaaat
gatgcagtagagtgggctggtttcgcgaatgacaatgcaacgttatatccatttaatttt
gcaaacggcggtaccattacgtttactgcagcgttacctgaaggtggagcacaggctgac
gttcgtttccgttttgaaaatgcaccttacccagatgtaaaccctgcatttgatgcgggt
acaatttctgttagtactacgactccgacaacgtacacaattaatgtcgaagctcgtcca
gcagaagaaaattacagctctctattaatgtatgttgacacgcgcgatacgccggtgatt
attacaaatattgaggtaactgaaacgccaatgcctggtgaggaagttgctacggctgtg
atgcaaccatttgcggattcaggtgctgtgaaggacggtgatacttacaccgttcctgca
gcggcagtggactgggctggatttgcaaacgataatgctgatttgtatcccttcaatttc
gcaaatggcggtacaattacatttactgcttctatcccagagggtggtgctactgcagat
gttcgtttccgtttcgaaaacgcaccctatcctgacgtcaatccagcgtttaacgcaggt
agcgtgactgttgatgcatcaactccgacctcgtataccattacggtagaagctcgtcca
gcagatgaaaactacagttcattgttgatgtatgtggatacccgtgatgctccagttact
attaccaatatagtagtaacagaagctgaagcgacggtcacagcagcaaatgcagtaatg
caaccctttgcagattcgggtgcaattaaggacggtgatacttacaccgtccctactagc
gcagtagagtgggcagggtttgcaaatgacaatgcggagctgtacccatttaattttgcc
aacggcggtaccattacgtttactgcagcgttacctgagggtggggctcaggctgacgtg
cgtttccgtttcgaaaacgcaccttaccctgatgtaaatcctgcgttcgatgcaggttct
gtttcggtaagtacgacaacagcaacaacttatacaattaatatagaagctcgtcctgca
gaagaaaactacagctcattattgatgtatgtagatacacgtgatacgcctgtaataatt
acaaatattgtggtgtcagagaaccctgcggctggtgaagcagttgcaactgctgtaatg
caaccatttgcagattcaggtgcagtaaaagatggtgacacttatactgttcctgctaca
gcagtagaatgggcaggtttcgcaaacgataacgcggatttgtatccatttaattttgca
acgggtggcacaattacatttactggagccataccaggtgatggcactcctgctgacgtg
cgcttccgttttgaaaaagctccatatcctgatgtaaaccctgcattcgacgcaggcact
ataacggtgagtggtgttgatgaaaatacttacaccataactgtgccagcacaagatgcg
gcaaataattacagctcattactgatgtacgttgatacacgggatgcaccagtgatcgtg
aaaaatatcgttgttactgattctgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system