Opacimonas immobilis: ACM613_07965
Help
Entry
ACM613_07965 CDS
T11110
Name
(GenBank) tandem-95 repeat protein
Organism
oim Opacimonas immobilis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_4
Cadherin_5
FG-GAP_2
He_PIG
Beta-prop_THOC3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XPD34847
LinkDB
All DBs
Position
1697116..1706106
Genome browser
AA seq
2996 aa
AA seq
DB search
MKHFLLIFTLFVVTILLTGCRDNFYVEIECKSCLDKSGNVDGRSTDGQGVFAIYMISDGN
VVDARYFTEDGNETSDLFTAFGNEHFLPEYLLDEGEARNSFNRSKRLYPFRNLPGDDYLD
VETSKALVPSQMPSADDNNYDVTRNIAKNTSAFRFTIPFGSKIYDDGDEEFQTAFGNGYV
SLDNPIDKVIVVTPLGGVFASQCVPYRDFFQSMNPSNRFKDVICNNFSHTYLYDPIYYIS
SSATDQLDGLAGEAFFLAFLYNPGSFVPFIKTTNYRVSNIDQLNAFPPYNLRSYTYYDGL
EKLQELTGSNDFKNIVIKSDIPFTVYAIDELTSPNIATPLECLVQEGKISNLAINDEQTL
LTLNTSVKISPYIVLNEFKKNSSLSRIEEVQILSHVSNANGEPYYASFEGINLFELCTNQ
NCDPMTIKPYSYSENGFYLHDLYSDESMTIEDNCQSNSISDIALYGKYSNNTVNRVGETV
RIQVDFTFPTKVSPSGRNNFSDHSITFSIGEQVVTAFGDEIITDGLSTEQIENNYISGMV
FAFTVTEDMYSEDGIQFNDSRDELYFDKRYVSFNLRQFERAIPMHDSLTIASNNVSIMPE
VNAPSVLEYQAILSQEMHVSPNFKLDDNQSTANAKGSGPYWSEGRLSSAIYETAIDILPW
QNNTTLSYRVHFSDEISGLDTDDFQLVDINGQASAAILEVRPATLTGAATRSQKTSSDRY
IVTIGEFSGQTAFKLVLKDDATFYSSVGGREIEGVVENYSNMDFYELPGSIIRFNDALDT
PKLGELITSDSFYPNGVPTEVNMSLNTILPTFIPSRDHFEIIILLKDGTSFSKLEQDIQL
SITPTYDVWLEEFPHFYNLKIDLSSLAQANIDFANLTVFVNTENTQPLMTKWGISHLNAI
GSTVNITAPTVDNIRLHSVDNSQVTFALDTSESVYIKNTEDFLQCCQLQTAAGTILPLAL
TGLNEGTTFLLQADVSDLSHNERLTFSLEQWNFPLEGTDGSGVGNTRLSLRNSFDDLDII
LDKQAAELTASSVYFTNSGPTLTLQFDELVSTNLSTLPSLISTANDQVLDVIDVVENTDQ
GYSIFDITFTIPHQQTAAQIKVDLSNAVIQDDFNNRSLFQAPQDYELCFPNLILHDMESN
IFGDDTAIQLLEGAEAKSMSLSLACPPSDTITVQVVRDGDDAISINGSTDRTTELTFTPS
NWNEPQLLALELLDNDYFEADRTIALSFEFIDTASDEMGYQLAPGKVINLMLQDDDYYLR
TDDPYLGFVLEEGITSPQINVSGNAVSEIPTTLILEVIGAQFLQPVESLLISKSESADLN
AQLLGNSGVKYVFSAEPNGPTENNTSIQRVEFIAQSEVVAWFDIKVEHSEVLTSVTEQVL
VEGGDAATLTVQLDSPPIEPTRFAVTSFDETELTVSPDVLEFNEFNWNQPQQVVITPVQD
IEQDGDTNASISLSVSDTIEYNPENVYAQYPAKTFEFNVRQSALSSFTVSELNGQIAEGG
QAQFTVVLNEPPTLPTNSQTIFITTNNNEANISTGELLFTSDNWNVPQTVIVQGTDDNNV
DGTSNVTIAIRSVTGSTSLQGTNTSIKTTVSDNDTWPKPDFTITVPEFYEGLDQFPSWMH
EDIALNTTFTAKPNQPTKATFEVVYDVNNERVGRKQCPRYSDECSLIKKELFTLSGGEWN
SYDSIYVEGLSSINDDIYNGTNTITGVIRYIEGDPVWEGFEKEFTYQLVDDEIGFQLTDL
PLQITSGESWDFNVYLSAFRVGEMAGFFENRRPTERYADIQLSTNDPQVSVSPTSMKIES
HTWDKNRPYHNETDIRLTYIQDGDDLQAGIFINQQALIFNTDNWNVPQIIEIETYGEVDS
GQSTIYGVSLNIDETIENRDSRFDASDVIFEVALVNELPEASDDSTQSRTNKPGLILSEN
IIYTYPSETASIAVSLSQAPQGEVRVRVNDLGKQVKLQLRSTGRDGLKVKPKDVIMYAQK
TLGLVETALSVTENETQIGLLNPSYSAAVTLGDSKYSDLFSITDNILSLSAPLDYEVTSE
PISLPLYITDSFGNQVTQTITVTVIDANDAPVINILNSLTAEEGESVSTRFTYTDQDGDT
VSATVSTPPSNGLASVDGTNVTYTPAANFHGSDSFVLTLTDGNGYETTQIINVTVNQVND
APEAFDLHRATEIDTATTFALIGRDVDGDVLTYEIVSTPNNGSLVVEQGSNKVTYTPDNG
FRGIDTFSYRVIDSSDADNNQSDISRVTINVSAKTWLSQLGEDILGVPTRSKYGRSVSLS
ADGRTMAIGDFNERQNGVFTSGTAGRVRVYTYRNDDENLGWQQLGVFYGEELGDKAGHSV
SLSADGRTVAIGAYMNDGNGLYSGHVRVYTYETGGESARWKRLGGDIDGESTQDNSGWSV
SLSADGRTVAIGAPFNSDNGRSAGHVRVYSYHAKEWQQLGADIDGEAEGDRSGYSVSLGA
DGRTLAIGAPYHDGNGSSSGQTRIYRYNYKLFGWEQLGTDINGEAEGDQSGHSVSLSADG
LTVAIGAPYNGQALETPFDPSSSGHVRVYRYHNETLAWEQLGIDIHGDRYAAEQGDMREG
KQLGDASFGHSVSISADGQKVAVGATEYFYQHENEIITFGHGQVRVYEYNTERETPEWHQ
VSSREAHVGLNTSINLSGDGSTVAVGAPYDYGLRPCLQTASIMNWEDCPPASNDPWYLQS
SVGAYRLKDTAPVAIAQSLTTNEGAAIDITLTGTDGDGDSLRFTVDDSTLEQNAILTAKE
GEENTYILTPTAYFHGELIFTFTARDGRSNSMPASVIVTVNALDNAVDDGVVYGFNSADS
ASVGVEDTSQVLTMPSVDRDGQTLVYDIVTQPTNGVISVNGHVFTYTPNTNAFGEDSFTY
AVTDNPADETRSVTQTAYIVVTSVNDAPYSIPIPEQAFTPGDYLEFNVVDFFGDEDANDE
LAFTFANQPMLNLEIIDGVISGYVDTEESFSVTVTATDSQGLSVSAEIRFVSRFAQ
NT seq
8991 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacactttttactcatatttacattgttcgtagtcaccatactcttaactggatgt
cgtgataatttttatgtcgaaattgaatgcaagagctgtctggataaatctggcaatgtt
gatggacgaagtacggacggtcaaggtgtatttgcgatctacatgatcagtgatggtaat
gtggtggatgcacgttactttacagaggatggaaatgaaacatccgatttgtttaccgcg
tttggaaatgaacattttttacctgagtatctgttagatgaaggcgaagctcgtaacagt
ttcaacagaagtaaacgattatacccttttagaaaccttcccggtgacgactatctggat
gttgagacctctaaagccctcgtcccttcacaaatgccgagtgctgacgataacaactac
gacgtaacacgtaacattgccaaaaatacatcagcatttcgtttcactatcccatttggt
tcaaaaatatatgacgatggcgatgaggagtttcaaaccgcctttggtaatggttatgtg
tcacttgataatcccatcgataaagtgattgttgtgacccctttaggcggggtttttgca
agtcaatgcgtgccataccgtgatttttttcaaagtatgaatccatcaaaccgtttcaaa
gatgttatttgtaacaacttttcgcatacctatctttacgatcctatttattacattagt
tcatcagctactgatcaacttgacggtttagcgggtgaagctttctttctcgctttcctt
tacaacccaggttcttttgtaccctttataaaaacaacgaactatagggtatctaatatc
gaccaacttaatgcgtttccaccctataatttacgatcctatacctattatgacggttta
gaaaaattacaagaactcactggttcaaatgattttaaaaacattgtcattaaatcagac
attccctttaccgtttatgccatcgacgagttaacgtcaccgaatattgcaacacctcta
gagtgtcttgttcaagaaggcaaaatatcaaacttagcgatcaatgatgagcaaacactt
ttaacgttaaatacatcagtaaaaatatccccttacattgttttaaatgaatttaaaaaa
aactcttctctttcaagaattgaagaagttcaaattttaagtcatgtttctaatgctaat
ggtgaaccttattatgcttcctttgaaggcatcaacctattcgaattgtgtacaaatcag
aattgtgaccccatgaccataaaaccgtattcttatagtgaaaacggtttttatctccac
gatttgtacagcgatgaaagcatgaccattgaagataattgtcaatccaattcgatcagt
gatatcgcgctttatggtaaatattcaaacaacacagtcaatcgtgtcggagagacggtt
cgtattcaagttgactttacttttccaacaaaagtcagcccttcaggtcgaaacaatttt
tcagaccacagcattacgttttcaatcggcgagcaagtggtaacggcttttggtgatgag
ataatcacggatggcttatcgacagaacaaattgaaaataactatatttcaggaatggtg
tttgcatttaccgtgactgaagacatgtattcagaagatggtattcaattcaatgattct
cgtgatgagctgtattttgataagcgttatgtttcgttcaatctaagacagtttgagagg
gctatcccaatgcatgatagtttgacgattgccagcaacaatgtctctatcatgccagaa
gttaatgcaccgagtgttctcgaataccaagcgatcctgtcgcaggagatgcatgtttct
ccgaattttaaattggatgataatcagtcgacggctaacgcaaaaggctcaggtccgtat
tggtctgaaggccgtttgtcttccgcaatatacgaaaccgcaatcgatattttgccgtgg
caaaataataccacgctatcgtaccgagttcatttttcagatgagatatctggattagat
acggatgattttcagttagtggatatcaatggtcaagcttctgctgctatccttgaagta
cgtccggcgacattaaccggggccgcgacacgatctcagaaaacatcatctgaccgatat
attgtgacaataggagagttttcaggacaaactgcgtttaaactggtactaaaagacgac
gccacattttactcatcggtgggcggtcgagaaattgagggcgttgttgaaaactattca
aatatggatttttacgagttaccagggagtattattcgcttcaatgacgcgttagatacc
cccaagcttggcgagttaatcacctctgattcattttatcccaatggtgtgccgaccgaa
gtcaatatgtcactgaataccatcttgccaacctttatcccctcaagagaccatttcgaa
attatcattttgttgaaagacggtacgagtttctctaagttggaacaggatattcaactg
agtattactcccacctatgatgtgtggttagaagagttccctcatttttacaaccttaaa
atagatttatcctctctagcgcaagccaatattgattttgctaatttgacggtttttgtc
aacacagaaaatacacagccgcttatgacaaaatggggtataagtcatcttaatgccatt
gggagtacagtcaatatcacagcaccgaccgttgataatattcgactgcactctgtagac
aattcgcaggtcacatttgcgttagataccagcgaatcggtgtacataaaaaacacggag
gatttcttacaatgttgtcagctgcaaaccgctgccggcacgatattaccattggcatta
acaggcctgaacgaaggcactacctttttgttgcaagcggatgtatcggatttgtctcac
aatgaacgactcacattctcgttagaacaatggaattttcctttagaggggactgatggg
agcggcgtaggcaatacgcgcctatcactgcgaaatagttttgatgatctggatatcata
ttagataaacaggcggctgaattaaccgcaagctcggtttattttaccaatagtgggcca
acactcacacttcagtttgatgagctggtcagtacgaatttatccaccttgcccagtttg
attagtactgcaaatgatcaggttcttgacgttattgatgtcgttgaaaatacagaccaa
ggctattcgatatttgatataacatttactatcccgcaccagcagacggcagcacagatc
aaagtagatctcagtaatgcggtcattcaggatgacttcaataatcgttcgttgtttcaa
gcgcctcaagattatgagttatgttttccaaatttgatcctacatgacatggaaagcaat
atattcggcgatgatacagcaatccagttattagaaggagcggaagccaaatcaatgagc
ctgtctctggcttgtccgccttccgatacgattaccgtgcaggttgtcagagacggtgat
gatgcgatttcgataaatggaagcacagatcgtactaccgaactgacattcacgccgtca
aattggaatgaaccacaattacttgcacttgagttattggataacgattatttcgaagcg
gatagaactattgctctaagctttgagtttattgatacagcgtcagatgaaatgggttat
cagttggcgccaggtaaagtcatcaatttgatgttacaagatgatgactattacttaaga
acagatgatccttatctgggctttgtgttagaagaaggcataacgtcaccacaaatcaat
gtgtctggaaatgcagtaagtgaaattcctaccacattgattttggaggtcatcggggct
cagtttcttcaaccggtggaaagtttgttgattagcaagagtgaatctgccgatttgaat
gcgcaactactgggcaattctggcgttaaatacgtgttttcagccgaaccgaatggacct
accgaaaacaatacctccattcaacgggttgagttcatcgctcagtctgaagtcgttgcg
tggtttgatatcaaggttgagcacagtgaagtgcttacatcggtgactgaacaagtattg
gtggaaggcggtgatgctgcaacattaacggtccaattagattctccacccattgaaccc
acacgttttgctgttacgtcttttgatgaaacagaattaacagtttcgcctgatgttctt
gagtttaatgaatttaactggaatcaacctcaacaagtagtcatcactccagtgcaagat
attgaacaagatggtgataccaatgcatcgatttcactctctgtcagcgatacaatagaa
tataatccggaaaatgtttatgcccagtatcctgccaaaacgtttgaatttaatgtgcgt
caatcagcactttcttcatttacggtgtctgaactgaacggtcaaatagccgaaggagga
caagctcaatttacagtagtgttaaatgagccgccgacattacccacaaacagtcaaaca
atcttcataacgactaataataatgaggcgaacataagtacaggggagttattgtttacc
tctgataattggaatgtgccacaaacggtcattgtgcaaggtacggatgataacaacgtc
gatggcacgtctaatgtgacgatcgcgattcgctccgttacgggctcaacatcattacaa
gggacaaatacgtccatcaaaacgacggtctcagataatgatacgtggcctaaacctgac
tttactatcacagtacctgaattttatgaggggcttgatcagttcccttcttggatgcat
gaagatatagcgctgaataccacgttcactgcgaagccaaatcaacccacaaaagcgact
ttcgaggtggtttatgacgtaaataatgaacgtgttggaagaaaacaatgtccgagatat
tctgatgaatgttcattaatcaaaaaagaactctttacccttagtgggggagaatggaat
agctacgactctatctacgttgagggtctgtctagcattaatgacgatatctataatggt
acaaatactatcactggtgtgattcgctatattgagggtgacccagtatgggaaggcttt
gaaaaagaatttacctaccaattagtggatgatgaaatagggtttcaattaactgactta
cctttgcagattacctcaggagaatcttgggattttaatgtttatttatcagcattccgt
gtgggggaaatggctgggtttttcgaaaatagacgaccgactgaacgatacgctgacatt
caactgtcgaccaatgacccacaggtttcggtatcgcctacttcaatgaaaattgaatca
catacttgggataaaaaccgcccataccataatgaaacagatattagattaacctatatt
caagatggggacgatttgcaagcaggcatattcattaaccagcaggcattaatctttaat
acagataattggaatgtccctcaaatcatagaaatcgaaacatatggtgaggttgactct
ggtcaaagtacaatttacggcgtaagtttaaatattgatgaaaccatagaaaatagagac
agccgatttgatgcttctgatgttatttttgaggttgcgttggtgaatgagctaccagag
gcttctgatgattcgacgcaatcaagaacgaataagccaggtctcattttatctgaaaat
atcatttatacgtatccgtcagaaactgcctcaattgcagtatctcttagtcaagcacct
caaggagaggtaagggtaagggtaaatgatttgggtaaacaggttaaattacaactgcgc
tcaacaggtcgtgatgggctaaaagtaaaacccaaagacgtcattatgtacgctcaaaaa
acacttggtcttgttgaaacggcactttctgtcactgagaacgaaacacagattggatta
ctgaatccaagttattctgccgctgttaccctaggggattctaaatatagtgacttgttc
agcattacggataatattttatcgctgagtgcgccattggactatgaagtaacctctgaa
cccattagtctgccattgtacataacggattcatttggtaatcaggttactcaaaccatt
accgtaacagtcattgatgcgaatgatgcgccagtaataaacatattgaatagcttaaca
gcggaagagggggagtctgtcagtactcgttttacttataccgatcaagacggggatacc
gtttctgcaacggtcagtacacctccgtccaatggtttggcgtcggtggatggcacgaac
gtgacctacacacccgcagccaacttccatggctccgatagctttgttctgaccttaacc
gatgggaatggttatgagacgacccaaatcatcaatgtgacggtaaaccaagtcaacgat
gccccggaggcatttgatttacatcgagcgacagaaatcgacactgccacaacatttgcc
ttgataggtagagatgttgacggtgatgtgttgacatatgagatagtatcgacaccaaac
aacggttctcttgtggttgaacaaggtagcaataaggtcacctacacgcctgataatggc
tttaggggcatagatacgttctcttatcgtgtcattgatagttctgatgcagacaataat
caaagtgacatcagtagggtgacgataaatgtctccgcaaaaacctggctcagtcagtta
ggtgaagatattctcggtgtgccaacacgaagtaaatatggtagatccgtgagtttaagt
gccgacggtcgcaccatggcaattggcgatttcaatgaaagacagaatggtgtttttacc
tctggaactgccggccgtgttcgtgtgtatacttaccgtaacgatgatgaaaacttaggc
tggcaacagcttggcgtcttttatggtgaagagttaggtgacaaagcagggcattcagtg
agtttaagtgctgacggtcgtacggtagctattggcgcctatatgaatgacggaaacggc
ttatattcaggtcacgttcgggtatatacctacgaaacaggcggagagagtgcacgctgg
aaacgtttagggggagacattgatggtgagtcaacacaagataattcaggttggtctgtc
agtctcagtgccgatggtcgcactgttgccattggtgctccatttaacagtgacaatggt
cgcagcgcgggccatgtacgcgtatattcttatcatgcaaaagagtggcaacaactgggg
gcagatatcgatggtgaagcggaaggagaccgttcaggttactcagtgagtttaggtgcc
gatggtcgaacactggcgattggtgcgccttaccatgacggcaatggatcatcttcaggt
caaacacgcatttaccgctataattacaagttgtttggttgggagcagctgggcacagat
attaacggtgaagcagaaggtgatcaatcgggtcattcagtgagcttaagcgctgatggt
ctcacggtggcgattggagcgccgtataatggccaagcactcgaaacaccatttgatccc
tcatcttcaggacatgttcgcgtttatcgctatcacaacgagacgcttgcatgggagcag
ttgggtatagatatccatggtgacaggtatgcagcagagcaaggggatatgcgtgaagga
aagcaacttggtgacgcgtcatttggtcactctgttagtataagtgccgatgggcaaaag
gtcgcagtcggcgcaacggaatatttttatcaacatgagaatgagattataacctttgga
catggtcaagttagggtgtacgagtacaacacagagcgtgaaacgcccgagtggcatcaa
gtgtcaagtcgagaggcacatgttggtttgaatacctccatcaatttaagtggcgatggc
agtacagtggcagtaggagcgccatatgattatgggcttagaccttgcttacagactgca
agtatcatgaactgggaagactgtcctcctgcttcaaatgacccttggtatttacaaagt
tctgtaggtgcttatcggttgaaagatacggccccagttgccatagcgcaatctcttacg
acaaatgaaggggctgctattgatatcacattaacaggcacagatggggatggagatagt
cttcgttttacggtcgatgactcaacccttgagcagaacgcgatattgacggctaaggaa
ggagaagaaaacacatatatccttactccaacggcgtacttccatggggagttaatattt
acctttaccgctcgagacggcagatcaaacagtatgcctgctagtgtaatcgtaacggtg
aatgcgttagataatgctgtggatgacggtgttgtgtatggttttaattcagccgattcc
gctagtgttggtgtcgaagatacttctcaagtattaacgatgccaagtgtggatagagat
ggccaaacattggtatatgatattgtgacgcagccaaccaatggtgtaatttcggtaaat
ggtcatgtgttcacatacacaccaaacacgaatgcgtttggagaagacagtttcacatac
gctgttacagataatcctgcagatgaaacacgctccgtcacacaaactgcatatatagtt
gtgacgtcagtcaatgatgcaccgtattcaatacccattcctgaacaagcgtttacgcca
ggagattatcttgaatttaatgtagtcgatttttttggtgacgaggatgctaatgatgaa
ttggcttttactttcgccaaccaacctatgcttaatttagaaatcatagacggtgtgatt
agcggatatgttgatactgaagaaagtttctcagtgactgtgactgcaacggatagtcaa
ggtctctcagtgtcggcagaaatacggtttgtgagtcgttttgcacaatga
DBGET
integrated database retrieval system
